992- Aspergilosis pulmonar

Frederic Lamoth,Thierry Calandra. Aspergilosis pulmonar: diagnóstico y tratamiento. Eur Respir Rev. 2022; 31(166): 220114. Infectious Diseases Service, Department of Medicine, Lausanne University Hospital and University of Lausanne, Lausanne, Switzerland.

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"El artículo "Aspergilosis pulmonar: diagnóstico y tratamiento" de Frederic Lamoth y Thierry Calandra proporciona una descripción completa del espectro clínico, el diagnóstico y el tratamiento de la aspergilosis pulmonar. Los autores comienzan definiendo la aspergilosis pulmonar como una infección fúngica de los pulmones causada por especies de Aspergillus. Luego analizan las dos presentaciones clínicas principales de la aspergilosis pulmonar: aspergilosis pulmonar invasiva (IPA) y aspergilosis pulmonar crónica (CPA).

La IPA es una infección grave y, a menudo, fatal que ocurre típicamente en pacientes inmunocomprometidos. Los factores de riesgo más comunes para IPA incluyen neoplasias malignas hematológicas, trasplante de órganos sólidos y uso prolongado de corticosteroides. La presentación clínica de la IPA es variable, pero a menudo incluye fiebre, tos, disnea y hemoptisis. Las imágenes de tórax suelen mostrar infiltrados o nódulos focales, pero también pueden ser normales hasta en un 20 % de los casos. El diagnóstico de API se basa en una combinación de hallazgos clínicos, radiológicos y microbiológicos. El estándar de oro para el diagnóstico es el aislamiento de especies de Aspergillus a partir de muestras respiratorias, pero a menudo esto no es posible. Otras pruebas de diagnóstico incluyen la serología, la detección del antígeno de galactomanano y la reacción en cadena de la polimerasa (PCR).

La CPA es una forma menos grave de aspergilosis pulmonar que generalmente ocurre en pacientes con enfermedad pulmonar preexistente, como tuberculosis o enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC). La presentación clínica de la CPA a menudo es indolente y puede incluir tos, disnea y sibilancias. Las imágenes de tórax generalmente muestran lesiones quísticas o cavitarias. El diagnóstico de CPA se basa en los hallazgos clínicos y radiológicos, y se puede utilizar la serología o la detección del antígeno de galactomanano para respaldar el diagnóstico.

Luego, los autores analizan el tratamiento de la aspergilosis pulmonar. El tratamiento de IPA es típicamente con agentes antifúngicos, como voriconazol o caspofungina. La duración del tratamiento depende de la gravedad de la infección, pero normalmente es de al menos 6 semanas. El tratamiento de la CPA también es con agentes antifúngicos, pero la duración del tratamiento suele ser más larga, al menos 12 semanas.

Los autores concluyen discutiendo los desafíos en el diagnóstico y tratamiento de la aspergilosis pulmonar. Estos desafíos incluyen la falta de pruebas de diagnóstico sensibles y específicas, la aparición de resistencia antifúngica y la toxicidad de los agentes antifúngicos. Los autores también destacan la necesidad de realizar más investigaciones sobre la prevención y el tratamiento de la aspergilosis pulmonar.

Además del texto principal, el artículo también incluye varias figuras y tablas que resumen las características clínicas, el diagnóstico y el tratamiento de la aspergilosis pulmonar. El artículo también incluye una serie de referencias a la literatura relevante.

En general, el artículo "Aspergilosis pulmonar: diagnóstico y tratamiento" es una descripción completa e informativa de esta importante entidad clínica. El artículo proporciona una descripción clara y concisa del espectro clínico, el diagnóstico y el tratamiento de la aspergilosis pulmonar. El artículo también incluye una serie de figuras y tablas que resumen la información clave. El artículo está bien referenciado y proporciona un buen punto de partida para futuras investigaciones sobre este tema.

Aquí hay algunos puntos adicionales que vale la pena mencionar del artículo:

• La incidencia de aspergilosis pulmonar está aumentando, en parte debido al uso cada vez mayor de terapias inmunosupresoras.
• El diagnóstico de aspergilosis pulmonar puede ser un desafío, ya que la presentación clínica suele ser inespecífica.
• El tratamiento de la aspergilosis pulmonar a menudo se prolonga y puede estar asociado con una toxicidad significativa.
• Existe la necesidad de nuevos agentes antifúngicos con eficacia y seguridad mejoradas".

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Nueva presentación el 05 de agosto
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

991- Micosis endemicas: guias para su diagnostico y control.

George R Thompson y 39 colaboradores. Guía global para el diagnóstico y control de las micosis endémicas: una iniciativa del European Confederation of Medical Mycology in cooperation with the International Society for Human and Animal Mycology. Lancet Infect Dis. 2021; 21(12): e364–e374. Department of Medical Microbiology and Immunology, University of California, Davis, CA, USA.

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"Esta guía completa, cubre varios aspectos del diagnóstico y tratamiento de las micosis endémicas. Ofrece información valiosa y recomendaciones para profesionales de la salud e investigadores de todo el mundo. El esfuerzo colaborativo de los autores asegura una perspectiva integral sobre este importante tema.

1- ¿Cuáles son las recomendaciones clave para el diagnóstico de micosis endémicas descritas en la guía?

La guía proporciona varias recomendaciones para el diagnóstico de micosis endémicas. Según el texto, los avances en las técnicas de laboratorio y las pruebas no invasivas han mejorado la especificidad y la sensibilidad de las pruebas diagnósticas. La guía también enfatiza la importancia de comprender la epidemiología, los factores de riesgo y los métodos de diagnóstico para diferentes poblaciones de pacientes. Los métodos de diagnóstico específicos mencionados en el texto incluyen serología, detección de antígenos, métodos moleculares y cultivo. La directriz también señala que las imágenes radiográficas generalmente se justifican sólo si existe preocupación por la infección en un sitio en particular. Para obtener información más detallada sobre el diagnóstico de micosis endémicas, consulte la guía.

2- Especificar las recomendaciones más relevantes sobre pruebas diagnósticas de laboratorio en micosis endémicas

De acuerdo con la guía, las recomendaciones más relevantes sobre pruebas de diagnóstico de laboratorio para micosis endémicas incluyen:

• Serología: las pruebas serológicas son útiles para el diagnóstico de algunas micosis endémicas, incluidas la histoplasmosis, la coccidioidomicosis y la paracoccidioidomicosis. Sin embargo, las pruebas serológicas pueden no ser útiles para todos los pacientes y la interpretación de los resultados puede ser un desafío.
• Detección de antígenos: las pruebas de detección de antígenos están disponibles para algunas micosis endémicas, incluidas la histoplasmosis y la criptococosis. Estas pruebas son útiles para el diagnóstico de enfermedad diseminada y se pueden utilizar para monitorear la respuesta a la terapia.
• Métodos moleculares: Los métodos moleculares, como la PCR, se utilizan cada vez más para el diagnóstico de micosis endémicas. Estas pruebas son muy sensibles y específicas, pero su disponibilidad puede ser limitada. 
• Cultivo: El cultivo sigue siendo el estándar de oro para el diagnóstico de micosis endémicas. Sin embargo, el cultivo puede ser lento y no ser sensible en todos los casos. 

En general, la directriz recomienda que se utilice una combinación de pruebas de diagnóstico y hallazgos clínicos para diagnosticar micosis endémicas. La elección de las pruebas diagnósticas debe basarse en la presentación clínica del paciente, la epidemiología de la enfermedad y la disponibilidad de las pruebas.

2- ¿Podría proporcionar una descripción general de las estrategias de manejo sugeridas para estas infecciones fúngicas?

La guía brinda una descripción general de las estrategias de manejo para las micosis endémicas. Según el texto, el manejo requiere el reconocimiento de los factores de riesgo (p. ej., exposición ambiental en una región endémica) y el uso apropiado de intervenciones diagnósticas y terapéuticas. Las opciones de tratamiento continúan ampliándose y nuestra comprensión de la selección de agentes, así como la dosis y la duración de la terapia continúa evolucionando. Las estrategias de tratamiento específicas mencionadas en el texto incluyen la terapia antimicótica, la intervención quirúrgica y la terapia inmunomoduladora. La guía también señala que la bioseguridad es una consideración importante cuando se manipulan estos organismos, y los laboratorios deben incorporar guías y reglamentos nacionales en sus procesos y prácticas para garantizar la seguridad del personal del laboratorio. 

3- ¿Existen secciones específicas en la guía que se centren en la prevención y el control de las micosis endémicas?

Los textos proporcionados no mencionan secciones específicas en la guía que se centren en la prevención y el control de micosis endémicas. Sin embargo, es común que las guías sobre enfermedades infecciosas incluyan recomendaciones y estrategias para medidas de prevención y control. Es probable que la guía también aborde estos importantes aspectos de las micosis endémicas. Para obtener información detallada sobre la prevención y el control de estas infecciones fúngicas, recomiendo consultar la propia guía completa".

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

989- Diagnostico inmunologico de micosis endemicas

Rodrigo Almeida-Paes, Andrea Reis Bernardes-Engemann, Beatriz da Silva Motta, Claudia Vera Pizzini, Marcos de Abreu Almeida, Mauro de Medeiros Muniz, Renata Alves Barcelos Dias, and Rosely Maria Zancopé-Oliveira. Alessandro C. Pasqualotto Editor. Diagnóstico inmunológico de micosis endémicas. J Fungi (Basel). 2022; 8(10): 993. Laboratório de Micologia, Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.

Resumen

Las micosis endémicas blastomicosis, coccidioidomicosis, histoplasmosis, paracoccidioidomicosis, criptococosis, esporotricosis, talaromicosis, adiaspiromicosis y emergomicosis son causadas principalmente por hongos térmicamente dimórficos geográficamente limitados (excepto la criptococosis), y su diagnóstico puede ser difícil. Los métodos de laboratorio usuales involucrados en el diagnóstico de micosis endémicas incluyen examen microscópico y cultivo de muestras biológicas; sin embargo, en los últimos años se han implementado técnicas serológicas, histopatológicas y moleculares para el diagnóstico de estas micosis, ya que la recuperación e identificación de sus agentes etiológicos requiere mucho tiempo y poca sensibilidad. En esta revisión nos enfocamos en los métodos de diagnóstico inmunológico relacionados con la detección de anticuerpos y antígenos ya que su evidencia es el diagnóstico presuntivo,

1. Introducción

Las micosis endémicas son causadas principalmente por hongos térmicamente dimórficos que presentan una distribución geográfica limitada, ocupan nichos ecológicos específicos en el medio ambiente y pueden causar enfermedades tanto primarias como oportunistas . Además, las micosis endémicas se reconocen como causas importantes de morbilidad y mortalidad, predominantemente en el VIH/SIDA y otras afecciones inmunosupresoras, incluidos los fármacos inmunosupresores. 

Las micosis endémicas más frecuentes son la blastomicosis, la coccidioidomicosis, la histoplasmosis, la paracoccidioidomicosis, la criptococosis, la esporotricosis y, más recientemente, la talaromicosis, la adiaspiromicosis y la emergomicosis, consideradas micosis endémicas emergentes. En los últimos años, el número de casos de micosis endémicas ha aumentado en todo el mundo. Además, existen variaciones significativas en su geografía, presentación clínica, manifestaciones radiográficas, métodos analíticos de diagnóstico y terapéutica. Su control adecuado implica el reconocimiento de factores de riesgo (p. ej., fuentes ambientales putativas de exposición a hongos en áreas endémicas), procedimientos de diagnóstico correctos y manejo terapéutico.

El diagnóstico de micosis endémicas es difícil de lograr. Es necesaria una evaluación precisa de los datos de laboratorio para garantizar una terapia adecuada para los pacientes. Aunque las manifestaciones de las micosis endémicas están bien definidas, su diagnóstico no puede centrarse únicamente en los datos clínicos del paciente, ya que los signos y síntomas de las micosis endémicas se superponen entre sí y con otras enfermedades infecciosas.

La asociación de datos clínicos, epidemiológicos y de laboratorio típicamente diagnostica micosis endémicas. Para corroborar el diagnóstico se deben realizar pruebas de laboratorio. Las pruebas de laboratorio habituales involucradas en el diagnóstico de micosis endémicas comprenden el examen microscópico y cultivo de varios tipos de muestras biológicas. El aspecto microscópico de los agentes suele ser indicativo en el caso de micosis endémica, pero se necesita una gran experiencia de laboratorio y la sensibilidad de estos métodos es variable. El cultivo de sitios posiblemente involucrados sigue siendo el método estándar de oro de diagnóstico, a pesar del crecimiento fúngico prolongado (hasta seis semanas en algunos casos) y la necesidad de instalaciones de bioseguridad de nivel 3 para manipular algunos agentes en el laboratorio.

Actualmente, hay otras herramientas de diagnóstico disponibles para el diagnóstico de micosis endémicas para complementar el cultivo y el examen directo. Estos métodos complementarios tienen un tiempo de respuesta rápido y una eficiencia satisfactoria. Se han desarrollado diferentes técnicas inmunológicas relacionadas con la detección de anticuerpos y antígenos para ayudar en el diagnóstico de micosis endémicas (tabla 1). En estas pruebas se han utilizado varias preparaciones antigénicas, desde antígenos crudos hasta purificados, así como proteínas recombinantes y péptidos sintéticos. Sin embargo, estos últimos no se utilizan en los ensayos validados para laboratorios de micología de rutina. 

Como se mencionó antes, la evidencia serológica de estas infecciones es valiosa debido a la naturaleza lenta y la baja sensibilidad de los métodos de referencia. Además de los métodos de detección de antígenos y anticuerpos, las pruebas cutáneas intradérmicas se emplearon en gran medida en el siglo pasado, pero su uso actual con fines diagnósticos en micología médica está severamente limitado, debido a la falta de antígenos estandarizados, avances en los métodos de detección de anticuerpos y antígenos y requisitos de bioseguridad para realizar las pruebas cutáneas. 

Las herramientas moleculares de detección de ADN de hongos dimórficos en muestras biológicas también se están estandarizando y validando en numerosos laboratorios para simplificar el diagnóstico. Desafortunadamente, aunque son prometedoras y útiles, las herramientas de diagnóstico no relacionadas con el cultivo no son accesibles en la mayoría de los países de bajos ingresos.

2. Blastomicosis

La blastomicosis es una infección fúngica de humanos y mamíferos causada por hongos dimórficos del género Blastomyces. Sus principales agentes etiológicos incluyen Blastomyces dermatitidis, Blastomyces gilchristii y Blastomyces percursus . La blastomicosis afecta con frecuencia a personas inmunocompetentes; sin embargo, los pacientes inmunocomprometidos son más propensos a presentar una enfermedad grave .

Visualización directa de Blastomyces spp. en muestras biológicas puede proporcionar un diagnóstico rápido, lo que permite iniciar una terapia antifúngica adecuada. La visualización correcta de los elementos fúngicos a veces es difícil de lograr mediante la tinción con hematoxilina-eosina (H&E), por lo que se recomiendan las tinciones con ácido peryódico de Schiff o plata con metenamina. El examen directo con hidróxido de potasio o blanco de calcoflúor es valioso para las muestras del tracto respiratorio. En cuanto a otras micosis endémicas, el cultivo es el método de diagnóstico estándar de oro. Los cultivos de agar dextrosa Sabouraud suelen mostrar moho Blastomyces sp. en semanas a meses.

2.1. Detección de anticuerpos

La reacción de fijación del complemento se utilizó como primera prueba inmunológica para el diagnóstico de blastomicosis utilizando el antígeno derivado de la forma de levadura, pero su sensibilidad (57%) y especificidad (30%) fueron bajas. Después de la introducción de la prueba de inmunodifusión en 1973 utilizando el antígeno “A” específico de Blastomyces spp. dermatitidis en un filtrado de cultivo, cuya eficacia de la prueba mejoró. La evaluación del antígeno “A” purificado, en lugar del antígeno de levadura crudo, y su aplicación en la prueba de fijación del complemento resultó en una alta especificidad, aunque la sensibilidad fue del 62%.

Posteriormente, se evaluó el valor del antígeno “A” purificado en un ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA), que reveló una sensibilidad del 92 % y una especificidad del 84 % al comparar su eficacia diagnóstica con la blastomicosis con pruebas de fijación del complemento e inmunodifusión como estándares de oro.

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Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
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988- Diagnóstico automatizado en parasitología

Sandra Valéria Inácio, Jancarlo Ferreira Gomes, Alexandre Xavier Falcão,  Bianca Martins dos Santos,  Felipe Augusto Soares, Saulo Hudson Nery Loiola,  Stefani Laryssa Rosa, Celso Tetsuo Nagase Suzuki, Katia Denise Saraiva Bresciani. Diagnóstico Automatizado: avances en el diagnóstico de infecciones parasitarias intestinales en humanos y animales. Front Vet Sci. 2021; 8: 715406. São Paulo State University (Unesp), School of Veterinary Medicine, Araçatuba, Brazil. Edited by Alessia Libera Gazzonis, University of Milan, Italy

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"Esta revisión integral reúne la experiencia de investigadores de varias instituciones, arrojando luz sobre los últimos avances en este campo. Desde el uso de tecnología de punta hasta el impacto potencial en la salud humana y animal, este artículo proporciona información valiosa sobre el futuro del diagnóstico de infecciones parasitarias.

1- ¿Cuáles son los métodos de diagnóstico automatizados clave que se analizan en esta revisión?

Los métodos clave de diagnóstico automatizado discutidos en esta revisión incluyen clasificadores supervisados, como el: clasificador bayesiano, las máquinas de vectores de soporte (SVM), las redes neuronales artificiales (ANN), el K-vecino más cercano (k-NN), el árbol de decisiones (DT) y el Optimum-Sendero Forestal (OPF) . Estos métodos se utilizan para la anotación de imágenes y la identificación de estructuras de parásitos en muestras fecales.

(N.del E.: El clasificador/aprendizaje supervisado, también conocido como machine learning supervisado, es una sub-categoría de machine learning y de inteligencia artificial. Se utiliza para el uso de un conjuntos de datos etiquetados para entrenar algoritmos que clasifican datos o prevén resultados con precisión.)

2- ¿Cómo benefician estos avances en el diagnóstico tanto a humanos como a animales?

"Los avances en el diagnóstico automatizado de infecciones parasitarias intestinales benefician tanto a humanos como a animales de varias maneras. En primer lugar, estos métodos automatizados ofrecen alta precisión en la identificación de la positividad del huésped y la carga parasitaria, lo que permite diagnósticos más precisos. Esto puede conducir a un tratamiento oportuno y específico, mejorando los resultados de salud tanto para humanos como para animales.

Además, los diagnósticos automatizados reducen el tiempo y el esfuerzo necesarios para contar huevos, quistes y ooquistes de helmintos y protozoos. En comparación con el proceso de microscopio tradicional, los diagnósticos automatizados ahorran tiempo y reducen la fatiga al eliminar la necesidad de contar manualmente en una pantalla de computadora. Esta mayor eficiencia permite procesar un mayor volumen de muestras en menos tiempo, lo que permite un diagnóstico y un tratamiento más rápidos.

Además, el uso de tecnologías computacionales y la producción de bases de datos visuales y textuales facilitan el almacenamiento y recuperación de información diagnóstica. Esto significa que los bioquímicos y veterinarios pueden acceder a los datos y analizarlos más fácilmente, lo que mejora la vigilancia, el seguimiento y el control de las infecciones parasitarias tanto en humanos como en animales.

En general, estos avances en el diagnóstico automatizado contribuyen a un diagnóstico más preciso y eficiente, un tratamiento más rápido y una mejor gestión de enfermedades tanto para humanos como para animales."

3- ¿Existen limitaciones o desafíos asociados con el diagnóstico automatizado de infecciones parasitarias intestinales?

"El artículo de revisión no proporciona una lista completa de limitaciones o desafíos asociados con el diagnóstico automatizado para infecciones parasitarias intestinales. Sin embargo, vale la pena señalar que la precisión de los diagnósticos automatizados depende de la calidad de las imágenes y los datos de entrenamiento utilizados para desarrollar los algoritmos. Por lo tanto, la calidad de las muestras fecales y la experiencia del personal que recolecta y procesa las muestras pueden afectar la precisión del diagnóstico automatizado.

Además, el costo de implementar diagnósticos automatizados puede ser una barrera para su adopción generalizada, particularmente en entornos de bajos recursos. La necesidad de equipo especializado y personal capacitado también puede limitar la accesibilidad de los diagnósticos automatizados en algunas regiones."

4- ¿Qué pasa con los avances y límites de las técnicas de diagnóstico computacional para la identificación de parásitos intestinales?

"El artículo de revisión reconoce que ha habido avances significativos en las técnicas de diagnóstico computacional para la identificación de parásitos intestinales durante la última década. Los investigadores han estado trabajando en modelos de procesamiento de imágenes digitales y técnicas de patrones para reconocer automáticamente los huevos de parásitos en imágenes microscópicas. El objetivo principal de estos avances es reducir los errores humanos que ocurren en el diagnóstico de parásitos fecales y producir resultados más rápidos y precisos.

Estas técnicas de diagnóstico computacional ofrecen el potencial para mejorar la eficiencia y confiabilidad de la identificación de parásitos. Su objetivo es superar las limitaciones de los métodos de microscopía tradicionales, como el proceso de conteo manual que requiere mucho tiempo, mano de obra calificada y el potencial del error humano. Al automatizar el proceso de identificación, estas técnicas pueden brindar resultados más rápidos y precisos, lo que lleva a un tratamiento oportuno y específico.

Sin embargo, el artículo de revisión también reconoce que aún existen desafíos y limitaciones que deben abordarse para garantizar la identificación adecuada de los parásitos. Estos desafíos incluyen el desarrollo de protocolos para la preparación de portaobjetos de microscopio con menos residuos y garantizar una buena tinción de las estructuras del parásito. Además, la creación de una base de datos de imágenes robusta es crucial para el éxito de estas técnicas computacionales.

En resumen, si bien ha habido avances significativos en las técnicas de diagnóstico computacional para la identificación de parásitos intestinales, aún existen desafíos que deben superarse para garantizar su precisión y eficacia. Se necesita más investigación y desarrollo para optimizar estas técnicas y abordar las limitaciones asociadas con ellas".

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Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
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Ciudada de Buenos Aires. R. Argentina

987- Vectores virales artificiales para remodelar el genoma humano

Jingen Zhu, Himanshu Batra, Neeti Ananthaswamy, Marthandan Mahalingam, Pan Tao, Xiaorong Wu, Wenzheng Guo, Andrei Fokine, Venigalla B. Rao. Diseño de vectores virales artificiales basados ​​en el bacteriófago T4 para la remodelación del genoma humano. Nature Communications vol 14, Article number: 2928 (2023). Bacteriophage Medical Research Center, Department of Biology, The Catholic University of America, Washington DC, USA. 

Abstracto

El diseño de vectores virales artificiales (AVV) programados con biomoléculas que puedan ingresar a las células humanas y realizar reparaciones moleculares tendrá amplias aplicaciones. Aquí, describimos un enfoque de línea de montaje para construir AVV mediante la ingeniería de los componentes estructurales bien caracterizados del bacteriófago T4. Comenzando con una cubierta de cápside de 120 × 86 nm que puede acomodar ADN de 171 Kbp y miles de copias de proteínas, se incorporan externa e internamente varias combinaciones de biomoléculas, incluidos ADN, proteínas, ARN y ribonucleoproteínas. Luego, las nanopartículas se recubren con lípidos catiónicos para permitir una entrada eficiente en las células humanas. Como prueba de concepto, ensamblamos una serie de AVV diseñados para administrar distrofina de longitud completa-gene o realizar varias operaciones moleculares para remodelar el genoma humano, incluida la edición del genoma, la recombinación de genes, el reemplazo de genes, la expresión de genes y el silenciamiento de genes. Estos AVV de gran capacidad, personalizables, multiplexados y basados ​​en fagos todo en uno representan una categoría adicional de nanomaterial que podría transformar potencialmente las terapias génicas y la medicina personalizada.

Introducción

Los virus son los organismos más abundantes y extendidos en la Tierra. También son algunas de las máquinas biológicas más eficientes. A pesar de su pequeño tamaño y su composición genética simple, los virus pueden causar infecciones mortales y pandemias globales, como el SIDA, la gripe y el COVID-19. Esto se debe a que los virus desarrollaron mecanismos eficientes para replicarse y ensamblar progenie en escalas de tiempo rápidas, del orden de minutos en el caso de virus bacterianos (bacteriófagos o simplemente fagos). 

Si algunos de los mecanismos virales eficientes pudieran aprovecharse mediante la construcción de vectores virales artificiales (AVV), programados con moléculas terapéuticas, tales virus, en lugar de replicarse en el huésped, podrían realizar reparaciones beneficiosas para restaurar la salud humana. Dichos AVV podrían potencialmente reemplazar genes defectuosos, producir moléculas terapéuticas, matar células cancerosas, etc. A pesar de muchos intentos a lo largo de los años  el desarrollo de los AVV se mantuvo en una etapa temprana.

Los virus humanos naturales, los virus adenoasociados (AAV) con un genoma de ADN monocatenario de ~5 Kbp de tamaño y los lentivirus con un genoma de ARN monocatenario de ~10 Kbp de tamaño han sido diseñados para administrar ADN o ARN terapéutico como parte de su genoma . Sin embargo, estos vectores virales tienen limitaciones. En el mejor de los casos, pueden administrar uno o dos genes terapéuticos y plantean dificultades para incorporar moléculas terapéuticas adicionales esenciales para reparaciones complejas. Las preocupaciones de seguridad, como la amplia infectividad de las células humanas, la inmunidad preexistente y la posible integración en el genoma del huésped, son problemas adicionales graves 

Aquí, describimos una plataforma AVV usando el fago T4. que pertenece a la familia Straboviridae e infecta a la bacteria Escherichia coli . Con una eficacia de infección cercana al 100 %  y replicando a una velocidad de ~20-30 min por ciclo, el T4 es uno de los virus más eficaces que se conocen. Contiene una gran cápside icosaédrica alargada de 120 × 86 nm (cabeza) ensamblada con 930 moléculas o 155 capsómeros hexamérica de la principal proteína gp23* de la cápside (* representa la forma madura escindida), 55 copias u 11 pentámeros de gp24* en once de los doce vértices y 12 copias de la proteína portal gp20 en el duodécimo vértice único (Fig.  1a-c ). El vértice del portal es una estructura de anillo con un canal central de ~35 Å a través del cual el genoma viral se transporta a la cápside mediante un motor molecular pentamérico alimentado por ATP conectado a él (Fig. 1c ). Después de empaquetar una cabeza de genoma, equivalente a ~171 Kbp de dsDNA lineal, 26 , 27 , el motor se disocia y las proteínas del cuello se ensamblan, seguido por el ensamblaje de la cola y la fibra de la cola para generar un virión infeccioso....

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

986- Cestodes

Ellen J. Lesh; Mark F. Brady. "Tenia". Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2023 Jan. Alpert Medical School of Brown University.

Resumen

Los cestodos son tenias planas, parásitas y hermafroditas con ciclos de vida complejos que infectan a los animales, incluidos los humanos. Tres cestodos que causan enfermedades en humanos son Taenia solium (tenia de cerdo), Taenia saginata (tenia de ganado) y Diphyllobothrium (tenia de pescado). Esta presentacion repasa el diagnóstico y  tratamiento de estas infecciones y destaca el papel del equipo interprofesional en estas patologías.

Objetivos

• Describir la transmisión de Taenia solium, Taenia saginata y Diphyllobothrium.
• Resumir la historia y los hallazgos del examen físico esperados en pacientes con estas infecciones.
• Resumir las opciones de diagnóstico y tratamiento para estas infecciones.
• Revisar la importancia de la colaboración y la comunicación entre el equipo interprofesional para el control y cuidado del paciente con estas patologias.................                                

Diagnóstico

1- El diagnóstico de un paciente con síntomas de neurocisticercosis (NCC) se basa principalmente en el examen microscópico de las heces en busca de la presencia de huevos de Taenia. Aunque esto permite el diagnóstico del género del parásito, a menudo no distingue entre especies. Las pruebas moleculares en suero y heces pueden ayudar en el diagnóstico y  diferenciación de especies. La NCC requiere una combinación de pruebas moleculares e imágenes. La eosinofilia a menudo está presente, pero rara vez aumenta más del 50%. Es más probable un aumento del 1% al 15%, y los niveles de IgE en suero también pueden aumentar. Los huevos de T. saginata y T. solium pueden identificarse pero no diferenciarse mediante el examen microscópico de las heces.  La especie se puede distinguir por un proglótido según el número de ramas uterinas.  El examen de heces puede ser menos eficaz en el caso de T. saginata , ya que las proglótides grávidas a menudo emergen espontáneamente a través del ano y depositan huevos en las regiones perianal y perineal.  Por lo tanto, se puede recomendar un hisopo anal para la recuperación de óvulos. Independientemente, el diagnóstico de Taenia se basa en la microscopía directa de los huevos expulsados ​​en las heces a pesar de la baja sensibilidad dada la naturaleza intermitente de la eliminación de los huevos (la sensibilidad oscila entre el 3,9 % y el 52,5 %).  

La detección ELISA de Copro-Ag (a partir de muestras de heces) no depende de la eliminación activa de huevos para la detección positiva. Sin embargo, esto no puede distinguir entre especies y puede haber reactividad cruzada con otros parásitos, incluidos Ascaris, Trichuris, Hymenoplepis nana y otros protozoos. Se ha demostrado que las pruebas de copro-Ag logran una sensibilidad del 98 % y una especificidad del 99 % en comparación con la sensibilidad del 38 % con microscopía directa. Para el diagnóstico específico de especie, la PCR por secuencias de genes de T. solium logra una especificidad del 100 % y una sensibilidad del 97 % al 100 %. Las pruebas de suero incluyen un ensayo de inmunotransferencia para la detección de anticuerpos para antígeno excretor-secretor (TSES) de T.solium que una sensibilidad del 95 % y una especificidad del 100 %. 

2- La difilobotriasis también se basa en el examen de heces en busca de huevos distintos, que pueden clasificar el género pero no la especie. Los métodos moleculares, como la PCR de muestras de heces, son el método más confiable para identificar a nivel de especie. No hay pruebas serológicas confiables para ayudar en el diagnóstico. Tanto para Diphyllobothrium  como para Taenia, no existe una razón clínica para distinguir entre especies ya que el tratamiento es el mismo; sin embargo, identificar las distintas especies ayudará en el cuadro epidemiológico de la transmisión y los casos importados.

3- Dado que los quistes en la mayoría de los tejidos son asintomáticos o están destruidos, rara vez se detectan o diagnostican. Sin embargo, la NCC conduce a lesiones quísticas visibles en el sistema nervioso central (SNC) y a una sintomatología importante y variable. Una gran parte de la patología del NCC se debe a la respuesta inmune del huésped al quiste larvario de T. solium. Una vez que el quiste está en el tejido, el sistema inmunitario del huésped induce la formación de granulomas y edema perilesional. En la etapa inicial de NCC, hay un quiste viable con inflamación periquística mínima. A medida que aumenta la respuesta inmunitaria del huésped, la inflamación perilesional matará al quiste, el líquido dentro del quiste se vuelve denso y  se encoge hasta que finalmente se elimina o se reemplaza con calcificación residual. La resonancia magnética y la tomografía computarizada pueden identificar lesiones granulomatosas calcificadas “con realce en anillo” que se encuentran en el cerebro. El diagnóstico de NCC depende de la sospecha radiológica y la interpretación congruente de la serología. La radiología puede clasificar la degeneración y el grado de inflamación, pero también se utiliza para controlar la eficacia del tratamiento.  

4- La serología ayuda a confirmar el diagnóstico. La serología para NCC incluye la detección de anticuerpos y antígenos a través de muestras de suero y LCR, respectivamente. Aunque la detección de antígenos es posible con suero y orina, se encontró que era mayor en LCR. El ensayo de inmuno-electrotransferencia ligado a enzimas (EITB) en suero para la detección de anticuerpos contra los quistes de T. solium tiene una especificidad del 98 % al 100 % en pacientes con más de un quiste cerebral viable; sin embargo, EITB tiene poca sensibilidad para una sola lesión cerebral.  La detección de anticuerpos no indica cisticercosis activa, ya que esto puede resultar de la exposición sola e infecciones que no se establecieron o no se resolvieron. 

La vida útil de los anticuerpos es variable y depende del historial inmunitario del huésped y de la carga de la infección. Algunos pacientes con antecedentes de quistes múltiples pueden tener anticuerpos positivos durante años después del tratamiento exitoso. Las pruebas ELISA basadas en monoclonales para la detección de antígenos pueden demostrar la presencia de parásitos vivos. Los niveles de antígeno caen rápidamente después del tratamiento, mientras que los anticuerpos pueden permanecer detectables. Es raro que la conversión a anticuerpos negativos ocurra en menos de 1 año, pero es un marcador de cura. En general, las pruebas positivas de anticuerpos y antígenos para NCC sugieren una infección viable. 

Una sola lesión en las imágenes (o una carga de infección baja) puede dar negativo para ambas. Los pacientes que solo tienen lesiones calcificadas suelen ser negativos para antígenos, pero pueden ser negativos o positivos para anticuerpos. Si las imágenes muestran solo lesiones calcificadas y el paciente tiene una prueba de antígeno positiva, se debe sospechar que se ha pasado por alto una lesión viable. El NCC subaracnoideo se asocia con altos niveles de anticuerpos y antígenos. Por lo tanto, las imágenes positivas con resultados negativos o débilmente positivos deben generar dudas sobre el diagnóstico.

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Nueva presentación el  15 de julio. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Cordiales saludos. 
Ciudada de Buenos Aires. R. Argentina

985- El ChatBot y las publicaciones cientificas

Gemma Conroy-Editor. Los científicos usaron ChatGPT para generar un documento completo desde cero, pero ¿es bueno?. Nature  news  article  07 July 2023

Utilizando el  chatbot en cada paso, los investigadores produjeron un documento fluido y perspicaz. Sin embargo, todavía tienen preocupaciones.

Un par de científicos ha producido un trabajo de investigación en menos de una hora con la ayuda de ChatGPT, una herramienta impulsada por inteligencia artificial (IA) que puede comprender y generar texto similar al humano. El artículo fue fluido, perspicaz y se presentó con la estructura esperada de un artículo científico, pero los investigadores dicen que hay muchos obstáculos que superar antes de que la herramienta pueda ser realmente útil.

El objetivo era explorar las capacidades de ChatGPT como 'copiloto' de investigación y provocar un debate sobre sus ventajas y desventajas, dice Roy Kishony, biólogo y científico de datos del Technion, el Instituto de Tecnología de Israel en Haifa. “Necesitamos una discusión sobre cómo podemos obtener los beneficios con menos desventajas”, dice.

Kishony y su alumno Tal Ifargan, un científico de datos que también trabaja en Technion, descargaron un conjunto de datos disponible públicamente del Sistema de Vigilancia de Factores de Riesgo del Comportamiento de los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de EE. UU., una base de datos de encuestas telefónicas relacionadas con la salud. El conjunto de datos incluye información recopilada de más de 250 000 personas sobre su estado de diabetes, consumo de frutas y verduras y actividad física.

Los bloques de construcción en un papel.

Los investigadores le pidieron al ChatGPT que escribiera un código que pudieran usar para descubrir patrones en los datos para pudieran analizarlos más a fondo. En su primer intento, el Chatbot generó un código que estaba plagado de errores y no funcionó. Pero cuando los científicos transmitieron los mensajes de error y le pidieron que corrigiera los errores, finalmente produjo un código que podría usarse para explorar el conjunto de datos.

Con un conjunto de datos más estructurado en la mano, Kishony e Ifargan le pidieron a ChatGPT que los ayudara a desarrollar un objetivo de estudio. La herramienta sugirió que exploraran cómo la actividad física y la dieta afectan el riesgo de diabetes. Una vez que generó más código, ChatGPT entregó los resultados: comer más frutas y verduras y hacer ejercicio está relacionado con un menor riesgo de diabetes. 

Luego se le pidió a ChatGPT que resumiera los hallazgos clave en una tabla y escribiera la sección de resultados completa. Paso a paso, le pidieron a ChatGPT que escribiera las secciones de Resumen, Introducción, Métodos y Discusión de un manuscrito. Finalmente, le pidieron a ChatGPT que refinara el texto. “Escribimos el documento a partir de la salida de muchas indicaciones”, dice Kishony. “Cada paso se basaba en los productos de los pasos anteriores”.

Aunque ChatGPT generó un manuscrito claramente escrito con un sólido análisis de datos, el documento estuvo lejos de ser perfecto, dice Kishony. Un problema que encontraron los investigadores fue la tendencia de ChatGPT a llenar los vacíos inventando cosas, un fenómeno conocido como "alucinación". En este caso, generó citas falsas e información inexacta. Por ejemplo, el documento afirma que el estudio "aborda un vacío en la literatura", una frase que es común en los documentos pero inexacta en este caso, dice Tom Hope, científico informático de la Universidad Hebrea de Jerusalén. El hallazgo “no es algo que vaya a sorprender a ningún experto médico”, dice. “No está cerca de ser novedoso”.

Beneficios y preocupaciones

A Kishony también le preocupa que tales herramientas puedan facilitar que los investigadores se involucren en prácticas deshonestas como el P-hacking, para el cual los científicos prueban varias hipótesis en un conjunto de datos, pero solo informan aquellas que producen un resultado significativo.

Otra preocupación, agrega,  es que la facilidad de producir artículos con herramientas generativas de IA podría resultar en que las revistas se inunden con artículos de baja calidad. Menciona que su enfoque de datos en papel, con supervisión humana central en cada paso, podría ser una forma de garantizar que los investigadores puedan comprender, verificar y replicar fácilmente los métodos y hallazgos.......

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Cordiales saludos. 
Ciudada de Buenos Aires. R. Argentina

 

981- Primer "pangenoma" humano (HPRC)

El primer 'pangenoma' humano pretende catalogar la diversidad genética. Nature News Article, 10 May 2023. Layal Liverpool, Editor

Los investigadores publican los resultados preliminares de un esfuerzo en curso para capturar la totalidad de la variación genética humana.

Más de 20 años después de que se publicara el primer borrador del genoma del histórico Proyecto Genoma Humano, los investigadores publicaron un borrador del "pangenoma" humano: una instantánea de lo que está a punto de convertirse en una nueva referencia para la investigación genética que captura más de la diversidad humana de lo que hasta ahora estuvo previamente disponible. Los genetistas dieron la bienvenida al hito, al tiempo que destacaron las consideraciones éticas clave que rodean el esfuerzo por hacer que la investigación del genoma sea más inclusiva.

“Esto es como pasar de la televisión en blanco y negro a 1080p”, dice Keolu Fox, científico del genoma de la Universidad de California en San Diego. “Es algo que todos estábamos esperando”, dice Aimé Lumaka, genetista que ocupa un cargo conjunto en la Universidad de Lieja en Bélgica y la Universidad de Kinshasa en la República Democrática del Congo dice “Al genoma de referencia actual le falta no solo parte de la información genómica sino, lo que es más importante, le falta diversidad”.

El borrador del genoma, publicado en Nature el 10 de mayo , fue producido por el Human Pangenome Reference Consortium (HPRC). Lanzado en 2019, el proyecto internacional tiene como objetivo mapear la totalidad de la variación genética humana, para crear una referencia integral contra la cual los genetistas podrán comparar otras secuencias. Tal referencia ayudaría a los estudios que investigan los posibles vínculos entre los genes y la enfermedad.

El borrador del pangenoma sigue a la publicación en 2022 de la primera secuencia completa del genoma humano, que llenó los vacíos que había dejado el Proyecto Genoma Humano original. Pero a diferencia del borrador original del genoma humano y su sucesor, los cuales se derivaron principalmente del ADN de una sola persona, el borrador del pangenoma representa una colección de secuencias de una selección diversa de 47 personas de todo el mundo, incluidas personas de África, las Américas, Asia y Europa.

Mapa del tubo genético

Eimear Kenny, genetista de la Escuela de Medicina Icahn en Mount Sinai en la ciudad de Nueva York, y sus colegas alinearon todas estas secuencias computacionalmente para formar un 'gráfico de pangenoma', conceptualmente similar a un mapa del metro de Londres, en el que las rutas de ramificación indican variación genética. Los investigadores descubrieron que el pangenoma les permitió identificar el doble de variantes estructurales (grandes alteraciones genómicas, como duplicaciones o eliminaciones de genes) por persona de lo que es posible utilizando el genoma de referencia lineal original. El equipo tiene como objetivo analizar secuencias de 350 personas para mediados de 2024.

Muchas de las muestras que se analizan son de personas que participaron en el Proyecto 1000 Genomas, un esfuerzo de secuenciación iniciado en 2008 para mapear la variación genética en 26 poblaciones diversas. El consorcio Pangenome está descongelando y volviendo a analizar las muestras de ADN congeladas de los participantes utilizando una técnica más detallada llamada "secuenciación de lectura larga". Este método  analiza simultáneamente secciones más largas de ADN, en comparación con métodos de secuenciación más antiguos y puede distinguir entre pares de cromosomas de la misma persona. “Es un enfoque de resolución mucho más alta”, dice Fox. ........

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Referencia original

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Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

980- ¿Origen del Covid-19?

Lawrence O. Gostin, J.D., Gigi K. Gronvall,. Perspective. Los orígenes del Covid-19: por qué es importante (y por qué no). NEJM  June 7, 2023. O’Neill Institute for National and Global Health Law, Georgetown University Law Center, Washington, DC (L.O.G.); Johns Hopkins Center for Health Security, Baltimore (G.K.G.).

Cuando surgen emergencias de salud, los científicos buscan descubrir la causa, por ejemplo, cómo surgió y se propagó un patógeno, porque este conocimiento puede mejorar nuestra comprensión de los riesgos y las estrategias de prevención, preparación y mitigación. Sin embargo, ha pesar de haber transcurrido el cuarto año de la pandemia de Covid-19, aún continúan los intensos debates políticos y científicos sobre sus orígenes. 

Las dos hipótesis principales son: un derrame zoonótico natural, que probablemente ocurrió en el mercado mayorista de mariscos de Huanan, y una fuga del laboratorio del Instituto de Virología de Wuhan (WIV). Vale la pena examinar los esfuerzos para descubrir los orígenes del SARS-CoV-2, los obstáculos políticos y lo que nos dice la evidencia. Esta evidencia puede ayudar a aclarar el camino evolutivo del virus. Pero en forma independiente los orígenes del virus,

La historia de los orígenes se remonta al 31 de diciembre de 2019, cuando la Organización Mundial de la Salud (OMS) se enteró de un grupo de casos de neumonía de causa desconocida en Wuhan (ver la cronología ). Las autoridades de Wuhan cerraron el mercado de Huanan al día siguiente, lo que hizo que los animales vivos no estuvieran disponibles para las pruebas. 

China compartió públicamente la secuencia genética del SARS-CoV-2 el 10 de enero de 2020. No fue sino hasta semanas después de que la OMS declarara al Covid-19 una emergencia de salud pública de importancia internacional el 30 de enero, que la Misión Conjunta OMS-China visitó Beijing y Wuhan (16 de febrero al 24 de febrero).

El informe técnico conjunto de la OMS y China publicado en marzo de 2021 calificó un derrame zoonótico del virus como una fuente "de probable a muy probable", a los productos de la cadena de alimentos fríos como "posible" y un incidente de laboratorio (WIV) como "extremadamente improbable". 

El director general de la OMS repudió de inmediato los hallazgos del informe, creyendo que era prematuro descartar un posible incidente de laboratorio. Una carta abierta publicada en Science el 14 de mayo de 2021 acreditó la teoría del laboratorio y pidió acceso abierto a los registros de laboratorio y estudios basados ​​en la ciencia. El 13 de octubre de 2021, el director general de la OMS estableció el Grupo Asesor Científico para los Orígenes de Nuevos Patógenos (SAGO). China rechazó oficialmente el plan de la OMS para una segunda fase de investigación de sus orígenes. El informe preliminar de SAGO advirtió que China estaba ocultando datos clave.

Recientemente, un equipo de expertos internacionales anunció que había identificado datos sobre muestras ambientales positivas para SARS-CoV-2 recolectadas del mercado de Huanan en enero de 2020, que China había ocultado del dominio público durante 3 años. Los científicos chinos cargaron los datos en GISAID (la Iniciativa global para compartir todos los datos sobre la influenza), pero luego los eliminaron. En respuesta a la presión de la OMS, China restauró esos datos a la GISAID.

Determinar los orígenes del SARS-CoV-2 debería ser estrictamente un asunto científico, pero se ha enredado en la política. En marzo de 2020, el Ministerio de Relaciones Exteriores de China alegó, sin pruebas, que el personal del Ejército de los EE. UU. había introducido el SARS-CoV-2 durante una visita a Wuhan, lo que llevó al presidente Donald Trump a afirmar que el virus se originó en el WIV. Tras acusar al director general de ponerse del lado de China, Trump notificó a las Naciones Unidas que Estados Unidos tenía la intención de retirarse de la OMS. Aunque el presidente Joe Biden luego revocó esa decisión, la controversia sobre los orígenes ha continuado. 

El 26 de mayo de 2021, Biden ordenó a las agencias de inteligencia de EE. UU. que revisaran las hipótesis de los orígenes en competencia. La Oficina del Director de Inteligencia Nacional publicó la “Evaluación desclasificada sobre los orígenes de COVID-19,3 .......

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

979- El dengue en diferentes materiales biológicos

Mahathir Humaidi, Wei Ping Tien, Grace Yap, Choon Rong Chua, Lee Ching Ng Zeno Bisoffi, Academic Editor. Diagnóstico no invasivo del Dengue: el uso de saliva y orina en las diferentes etapas de la enfermedad. Diagnostics (Basel). 2021 Aug; 11(8): 1345. Environmental Health Institute, National Environment Agency, Singapore.

Resumen

El diagnóstico del dengue (DENV) depende en gran medida de los síntomas clínicos y se confirma de forma rutinaria con su detección en el laboratorio en muestras de suero de pacientes recolectadas mediante flebotomía. Esto presenta un desafío para los pacientes que no son aptos para la venopunción. Los métodos no invasivos de diagnóstico del dengue tienen el potencial de mejorar el actual algoritmo de detección del dengue. En este estudio, se recolectaron muestras de pacientes infectados con dengue entre enero y septiembre de 2012 y desde septiembre hasta diciembre de 2013 con dos configuraciones diferentes. Las muestras del Panel A (sangre, orina y saliva) se recolectaron diariamente cuando los 39 pacientes estaban hospitalizados y durante sus visitas de seguimiento, mientras que las muestras del Panel B (saliva) se recolectaron de 23 pacientes durante la etapa aguda del dengue. Usando DENV- PCR en el Panel A, desde el día 2 hasta el día 4 después del inicio de la fiebre, el suero mostró la mejor positividad general seguido de la saliva y la orina (100 % /82,1 %/ 67,9 %). Desde el día 5 hasta el día 10 después del inicio de la fiebre, el suero y la orina tuvieron una positividad similar (67,4% /61,2%), seguidos de la saliva (51,3%). Más allá del día 10 posterior al inicio de la fiebre, el DENV fue indetectable en el suero, pero la orina y la saliva mostraron un 56,8 % y un 28,6 % de positividad. El DENV en la orina fue detectable hasta 32 días después de la fiebre. Los resultados del panel B mostraron una sensibilidad general del 32,4 % -36 % (ARN/NS1) para la detección de DENV en la saliva. Nuestros resultados sugieren que el método de detección basado en la orina es útil especialmente para la detección tardía del dengue, donde el DENV no se detecta en el suero pero aún se puede detectar en la orina.

1. Introducción

El dengue es el virus transmitido por mosquitos más común del mundo, con aproximadamente tres mil millones de personas en riesgo de infección cada año. En aproximadamente 100 países, se estima que 50 millones de infecciones por año desafían la infraestructura de salud pública de los países afectados. Un diagnóstico de laboratorio preciso y rápido es esencial para que el médico distinga el dengue en fase inicial de otras enfermedades con síntomas clínicos similares. Esto permite la asignación eficiente de recursos limitados para actividades de control de vectores.

Existen dos métodos en el diagnóstico de laboratorio del dengue. i) El método directo implica la detección de DENV aislado, de antígenos virales como la proteína NS1, o la secuencia genómica a través de la PCR con transcriptasa inversa (RT-PCR).  ii)  El método indirecto requiere la detección de altos niveles de anticuerpos IgM, IgG o IgA específicos del dengue. 

Actualmente, la prueba de RT-PCR,  la detección de NS1 mediante el ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA) o la prueba rápida de flujo lateral son suficientes para la confirmación de la infección aguda por dengue. Los ensayos serológicos de anticuerpos IgM e IgG reactivos contra el dengue se pueden usar para mostrar si un paciente tiene una infección primaria o secundaria por dengue. 

Los kits de IgM basados ​​en ELISA, en comparación con los kits de IgM de prueba rápida, tienen sensibilidades más altas (61,5–99,0 % frente a 20,5–97,7 %) y especificidades más altas (79,9–97,8 % frente a 76,6–90,6 %). También se debe tener en cuenta que la IgM del dengue reacciona de forma cruzada con los cuatro serotipos de DENV y otros flavivirus como el virus del Nilo Occidental (WNV), el virus de la encefalitis de St. Louis (SLE), el virus de la encefalitis japonesa (JEV) y el virus de la fiebre amarilla (YFV). 

La IgG no es adecuada para el diagnóstico precoz de casos de infección primaria, ya que solo se puede detectar después de 10 días desde el inicio de la enfermedad. En la infección secundaria, sin embargo, se puede detectar un aumento rápido de IgG desde el día 4 después del inicio de la enfermedad. Se ha detectado Dengue IgA en suero de pacientes febriles entre los días 8 y 11 después del inicio de la fiebre de una infección primaria por dengue. Durante la infección secundaria, la IgA aumenta casi inmediatamente después del inicio de la fiebre.

El empleo de una técnica basada en la saliva en el diagnóstico del dengue proporciona un método fácil y no invasivo para la recolección de muestras. Poloni et al. y Mizuno et al. también pudieron detectar el genoma del virus del dengue en la saliva mediante RT-PCR en tiempo real, mientras que Ravi Banavar et al. demostró una sensibilidad y especificidad del 100% con muestras de saliva seropositivas en un kit ELISA IgG.  Vázquez et al. han demostrado que Dengue IgA e IgG, pero no IgM, pueden detectarse en la orina de pacientes con infección primaria y secundaria por dengue. 

Comparando las tasas positivas de antígeno NS1, Saito et al. detectó tasas similares en orina y suero en los días 11 a > 15 posteriores al inicio de la fiebre. En un estudio de viajeros japoneses que se infectaron con dengue en el extranjero, la tasa de positividad del genoma de DENV para muestras de orina y suero fue del 30 % y 79 %, respectivamente, entre los días 1 y 5 después del inicio de la enfermedad y entre los días 10 y 16 después del inicio de la enfermedad; la tasa de positividad correspondiente fue del 61 % (orina) y del 11 % (suero). Yingsiwaphat et al. pudieron aislar DENV vivo de la orina de pacientes con infección aguda y de pacientes 14 días después de la defervescencia. 

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978- Historia del laboratorio clínico - I

Angela Tomei Robinson. Patologia- los inicios del laboratorio clínico. Oxford-Laboratory Medicine 2021;52:e66-e82. St. John’s University College of Pharmacy and Health Sciences, Queens, NY

Resumen

El primer artículo de esta serie corresponde a la cronología histórica de la patología y el laboratotio clínico desde la antigüedad, con el desarrollo más temprano de las pruebas de laboratorio a lo largo de los siglos hasta el día de hoy. Varios desarrollos iniciales de "laboratorios"  (farmacéuticos, físicos, químicos, biológicos, forenses, microbiológicos) eran con fines de estudio experimental e investigación cientifica. Ninguno al principio estaba específicamente orientado clinicamente para análisis de diagnóstico directo para el cuidado del paciente. Ademas, los laboratorios clínicos originalmente no estarían afiliados a los hospitales. El uso de laboratorios clínicos para pruebas médicas para ayudar en la detección, diagnóstico y tratamiento de enfermedades sería una consecuencia de estos laboratorios de investigación y sera necesario algún tiempo para que la patología y el laboratorio clínico  fueran reconocidas como una especialidad establecida. Los historiadores generalmente demuestran que los laboratorios se crearon primero como salas independientes separadas de los hospitales para eventualmente formar parte de los hospitales universitarios. (Lab Med. 2023 Apr 13:lmac164. 10.1093/)

¿Qué es la patología?

En esencia, la patología es el estudio de la enfermedad con dos divisiones principales: patología anatómica (el estudio de las partes del cuerpo) y patología-bioquímica clínica (el estudio de los fluidos corporales).La primera aplicación de la patología comenzó y se basó en el desarrollo de la medicina donde la mayoría de los primeros patólogos eran médicos. Es importante seguir la historia hasta el día de hoy para arrojar algo de luz sobre cómo evolucionó el laboratorio clínico y observar que dicha historia ha sido complicada y enrevesada.

Cronología histórica del laboratorio clínico: primeras técnicas.

El laboratorio clínico comenzó con el estudio de un subproducto natural de todos los humanos que se obtenía fácilmente: la orina. Las muestras de orina pueden proporcionar información valiosa para un médico. Incluso si muchos profesionales de laboratorio actuales opinan que el análisis de orina quizás no sea el área de trabajo más popular asignada, la prueba de orina en sí misma ha sido bastante divertida y dramática desde el principio. Hace miles de años, las primeras pruebas se basaban en métodos de análisis muy diferentes y primitivos y dependían en gran medida de suposiciones en base únicamente a observaciones.

4000 a.C.: según papiros desenterrados, los "médicos" babilónicos registraban observaciones de orina en tablillas de arcilla. Las primeras evaluaciones médicas egipcias también se registraron en rollos y se consideraron avanzadas. Sin embargo, el lujo de obtener un diagnóstico de enfermedad se le asignaba únicamente a los miembros de la realeza y los ricos. Los rituales y sacrificios (es decir, dioses/ demonios) generalmente se usaban para determinar la naturaleza de la enfermedad. En cualquier caso, la atención al paciente se dejaba en gran medida al azar.

300-100 a.C.: Los antiguos médicos hindúes realizaron pruebas vertiendo orina en el suelo para observar si las hormigas se sentirían atraídas por la dulzura de la orina.

Era Clásica

400–301 a.C.: El médico griego Hipócrates (460–370 a.C.), conocido como el “Padre de la Medicina”, tuvo un impacto indeleble en la cultura griega durante la era helenística que se transmitió directamente a la medicina romana. Hipócrates fue uno de los primeros médicos en interpretar el funcionamiento del cuerpo a partir de la orina, al afirmar que ningún otro sistema de órganos del cuerpo humano proporcionaba tanta información mediante su excreción como el sistema urinario, y determinó que la orina podía utilizarse como indicador pronóstico para el examen de enfermedades. 

Utilizó los sentidos humanos como los ojos y los oídos. Por ejemplo, ver sedimentos lo correlacionaba con aumento de la fiebre y ver burbujas flotando indicaba que la enfermedad se prolongaría. Hipócrates también profesó la importancia del olfato e incluso del gusto. Su hipótesis mencionaba que la orina era un filtrado de 4 fluidos corporales (humores), cada uno procedente de una región diferente del cuerpo y que cada humor era necesario para mantener el equilibrio de la salud. Una de las primeras pruebas manuales de laboratorio realizadas fue la degustación de orina para confirmando su dulzura.

101–200 d.C: Aproximadamente 6 siglos después, Aelius (Claudius) Glenus (129–216 d.C.), conocido popularmente con el nombre de Galeno, fue un médico del Imperio Romano nacido en una rica familia griega, que amplió los ideales de Hipócrates. Considerado como quizás la figura médica más grande de la época, aclaró que la orina no era un filtrado de los 4 humores conocidos (sangre, flema, bilis amarilla-bilis negra) y propuso que la orina era un filtrado sólo de la sangre. También sugirió que la ingesta de líquidos por parte de un paciente sano era proporcional a su excresión. Los escritos de Galeno fueron extensos, y sus teorías sobre la anatomía (a través de animales vivos, porque las disecciones humanas estaban prohibidas por la ley romana) guiaron la medicina hasta la Edad Media. La aceptación indiscutible de sus puntos de vista (es decir, la sangre se crea en el hígado después de ingerir alimentos y fluye hacia el lado derecho o izquierdo del corazón) dominó el pensamiento médico durante aproximadamente 1500 años, lo que desafortunadamente no promovió nuevas investigaciones con nuevas ideas. para desafiar y permitió prolongar el pensamiento improductivo......

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977- Estándares OSHA para patógenos transmitidos por la sangre

Deanna Denault; Holly Gardner. Estándares OSHA para patógenos transmitidos por la sangre. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2023 Jan. Clarkson Ave, Potsdam, NY, USA. Saint Vincent Hospital Worcester, Massachusetts, USA.

Resumen

Los patógenos transmitidos por la sangre son microorganismos infecciosos en la sangre humana que pueden provocar enfermedades graves. Los trabajadores de la salud y el personal de apoyo tienen un mayor riesgo de exposición a estos patógenos. El Occupational Safety and Health Administration (OSHA) consiste en regulaciones diseñadas para proteger a los trabajadores de la atención médica expuestos ocupacionalmente. Esta presentación repasa los elementos del Estándar de la OSHA para patógenos transmitidos por la sangre. Destaca el papel del equipo interprofesional en la reducción o eliminación del riesgo de exposición ocupacional a materiales infecciosos en una amplia gama de enfermedades.

Objetivos:

• Identificar los patógenos comunes transmitidos por la sangre y el método de transmisión. 
• Enumerar y analizar la naturaleza y la frecuencia del contacto con la sangre y el método de exposición a las enfermedades transmitidas por la sangre.
• Describir las herramientas para proteger al personal sanitario de las infecciones transmitidas por la sangre.
• Resumir los elementos del estándar de patógenos transmitidos por la sangre.

Introducción

Los patógenos transmitidos por la sangre son microorganismos que pueden causar enfermedades potencialmente mortales y representar un riesgo grave para los trabajadores de la salud en contacto con sangre u otros fluidos, incluidos semen, secreciones vaginales, saliva y fluidos serosos (pleurales, pericárdicos, peritoneales y amnióticos) transparentes o visiblemente contaminados con sangre que pueden transmitir el patógeno y causar enfermedades infecciosas. 

En el ámbito de la atención de la salud, los patógenos transmitidos por la sangre a menudo se transmiten por lesión percutánea, pinchazos accidentales, mordeduras humanas, cortes, abrasiones o por exposición mucocutánea a los fluidos del paciente infectado. En el lugar de trabajo, la principal fuente de infecciones transmitidas por la sangre son las lesiones percutáneas causadas por agujas u otros objetos punzo-cortantes. 

Especialmente propensas a la exposición, son las profesiones médicas que involucran procedimientos invasivos frecuentes, un alto volumen de sangre y urgencia de atención, trabajadores de la salud en las unidades de cirugía, medicina de emergencia, cuidados intensivos, parto y diálisis, que son los más propensos a la exposición ocupacional. Otras ocupaciones con riesgo de exposición incluyen servicios mortuorios y funerarios, mantenimiento de hospitales y trabajadores en la eliminación de desechos.

De los 20 patógenos transmitidos por la sangre que se sabe que causan enfermedades como la malaria, la sífilis y la fiebre hemorrágica, hay tres que son los patógenos más comunes y que causan preocupación:  el virus de la hepatitis B (VHB), el virus de la hepatitis C (VHC) y el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH),  Estos tres virus representan la mayoría de las infecciones adquiridas en el trabajo y están asociados con morbilidad y mortalidad significativas.  Aunque la gran mayoría de las exposiciones ocupacionales no se manifiestan en forma de enfermedad, el riesgo general de transmisión depende de forma variable de varios factores, incluidos el tipo y el tamaño del inóculo, la duración de la exposición, el título del virus y la prevalencia de la infección activa en la población.

La hepatitis B es una infección viral capaz de causar una infección crónica persistente que puede conducir a una enfermedad aguda y crónica. Es un virus hepatotrópico que se transmite a través de la sangre o el semen de individuos infectados a aquellos que carecen de inmunidad. El VHB es un problema de salud mundial y un riesgo laboral bien establecido para los trabajadores de la salud. La incidencia del VHB en la población está aumentando constantemente, y la prevalencia de la infección por VHB en los trabajadores de la salud es mucho mayor que en la población general. El virus es estructuralmente estable, permaneciendo viable e infeccioso por períodos prolongados de hasta 1 semana en las superficies.  El VHB es altamente infeccioso y se transmite de manera eficiente a través de la exposición percutánea, mucosa a sangre o fluidos corporales infecciosos. El riesgo de infección percutánea por VHB varía del 6 al 30%, según la serología de la fuente. Las vacunas para prevenir el VHB están  disponibles desde 1981 y siguen siendo el pilar de la prevención de la hepatitis B. Entre las medidas de seguridad enumeradas, el Estándar de patógenos transmitidos por la sangre exige que los empleadores aseguren la disponibilidad de esta vacuna para todos los empleados en riesgo de exposición ocupacional.

La hepatitis C, otro virus hepatotrópico, es la infección transmitida por la sangre más comúnmente reportada en los Estados Unidos y un grave problema de salud pública. El VHC se transmite principalmente a través de la exposición parenteral, más comúnmente con agujas contaminadas. La prevalencia del VHC entre los trabajadores de la salud no supera la de la población general; sin embargo, existe un mayor riesgo de exposición en el ámbito de la atención de la salud. El riesgo de transmisión cuando se expone a sangre VHC positiva es del 1,8%, considerablemente más bajo que el VHB. Los tratamientos están evolucionando con el desarrollo de nuevas terapias dirigidas. Actualmente, no existe una vacuna o profilaxis posterior a la exposición (PEP) para la infección por VHC. 

El virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) se dirige al sistema inmunitario causando el síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA). El VIH se transmite a través del contacto directo con sangre, semen, fluidos rectales, fluidos vaginales o leche materna de una persona con una carga viral detectable. En el lugar de trabajo, la transmisión ocupacional está influenciada por varios factores, incluido el volumen de sangre, el tipo de procedimiento, el tipo de lesión o la penetración percutánea. En comparación con el VHB y el VHC, el riesgo percutáneo de transmisión del VIH es el más pequeño: estimado en alrededor del 0,3%. Si bien no existe una cura para la enfermedad, existen medicamentos antivirales que retrasan la progresión. En casos de exposición, si se toman dentro de las 72 horas, la administración de medicamentos profilácticos posteriores a la exposición (PEP) son altamente efectivos para prevenir esta patpología.

Colectivamente, los patógenos transmitidos por la sangre son una amenaza para la vida humana y siguen siendo un problema de salud pública. Se estima que cada año se producen aproximadamente tres millones de exposiciones a patógenos transmitidos por la sangre. En la mayoría de los entornos de trabajo o laboratorio, las infecciones transmitidas por la sangre a menudo se deben a pinchazos accidentales. En los Estados Unidos, se estima que hay 400.000 lesiones cortantes al año en el ámbito hospitalario.

En 1991, the Occupational Safety and Health Administration (OSHA) emitio el Bloodborne Pathogens Standarden en respuesta a una preocupación mundial. Esta norma garantiza la seguridad de los trabajadores de la salud en riesgo de exposición ocupacional. Los reglamentos prescritos a los empleadores se encuentran en el Título 29 del Código de Reglamentos Federales en 29 CFR 1910.1030. El cumplimiento estricto de estas normas y directrices reducirá el riesgo, minimizará la exposición y ayudará a prevenir la transmisión de patógenos transmitidos por la sangre.

Específicamente, la norma federal exige que los empleadores hagan lo siguiente:

• Establecer y actualizar anualmente un plan de control de exposición.
• Brindar educación y capacitación inicial y anual a los trabajadores. 
• Poner a disposición la serie de vacunas contra la hepatitis B dentro de los 10 días posteriores a la asignación del empleado.
• Implementar el uso de las precauciones universales.
• Identificar y utilizar controles de ingeniería aprobados.
• Identificar y garantizar el uso de controles de prácticas laborales. 
• Uso de etiquetas y/o señales de advertencia para comunicar peligros. 
• Proporcionar equipo de protección personal (PPE) adecuado y adecuado para los empleados.
• Establezca planes de evaluación y seguimiento posteriores a la exposición fácilmente disponibles.
• Mantener registros médicos y de capacitación de los empleados.

Dado que la mayor proporción de transmisión ocupacional de patógenos sanguíneos se debió a lesiones percutáneas, en 2000 se revisó la norma para incluir the Needlestick Safety and Prevention Act (HR.5178). Como sugiere el nombre, esta revisión impuso requisitos adicionales con mayor detalle para los empleados relacionados con objetos corto-punzantes. Específicamente, requiere que los empleadores consideren e implementen nuevas tecnologías y usen dispositivos médicos efectivos y más seguros. Al considerar tecnologías más nuevas, los empleadores deben solicitar la opinión de los empleados. Por último, los empleadores están obligados a mantener un registro de lesiones corto-punzantes. La promoción del uso de agujas seguras o dispositivos sin agujas y otras intervenciones ha resultado en una disminución significativa de las lesiones percutáneas entre los trabajadores de la salud en los hospitales de EE. UU...... 

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Nueva presentación el  16 de Junio. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina