994- Control de calidad interno basado en riesgos del paciente

Yu Zhang, Biqiong Ren, Guoying Zou, Lihua Yang. Una herramienta de hoja de cálculo para diseñar programas estadísticos de control de calidad basados ​​en parámetros de riesgo del paciente. Clinical Biochemistry 2023; 116: 52–58. Brain Hospital of Hunan Province and Hunan Center For Clinical Laboratory, Changsha, Hunan, PR China  

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1- ¿Qué es el modelo de riesgo del paciente de Parvin y cómo se utiliza para desarrollar una herramienta en la hoja de cálculo?

El modelo de riesgo del paciente de Parvin es un método cuantitativo para correlacionar la estrategia de control de calidad estadístico (SQC) de un laboratorio con el número esperado de resultados de pacientes no confiables producidos bajo una condición fuera de control. El modelo se basa en el parámetro de riesgo MaxE(Nuf), que se reconoce como el núcleo del modelo. El valor de este parámetro y el estándar aceptable desarrollado por el laboratorio determinan si la estrategia de control de calidad actual se ajusta a los requisitos de riesgo, si se deben cambiar las reglas de control de calidad y si se debe ajustar el tamaño de la serie. 

En este estudio, se desarrolla una herramienta gráfica conveniente utilizando el software Excel de uso común basado en la fórmula matemática del valor E(Nuf) y una programación simple. La herramienta simplifica el diseño de los procedimientos de SQC en función de los parámetros de riesgo del paciente y puede calcular otros parámetros en el modelo de riesgo y proporcionar un diagrama de riesgo, lo que ayuda a los laboratorios a diseñar fácilmente un esquema de SQC basado en el riesgo del paciente.

 2- ¿Cómo calcula la herramienta el número esperado de resultados finales de pacientes no confiables y cuál es el significado del valor máximo de E(Nuf)?

La herramienta calcula el número esperado de resultados finales de pacientes no confiables (E(Nuf)) utilizando una fórmula que tiene en cuenta varios parámetros, incluido el rendimiento del procedimiento de medición, la regla de control de calidad candidata, el objetivo de calidad analítica de los elementos de prueba y el número de muestras de pacientes analizadas entre eventos de control de calidad (tamaño de ejecución).

La fórmula es la siguiente: E(Nuf) = ΔPE{(ARLed-1)E(NB)-(1-P1)[E(NB)-E(N0)]}, donde ΔPE es el porcentaje incrementado de resultados que superan el error total permisible (TEa) en un estado fuera de control, ARLed es la duración promedio de la serie hasta la detección del error, NB es el número esperado de muestras de pacientes analizadas entre eventos de control de calidad, P1 es la proporción de resultados que exceden el TEa en un estado estable y E(N0) es el número esperado de resultados no confiables en un estado estable. El valor máximo de E(Nuf) es el número máximo de resultados finales de pacientes no confiables que el laboratorio está dispuesto a aceptar bajo un cierto número de muestras de pacientes analizadas entre eventos de control de calidad.

La importancia de este valor es que ayuda a los laboratorios a controlar la cantidad de resultados de pacientes no confiables y diseñar un esquema SQC que cumpla con los requisitos de riesgo.

3- ¿Se puede personalizar la herramienta para adaptarse a diferentes parámetros de riesgo y estrategias de control de calidad?

Sí, la herramienta se puede personalizar para adaptarse a diferentes parámetros de riesgo y estrategias de control de calidad. La herramienta tiene en cuenta varios parámetros, incluido el rendimiento del procedimiento de medición, la regla de control de calidad candidata, el objetivo de calidad analítica de los elementos de prueba y la cantidad de muestras de pacientes analizadas entre eventos de control de calidad (tamaño de ejecución), que se puede ajustar según de las necesidades específicas del laboratorio.

El laboratorio puede ingresar los requisitos de calidad, los parámetros de rendimiento, el tamaño de ejecución práctico, las reglas de control de calidad y la cantidad de resultados de control de calidad de los elementos de prueba en la herramienta para obtener el valor MaxE (Nuf), el tamaño máximo de ejecución y otros datos basados en la estrategia. .

La estrategia de control de calidad que se ajusta a los requisitos de riesgo se puede desarrollar cambiando las reglas de control de calidad o la cantidad de tamaño de ejecución. La herramienta también proporciona un gráfico de función de potencia de la estrategia de control de calidad y dos diagramas de riesgo simultáneamente, lo que puede ayudar a los laboratorios a evaluar los riesgos de las estrategias de control de calidad y diseñar estrategias de SQC adecuadas basadas en el riesgo para reducir el riesgo del paciente a niveles aceptables. 

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Nueva presentación el 15 de agosto 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

993- Infecciones pulmonares por hongos no-Aspergillus

Pedro Puerta-Alcalde, Carolina Garcia-Vidal. Infecciones pulmonares por hongos no-Aspergillus. Eur Respir Rev. 2022 Dec 31; 31(166): 220104. Eur Respir Rev. 2022 Dec 31; 31(166): 220104. Infectious Disease Department, Hospital Clinic of Barcelona, Barcelona, Spain​​​​

Resumen

Los hongos filamentosos distintos de Aspergillus que causan infecciones invasivas por mohos han aumentado en los últimos años debido al uso generalizado de la profilaxis anti- Aspergillus y al aumento de la complejidad y supervivencia de los pacientes inmunodeprimidos. En los pocos estudios que han informado sobre la epidemiología de la infección invasiva por mohos, los Mucorales son el grupo aislado con mayor frecuencia, seguidos por Fusarium spp. o Scedosporium spp. La incidencia general es baja, pero la mortalidad relacionada es extremadamente alta. Los pacientes con neoplasias hematológicas malignas y los receptores de trasplantes de células madre hematopoyéticas comprenden los grupos clásicos en riesgo de infección por hongos no Aspergillus debido a la profunda inmunosupresión y al amplio uso de anti-Profilaxis de Aspergillus . Los receptores de trasplantes de órganos sólidos también se enfrentan a un alto riesgo, especialmente los receptores de trasplantes de pulmón, debido a la exposición directa del injerto a esporas de moho con eliminación mecánica e inmunológica alterada, e inmunosupresión intensa asociada. Diagnóstico de no Aspergillusmohos es un desafío debido a los síntomas y hallazgos radiológicos inespecíficos, la falta de biomarcadores específicos y la baja sensibilidad de los cultivos. Sin embargo, el advenimiento de las técnicas moleculares puede resultar útil. La mucormicosis, la fusariosis y la scedosporiosis tienen algunas diferencias con respecto a las presentaciones clínicas paradigmáticas y la terapia antifúngica preferida. La cirugía podría ser una opción, especialmente en la mucormicosis. Finalmente, actualmente se están evaluando varias estrategias prometedoras para restaurar o mejorar la respuesta inmune del huésped.

Introducción

Las enfermedades fúngicas invasivas (EFI) son una causa importante de morbilidad y mortalidad en todo el mundo. En los últimos años se ha producido un cambio epidemiológico en las infecciones fúngicas, con un aumento de las infecciones invasivas por mohos (IMI) y una disminución de las infecciones por hongos  Los hongos filamentosos o mohos típicamente causan infecciones pulmonares debido a la inhalación de esporas del ambiente, aunque las infecciones diseminadas no son infrecuentes.

Los hongos más comunes que causan IMI son Aspergillus spp. Sin embargo, el uso extensivo de la profilaxis anti- Aspergillus en diferentes contextos, junto con una mayor complejidad y supervivencia de los pacientes inmunodeprimidos, ha impulsado en parte la aparición de infecciones por moho no Aspergillus. Asimismo, el advenimiento de las técnicas moleculares microbiológicas ha favorecido un mejor reconocimiento de estos hongos, típicamente descritos en pacientes con inmunosupresión, aunque se han reportado reportes en pacientes inmunocompetentes luego de desastres naturales o infecciones virales. Es de destacar que la mayoría de las definiciones aceptadas sobre EFI se aplican principalmente en pacientes con neoplasias malignas hematológicas o que reciben trasplantes. Dicho esto, las IMI no relacionadas con Aspergillus probablemente no se reconozcan ni se notifiquen en varias poblaciones de riesgo.

Las infecciones por moho no Aspergillus están asociadas con una mortalidad extremadamente alta. Esto se debe principalmente a la resistencia intrínseca a múltiples fármacos antimicóticos. Sin embargo, la falta de herramientas de diagnóstico adecuadas también se ha asociado con retrasos en tratamientos específicos, lo que a su vez puede conducir a un peor pronóstico. En este contexto, se necesitan con urgencia pruebas diagnósticas mejoradas y nuevos antifúngicos y estrategias terapéuticas.

En este artículo, revisaremos la literatura reciente sobre datos sobre infecciones pulmonares por moho no Aspergillus , centrándonos en diferentes poblaciones en riesgo, desafíos de diagnóstico, agentes causales específicos y estrategias terapéuticas actuales y futuras. Decidimos no incluir otros tipos importantes de hongos que causan infecciones pulmonares, por ejemplo, Pneumocystis jirovecii , u hongos dimórficos como Histoplasma spp., Coccidioides spp. o Sporothrix schenckii . Las razones de esto incluyen limitaciones de espacio y el deseo de centrar la revisión en un grupo de infecciones por moho más similares.

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

 

992- Aspergilosis pulmonar

Frederic Lamoth,Thierry Calandra. Aspergilosis pulmonar: diagnóstico y tratamiento. Eur Respir Rev. 2022; 31(166): 220114. Infectious Diseases Service, Department of Medicine, Lausanne University Hospital and University of Lausanne, Lausanne, Switzerland.

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"El artículo "Aspergilosis pulmonar: diagnóstico y tratamiento" de Frederic Lamoth y Thierry Calandra proporciona una descripción completa del espectro clínico, el diagnóstico y el tratamiento de la aspergilosis pulmonar. Los autores comienzan definiendo la aspergilosis pulmonar como una infección fúngica de los pulmones causada por especies de Aspergillus. Luego analizan las dos presentaciones clínicas principales de la aspergilosis pulmonar: aspergilosis pulmonar invasiva (IPA) y aspergilosis pulmonar crónica (CPA).

La IPA es una infección grave y, a menudo, fatal que ocurre típicamente en pacientes inmunocomprometidos. Los factores de riesgo más comunes para IPA incluyen neoplasias malignas hematológicas, trasplante de órganos sólidos y uso prolongado de corticosteroides. La presentación clínica de la IPA es variable, pero a menudo incluye fiebre, tos, disnea y hemoptisis. Las imágenes de tórax suelen mostrar infiltrados o nódulos focales, pero también pueden ser normales hasta en un 20 % de los casos. El diagnóstico de API se basa en una combinación de hallazgos clínicos, radiológicos y microbiológicos. El estándar de oro para el diagnóstico es el aislamiento de especies de Aspergillus a partir de muestras respiratorias, pero a menudo esto no es posible. Otras pruebas de diagnóstico incluyen la serología, la detección del antígeno de galactomanano y la reacción en cadena de la polimerasa (PCR).

La CPA es una forma menos grave de aspergilosis pulmonar que generalmente ocurre en pacientes con enfermedad pulmonar preexistente, como tuberculosis o enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC). La presentación clínica de la CPA a menudo es indolente y puede incluir tos, disnea y sibilancias. Las imágenes de tórax generalmente muestran lesiones quísticas o cavitarias. El diagnóstico de CPA se basa en los hallazgos clínicos y radiológicos, y se puede utilizar la serología o la detección del antígeno de galactomanano para respaldar el diagnóstico.

Luego, los autores analizan el tratamiento de la aspergilosis pulmonar. El tratamiento de IPA es típicamente con agentes antifúngicos, como voriconazol o caspofungina. La duración del tratamiento depende de la gravedad de la infección, pero normalmente es de al menos 6 semanas. El tratamiento de la CPA también es con agentes antifúngicos, pero la duración del tratamiento suele ser más larga, al menos 12 semanas.

Los autores concluyen discutiendo los desafíos en el diagnóstico y tratamiento de la aspergilosis pulmonar. Estos desafíos incluyen la falta de pruebas de diagnóstico sensibles y específicas, la aparición de resistencia antifúngica y la toxicidad de los agentes antifúngicos. Los autores también destacan la necesidad de realizar más investigaciones sobre la prevención y el tratamiento de la aspergilosis pulmonar.

Además del texto principal, el artículo también incluye varias figuras y tablas que resumen las características clínicas, el diagnóstico y el tratamiento de la aspergilosis pulmonar. El artículo también incluye una serie de referencias a la literatura relevante.

En general, el artículo "Aspergilosis pulmonar: diagnóstico y tratamiento" es una descripción completa e informativa de esta importante entidad clínica. El artículo proporciona una descripción clara y concisa del espectro clínico, el diagnóstico y el tratamiento de la aspergilosis pulmonar. El artículo también incluye una serie de figuras y tablas que resumen la información clave. El artículo está bien referenciado y proporciona un buen punto de partida para futuras investigaciones sobre este tema.

Aquí hay algunos puntos adicionales que vale la pena mencionar del artículo:

• La incidencia de aspergilosis pulmonar está aumentando, en parte debido al uso cada vez mayor de terapias inmunosupresoras.
• El diagnóstico de aspergilosis pulmonar puede ser un desafío, ya que la presentación clínica suele ser inespecífica.
• El tratamiento de la aspergilosis pulmonar a menudo se prolonga y puede estar asociado con una toxicidad significativa.
• Existe la necesidad de nuevos agentes antifúngicos con eficacia y seguridad mejoradas".

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

991- Micosis endemicas: guias para su diagnostico y control.

George R Thompson y 39 colaboradores. Guía global para el diagnóstico y control de las micosis endémicas: una iniciativa del European Confederation of Medical Mycology in cooperation with the International Society for Human and Animal Mycology. Lancet Infect Dis. 2021; 21(12): e364–e374. Department of Medical Microbiology and Immunology, University of California, Davis, CA, USA.

Resumen de la publicación generada por ChatGPT-3.5; al final se puede leer el articulo original.

"Esta guía completa, cubre varios aspectos del diagnóstico y tratamiento de las micosis endémicas. Ofrece información valiosa y recomendaciones para profesionales de la salud e investigadores de todo el mundo. El esfuerzo colaborativo de los autores asegura una perspectiva integral sobre este importante tema.

1- ¿Cuáles son las recomendaciones clave para el diagnóstico de micosis endémicas descritas en la guía?

La guía proporciona varias recomendaciones para el diagnóstico de micosis endémicas. Según el texto, los avances en las técnicas de laboratorio y las pruebas no invasivas han mejorado la especificidad y la sensibilidad de las pruebas diagnósticas. La guía también enfatiza la importancia de comprender la epidemiología, los factores de riesgo y los métodos de diagnóstico para diferentes poblaciones de pacientes. Los métodos de diagnóstico específicos mencionados en el texto incluyen serología, detección de antígenos, métodos moleculares y cultivo. La directriz también señala que las imágenes radiográficas generalmente se justifican sólo si existe preocupación por la infección en un sitio en particular. Para obtener información más detallada sobre el diagnóstico de micosis endémicas, consulte la guía.

2- Especificar las recomendaciones más relevantes sobre pruebas diagnósticas de laboratorio en micosis endémicas

De acuerdo con la guía, las recomendaciones más relevantes sobre pruebas de diagnóstico de laboratorio para micosis endémicas incluyen:

• Serología: las pruebas serológicas son útiles para el diagnóstico de algunas micosis endémicas, incluidas la histoplasmosis, la coccidioidomicosis y la paracoccidioidomicosis. Sin embargo, las pruebas serológicas pueden no ser útiles para todos los pacientes y la interpretación de los resultados puede ser un desafío.
• Detección de antígenos: las pruebas de detección de antígenos están disponibles para algunas micosis endémicas, incluidas la histoplasmosis y la criptococosis. Estas pruebas son útiles para el diagnóstico de enfermedad diseminada y se pueden utilizar para monitorear la respuesta a la terapia.
• Métodos moleculares: Los métodos moleculares, como la PCR, se utilizan cada vez más para el diagnóstico de micosis endémicas. Estas pruebas son muy sensibles y específicas, pero su disponibilidad puede ser limitada. 
• Cultivo: El cultivo sigue siendo el estándar de oro para el diagnóstico de micosis endémicas. Sin embargo, el cultivo puede ser lento y no ser sensible en todos los casos. 

En general, la directriz recomienda que se utilice una combinación de pruebas de diagnóstico y hallazgos clínicos para diagnosticar micosis endémicas. La elección de las pruebas diagnósticas debe basarse en la presentación clínica del paciente, la epidemiología de la enfermedad y la disponibilidad de las pruebas.

2- ¿Podría proporcionar una descripción general de las estrategias de manejo sugeridas para estas infecciones fúngicas?

La guía brinda una descripción general de las estrategias de manejo para las micosis endémicas. Según el texto, el manejo requiere el reconocimiento de los factores de riesgo (p. ej., exposición ambiental en una región endémica) y el uso apropiado de intervenciones diagnósticas y terapéuticas. Las opciones de tratamiento continúan ampliándose y nuestra comprensión de la selección de agentes, así como la dosis y la duración de la terapia continúa evolucionando. Las estrategias de tratamiento específicas mencionadas en el texto incluyen la terapia antimicótica, la intervención quirúrgica y la terapia inmunomoduladora. La guía también señala que la bioseguridad es una consideración importante cuando se manipulan estos organismos, y los laboratorios deben incorporar guías y reglamentos nacionales en sus procesos y prácticas para garantizar la seguridad del personal del laboratorio. 

3- ¿Existen secciones específicas en la guía que se centren en la prevención y el control de las micosis endémicas?

Los textos proporcionados no mencionan secciones específicas en la guía que se centren en la prevención y el control de micosis endémicas. Sin embargo, es común que las guías sobre enfermedades infecciosas incluyan recomendaciones y estrategias para medidas de prevención y control. Es probable que la guía también aborde estos importantes aspectos de las micosis endémicas. Para obtener información detallada sobre la prevención y el control de estas infecciones fúngicas, recomiendo consultar la propia guía completa".

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990- Historia de los laboratories en el Baylor University Medical Center

George J. Race, G.Weldon Tillery, A. Dysert, II. Historia de los laboratorios de patología y medicina en el Baylor University Medical Center. Proc (Bayl Univ Med Cent). 2004; 17(1): 42-55. Department of Pathology, Baylor University Medical Center, Dallas, Texas.

Según los estándares modernos, los laboratorios de un gran centro médico representan un lugar para la síntesis y la aplicación de las ciencias básicas al tratamiento de pacientes mediante la investigación clínica y básica, la realización de miles de procedimientos diarios y la provisión de programas de enseñanza discretos. Estos laboratorios dependen de la institución mientras que la institución y sus estudiantes, médicos y pacientes dependen de ellos.

The laboratories at Baylor University Medical Center (BUMC) han evolucionado hasta convertirse en un servicio completamente automatizado que utiliza la última tecnología para realizar millones de procedimientos cada año para BUMC, hospitales y centros de salud afiliados al Baylor Health Care System (BHCS) y otros hospitales.

Desarrollo temprano del laboratorio de Patología y Medicina

La patología tiene sus orígenes en la medicina antigua, pero se desarrolló solo a medida que avanzaba la ciencia. Herófilo, uno de los grandes médicos griegos, junto con Erasístrato, dieron inicio a la anatomía patológica y la autopsia. Realizaron las primeras disecciones cadavéricas humanas científicas durante un período de 30 a 40 años. Entonces se prohibió la disección humana y no se volvió a permitir durante más de 1.800 años.

Los acontecimientos en el norte de África y el sur de Europa, especialmente en Monte Cassino y Salerno, llevaron al establecimiento de las líneas maestras de la educación médica clásica que prevalecerían durante medio milenio. Los elementos básicos de la teoría fisiológica y patológica siguieron siendo los cuatro humores básicos y las cuatro cualidades; su respectivo equilibrio se entendía como el objetivo de la salud. El desequilibrio humoral o la alteración de la tez pueden diagnosticarse fácilmente mediante el examen de la orina. Los procedimientos terapéuticos siguieron la tríada hipocrática de régimen, fármacos y cirugía, incluida la sangría.

Esta teoría humoral fue refutada durante la Ilustración del siglo XVIII cuando se desarrollaron los hospitales y la educación médica. El estudio de la patología comenzó a desarrollarse rápidamente a medida que las autopsias se realizaban con mayor frecuencia, especialmente aquellas realizadas después de que la enfermedad de un paciente había sido monitoreada en el hospital. Como resultado, los médicos comenzaron a creer que la patología podría informar el diagnóstico. Durante este período, Auenbrugger (1722–1809) desarrolló un método de auscultación (golpear el pecho y notar el sonido resultante) trabajando con cadáveres y luego con pacientes.

En el siglo XIX, la teoría celular avanzó. Theodore Schwann (1810-1882) descubrió células en todos los tejidos humanos. A mediados de la década de 1850, Rudolph Virchow (1821–1902) desarrolló el concepto de patología celular: se podía hacer un diagnóstico de enfermedad examinando las células 

Los avances en el conocimiento científico impactaron tanto en la práctica médica como en la educación médica en Europa y América. La aceptación de la anatomía como base de la enfermedad condujo al estudio de la anatomía, tanto teórica como práctica, “como piedra angular de toda enseñanza médica”.

Durante la primera mitad del siglo XIX, el estudio de la anatomía en los EE. UU. se vio afectado por una “escasez de hospitales y clínicas docentes, la falta de profesores a tiempo completo y, especialmente, la ausencia de un control centralizado sobre lo que se enseñaba y quién podía ejercer la medicina” . La anatomía patológica no se enseñaba como una materia independiente, sino que a menudo se combinaba con la medicina o quizá con la anatomía.

Las reformas muy necesarias en la educación médica se realizaron en los EE. UU. en las décadas posteriores a la Guerra Civil. La Universidad de Harvard hizo reformas en 1871, enfatizando el “aprender haciendo”. Estas reformas fueron seguidas por reformas en la Universidad de Pensilvania y la Universidad de Michigan. Sin embargo, la innovación más espectacular en la historia de la educación médica estadounidense fue la apertura de la Escuela de Medicina Johns Hopkins, que proporcionó dos años de instrucción en ciencias básicas y trabajo de laboratorio obligatorio .

A medida que se hacían avances en Europa y en las ciudades estadounidenses donde las facultades de medicina se desarrollaban sobre una base científica, las nociones fundamentales de patología cambiaron más lentamente en la mayor parte del país:

Las ideas más antiguas sobre la naturaleza de la enfermedad seguían siendo indispensables. Para la mayoría de los médicos de mediados de siglo, una enfermedad aún podía convertirse en otra; la enfermedad seguía siendo, en muchos sentidos, un lugar dentro del espectro de posibilidades fisiológicas, no una entidad categórica capaz de afligir a casi cualquier persona con los mismos patrones de síntomas, como sostenían los más devotos defensores de la medicina francesa.

Las definiciones holísticas de la enfermedad como un estado general del organismo eran consistentes con las actitudes sociales hacia la necesidad y la dependencia, ya que ambas incluían elementos tanto morales como materiales. En ambos, la interacción del individuo y el entorno bien podría generar salud o enfermedad, prosperidad o pobreza. A mediados de siglo, cada aspecto de la relación entre el conocimiento médico y el hospital era incierto y estaba sujeto a negociación futura........

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989- Diagnostico inmunologico de micosis endemicas

Rodrigo Almeida-Paes, Andrea Reis Bernardes-Engemann, Beatriz da Silva Motta, Claudia Vera Pizzini, Marcos de Abreu Almeida, Mauro de Medeiros Muniz, Renata Alves Barcelos Dias, and Rosely Maria Zancopé-Oliveira. Alessandro C. Pasqualotto Editor. Diagnóstico inmunológico de micosis endémicas. J Fungi (Basel). 2022; 8(10): 993. Laboratório de Micologia, Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.

Resumen

Las micosis endémicas blastomicosis, coccidioidomicosis, histoplasmosis, paracoccidioidomicosis, criptococosis, esporotricosis, talaromicosis, adiaspiromicosis y emergomicosis son causadas principalmente por hongos térmicamente dimórficos geográficamente limitados (excepto la criptococosis), y su diagnóstico puede ser difícil. Los métodos de laboratorio usuales involucrados en el diagnóstico de micosis endémicas incluyen examen microscópico y cultivo de muestras biológicas; sin embargo, en los últimos años se han implementado técnicas serológicas, histopatológicas y moleculares para el diagnóstico de estas micosis, ya que la recuperación e identificación de sus agentes etiológicos requiere mucho tiempo y poca sensibilidad. En esta revisión nos enfocamos en los métodos de diagnóstico inmunológico relacionados con la detección de anticuerpos y antígenos ya que su evidencia es el diagnóstico presuntivo,

1. Introducción

Las micosis endémicas son causadas principalmente por hongos térmicamente dimórficos que presentan una distribución geográfica limitada, ocupan nichos ecológicos específicos en el medio ambiente y pueden causar enfermedades tanto primarias como oportunistas . Además, las micosis endémicas se reconocen como causas importantes de morbilidad y mortalidad, predominantemente en el VIH/SIDA y otras afecciones inmunosupresoras, incluidos los fármacos inmunosupresores. 

Las micosis endémicas más frecuentes son la blastomicosis, la coccidioidomicosis, la histoplasmosis, la paracoccidioidomicosis, la criptococosis, la esporotricosis y, más recientemente, la talaromicosis, la adiaspiromicosis y la emergomicosis, consideradas micosis endémicas emergentes. En los últimos años, el número de casos de micosis endémicas ha aumentado en todo el mundo. Además, existen variaciones significativas en su geografía, presentación clínica, manifestaciones radiográficas, métodos analíticos de diagnóstico y terapéutica. Su control adecuado implica el reconocimiento de factores de riesgo (p. ej., fuentes ambientales putativas de exposición a hongos en áreas endémicas), procedimientos de diagnóstico correctos y manejo terapéutico.

El diagnóstico de micosis endémicas es difícil de lograr. Es necesaria una evaluación precisa de los datos de laboratorio para garantizar una terapia adecuada para los pacientes. Aunque las manifestaciones de las micosis endémicas están bien definidas, su diagnóstico no puede centrarse únicamente en los datos clínicos del paciente, ya que los signos y síntomas de las micosis endémicas se superponen entre sí y con otras enfermedades infecciosas.

La asociación de datos clínicos, epidemiológicos y de laboratorio típicamente diagnostica micosis endémicas. Para corroborar el diagnóstico se deben realizar pruebas de laboratorio. Las pruebas de laboratorio habituales involucradas en el diagnóstico de micosis endémicas comprenden el examen microscópico y cultivo de varios tipos de muestras biológicas. El aspecto microscópico de los agentes suele ser indicativo en el caso de micosis endémica, pero se necesita una gran experiencia de laboratorio y la sensibilidad de estos métodos es variable. El cultivo de sitios posiblemente involucrados sigue siendo el método estándar de oro de diagnóstico, a pesar del crecimiento fúngico prolongado (hasta seis semanas en algunos casos) y la necesidad de instalaciones de bioseguridad de nivel 3 para manipular algunos agentes en el laboratorio.

Actualmente, hay otras herramientas de diagnóstico disponibles para el diagnóstico de micosis endémicas para complementar el cultivo y el examen directo. Estos métodos complementarios tienen un tiempo de respuesta rápido y una eficiencia satisfactoria. Se han desarrollado diferentes técnicas inmunológicas relacionadas con la detección de anticuerpos y antígenos para ayudar en el diagnóstico de micosis endémicas (tabla 1). En estas pruebas se han utilizado varias preparaciones antigénicas, desde antígenos crudos hasta purificados, así como proteínas recombinantes y péptidos sintéticos. Sin embargo, estos últimos no se utilizan en los ensayos validados para laboratorios de micología de rutina. 

Como se mencionó antes, la evidencia serológica de estas infecciones es valiosa debido a la naturaleza lenta y la baja sensibilidad de los métodos de referencia. Además de los métodos de detección de antígenos y anticuerpos, las pruebas cutáneas intradérmicas se emplearon en gran medida en el siglo pasado, pero su uso actual con fines diagnósticos en micología médica está severamente limitado, debido a la falta de antígenos estandarizados, avances en los métodos de detección de anticuerpos y antígenos y requisitos de bioseguridad para realizar las pruebas cutáneas. 

Las herramientas moleculares de detección de ADN de hongos dimórficos en muestras biológicas también se están estandarizando y validando en numerosos laboratorios para simplificar el diagnóstico. Desafortunadamente, aunque son prometedoras y útiles, las herramientas de diagnóstico no relacionadas con el cultivo no son accesibles en la mayoría de los países de bajos ingresos.

2. Blastomicosis

La blastomicosis es una infección fúngica de humanos y mamíferos causada por hongos dimórficos del género Blastomyces. Sus principales agentes etiológicos incluyen Blastomyces dermatitidis, Blastomyces gilchristii y Blastomyces percursus . La blastomicosis afecta con frecuencia a personas inmunocompetentes; sin embargo, los pacientes inmunocomprometidos son más propensos a presentar una enfermedad grave .

Visualización directa de Blastomyces spp. en muestras biológicas puede proporcionar un diagnóstico rápido, lo que permite iniciar una terapia antifúngica adecuada. La visualización correcta de los elementos fúngicos a veces es difícil de lograr mediante la tinción con hematoxilina-eosina (H&E), por lo que se recomiendan las tinciones con ácido peryódico de Schiff o plata con metenamina. El examen directo con hidróxido de potasio o blanco de calcoflúor es valioso para las muestras del tracto respiratorio. En cuanto a otras micosis endémicas, el cultivo es el método de diagnóstico estándar de oro. Los cultivos de agar dextrosa Sabouraud suelen mostrar moho Blastomyces sp. en semanas a meses.

2.1. Detección de anticuerpos

La reacción de fijación del complemento se utilizó como primera prueba inmunológica para el diagnóstico de blastomicosis utilizando el antígeno derivado de la forma de levadura, pero su sensibilidad (57%) y especificidad (30%) fueron bajas. Después de la introducción de la prueba de inmunodifusión en 1973 utilizando el antígeno “A” específico de Blastomyces spp. dermatitidis en un filtrado de cultivo, cuya eficacia de la prueba mejoró. La evaluación del antígeno “A” purificado, en lugar del antígeno de levadura crudo, y su aplicación en la prueba de fijación del complemento resultó en una alta especificidad, aunque la sensibilidad fue del 62%.

Posteriormente, se evaluó el valor del antígeno “A” purificado en un ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA), que reveló una sensibilidad del 92 % y una especificidad del 84 % al comparar su eficacia diagnóstica con la blastomicosis con pruebas de fijación del complemento e inmunodifusión como estándares de oro.

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
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988- Diagnóstico automatizado en parasitología

Sandra Valéria Inácio, Jancarlo Ferreira Gomes, Alexandre Xavier Falcão,  Bianca Martins dos Santos,  Felipe Augusto Soares, Saulo Hudson Nery Loiola,  Stefani Laryssa Rosa, Celso Tetsuo Nagase Suzuki, Katia Denise Saraiva Bresciani. Diagnóstico Automatizado: avances en el diagnóstico de infecciones parasitarias intestinales en humanos y animales. Front Vet Sci. 2021; 8: 715406. São Paulo State University (Unesp), School of Veterinary Medicine, Araçatuba, Brazil. Edited by Alessia Libera Gazzonis, University of Milan, Italy

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"Esta revisión integral reúne la experiencia de investigadores de varias instituciones, arrojando luz sobre los últimos avances en este campo. Desde el uso de tecnología de punta hasta el impacto potencial en la salud humana y animal, este artículo proporciona información valiosa sobre el futuro del diagnóstico de infecciones parasitarias.

1- ¿Cuáles son los métodos de diagnóstico automatizados clave que se analizan en esta revisión?

Los métodos clave de diagnóstico automatizado discutidos en esta revisión incluyen clasificadores supervisados, como el: clasificador bayesiano, las máquinas de vectores de soporte (SVM), las redes neuronales artificiales (ANN), el K-vecino más cercano (k-NN), el árbol de decisiones (DT) y el Optimum-Sendero Forestal (OPF) . Estos métodos se utilizan para la anotación de imágenes y la identificación de estructuras de parásitos en muestras fecales.

(N.del E.: El clasificador/aprendizaje supervisado, también conocido como machine learning supervisado, es una sub-categoría de machine learning y de inteligencia artificial. Se utiliza para el uso de un conjuntos de datos etiquetados para entrenar algoritmos que clasifican datos o prevén resultados con precisión.)

2- ¿Cómo benefician estos avances en el diagnóstico tanto a humanos como a animales?

"Los avances en el diagnóstico automatizado de infecciones parasitarias intestinales benefician tanto a humanos como a animales de varias maneras. En primer lugar, estos métodos automatizados ofrecen alta precisión en la identificación de la positividad del huésped y la carga parasitaria, lo que permite diagnósticos más precisos. Esto puede conducir a un tratamiento oportuno y específico, mejorando los resultados de salud tanto para humanos como para animales.

Además, los diagnósticos automatizados reducen el tiempo y el esfuerzo necesarios para contar huevos, quistes y ooquistes de helmintos y protozoos. En comparación con el proceso de microscopio tradicional, los diagnósticos automatizados ahorran tiempo y reducen la fatiga al eliminar la necesidad de contar manualmente en una pantalla de computadora. Esta mayor eficiencia permite procesar un mayor volumen de muestras en menos tiempo, lo que permite un diagnóstico y un tratamiento más rápidos.

Además, el uso de tecnologías computacionales y la producción de bases de datos visuales y textuales facilitan el almacenamiento y recuperación de información diagnóstica. Esto significa que los bioquímicos y veterinarios pueden acceder a los datos y analizarlos más fácilmente, lo que mejora la vigilancia, el seguimiento y el control de las infecciones parasitarias tanto en humanos como en animales.

En general, estos avances en el diagnóstico automatizado contribuyen a un diagnóstico más preciso y eficiente, un tratamiento más rápido y una mejor gestión de enfermedades tanto para humanos como para animales."

3- ¿Existen limitaciones o desafíos asociados con el diagnóstico automatizado de infecciones parasitarias intestinales?

"El artículo de revisión no proporciona una lista completa de limitaciones o desafíos asociados con el diagnóstico automatizado para infecciones parasitarias intestinales. Sin embargo, vale la pena señalar que la precisión de los diagnósticos automatizados depende de la calidad de las imágenes y los datos de entrenamiento utilizados para desarrollar los algoritmos. Por lo tanto, la calidad de las muestras fecales y la experiencia del personal que recolecta y procesa las muestras pueden afectar la precisión del diagnóstico automatizado.

Además, el costo de implementar diagnósticos automatizados puede ser una barrera para su adopción generalizada, particularmente en entornos de bajos recursos. La necesidad de equipo especializado y personal capacitado también puede limitar la accesibilidad de los diagnósticos automatizados en algunas regiones."

4- ¿Qué pasa con los avances y límites de las técnicas de diagnóstico computacional para la identificación de parásitos intestinales?

"El artículo de revisión reconoce que ha habido avances significativos en las técnicas de diagnóstico computacional para la identificación de parásitos intestinales durante la última década. Los investigadores han estado trabajando en modelos de procesamiento de imágenes digitales y técnicas de patrones para reconocer automáticamente los huevos de parásitos en imágenes microscópicas. El objetivo principal de estos avances es reducir los errores humanos que ocurren en el diagnóstico de parásitos fecales y producir resultados más rápidos y precisos.

Estas técnicas de diagnóstico computacional ofrecen el potencial para mejorar la eficiencia y confiabilidad de la identificación de parásitos. Su objetivo es superar las limitaciones de los métodos de microscopía tradicionales, como el proceso de conteo manual que requiere mucho tiempo, mano de obra calificada y el potencial del error humano. Al automatizar el proceso de identificación, estas técnicas pueden brindar resultados más rápidos y precisos, lo que lleva a un tratamiento oportuno y específico.

Sin embargo, el artículo de revisión también reconoce que aún existen desafíos y limitaciones que deben abordarse para garantizar la identificación adecuada de los parásitos. Estos desafíos incluyen el desarrollo de protocolos para la preparación de portaobjetos de microscopio con menos residuos y garantizar una buena tinción de las estructuras del parásito. Además, la creación de una base de datos de imágenes robusta es crucial para el éxito de estas técnicas computacionales.

En resumen, si bien ha habido avances significativos en las técnicas de diagnóstico computacional para la identificación de parásitos intestinales, aún existen desafíos que deben superarse para garantizar su precisión y eficacia. Se necesita más investigación y desarrollo para optimizar estas técnicas y abordar las limitaciones asociadas con ellas".

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Nueva presentación el  20 de julio. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Cordiales saludos. 
Ciudada de Buenos Aires. R. Argentina

987- Vectores virales artificiales para remodelar el genoma humano

Jingen Zhu, Himanshu Batra, Neeti Ananthaswamy, Marthandan Mahalingam, Pan Tao, Xiaorong Wu, Wenzheng Guo, Andrei Fokine, Venigalla B. Rao. Diseño de vectores virales artificiales basados ​​en el bacteriófago T4 para la remodelación del genoma humano. Nature Communications vol 14, Article number: 2928 (2023). Bacteriophage Medical Research Center, Department of Biology, The Catholic University of America, Washington DC, USA. 

Abstracto

El diseño de vectores virales artificiales (AVV) programados con biomoléculas que puedan ingresar a las células humanas y realizar reparaciones moleculares tendrá amplias aplicaciones. Aquí, describimos un enfoque de línea de montaje para construir AVV mediante la ingeniería de los componentes estructurales bien caracterizados del bacteriófago T4. Comenzando con una cubierta de cápside de 120 × 86 nm que puede acomodar ADN de 171 Kbp y miles de copias de proteínas, se incorporan externa e internamente varias combinaciones de biomoléculas, incluidos ADN, proteínas, ARN y ribonucleoproteínas. Luego, las nanopartículas se recubren con lípidos catiónicos para permitir una entrada eficiente en las células humanas. Como prueba de concepto, ensamblamos una serie de AVV diseñados para administrar distrofina de longitud completa-gene o realizar varias operaciones moleculares para remodelar el genoma humano, incluida la edición del genoma, la recombinación de genes, el reemplazo de genes, la expresión de genes y el silenciamiento de genes. Estos AVV de gran capacidad, personalizables, multiplexados y basados ​​en fagos todo en uno representan una categoría adicional de nanomaterial que podría transformar potencialmente las terapias génicas y la medicina personalizada.

Introducción

Los virus son los organismos más abundantes y extendidos en la Tierra. También son algunas de las máquinas biológicas más eficientes. A pesar de su pequeño tamaño y su composición genética simple, los virus pueden causar infecciones mortales y pandemias globales, como el SIDA, la gripe y el COVID-19. Esto se debe a que los virus desarrollaron mecanismos eficientes para replicarse y ensamblar progenie en escalas de tiempo rápidas, del orden de minutos en el caso de virus bacterianos (bacteriófagos o simplemente fagos). 

Si algunos de los mecanismos virales eficientes pudieran aprovecharse mediante la construcción de vectores virales artificiales (AVV), programados con moléculas terapéuticas, tales virus, en lugar de replicarse en el huésped, podrían realizar reparaciones beneficiosas para restaurar la salud humana. Dichos AVV podrían potencialmente reemplazar genes defectuosos, producir moléculas terapéuticas, matar células cancerosas, etc. A pesar de muchos intentos a lo largo de los años  el desarrollo de los AVV se mantuvo en una etapa temprana.

Los virus humanos naturales, los virus adenoasociados (AAV) con un genoma de ADN monocatenario de ~5 Kbp de tamaño y los lentivirus con un genoma de ARN monocatenario de ~10 Kbp de tamaño han sido diseñados para administrar ADN o ARN terapéutico como parte de su genoma . Sin embargo, estos vectores virales tienen limitaciones. En el mejor de los casos, pueden administrar uno o dos genes terapéuticos y plantean dificultades para incorporar moléculas terapéuticas adicionales esenciales para reparaciones complejas. Las preocupaciones de seguridad, como la amplia infectividad de las células humanas, la inmunidad preexistente y la posible integración en el genoma del huésped, son problemas adicionales graves 

Aquí, describimos una plataforma AVV usando el fago T4. que pertenece a la familia Straboviridae e infecta a la bacteria Escherichia coli . Con una eficacia de infección cercana al 100 %  y replicando a una velocidad de ~20-30 min por ciclo, el T4 es uno de los virus más eficaces que se conocen. Contiene una gran cápside icosaédrica alargada de 120 × 86 nm (cabeza) ensamblada con 930 moléculas o 155 capsómeros hexamérica de la principal proteína gp23* de la cápside (* representa la forma madura escindida), 55 copias u 11 pentámeros de gp24* en once de los doce vértices y 12 copias de la proteína portal gp20 en el duodécimo vértice único (Fig.  1a-c ). El vértice del portal es una estructura de anillo con un canal central de ~35 Å a través del cual el genoma viral se transporta a la cápside mediante un motor molecular pentamérico alimentado por ATP conectado a él (Fig. 1c ). Después de empaquetar una cabeza de genoma, equivalente a ~171 Kbp de dsDNA lineal, 26 , 27 , el motor se disocia y las proteínas del cuello se ensamblan, seguido por el ensamblaje de la cola y la fibra de la cola para generar un virión infeccioso....

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

986- Cestodes

Ellen J. Lesh; Mark F. Brady. "Tenia". Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2023 Jan. Alpert Medical School of Brown University.

Resumen

Los cestodos son tenias planas, parásitas y hermafroditas con ciclos de vida complejos que infectan a los animales, incluidos los humanos. Tres cestodos que causan enfermedades en humanos son Taenia solium (tenia de cerdo), Taenia saginata (tenia de ganado) y Diphyllobothrium (tenia de pescado). Esta presentacion repasa el diagnóstico y  tratamiento de estas infecciones y destaca el papel del equipo interprofesional en estas patologías.

Objetivos

• Describir la transmisión de Taenia solium, Taenia saginata y Diphyllobothrium.
• Resumir la historia y los hallazgos del examen físico esperados en pacientes con estas infecciones.
• Resumir las opciones de diagnóstico y tratamiento para estas infecciones.
• Revisar la importancia de la colaboración y la comunicación entre el equipo interprofesional para el control y cuidado del paciente con estas patologias.................                                

Diagnóstico

1- El diagnóstico de un paciente con síntomas de neurocisticercosis (NCC) se basa principalmente en el examen microscópico de las heces en busca de la presencia de huevos de Taenia. Aunque esto permite el diagnóstico del género del parásito, a menudo no distingue entre especies. Las pruebas moleculares en suero y heces pueden ayudar en el diagnóstico y  diferenciación de especies. La NCC requiere una combinación de pruebas moleculares e imágenes. La eosinofilia a menudo está presente, pero rara vez aumenta más del 50%. Es más probable un aumento del 1% al 15%, y los niveles de IgE en suero también pueden aumentar. Los huevos de T. saginata y T. solium pueden identificarse pero no diferenciarse mediante el examen microscópico de las heces.  La especie se puede distinguir por un proglótido según el número de ramas uterinas.  El examen de heces puede ser menos eficaz en el caso de T. saginata , ya que las proglótides grávidas a menudo emergen espontáneamente a través del ano y depositan huevos en las regiones perianal y perineal.  Por lo tanto, se puede recomendar un hisopo anal para la recuperación de óvulos. Independientemente, el diagnóstico de Taenia se basa en la microscopía directa de los huevos expulsados ​​en las heces a pesar de la baja sensibilidad dada la naturaleza intermitente de la eliminación de los huevos (la sensibilidad oscila entre el 3,9 % y el 52,5 %).  

La detección ELISA de Copro-Ag (a partir de muestras de heces) no depende de la eliminación activa de huevos para la detección positiva. Sin embargo, esto no puede distinguir entre especies y puede haber reactividad cruzada con otros parásitos, incluidos Ascaris, Trichuris, Hymenoplepis nana y otros protozoos. Se ha demostrado que las pruebas de copro-Ag logran una sensibilidad del 98 % y una especificidad del 99 % en comparación con la sensibilidad del 38 % con microscopía directa. Para el diagnóstico específico de especie, la PCR por secuencias de genes de T. solium logra una especificidad del 100 % y una sensibilidad del 97 % al 100 %. Las pruebas de suero incluyen un ensayo de inmunotransferencia para la detección de anticuerpos para antígeno excretor-secretor (TSES) de T.solium que una sensibilidad del 95 % y una especificidad del 100 %. 

2- La difilobotriasis también se basa en el examen de heces en busca de huevos distintos, que pueden clasificar el género pero no la especie. Los métodos moleculares, como la PCR de muestras de heces, son el método más confiable para identificar a nivel de especie. No hay pruebas serológicas confiables para ayudar en el diagnóstico. Tanto para Diphyllobothrium  como para Taenia, no existe una razón clínica para distinguir entre especies ya que el tratamiento es el mismo; sin embargo, identificar las distintas especies ayudará en el cuadro epidemiológico de la transmisión y los casos importados.

3- Dado que los quistes en la mayoría de los tejidos son asintomáticos o están destruidos, rara vez se detectan o diagnostican. Sin embargo, la NCC conduce a lesiones quísticas visibles en el sistema nervioso central (SNC) y a una sintomatología importante y variable. Una gran parte de la patología del NCC se debe a la respuesta inmune del huésped al quiste larvario de T. solium. Una vez que el quiste está en el tejido, el sistema inmunitario del huésped induce la formación de granulomas y edema perilesional. En la etapa inicial de NCC, hay un quiste viable con inflamación periquística mínima. A medida que aumenta la respuesta inmunitaria del huésped, la inflamación perilesional matará al quiste, el líquido dentro del quiste se vuelve denso y  se encoge hasta que finalmente se elimina o se reemplaza con calcificación residual. La resonancia magnética y la tomografía computarizada pueden identificar lesiones granulomatosas calcificadas “con realce en anillo” que se encuentran en el cerebro. El diagnóstico de NCC depende de la sospecha radiológica y la interpretación congruente de la serología. La radiología puede clasificar la degeneración y el grado de inflamación, pero también se utiliza para controlar la eficacia del tratamiento.  

4- La serología ayuda a confirmar el diagnóstico. La serología para NCC incluye la detección de anticuerpos y antígenos a través de muestras de suero y LCR, respectivamente. Aunque la detección de antígenos es posible con suero y orina, se encontró que era mayor en LCR. El ensayo de inmuno-electrotransferencia ligado a enzimas (EITB) en suero para la detección de anticuerpos contra los quistes de T. solium tiene una especificidad del 98 % al 100 % en pacientes con más de un quiste cerebral viable; sin embargo, EITB tiene poca sensibilidad para una sola lesión cerebral.  La detección de anticuerpos no indica cisticercosis activa, ya que esto puede resultar de la exposición sola e infecciones que no se establecieron o no se resolvieron. 

La vida útil de los anticuerpos es variable y depende del historial inmunitario del huésped y de la carga de la infección. Algunos pacientes con antecedentes de quistes múltiples pueden tener anticuerpos positivos durante años después del tratamiento exitoso. Las pruebas ELISA basadas en monoclonales para la detección de antígenos pueden demostrar la presencia de parásitos vivos. Los niveles de antígeno caen rápidamente después del tratamiento, mientras que los anticuerpos pueden permanecer detectables. Es raro que la conversión a anticuerpos negativos ocurra en menos de 1 año, pero es un marcador de cura. En general, las pruebas positivas de anticuerpos y antígenos para NCC sugieren una infección viable. 

Una sola lesión en las imágenes (o una carga de infección baja) puede dar negativo para ambas. Los pacientes que solo tienen lesiones calcificadas suelen ser negativos para antígenos, pero pueden ser negativos o positivos para anticuerpos. Si las imágenes muestran solo lesiones calcificadas y el paciente tiene una prueba de antígeno positiva, se debe sospechar que se ha pasado por alto una lesión viable. El NCC subaracnoideo se asocia con altos niveles de anticuerpos y antígenos. Por lo tanto, las imágenes positivas con resultados negativos o débilmente positivos deben generar dudas sobre el diagnóstico.

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
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Ciudada de Buenos Aires. R. Argentina

985- El ChatBot y las publicaciones cientificas

Gemma Conroy-Editor. Los científicos usaron ChatGPT para generar un documento completo desde cero, pero ¿es bueno?. Nature  news  article  07 July 2023

Utilizando el  chatbot en cada paso, los investigadores produjeron un documento fluido y perspicaz. Sin embargo, todavía tienen preocupaciones.

Un par de científicos ha producido un trabajo de investigación en menos de una hora con la ayuda de ChatGPT, una herramienta impulsada por inteligencia artificial (IA) que puede comprender y generar texto similar al humano. El artículo fue fluido, perspicaz y se presentó con la estructura esperada de un artículo científico, pero los investigadores dicen que hay muchos obstáculos que superar antes de que la herramienta pueda ser realmente útil.

El objetivo era explorar las capacidades de ChatGPT como 'copiloto' de investigación y provocar un debate sobre sus ventajas y desventajas, dice Roy Kishony, biólogo y científico de datos del Technion, el Instituto de Tecnología de Israel en Haifa. “Necesitamos una discusión sobre cómo podemos obtener los beneficios con menos desventajas”, dice.

Kishony y su alumno Tal Ifargan, un científico de datos que también trabaja en Technion, descargaron un conjunto de datos disponible públicamente del Sistema de Vigilancia de Factores de Riesgo del Comportamiento de los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de EE. UU., una base de datos de encuestas telefónicas relacionadas con la salud. El conjunto de datos incluye información recopilada de más de 250 000 personas sobre su estado de diabetes, consumo de frutas y verduras y actividad física.

Los bloques de construcción en un papel.

Los investigadores le pidieron al ChatGPT que escribiera un código que pudieran usar para descubrir patrones en los datos para pudieran analizarlos más a fondo. En su primer intento, el Chatbot generó un código que estaba plagado de errores y no funcionó. Pero cuando los científicos transmitieron los mensajes de error y le pidieron que corrigiera los errores, finalmente produjo un código que podría usarse para explorar el conjunto de datos.

Con un conjunto de datos más estructurado en la mano, Kishony e Ifargan le pidieron a ChatGPT que los ayudara a desarrollar un objetivo de estudio. La herramienta sugirió que exploraran cómo la actividad física y la dieta afectan el riesgo de diabetes. Una vez que generó más código, ChatGPT entregó los resultados: comer más frutas y verduras y hacer ejercicio está relacionado con un menor riesgo de diabetes. 

Luego se le pidió a ChatGPT que resumiera los hallazgos clave en una tabla y escribiera la sección de resultados completa. Paso a paso, le pidieron a ChatGPT que escribiera las secciones de Resumen, Introducción, Métodos y Discusión de un manuscrito. Finalmente, le pidieron a ChatGPT que refinara el texto. “Escribimos el documento a partir de la salida de muchas indicaciones”, dice Kishony. “Cada paso se basaba en los productos de los pasos anteriores”.

Aunque ChatGPT generó un manuscrito claramente escrito con un sólido análisis de datos, el documento estuvo lejos de ser perfecto, dice Kishony. Un problema que encontraron los investigadores fue la tendencia de ChatGPT a llenar los vacíos inventando cosas, un fenómeno conocido como "alucinación". En este caso, generó citas falsas e información inexacta. Por ejemplo, el documento afirma que el estudio "aborda un vacío en la literatura", una frase que es común en los documentos pero inexacta en este caso, dice Tom Hope, científico informático de la Universidad Hebrea de Jerusalén. El hallazgo “no es algo que vaya a sorprender a ningún experto médico”, dice. “No está cerca de ser novedoso”.

Beneficios y preocupaciones

A Kishony también le preocupa que tales herramientas puedan facilitar que los investigadores se involucren en prácticas deshonestas como el P-hacking, para el cual los científicos prueban varias hipótesis en un conjunto de datos, pero solo informan aquellas que producen un resultado significativo.

Otra preocupación, agrega,  es que la facilidad de producir artículos con herramientas generativas de IA podría resultar en que las revistas se inunden con artículos de baja calidad. Menciona que su enfoque de datos en papel, con supervisión humana central en cada paso, podría ser una forma de garantizar que los investigadores puedan comprender, verificar y replicar fácilmente los métodos y hallazgos.......

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Ciudada de Buenos Aires. R. Argentina

 

984- Deteccion simultanea de varios parasitos por PCR.

Alejandro Dashti, Henar Alonso, Cristina Escolar-Miñana, Pamela C. Köster, Begoña Bailo, David Carmena, David González-Barrio William Lainhart, Editor.Evaluación de un nuevo ensayo comercial de PCR en tiempo real para la detección simultánea de Cryptosporidium spp., Giardia duodenalis y Entamoeba histolytica. Microbiol Spectr. 2022; 10(3): e00531-22. Parasitology Reference and Research Laboratory, National Centre for Microbiology, Carlos III Health Institute, Madrid, Spain. University of Arizona/Banner Health. 

Resumen de la publicación generada por ChatGPT-3.5;
al final se puede leer el articulo original

"Este estudio proporciona información valiosa sobre el alto rendimiento de diagnóstico y la rentabilidad de la multiplexación en la detección por PCR Viasure en las siguientes especies de protozoos que causan diarrea: Cryptosporidium spp., Giardia duodenalis y Entamoeba histolytica (CGE) 

Preguntas

1- ¿Cuáles fueron los hallazgos clave de la evaluación clínica del ensayo de PCR en tiempo real Viasure para CGE? Los hallazgos clave de la evaluación clínica del ensayo de PCR en tiempo real Viasure son los siguientes:

• El ensayo  demostró un buen rendimiento para las pruebas de rutina de CGE en laboratorios microbiológicos clínicos. 
• El ensayo identificó correctamente el 94,8 % (91/96 muestras) de las muestras de ADN que dieron positivo para CGE.
• Los valores de sensibilidad para los tres parásitos protozoarios variaron de 0,94 a 0,96, los valores de especificidad de 0,99 a 1, los valores predictivos positivos de 0,99 a 1 y los valores predictivos negativos de 0,98 a 0,99.

Estos hallazgos indican que el ensayo de PCR en tiempo real VIASURE es efectivo para detectar e identificar estos parásitos protozoarios que causan diarrea, proporcionando resultados rápidos y precisos para el diagnóstico clínico.

2- ¿Cómo mejora la multiplexación la precisión y la eficiencia de la detección de múltiples especies de parásitos en una sola prueba?

La multiplexación, que se refiere a la detección de más de un parásito en una sola prueba mediante PCR en tiempo real, permite un alto rendimiento diagnóstico con una rentabilidad favorable. Al combinar múltiples ensayos de PCR en una sola reacción, la multiplexación puede mejorar la precisión y la eficiencia en la detección de múltiples especies de parásitos de varias maneras:

• Tiempos prácticos y de respuesta reducidos: la multiplexación reduce el tiempo y la mano de obra necesarios para realizar múltiples ensayos de PCR por separado, lo que permite realizar pruebas más rápidas y eficientes.
• Detección de heces de alto rendimiento: la multiplexación permite la detección simultánea de múltiples especies de parásitos en una gran cantidad de muestras de heces, lo que la hace ideal para la detección de grandes poblaciones.
• Cuantificación de la carga de patógenos: la multiplexación permite la cuantificación de la carga de patógenos, que puede servir como indicador potencial de la gravedad de la enfermedad.
• Implementación personalizada y rentable: la multiplexación se puede adaptar a las necesidades específicas de los laboratorios clínicos, lo que permite una implementación rentable en algoritmos de diagnóstico de rutina.

En general, la multiplexación ofrece un enfoque más eficiente y rentable para detectar múltiples especies de parásitos en entornos clínicos.

3- ¿Cuáles son las implicaciones de este estudio para el diagnóstico y tratamiento de infecciones asintomáticas y crónicas causadas por CGE?

El estudio tiene varias implicaciones para el diagnóstico y tratamiento de infecciones asintomáticas y crónicas causadas por CGE:

• Mayor precisión y eficiencia del diagnóstico: el ensayo de PCR en tiempo real Viasure demostró un buen rendimiento para las pruebas de rutina de estos parásitos protozoarios en laboratorios microbiológicos clínicos, proporcionando resultados rápidos y precisos para el diagnóstico clínico.
• Detección y tratamiento tempranos: el alto rendimiento diagnóstico del ensayo  puede facilitar la detección y el tratamiento tempranos de estas infecciones, lo que puede ayudar a prevenir el desarrollo de enfermedades crónicas y graves.
• Pruebas rentables: la multiplexación permite una implementación rentable en los algoritmos de diagnóstico de rutina de los laboratorios clínicos de acuerdo con sus necesidades específicas, lo que la convierte en una opción atractiva para los programas de detección y vigilancia a gran escala.
• Riesgo reducido de diagnóstico erróneo: la multiplexación puede reducir el riesgo de diagnóstico erróneo, que es una preocupación para las infecciones asintomáticas y crónicas.

El estudio sugiere que el ensayo de PCR en tiempo real Viasure es una herramienta valiosa para el diagnóstico y el tratamiento de estos parásitos protozoarios comunes que causan diarrea, con beneficios potenciales para la salud pública y la práctica clínica".

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983- Enfermedad de Chagas en paises no endémicos

Cristina Suárez, Debbie Nolder, Ana García-Mingo, David A J Moore, Peter L Chiodini. Diagnóstico y control clínico de la enfermedad de Chagas: un desafío creciente en áreas no endémicas. Dove Press- Res Rep Trop Med. 2022; 13: 25–40.  Chagas Hub, London, Department of Infection, Barts Health NHS Trust, London, UK.

Resumen

La enfermedad de Chagas (EC) es causada por el parásito Trypanosoma cruzi, y es endémica de América Central, Sur de México y  Sur de los Estados Unidos. Es una causa importante de mortalidad y morbilidad precoces, y está asociada con la pobreza y el estigma. Un tercio de los casos evolucionan a miocardiopatía crónica y enfermedad gastrointestinal. La infección se transmite verticalmente y por donación de sangre/órganos y puede reactivarse con inmunosupresión. La identificación de casos requiere programas de concientización y tamizaje dirigidos a la población de riesgo (mujeres en edad reproductiva, donantes, pacientes inmunocomprometidos). El tratamiento con benznidazol o nifurtimox es más efectivo en la fase aguda y previene la progresión a la fase crónica cuando se administra a niños. El tratamiento prenatal de las mujeres reduce, pero no elimina, la transmisión vertical. El tratamiento es mal tolerado, contraindicado durante el embarazo, y tiene poco efecto modificando la enfermedad en la fase crónica. La detección se realiza fácilmente con serología. La migración ha llevado la enfermedad fuera de los países endémicos, donde la transmisión continúa verticalmente y a través de donaciones de sangre y tejidos/órganos. Hay más de 32 millones de migrantes de América Latina que viven en países no endémicos. Sin embargo, la infección está masivamente infra-diagnosticada en este medio debido a la falta de concientización por parte de pacientes, autoridades sanitarias y profesionales. Las políticas de control y detección en la donación de sangre y tejidos han reducido significativamente la transmisión en países endémicos, pero no están universalmente establecidas en el entorno no endémico. La detección prenatal no se realiza comúnmente. Otros desafíos incluyen las dificultades para acceder y retener a los pacientes en el sistema de salud y la falta de financiamiento específico para las intervenciones. Toda estrategia debe ir acompañada de campañas de educación y sensibilización dirigidas a pacientes, profesionales y responsables políticos. La participación de los pacientes y sus comunidades es central y clave para el éxito y debe buscarse de manera temprana y activa. Esta revisión propone estrategias para abordar los desafíos que enfrentan los países no endémicos.

Introducción

La enfermedad de Chagas (EC) o tripanosomiasis americana es una enfermedad parasitaria desatendida asociada con una mortalidad y una morbilidad significativas que incluyen discapacidad a largo plazo, estigma social y un costo de salud mental. Percibida como una enfermedad de los más pobres, esta infección, antes limitada a las zonas rurales de América Latina (AL), ahora se ha propagado a través de la migración a áreas y países no endémicos, donde la transmisión se mantiene por vías no vectoriales. La falta de conciencia individual e institucional, particularmente en países no endémicos, contribuye a perpetuar el ciclo al no identificar a los individuos con la enfermedad o en riesgo de adquirirla, y las oportunidades de tratamiento y prevención. 

Esta revisión tiene como objetivo, un enfoque específico en países no endémicos. A saber:  1) resumir el conocimiento actual en epidemiología, diagnóstico, estrategias de tratamiento y prevención en EC; 2) proponer estrategias para implementar programas de detección y tratamiento; y 3) identificar desafíos comunes.

Métodos

Revisión bibliográfica no sistemática de artículos, libros de texto y literatura gris relevantes (documentos de políticas, guías locales y nacionales disponibles, redes sociales y sitios web de pacientes y organizaciones públicas que trabajan con EC). Los autores también describen su propia experiencia en el tratamiento de pacientes con EC y la implementación de un programa de detección y tratamiento en Londres, como miembros del Chagas Hub del Reino Unido. 

Epidemiología: Causa, Patogenia y Mecanismos de Transmisión

La EC es causada por el protozoo hemoflagelado Trypanosoma cruzi , que se transmite en áreas endémicas por especies de insectos triatominos succionadores de sangre, activos durante la noche (Triatoma, Panstrongylus, y Rhodnius) que viven en techos y grietas de paredes de casas y estructuras peridomésticas. Las formas flageladas o infectivas del parásito (tripomastigote) son transportadas en la sangre del huésped y adquiridas por el insecto vector durante una ingesta de sangre; el parásito luego se desarrolla en el intestino medio del insecto en epimastigote y más tarde en formas metacíclicas de tripomastigote que se excretan con las heces. Estos se introducen en el huésped a través de roturas en la piel (después o no de una mordedura) o membranas mucosas e invaden las células del huésped donde se dividen intracelularmente para formar nidos de formas de amastigotes no flagelados. Estos pueden permanecer inactivos dentro de las células, pero también pueden revertirse a tripomastigotes y liberarse al torrente sanguíneo, desde donde pueden infectar otras células o ser adquiridos por el insecto vector, cerrando el ciclo. El T. cruzi infecta a una amplia gama de mamíferos domésticos y salvajes que mantienen los ciclos de vida domésticos y silvestres. 

El Trypanosoma cruzi responsable de la EC se puede agrupar en siete unidades de tipificación discretas (UTD), linajes genéticos, TcI a TcVI 5 y Tcbat. Los parásitos TcI-TcVI, tradicionalmente asociados con la EC, tienen diversos nichos ecológicos en áreas endémicas y las asociaciones entre el linaje del parásito y la presentación clínica no están claramente definidas. El Tcbat, un linaje encontrado recientemente en un caso humano en Ecuador, está muy relacionado con el clado TcI; sin embargo, se desconoce su significado clínico.

La transmisión implica la adquisición de formas infecciosas del parásito directamente del insecto vector (vectorial) o de la sangre o los tejidos (no vectorial). La transmisión vectorial ocurre en áreas endémicas a través de la contaminación con heces de insectos o picaduras de áreas expuestas de piel erosionada o superficies mucosas, típicamente frotando la piel o el ojo después de una picadura nocturna inadvertida o defecación en o cerca de la conjuntiva. La transmisión oral también es posible a través de la contaminación de alimentos o bebidas por las heces del vector y puede causar brotes. Las vías de transmisión no vectoriales incluyen la madre-feto, a través de transfusiones de sangre, órganos sólidos o trasplante de médula ósea.

La transmisión materno-fetal (congénita) se refiere a la transmisión durante el embarazo y el parto, y ocurre principalmente por vía transplacentaria después del primer trimestre y perinatalmente por contacto con sangre infectada de la madre. La transmisión vertical es un concepto teórico más amplio que también incluye la transmisión pos-natal y se refiere a la perpetuación transgeneracional de la infección a través de mujeres asintomáticas en edad fértil, crónicamente infectadas y no diagnosticadas que pueden transmitir la infección con cada embarazo. La transmisión es similar para los bebés nacidos por vía vaginal y por cesárea, lo que sugiere que la mayoría de la transmisión ocurre antes del parto. Una mujer crónicamente infectada puede potencialmente transmitir el parásito con cada embarazo. El tratamiento de las mujeres antes o entre embarazos reduce, pero no elimina, el riesgo de transmisión......

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Nueva presentación el  05 de julio. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Cordiales saludos. 
Ciudada de Buenos Aires. R. Argentina