981- Primer "pangenoma" humano (HPRC)

El primer 'pangenoma' humano pretende catalogar la diversidad genética. Nature News Article, 10 May 2023. Layal Liverpool, Editor

Los investigadores publican los resultados preliminares de un esfuerzo en curso para capturar la totalidad de la variación genética humana.

Más de 20 años después de que se publicara el primer borrador del genoma del histórico Proyecto Genoma Humano, los investigadores publicaron un borrador del "pangenoma" humano: una instantánea de lo que está a punto de convertirse en una nueva referencia para la investigación genética que captura más de la diversidad humana de lo que hasta ahora estuvo previamente disponible. Los genetistas dieron la bienvenida al hito, al tiempo que destacaron las consideraciones éticas clave que rodean el esfuerzo por hacer que la investigación del genoma sea más inclusiva.

“Esto es como pasar de la televisión en blanco y negro a 1080p”, dice Keolu Fox, científico del genoma de la Universidad de California en San Diego. “Es algo que todos estábamos esperando”, dice Aimé Lumaka, genetista que ocupa un cargo conjunto en la Universidad de Lieja en Bélgica y la Universidad de Kinshasa en la República Democrática del Congo dice “Al genoma de referencia actual le falta no solo parte de la información genómica sino, lo que es más importante, le falta diversidad”.

El borrador del genoma, publicado en Nature el 10 de mayo , fue producido por el Human Pangenome Reference Consortium (HPRC). Lanzado en 2019, el proyecto internacional tiene como objetivo mapear la totalidad de la variación genética humana, para crear una referencia integral contra la cual los genetistas podrán comparar otras secuencias. Tal referencia ayudaría a los estudios que investigan los posibles vínculos entre los genes y la enfermedad.

El borrador del pangenoma sigue a la publicación en 2022 de la primera secuencia completa del genoma humano, que llenó los vacíos que había dejado el Proyecto Genoma Humano original. Pero a diferencia del borrador original del genoma humano y su sucesor, los cuales se derivaron principalmente del ADN de una sola persona, el borrador del pangenoma representa una colección de secuencias de una selección diversa de 47 personas de todo el mundo, incluidas personas de África, las Américas, Asia y Europa.

Mapa del tubo genético

Eimear Kenny, genetista de la Escuela de Medicina Icahn en Mount Sinai en la ciudad de Nueva York, y sus colegas alinearon todas estas secuencias computacionalmente para formar un 'gráfico de pangenoma', conceptualmente similar a un mapa del metro de Londres, en el que las rutas de ramificación indican variación genética. Los investigadores descubrieron que el pangenoma les permitió identificar el doble de variantes estructurales (grandes alteraciones genómicas, como duplicaciones o eliminaciones de genes) por persona de lo que es posible utilizando el genoma de referencia lineal original. El equipo tiene como objetivo analizar secuencias de 350 personas para mediados de 2024.

Muchas de las muestras que se analizan son de personas que participaron en el Proyecto 1000 Genomas, un esfuerzo de secuenciación iniciado en 2008 para mapear la variación genética en 26 poblaciones diversas. El consorcio Pangenome está descongelando y volviendo a analizar las muestras de ADN congeladas de los participantes utilizando una técnica más detallada llamada "secuenciación de lectura larga". Este método  analiza simultáneamente secciones más largas de ADN, en comparación con métodos de secuenciación más antiguos y puede distinguir entre pares de cromosomas de la misma persona. “Es un enfoque de resolución mucho más alta”, dice Fox. ........

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Referencia original

(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Nueva presentación el  25 de Junio. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

980- ¿Origen del Covid-19?

Lawrence O. Gostin, J.D., Gigi K. Gronvall,. Perspective. Los orígenes del Covid-19: por qué es importante (y por qué no). NEJM  June 7, 2023. O’Neill Institute for National and Global Health Law, Georgetown University Law Center, Washington, DC (L.O.G.); Johns Hopkins Center for Health Security, Baltimore (G.K.G.).

Cuando surgen emergencias de salud, los científicos buscan descubrir la causa, por ejemplo, cómo surgió y se propagó un patógeno, porque este conocimiento puede mejorar nuestra comprensión de los riesgos y las estrategias de prevención, preparación y mitigación. Sin embargo, ha pesar de haber transcurrido el cuarto año de la pandemia de Covid-19, aún continúan los intensos debates políticos y científicos sobre sus orígenes. 

Las dos hipótesis principales son: un derrame zoonótico natural, que probablemente ocurrió en el mercado mayorista de mariscos de Huanan, y una fuga del laboratorio del Instituto de Virología de Wuhan (WIV). Vale la pena examinar los esfuerzos para descubrir los orígenes del SARS-CoV-2, los obstáculos políticos y lo que nos dice la evidencia. Esta evidencia puede ayudar a aclarar el camino evolutivo del virus. Pero en forma independiente los orígenes del virus,

La historia de los orígenes se remonta al 31 de diciembre de 2019, cuando la Organización Mundial de la Salud (OMS) se enteró de un grupo de casos de neumonía de causa desconocida en Wuhan (ver la cronología ). Las autoridades de Wuhan cerraron el mercado de Huanan al día siguiente, lo que hizo que los animales vivos no estuvieran disponibles para las pruebas. 

China compartió públicamente la secuencia genética del SARS-CoV-2 el 10 de enero de 2020. No fue sino hasta semanas después de que la OMS declarara al Covid-19 una emergencia de salud pública de importancia internacional el 30 de enero, que la Misión Conjunta OMS-China visitó Beijing y Wuhan (16 de febrero al 24 de febrero).

El informe técnico conjunto de la OMS y China publicado en marzo de 2021 calificó un derrame zoonótico del virus como una fuente "de probable a muy probable", a los productos de la cadena de alimentos fríos como "posible" y un incidente de laboratorio (WIV) como "extremadamente improbable". 

El director general de la OMS repudió de inmediato los hallazgos del informe, creyendo que era prematuro descartar un posible incidente de laboratorio. Una carta abierta publicada en Science el 14 de mayo de 2021 acreditó la teoría del laboratorio y pidió acceso abierto a los registros de laboratorio y estudios basados ​​en la ciencia. El 13 de octubre de 2021, el director general de la OMS estableció el Grupo Asesor Científico para los Orígenes de Nuevos Patógenos (SAGO). China rechazó oficialmente el plan de la OMS para una segunda fase de investigación de sus orígenes. El informe preliminar de SAGO advirtió que China estaba ocultando datos clave.

Recientemente, un equipo de expertos internacionales anunció que había identificado datos sobre muestras ambientales positivas para SARS-CoV-2 recolectadas del mercado de Huanan en enero de 2020, que China había ocultado del dominio público durante 3 años. Los científicos chinos cargaron los datos en GISAID (la Iniciativa global para compartir todos los datos sobre la influenza), pero luego los eliminaron. En respuesta a la presión de la OMS, China restauró esos datos a la GISAID.

Determinar los orígenes del SARS-CoV-2 debería ser estrictamente un asunto científico, pero se ha enredado en la política. En marzo de 2020, el Ministerio de Relaciones Exteriores de China alegó, sin pruebas, que el personal del Ejército de los EE. UU. había introducido el SARS-CoV-2 durante una visita a Wuhan, lo que llevó al presidente Donald Trump a afirmar que el virus se originó en el WIV. Tras acusar al director general de ponerse del lado de China, Trump notificó a las Naciones Unidas que Estados Unidos tenía la intención de retirarse de la OMS. Aunque el presidente Joe Biden luego revocó esa decisión, la controversia sobre los orígenes ha continuado. 

El 26 de mayo de 2021, Biden ordenó a las agencias de inteligencia de EE. UU. que revisaran las hipótesis de los orígenes en competencia. La Oficina del Director de Inteligencia Nacional publicó la “Evaluación desclasificada sobre los orígenes de COVID-19,3 .......

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Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

979- El dengue en diferentes materiales biológicos

Mahathir Humaidi, Wei Ping Tien, Grace Yap, Choon Rong Chua, Lee Ching Ng Zeno Bisoffi, Academic Editor. Diagnóstico no invasivo del Dengue: el uso de saliva y orina en las diferentes etapas de la enfermedad. Diagnostics (Basel). 2021 Aug; 11(8): 1345. Environmental Health Institute, National Environment Agency, Singapore.

Resumen

El diagnóstico del dengue (DENV) depende en gran medida de los síntomas clínicos y se confirma de forma rutinaria con su detección en el laboratorio en muestras de suero de pacientes recolectadas mediante flebotomía. Esto presenta un desafío para los pacientes que no son aptos para la venopunción. Los métodos no invasivos de diagnóstico del dengue tienen el potencial de mejorar el actual algoritmo de detección del dengue. En este estudio, se recolectaron muestras de pacientes infectados con dengue entre enero y septiembre de 2012 y desde septiembre hasta diciembre de 2013 con dos configuraciones diferentes. Las muestras del Panel A (sangre, orina y saliva) se recolectaron diariamente cuando los 39 pacientes estaban hospitalizados y durante sus visitas de seguimiento, mientras que las muestras del Panel B (saliva) se recolectaron de 23 pacientes durante la etapa aguda del dengue. Usando DENV- PCR en el Panel A, desde el día 2 hasta el día 4 después del inicio de la fiebre, el suero mostró la mejor positividad general seguido de la saliva y la orina (100 % /82,1 %/ 67,9 %). Desde el día 5 hasta el día 10 después del inicio de la fiebre, el suero y la orina tuvieron una positividad similar (67,4% /61,2%), seguidos de la saliva (51,3%). Más allá del día 10 posterior al inicio de la fiebre, el DENV fue indetectable en el suero, pero la orina y la saliva mostraron un 56,8 % y un 28,6 % de positividad. El DENV en la orina fue detectable hasta 32 días después de la fiebre. Los resultados del panel B mostraron una sensibilidad general del 32,4 % -36 % (ARN/NS1) para la detección de DENV en la saliva. Nuestros resultados sugieren que el método de detección basado en la orina es útil especialmente para la detección tardía del dengue, donde el DENV no se detecta en el suero pero aún se puede detectar en la orina.

1. Introducción

El dengue es el virus transmitido por mosquitos más común del mundo, con aproximadamente tres mil millones de personas en riesgo de infección cada año. En aproximadamente 100 países, se estima que 50 millones de infecciones por año desafían la infraestructura de salud pública de los países afectados. Un diagnóstico de laboratorio preciso y rápido es esencial para que el médico distinga el dengue en fase inicial de otras enfermedades con síntomas clínicos similares. Esto permite la asignación eficiente de recursos limitados para actividades de control de vectores.

Existen dos métodos en el diagnóstico de laboratorio del dengue. i) El método directo implica la detección de DENV aislado, de antígenos virales como la proteína NS1, o la secuencia genómica a través de la PCR con transcriptasa inversa (RT-PCR).  ii)  El método indirecto requiere la detección de altos niveles de anticuerpos IgM, IgG o IgA específicos del dengue. 

Actualmente, la prueba de RT-PCR,  la detección de NS1 mediante el ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA) o la prueba rápida de flujo lateral son suficientes para la confirmación de la infección aguda por dengue. Los ensayos serológicos de anticuerpos IgM e IgG reactivos contra el dengue se pueden usar para mostrar si un paciente tiene una infección primaria o secundaria por dengue. 

Los kits de IgM basados ​​en ELISA, en comparación con los kits de IgM de prueba rápida, tienen sensibilidades más altas (61,5–99,0 % frente a 20,5–97,7 %) y especificidades más altas (79,9–97,8 % frente a 76,6–90,6 %). También se debe tener en cuenta que la IgM del dengue reacciona de forma cruzada con los cuatro serotipos de DENV y otros flavivirus como el virus del Nilo Occidental (WNV), el virus de la encefalitis de St. Louis (SLE), el virus de la encefalitis japonesa (JEV) y el virus de la fiebre amarilla (YFV). 

La IgG no es adecuada para el diagnóstico precoz de casos de infección primaria, ya que solo se puede detectar después de 10 días desde el inicio de la enfermedad. En la infección secundaria, sin embargo, se puede detectar un aumento rápido de IgG desde el día 4 después del inicio de la enfermedad. Se ha detectado Dengue IgA en suero de pacientes febriles entre los días 8 y 11 después del inicio de la fiebre de una infección primaria por dengue. Durante la infección secundaria, la IgA aumenta casi inmediatamente después del inicio de la fiebre.

El empleo de una técnica basada en la saliva en el diagnóstico del dengue proporciona un método fácil y no invasivo para la recolección de muestras. Poloni et al. y Mizuno et al. también pudieron detectar el genoma del virus del dengue en la saliva mediante RT-PCR en tiempo real, mientras que Ravi Banavar et al. demostró una sensibilidad y especificidad del 100% con muestras de saliva seropositivas en un kit ELISA IgG.  Vázquez et al. han demostrado que Dengue IgA e IgG, pero no IgM, pueden detectarse en la orina de pacientes con infección primaria y secundaria por dengue. 

Comparando las tasas positivas de antígeno NS1, Saito et al. detectó tasas similares en orina y suero en los días 11 a > 15 posteriores al inicio de la fiebre. En un estudio de viajeros japoneses que se infectaron con dengue en el extranjero, la tasa de positividad del genoma de DENV para muestras de orina y suero fue del 30 % y 79 %, respectivamente, entre los días 1 y 5 después del inicio de la enfermedad y entre los días 10 y 16 después del inicio de la enfermedad; la tasa de positividad correspondiente fue del 61 % (orina) y del 11 % (suero). Yingsiwaphat et al. pudieron aislar DENV vivo de la orina de pacientes con infección aguda y de pacientes 14 días después de la defervescencia. 

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Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
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978- Historia del laboratorio clínico - I

Angela Tomei Robinson. Patologia- los inicios del laboratorio clínico. Oxford-Laboratory Medicine 2021;52:e66-e82. St. John’s University College of Pharmacy and Health Sciences, Queens, NY

Resumen

El primer artículo de esta serie corresponde a la cronología histórica de la patología y el laboratotio clínico desde la antigüedad, con el desarrollo más temprano de las pruebas de laboratorio a lo largo de los siglos hasta el día de hoy. Varios desarrollos iniciales de "laboratorios"  (farmacéuticos, físicos, químicos, biológicos, forenses, microbiológicos) eran con fines de estudio experimental e investigación cientifica. Ninguno al principio estaba específicamente orientado clinicamente para análisis de diagnóstico directo para el cuidado del paciente. Ademas, los laboratorios clínicos originalmente no estarían afiliados a los hospitales. El uso de laboratorios clínicos para pruebas médicas para ayudar en la detección, diagnóstico y tratamiento de enfermedades sería una consecuencia de estos laboratorios de investigación y sera necesario algún tiempo para que la patología y el laboratorio clínico  fueran reconocidas como una especialidad establecida. Los historiadores generalmente demuestran que los laboratorios se crearon primero como salas independientes separadas de los hospitales para eventualmente formar parte de los hospitales universitarios. (Lab Med. 2023 Apr 13:lmac164. 10.1093/)

¿Qué es la patología?

En esencia, la patología es el estudio de la enfermedad con dos divisiones principales: patología anatómica (el estudio de las partes del cuerpo) y patología-bioquímica clínica (el estudio de los fluidos corporales).La primera aplicación de la patología comenzó y se basó en el desarrollo de la medicina donde la mayoría de los primeros patólogos eran médicos. Es importante seguir la historia hasta el día de hoy para arrojar algo de luz sobre cómo evolucionó el laboratorio clínico y observar que dicha historia ha sido complicada y enrevesada.

Cronología histórica del laboratorio clínico: primeras técnicas.

El laboratorio clínico comenzó con el estudio de un subproducto natural de todos los humanos que se obtenía fácilmente: la orina. Las muestras de orina pueden proporcionar información valiosa para un médico. Incluso si muchos profesionales de laboratorio actuales opinan que el análisis de orina quizás no sea el área de trabajo más popular asignada, la prueba de orina en sí misma ha sido bastante divertida y dramática desde el principio. Hace miles de años, las primeras pruebas se basaban en métodos de análisis muy diferentes y primitivos y dependían en gran medida de suposiciones en base únicamente a observaciones.

4000 a.C.: según papiros desenterrados, los "médicos" babilónicos registraban observaciones de orina en tablillas de arcilla. Las primeras evaluaciones médicas egipcias también se registraron en rollos y se consideraron avanzadas. Sin embargo, el lujo de obtener un diagnóstico de enfermedad se le asignaba únicamente a los miembros de la realeza y los ricos. Los rituales y sacrificios (es decir, dioses/ demonios) generalmente se usaban para determinar la naturaleza de la enfermedad. En cualquier caso, la atención al paciente se dejaba en gran medida al azar.

300-100 a.C.: Los antiguos médicos hindúes realizaron pruebas vertiendo orina en el suelo para observar si las hormigas se sentirían atraídas por la dulzura de la orina.

Era Clásica

400–301 a.C.: El médico griego Hipócrates (460–370 a.C.), conocido como el “Padre de la Medicina”, tuvo un impacto indeleble en la cultura griega durante la era helenística que se transmitió directamente a la medicina romana. Hipócrates fue uno de los primeros médicos en interpretar el funcionamiento del cuerpo a partir de la orina, al afirmar que ningún otro sistema de órganos del cuerpo humano proporcionaba tanta información mediante su excreción como el sistema urinario, y determinó que la orina podía utilizarse como indicador pronóstico para el examen de enfermedades. 

Utilizó los sentidos humanos como los ojos y los oídos. Por ejemplo, ver sedimentos lo correlacionaba con aumento de la fiebre y ver burbujas flotando indicaba que la enfermedad se prolongaría. Hipócrates también profesó la importancia del olfato e incluso del gusto. Su hipótesis mencionaba que la orina era un filtrado de 4 fluidos corporales (humores), cada uno procedente de una región diferente del cuerpo y que cada humor era necesario para mantener el equilibrio de la salud. Una de las primeras pruebas manuales de laboratorio realizadas fue la degustación de orina para confirmando su dulzura.

101–200 d.C: Aproximadamente 6 siglos después, Aelius (Claudius) Glenus (129–216 d.C.), conocido popularmente con el nombre de Galeno, fue un médico del Imperio Romano nacido en una rica familia griega, que amplió los ideales de Hipócrates. Considerado como quizás la figura médica más grande de la época, aclaró que la orina no era un filtrado de los 4 humores conocidos (sangre, flema, bilis amarilla-bilis negra) y propuso que la orina era un filtrado sólo de la sangre. También sugirió que la ingesta de líquidos por parte de un paciente sano era proporcional a su excresión. Los escritos de Galeno fueron extensos, y sus teorías sobre la anatomía (a través de animales vivos, porque las disecciones humanas estaban prohibidas por la ley romana) guiaron la medicina hasta la Edad Media. La aceptación indiscutible de sus puntos de vista (es decir, la sangre se crea en el hígado después de ingerir alimentos y fluye hacia el lado derecho o izquierdo del corazón) dominó el pensamiento médico durante aproximadamente 1500 años, lo que desafortunadamente no promovió nuevas investigaciones con nuevas ideas. para desafiar y permitió prolongar el pensamiento improductivo......

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Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
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977- Estándares OSHA para patógenos transmitidos por la sangre

Deanna Denault; Holly Gardner. Estándares OSHA para patógenos transmitidos por la sangre. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2023 Jan. Clarkson Ave, Potsdam, NY, USA. Saint Vincent Hospital Worcester, Massachusetts, USA.

Resumen

Los patógenos transmitidos por la sangre son microorganismos infecciosos en la sangre humana que pueden provocar enfermedades graves. Los trabajadores de la salud y el personal de apoyo tienen un mayor riesgo de exposición a estos patógenos. El Occupational Safety and Health Administration (OSHA) consiste en regulaciones diseñadas para proteger a los trabajadores de la atención médica expuestos ocupacionalmente. Esta presentación repasa los elementos del Estándar de la OSHA para patógenos transmitidos por la sangre. Destaca el papel del equipo interprofesional en la reducción o eliminación del riesgo de exposición ocupacional a materiales infecciosos en una amplia gama de enfermedades.

Objetivos:

• Identificar los patógenos comunes transmitidos por la sangre y el método de transmisión. 
• Enumerar y analizar la naturaleza y la frecuencia del contacto con la sangre y el método de exposición a las enfermedades transmitidas por la sangre.
• Describir las herramientas para proteger al personal sanitario de las infecciones transmitidas por la sangre.
• Resumir los elementos del estándar de patógenos transmitidos por la sangre.

Introducción

Los patógenos transmitidos por la sangre son microorganismos que pueden causar enfermedades potencialmente mortales y representar un riesgo grave para los trabajadores de la salud en contacto con sangre u otros fluidos, incluidos semen, secreciones vaginales, saliva y fluidos serosos (pleurales, pericárdicos, peritoneales y amnióticos) transparentes o visiblemente contaminados con sangre que pueden transmitir el patógeno y causar enfermedades infecciosas. 

En el ámbito de la atención de la salud, los patógenos transmitidos por la sangre a menudo se transmiten por lesión percutánea, pinchazos accidentales, mordeduras humanas, cortes, abrasiones o por exposición mucocutánea a los fluidos del paciente infectado. En el lugar de trabajo, la principal fuente de infecciones transmitidas por la sangre son las lesiones percutáneas causadas por agujas u otros objetos punzo-cortantes. 

Especialmente propensas a la exposición, son las profesiones médicas que involucran procedimientos invasivos frecuentes, un alto volumen de sangre y urgencia de atención, trabajadores de la salud en las unidades de cirugía, medicina de emergencia, cuidados intensivos, parto y diálisis, que son los más propensos a la exposición ocupacional. Otras ocupaciones con riesgo de exposición incluyen servicios mortuorios y funerarios, mantenimiento de hospitales y trabajadores en la eliminación de desechos.

De los 20 patógenos transmitidos por la sangre que se sabe que causan enfermedades como la malaria, la sífilis y la fiebre hemorrágica, hay tres que son los patógenos más comunes y que causan preocupación:  el virus de la hepatitis B (VHB), el virus de la hepatitis C (VHC) y el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH),  Estos tres virus representan la mayoría de las infecciones adquiridas en el trabajo y están asociados con morbilidad y mortalidad significativas.  Aunque la gran mayoría de las exposiciones ocupacionales no se manifiestan en forma de enfermedad, el riesgo general de transmisión depende de forma variable de varios factores, incluidos el tipo y el tamaño del inóculo, la duración de la exposición, el título del virus y la prevalencia de la infección activa en la población.

La hepatitis B es una infección viral capaz de causar una infección crónica persistente que puede conducir a una enfermedad aguda y crónica. Es un virus hepatotrópico que se transmite a través de la sangre o el semen de individuos infectados a aquellos que carecen de inmunidad. El VHB es un problema de salud mundial y un riesgo laboral bien establecido para los trabajadores de la salud. La incidencia del VHB en la población está aumentando constantemente, y la prevalencia de la infección por VHB en los trabajadores de la salud es mucho mayor que en la población general. El virus es estructuralmente estable, permaneciendo viable e infeccioso por períodos prolongados de hasta 1 semana en las superficies.  El VHB es altamente infeccioso y se transmite de manera eficiente a través de la exposición percutánea, mucosa a sangre o fluidos corporales infecciosos. El riesgo de infección percutánea por VHB varía del 6 al 30%, según la serología de la fuente. Las vacunas para prevenir el VHB están  disponibles desde 1981 y siguen siendo el pilar de la prevención de la hepatitis B. Entre las medidas de seguridad enumeradas, el Estándar de patógenos transmitidos por la sangre exige que los empleadores aseguren la disponibilidad de esta vacuna para todos los empleados en riesgo de exposición ocupacional.

La hepatitis C, otro virus hepatotrópico, es la infección transmitida por la sangre más comúnmente reportada en los Estados Unidos y un grave problema de salud pública. El VHC se transmite principalmente a través de la exposición parenteral, más comúnmente con agujas contaminadas. La prevalencia del VHC entre los trabajadores de la salud no supera la de la población general; sin embargo, existe un mayor riesgo de exposición en el ámbito de la atención de la salud. El riesgo de transmisión cuando se expone a sangre VHC positiva es del 1,8%, considerablemente más bajo que el VHB. Los tratamientos están evolucionando con el desarrollo de nuevas terapias dirigidas. Actualmente, no existe una vacuna o profilaxis posterior a la exposición (PEP) para la infección por VHC. 

El virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) se dirige al sistema inmunitario causando el síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA). El VIH se transmite a través del contacto directo con sangre, semen, fluidos rectales, fluidos vaginales o leche materna de una persona con una carga viral detectable. En el lugar de trabajo, la transmisión ocupacional está influenciada por varios factores, incluido el volumen de sangre, el tipo de procedimiento, el tipo de lesión o la penetración percutánea. En comparación con el VHB y el VHC, el riesgo percutáneo de transmisión del VIH es el más pequeño: estimado en alrededor del 0,3%. Si bien no existe una cura para la enfermedad, existen medicamentos antivirales que retrasan la progresión. En casos de exposición, si se toman dentro de las 72 horas, la administración de medicamentos profilácticos posteriores a la exposición (PEP) son altamente efectivos para prevenir esta patpología.

Colectivamente, los patógenos transmitidos por la sangre son una amenaza para la vida humana y siguen siendo un problema de salud pública. Se estima que cada año se producen aproximadamente tres millones de exposiciones a patógenos transmitidos por la sangre. En la mayoría de los entornos de trabajo o laboratorio, las infecciones transmitidas por la sangre a menudo se deben a pinchazos accidentales. En los Estados Unidos, se estima que hay 400.000 lesiones cortantes al año en el ámbito hospitalario.

En 1991, the Occupational Safety and Health Administration (OSHA) emitio el Bloodborne Pathogens Standarden en respuesta a una preocupación mundial. Esta norma garantiza la seguridad de los trabajadores de la salud en riesgo de exposición ocupacional. Los reglamentos prescritos a los empleadores se encuentran en el Título 29 del Código de Reglamentos Federales en 29 CFR 1910.1030. El cumplimiento estricto de estas normas y directrices reducirá el riesgo, minimizará la exposición y ayudará a prevenir la transmisión de patógenos transmitidos por la sangre.

Específicamente, la norma federal exige que los empleadores hagan lo siguiente:

• Establecer y actualizar anualmente un plan de control de exposición.
• Brindar educación y capacitación inicial y anual a los trabajadores. 
• Poner a disposición la serie de vacunas contra la hepatitis B dentro de los 10 días posteriores a la asignación del empleado.
• Implementar el uso de las precauciones universales.
• Identificar y utilizar controles de ingeniería aprobados.
• Identificar y garantizar el uso de controles de prácticas laborales. 
• Uso de etiquetas y/o señales de advertencia para comunicar peligros. 
• Proporcionar equipo de protección personal (PPE) adecuado y adecuado para los empleados.
• Establezca planes de evaluación y seguimiento posteriores a la exposición fácilmente disponibles.
• Mantener registros médicos y de capacitación de los empleados.

Dado que la mayor proporción de transmisión ocupacional de patógenos sanguíneos se debió a lesiones percutáneas, en 2000 se revisó la norma para incluir the Needlestick Safety and Prevention Act (HR.5178). Como sugiere el nombre, esta revisión impuso requisitos adicionales con mayor detalle para los empleados relacionados con objetos corto-punzantes. Específicamente, requiere que los empleadores consideren e implementen nuevas tecnologías y usen dispositivos médicos efectivos y más seguros. Al considerar tecnologías más nuevas, los empleadores deben solicitar la opinión de los empleados. Por último, los empleadores están obligados a mantener un registro de lesiones corto-punzantes. La promoción del uso de agujas seguras o dispositivos sin agujas y otras intervenciones ha resultado en una disminución significativa de las lesiones percutáneas entre los trabajadores de la salud en los hospitales de EE. UU...... 

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976- ChatGPT 3.5: optimo rendimiento en exámenes de licencia medica

Tiffany H. Kung, Morgan Cheatham, Arielle Medenilla, Czarina Sillos, Lorie De Leon, Camille Elepaño, Maria Madriaga, Rimel Aggabao, Giezel Diaz-Candido, James Maningo, Victor Tseng. Rendimiento de ChatGPT en USMLE: importancia para la educación médica asistida por IA utilizando modelos de grandes lenguaje. PLOS Digit Health. 2023; 2(2): e0000198. AnsibleHealth, Inc Mountain View, California, United States of America.

Resumen

Evaluamos el rendimiento del modelo de un gran lenguaje llamado ChatGPT en the United States Medical Licensing Exam (USMLE) que consta de tres exámenes: Paso 1, Paso 2CK y Paso 3.  ChatGPT lo realizó en o cerca del umbral de aprobación de los tres exámenes sin ninguna formación especializada o refuerzo. Además, ChatGPT demostró un alto nivel de concordancia y perspicacia en sus explicaciones. Estos resultados sugieren que los modelos de grandes lenguajes pueden tener el potencial de ayudar con la educación médica y en la toma de decisiones clínicas.

Resumen del autor

Los sistemas de inteligencia artificial (IA) son una gran promesa para mejorar la atención médica y los resultados de salud. Como tal, es crucial garantizar que el desarrollo de la IA clínica se guíe por los principios de confianza y explicabilidad. Medir el conocimiento médico de la IA en comparación con el de los médicos humanos expertos es un primer paso fundamental para evaluar estas cualidades. 

Para lograr esto, evaluamos el desempeño de ChatGPT, una IA basada en lenguaje, en el Examen de Licencias Médicas de los Estados Unidos (USMLE). El USMLE es un conjunto de tres pruebas estandarizadas de conocimiento de nivel experto, que se requieren para obtener la licencia médica en los Estados Unidos. 

Descubrimos que ChatGPT funcionó en o cerca del umbral de aprobación del 60% de precisión. Siendo el primero en lograr este punto de referencia, esto marca un hito notable en la maduración de la IA. En forma impresionante, ChatGPT pudo lograr este resultado sin el aporte especializado de entrenadores humanos. Además, ChatGPT mostró un razonamiento comprensible y conocimientos clínicos válidos, lo que brindó una mayor confianza a la confianza y la explicabilidad. Nuestro estudio sugiere que los modelos de lenguaje grande, como ChatGPT, pueden ayudar potencialmente a los estudiantes humanos en un entorno de educación médica, como preludio de la futura integración en la toma de decisiones clínicas.

Introducción

Durante la última década, los avances en las redes neuronales, el aprendizaje profundo y la inteligencia artificial (IA) han transformado la forma en que abordamos una amplia gama de tareas e industrias que van desde la fabricación y las finanzas hasta los productos de consumo. La capacidad de construir modelos de clasificación de alta precisión rápidamente e independientemente del tipo de datos de entrada (por ejemplo, imágenes, texto, audio) ha permitido la adopción generalizada de aplicaciones como el etiquetado automático de objetos y usuarios en fotografías, traducción de texto casi a nivel humano, escaneo automatizado en cajeros automáticos de bancos, e incluso la generación de pies de imagen.

Si bien estas tecnologías han tenido un impacto significativo en muchas industrias, las aplicaciones en la atención clínica siguen siendo limitadas. La proliferación de campos clínicos de texto libre combinados con la falta de interoperabilidad general entre los sistemas de TI de salud contribuyen a la escasez de datos estructurados y legibles por máquina necesarios para el desarrollo de algoritmos de aprendizaje profundo. Incluso cuando se desarrollan algoritmos aplicables a la atención clínica, su calidad tiende a ser muy variable, y muchos no logran generalizar entre entornos debido a la limitada reproducibilidad técnica, estadística y conceptual. 

Como resultado, la gran mayoría de las aplicaciones de atención médica exitosas actualmente admiten funciones administrativas que van desde operaciones de pago, procesamiento automatizado de autorizaciones previas y gestión de cadenas de suministro y amenazas de seguridad cibernética. Con raras excepciones, incluso en imágenes médicas, existen relativamente pocas aplicaciones de IA que se usan directamente en la atención clínica generalizada en la actualidad. El desarrollo adecuado de modelos clínicos de IA  requiere una gran cantidad de tiempo, recursos y, lo que es más importante, datos de capacitación altamente específicos del dominio y del problema, todos los cuales son escasos en el mundo de la atención médica. 

Uno de los desarrollos clave que permitió la IA basada en imágenes clínicas ha sido la capacidad de los grandes modelos de dominio general para funcionar tan bien como, o incluso superar, los modelos de dominio específico. Este desarrollo ha catalizado una actividad significativa de IA en imágenes médicas, donde de otro modo sería un desafío obtener suficientes imágenes clínicas anotadas. De hecho, hoy en día, Inception-V3 sirve como la base básica de muchos de los mejores modelos de imágenes médicas publicados actualmente, que van desde oftalmología y patología a la dermatología.....

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Nueva presentación el  12 de Junio. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

975- Meningitis virales

Rebecca M. Cantu, Joe M Das.Meningitis virales. StatPearls Publishing; 2023 Jan. University of Arkansas.

Resumen

La meningitis viral es la inflamación de las meninges causada por un virus. Es más común en niños pequeños, pero se observa en todos los grupos etarios. Esta presentación repasa la evaluación y el manejo de la meningitis viral y explica el papel del equipo interprofesional en la evaluación y el tratamiento de pacientes con la misma.

Objetivos:

• Identificar las etiologías comunes de la meningitis viral.
• Revisar la presentación típica de los pacientes con esta patología.
• Resumir las opciones de diagnostico y tratamiento disponibles.
• Describir las estrategias del equipo interprofesional para mejorar la coordinación y la comunicación de la atención para avanzar en el manejo de la meningitis viral y mejorar los resultados.

Introducción

La meningitis es la inflamación de las meninges con un recuento celular anormal asociado en el líquido cefalorraquídeo (LCR).  La meningitis aséptica, definida por la falta de crecimiento bacteriano en los cultivos, es la forma más común, siendo los virus una causa frecuente. Las causas virales de la meningitis se han vuelto más comunes a medida que la prevalencia de la meningitis bacteriana ha disminuido debido a las vacunas, y la meningitis viral es la forma más común de meningitis en muchos países. 

La meningitis viral generalmente se presenta con un inicio agudo de fiebre, dolor de cabeza, fotofobia, rigidez en el cuello y, a menudo, náuseas y vómitos, aunque es posible que los niños más pequeños no muestren signos de irritación meníngea.

La evaluación adecuada y oportuna es crítica ya que no existen indicadores clínicos iniciales confiables para diferenciar las etiologías bacterianas y virales de la meningitis. La meningitis viral suele ser una enfermedad auto-limitada y con un buen pronóstico.  

Etiología

Los enterovirus (grupos Coxsackie o Echovirus) son la causa más común de meningitis viral en todos los grupos de edad; Los parechovirus también son comunes en los niños.  Los herpesvirus que causan meningitis incluyen el virus del herpes simple (VHS) 1 y 2, el virus de la varicela-zóster (VZV), el citomegalovirus, el virus de Epstein-Barr y el virus del herpes humano. Otras causas virales incluyen el adenovirus, el virus de la coriomeningitis linfocítica (LCMV), influenza, parainfluenza y paperas. Los arbovirus que pueden causar meningitis viral incluyen el virus del Nilo Occidental (WNV), Zika, chikungunya, dengue, LaCross, encefalitis de Saint Louise, Powassan y el virus de la encefalitis equina del este.

Epidemiología

La meningitis viral ocurre con mayor frecuencia en niños pequeños y la incidencia disminuye con la edad.  En países con altas tasas de cobertura de inmunización, la meningitis viral es más común que la meningitis bacteriana, y se estima que entre el 3 y el 18 % de las meningitis infantiles son de origen bacteriano.

Las vacunas contra Haemophilus influenza tipo B, Streptococcus pneumoniae y Neisseria meningitidis han disminuido significativamente los casos de meningitis bacteriana. Se ha estimado que la incidencia de la meningitis viral oscila entre 0,26 y 17 casos por cada 100.000 personas. En los Estados Unidos, hay hasta 75.000 casos de meningitis enteroviral anualmente. En climas templados, la meningitis viral es más común en los meses de verano y otoño, mientras que está presente todo el año en áreas tropicales y subtropicales.  

Los enterovirus se clasifican como la causa más común de meningitis viral en muchos lugares del mundo, con hasta 12 a 19 casos por 100.000 habitantes al año en algunos países de ingresos altos.  El WNV, que es transmitido por mosquitos, puede causar meningitis y encefalitis. Ahora es endémico en América del Norte y tiene una tasa de mortalidad del 4 al 13%. La mortalidad es mayor en pacientes de edad avanzada, inmunodeprimidos o diabéticos. La mitad de los pacientes con encefalitis por WNV tienen secuelas neurológicas o psicológicas a largo plazo.  

La meningitis por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) puede estar presente durante la seroconversión, ocurriendo en 10 a 17% de las enfermedades sintomáticas de seroconversión, con un pequeño número que progresa a meningitis crónica. 

El VZV puede causar meningitis viral, más comúnmente con reactivación que en infección primaria. La meningitis por varicela puede ocurrir sin lesiones cutáneas. 

HSV 1 y 2 pueden causar meningitis viral. El HSV-1 se relaciona más comúnmente con encefalitis esporádica, mientras que el HSV-2 puede causar una meningitis viral recurrente benigna; la meningitis generalmente ocurre en ausencia de lesiones genitales o antecedentes de infección previa por herpes genital. 

El HSV llega al sistema nervioso central a través de los nervios craneales. El LCMV es un virus transmitido por roedores, que generalmente se propaga a través de la inhalación de orina o excrementos en aerosol, a través de la transmisión vertical y también es posible la transmisión a través de trasplantes infectados de córnea, hígado y riñón. Es más común en invierno y principios de primavera. Anteriormente, las paperas eran una causa común de meningitis viral en los Estados Unidos, pero recientemente han disminuido debido al uso generalizado de la vacuna contra el sarampión, las paperas y la rubéola (MMR). Es más común en pacientes masculinos. 

Evaluación: .............................

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
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