jueves, 30 de marzo de 2017

434- Pruebas nano-arrays para aire exhalado

Morad K. Nakhleh, y 50 autores màs. Diagnóstico y clasificación de 17 enfermedades en 1404 pacientes mediante el análisis de patrones moléculares exhalados. ACS Nano. 2017 Jan 24; 11(1): 112–125. Department of Chemical Engineering and Russell Berrie Nanotechnology Institute, Technion−Israel y otros
Resumen

Se presenta un array con inteligencia artificial basado en nanopartículas de oro modificadas molecularmente en una red aleatoria de nanotubos de carbono de pared simple para el diagnóstico no invasivo y la clasificación de una serie de enfermedades realizadas en muestras de aliento exhalado. El rendimiento de este nanoarray de inteligencia artificial se evaluó clínicamente con muestras de aliento recogidas en 1404 sujetos que tienen  una de las 17 diferentes patologías incluidas en el estudio contra otros pacientes que no tenían  ninguna evidencia de cualquier enfermedad (controles sanos). Los experimentos ciegos mostraron que con estos nanoarray de inteligencia artificial había un 86% de precisión, lo que permite la detección y la discriminación entre las diferentes condiciones de la enfermedad examinados. Estos análisis también demostraron que cada enfermedad tiene su propia y única huella, y que la presencia de una enfermedad no sería para descartar otras. El análisis de conglomerados mostró una potencia razonable de clasificación de las enfermedades de las mismas categorías. El efecto de los factores clínicos y ambientales en el rendimiento del nanoarray no alteró significativamente los resultados obtenidos. El poder diagnóstico y la clasificación de la nanoarray también fue validado por una técnica analítica independiente, como la cromatografía de gases con espectrometría de masas. Estos análisis demostraron que 13 especies químicas exhaladas, llamados compuestos orgánicos volátiles, están asociados con ciertas enfermedades, y la composición de este conjunto de compuestos orgánicos volátiles varían de una enfermedad a otra. En general, estos resultados podrían contribuir a uno de los criterios más importantes para la intervención médica con éxito en la era moderna, a saber: fácil de usar, de bajo costo (asequible), y son herramientas que también podrían ser utilizados para la detección personalizada, realizar un diagnóstico miniaturizado, y permitir el seguimiento de una serie de enfermedades, lo que claramente puede extender este concepto en  un mayor desarrollo.

Introduccion

Desde la antigüedad (400 años AC), los médicos aprendieron a evaluar sus pacientes mediante compuestos orgánicos volátiles exhalados  (COV), que entre otros medios, estárían vinculados a determinadas enfermedades. Por ejemplo, las heces y la orina  de infantes de la nobleza eran olfateados  a diario por sus médicos. Este enfoque se basa en el hecho de que un compendio de COV con peso molecular relativamente bajo expresa cambios distintos e inmediatos como consecuencia de procesos fisiopatológicos que ocurren por alteración del metabolismo del cuerpo. 

Resultados experimentales muestran que los COV se puede detectar directamente desde el aire exhalado, de sangre, orina y/u otros fluidos corporales.  De estos fluidos corporales, el aire exhalado es la fuente de COV más accesible y útil para el seguimiento de la salud y el trastorno corporal. Esto es porque el aire exhalado es fácil de obtener,  no es invasivo, proporciona  una matriz de baja complejidad, se puede manejar de forma segura y repitir con tanta frecuiencia como se desee……….

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(*)  Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a la traducción del mismo al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica no persigue fin de lucro alguno. Está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den al mismo. Las páginas de este blog se renuevan cada 5 días en forma automática. Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli, Bioquímico-UBA. Ciudad de Buenos Aires, Argentina




sábado, 25 de marzo de 2017

433- Fraude en la revisión de publicaciones científicas por "pares"

Charlotte J. Haug (*). Fraude en la revisiòn por pares. Hackeando el proceso de publicación científica. N Engl J Med 2015; 373:2393-2395. (*) Corresponsal  Internacional  del  N Engl J Med

En agosto de 2015, la Editorial Springer según un comunicado en su página Web retiro 64 artículos de 10 revistas de diferentes suscripción, “cuando  al realizar los controles de editorial descubre direcciones de correo electrónico falsas y en investigaciones internas posteriores  establece que los informes de revisión de pares eran fabricados"....  Sólo meses después  el BioMed Central, una editorial de acceso abierto también propiedad de Springer, retira 43 artículos mas por la misma razón.

"Esto se está convirtiendo oficialmente en una tendencia " escribió Alison McCook (Retarction Wacht) en referencia al creciente número de  publicaciones retiradas debido a revisiones por pares "fabricadas".  Desde que se informó este hecho por primera vez hace 3 años, cuando el investigador Surcoreano Hyung-in Moon admitió haber inventado direcciones de correo electrónico para que pudiera proporcionar "revisión por pares" de sus propios manuscritos, más de 250 artículos se han retirado a causa de falsas evaluaciones que son alrededor del 15% del número total de retiros..

¿Cómo es posible la revisión por pares falsa?  Hyung-in Moon , cuyo estudio versaba sobre plantas medicinales, estableció un procedimiento sencillo: entregaba a las editoriales, recomendaciones de revisores de  revistas para sus manuscritos, proporcionándoles nombres y direcciones de correo electrónico. creadas  por él .  No es sorprendente que el editor recibiera críticas favorables,  a veces en cuestión de horas después que la revisión de las solicitudes habían sido enviados. Las consecuencias de la confesión de Moon fueron que 28 artículos en diversas revistas publicadas se retiraron  y un editor tuvo que renunciar. 

Otro caso es el de Peter Chen, que era entonces un ingeniero en la Taiwan’s National Pingtung University of Education, desarrolló un esquema más sofisticado: se construyó un "anillo de revisión por pares y de citas" en el que utilizó 130 direcciones de correo electrónico falsas e identidades fabricadas para generar falsos críticas. Un editor de una de las revistas publicadas por Sage Publications comenzó a sospechar, lo que provocó una larga e integral investigación, que dio lugar al retiro de al menos  60 artículos en julio de 2014……………….



lunes, 20 de marzo de 2017

432- Discusión sobre revisión de publicaciones científicas por "pares".

Perspectiva. Michael S. Lauer, M.D., and Richard Nakamura, Ph.D. Un análisis de la revisión por pares en el NIH. N Engl J Med 2015; 373:1893-1895.  The Office of Extramural Research (M.S.L.) and the Center for Scientific Review (R.N.), National Institutes of Health, Bethesda, MD.

Desde 1946, la financiación federal de trabajos científicos en la investigación biomédica en el medio civil que esta a cargo del National Institute of Health (NIH) se ha basado en la decisión de científicos expertos en la materia sobre la base de “revisión por pares”. La financiación de la ciencia del NIH, que es la única y mayor fuente de apoyo del Gobierno de Estados Unidos  se ha reducido de manera constante desde el año 2003 (medido en dólares ajustados a la inflación) y  marcó el final de un período durante el cual el presupuesto de los NIH se había duplicado. Por lo tanto, el monto de los premios ha disminuido y es  un problema que se ha exacerbado por el crecimiento en el número de solicitudes presentadas para recibir subvenciones.  

Dado que las puntuaciones otorgada en la revisión son vistos como la principal inmediata para la falta de apoyo de un proyecto de investigación, la revisión por pares ha sido objeto de crecientes críticas por su supuesta debilidad al priorización investigaciones que tendrían el mayor impacto. Para evaluar esa crítica, primero tenemos que tener en cuenta lo que entendemos por impacto científico. Aunque es posible ver el impacto de las inversiones de los NIH en el transcurso de 70 años, es difícil medir el impacto en una escala de tiempo que sea útil para mejorar la selección de los proyectos para otorgar los premios. 

Idealmente, cualquier método para evaluar el desempeño en la revisión por pares y con ello garantizar el impacto científico posible, debe ser viable, medible, objetivo, pertinentes a los resultados, y capaz de ser aplicado en el momento oportuno. Aunque se han propuesto varios marcos, la actual ausencia de criterios de referencia para la evaluación de la revisión por pares del impacto científico ello indica la dificultad del problema. Por otra parte, la investigación se ha hecho mucho menos en la revisión por pares de las solicitudes de subvención, que en la revisión por pares de los manuscritos considerados para la publicación en una revista.

Recientemente, Ioannidis y Khoury propusieron un enfoque "PQRST" para medir el impacto, donde "P" se refiere a la productividad, medida en tèrminos de publicación de los principales resultados de los ensayos registrados y el número de artículos que estén ubicados en  la parte superior de la distribución porcentual de cuanto al número de citaciones estandarizadas por área, año de publicación, y tipo de artículo. "Q" es sinónimo de calidad en la escalas validadas, "R" su reproducibilidad, "S" es el intercambio de datos y otros recursos, y "T" es la influencia de la traducción.  Sin embargo, las medidas bibliométricos son controvertidos. 

Los críticos argumentan que la mayor concentración en el número de publicaciones, la cantidad de citación, y de impacto de revistas producen factores distorsionadas, y los incentivos son perjudiciales para científicos, universidades y editores de revistas, lo que lleva a la profusión de la ciencia sub-óptima, no reproducible. Los autores sostienen que no hay pruebas de que cuando se consideran cuidadosamente  por área temática, tales medidas no proporcionan información valiosa. .........


(*)  Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a la traducción del mismo al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica no persigue fin de lucro alguno. Está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den al mismo. Las páginas de este blog se renuevan cada 5 dìas en forma automática. Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli, Bioquímico-UBA. Ciudad de Buenos Aires, Argentina

miércoles, 15 de marzo de 2017

431- Leucemias de origen raro

Anna Porwit,  Marie C. Béné . Leucemias agudas de linaje ambiguo. Oxsford Academic. American Journal of Clinical Pathology Am J Clin Pathol September 2015;144:361. Department of Laboratory Medicine and Pathobiology, University Health Network, University of Toronto, Toronto, Canada, and 2Immunology. Laboratory, University Hospital of Nancy-Brabois, Nancy, France

Objetivos: Esta sesión de la Society for Hematopathology/European Association for  Hemato-pathology Worshop  se focalizo en  las leucemias agudas de origen ambiguo.

Métodos: Brindamos una visión general de una combinación de fenotipos de leucemia aguda (MPAL) como se reconoce actualmente en la clasificación de la Organización Mundial de la Salud (OMS ) y un resumen  sobre  criterios diagnósticos para las categorías principales de MPAL: B/mieloides, T/ mieloides,  B/T y B/T/ mieloide.

Resultados: La mayoría de los casos MPAL presentados fueron B/mieloides, y T/mieloides, pero también se presentaron tres casos de MPAL B/T y se ilustran ejemplos de todas estas categorías. Hacemos hincapié en que se requiere un enfoque integral para el inmunofenotipeo para poder establecer con precisión el diagnóstico de MPAL.  El  inmunofenotipeo  por citometría de flujo utiliza un  gran panel de anticuerpos, así como también son necesarios estudios de análisis de inmunohistoquímica y citoquímica confirmatorias con mieloperoxidasa y esterasa no específica. Se discuten los problemas técnicos de la determinación de linaje y posibles dificultades en el diagnóstico MPAL. En particular, los casos raros de leucemia linfoblástica aguda B  (B-All)  pueden expresar mieloperoxidasa, pero  por lo demás son consistentes con  B-ALL y debe ser tratado como tal. Por último, se revisa el diagnóstico diferencial entre la leucemia aguda indiferenciada y la leucemia mieloide aguda con diferenciación mínima.

Conclusiones: Se ha establecido  un acuerdo de que el diagnóstico de MPAL puede ser un reto, especialmente cuando los paneles de anticuerpos utilizados en citometría de flujo no son lo suficientemente amplios.

¿Cuál es la definición de la leucemia aguda de origen ambiguo?

En la clasificación de 2008 la OMS, se definieron las leucemias agudas de linaje ambiguo como leucemias que no muestran ninguna evidencia clara de diferenciación a lo largo de un único linaje. El reconocimiento de la leucemia aguda de linaje ambiguo requiere un extensivo y multi-parametrico fenotipeo con citometria de flujo (CF) para describir  las características específicas de estas enfermedades . 

En casos extremadamente raros de leucemia aguda indiferenciada (AUL), aunque se han investigado los marcadores de todos los linajes, no se detecta ninguna expresión significativa en células blásticas con excepción de CD34 y/o HLA-DR (presente en la mayoría de estos casos). Una segunda aparición, ligeramente más frecuente es  la súbita aparición  de  células marcadas con  varios anticuerpos monoclonales, reconociendo  antígenos expresados normalmente en diferentes linajes. Anteriormente las llamadas leucemias agudas bifenotípicas (LBA), han cambiado de nombre por el de leucemia aguda fenotipo-mixto (MPAL). 

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viernes, 10 de marzo de 2017

430- Leucemia mieloide aguda

Yu MG, Zheng HY. Leucemia mieloide aguda:  avances  en el diagnóstico y tratamiento. Chin Med J (Engl). 2017; 130(2): 211-218. Beijing Key Laboratory of Pediatric Hematology Oncology; National Key Discipline of Pediatrics, Ministry of Education; Key Laboratory of Major Diseases in Children, Ministry of Education, Hematology Oncology Center, Beijing Children's Hospital, Capital Medical University, Beijing China.

Objetivo:  La leucemia es el cáncer pediátrico más común y una causa importante de morbilidad y mortalidad en los niños. Entre todos los subtipos, existe una falta de consenso en cuanto al diagnóstico y tratamiento de esta patología (LMA). Las tasas de supervivencia de los pacientes se han mantenido bajas durante las últimas tres décadas.  Recientemente, la terapia dirigida ha emergido como un tratamiento prometedor.

Fuente de los datos: Se realizaron búsquedas en la base de datos PubMed de artículos de investigación publicados recientemente sobre el desarrollo en el diagnóstico,  terapia de destino, y otras terapias novedosas de en la LMA. La información sobre ensayos clínicos se obtuvo de ClinicalTrials.gov. Para el propósito principal de esta presentación que es delinear el último desarrollo terapéutico de la LMA, se presentan solamente  una lista de ensayos clínicos en curso como referencia. Sin embargo, también se mencionaron los resultados publicados de ensayos clínicos completos.

Selección de los estudios:  Este artículo revisa los últimos desarrollos relacionados con el diagnóstico y  tratamiento de la LMA. En la primera parte, hemos proporcionado algunas ideas novedosas sobre la base molecular de la LMA así como se presenta una actualización de la Clasificación de la LMA. En la segunda parte, se resumieron los resultados de la investigación sobre agentes terapéuticos potenciales moleculares que incluyen anticuerpos monoclonales, inhibidores de la tirosina quinasa / FMS tirosina quinasa 3 (FLT3), epigenética /agentes de desmetilación, y agentes terapéuticos celulares. También vamos a poner de relieve la investigación en curso y los ensayos clínicos en la LMA pediátrica.

Resultados:  Describimos la evolución clonal y cómo ha cambiado nuestra opinión sobre la leucemia, la respuesta al tratamiento, y la recaída de la enfermedad.  El mapeo genómico-pediátrico específico se discutió con un método de diagnóstico de novedosos novedoso resaltados. En la parte posterior de esta revisión, se resumieron las investigaciones sobre posibles agentes terapéuticos moleculares que incluyen anticuerpos monoclonales, inhibidores de la tirosina quinasa FLT3 / epigenética, el /los agentes de desmetilación, y agentes terapéuticos celulares.

Conclusión: Las técnicas de secuenciación de genes deben fijar las bases de los métodos de diagnóstico de la próxima generación de AML, y apuntar a la terapia debe ser el foco de la investigación clínica futuro en la exploración de las posibilidades terapéuticas.

Introducción

La leucemia mieloide aguda (LMA) es un tumor maligno hematológico heterogéneo caracterizado por muy diversas anomalías genéticas y epigenéticas. Los diagnóstico tradicional de la LMA dependen de la morfología, la inmunología, la citogenética, su biología molecular y clasificación (“MICM). A medida que los avances en las tecnologías de secuenciación están ocurriendo en casi todas las disciplinas natural y científica, la base de las decisiones clínicas se está desplazando progresivamente a partir de la primera "M" a la última "M." de la MICM. Sin embargo, debido a la heterogeneidad y las posibles interacciones gen-gen, todavía estamos explorando el paisaje genético y sus implicaciones pronosticas en la LMA correspondiente. 

Papaemmanuil et al. han publicado recientemente un análisis exhaustivo de los genes de leucemia en un total de 1540 pacientes con LMA. Se propuso una clasificación genómica actualizado que identificó tres nuevos subgrupos:  LMA con cromatina mutada, los genes de ARN de empalme, o ambos;  LMA con proteína tumoral p53 ( TP53 ) mutaciones, aneuploidía cromosómica, o ambos;  y LMA con mutaciones  isocitrato deshidrogenasa 2 ( IDH2 R172 ) mutaciones,  y no hay otras lesiones con clases definidas.


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domingo, 5 de marzo de 2017

429- Corrigiendo las deficiencia de hierro

Jonathan Baird-Gunning y Jonathan Bromley. Corrección de la deficiencia de hierro. Aust Prescr. 2016; 39(6):193-199. Register Acute General Medicine, and Consultant physician, Gastroenterologist and General Medicine, Canberra Hospital

Resumen

La deficiencia de hierro es la causa más común de anemia. Tiene muchas causas diferentes, por lo que se necesitan más investigaciones para establecer una etiología subyacente. El estudio inicial incluye la medición de hierro sérico, ferritina, transferrina y saturación de transferrina. La ferritina sérica es normalmente un indicador adecuado de las reservas de hierro, pero pueden aumentar por la inflamación en un grado no aceptable para evaluar la deficiencia de hierro. El tratamiento de primera línea más adecuada en la mayoría de los pacientes es su reemplazo por vía oral pero su  eficacia puede estar limitada por la poca aceptación del paciente debido a sus efectos gastrointestinales y a  la necesidad de un tratamiento prolongado para reponer las reservas de hierro del organismo. Preparados de hierro por vía intravenosa se indican cuando la terapia con hierro por vía oral ha fallado o se requiere su rápida reposición. El carboximaltosa férrico puede entregar rápidamente una gran dosis de hierro, por lo que es la preparación de elección para los pacientes ambulatorios. A pesar de sus excelentes perfiles de seguridad, todos los preparados de hierro por vía intravenosa un determinado riesgo de anafilaxis y por lo tanto los pacientes requieren  un monitoreo y acceso a instalaciones de reanimación.

Introducción

En 2010, la prevalencia mundial de la anemia era del 32,9% y la causa mas común es la deficiencia de hierro.  Existen pocos estudios poblacionales que analizan la prevalencia de la deficiencia de hierro y los datos epidemiológicos puede tener defectos metodológicos porque la anemia generalmente es atribuida a la deficiencia de hierro.  La anemia como un indicador indirecto de la  deficientes de hierro se puede estimar en la mayoría de los niños en edad preescolar en los países no industrializados y en una proporción significativa de los países industrializados.

En Australia la prevalencia de la deficiencia de hierro varía en función de la población en estudio. Afecta aproximadamente al 10% de las mujeres jóvenes que no están embarazadas, y se estima que es altamente prevalente en las comunidades indígenas.  Otros grupos de riesgo para la deficiencia de hierro incluyen los muy jóvenes y los muy viejos, y las personas con patrones dietéticos restringidos como los vegetarianos y veganos.

Deficiencia de hierro

El hierro juega un papel clave en múltiples vías metabólicas incluyendo la respiración, la producción de energía, la síntesis de ADN y la proliferación celular. Las consecuencias clínicas de la deficiencia de hierro sin tratar son diversos e incluyen fatiga, exacerbaciones de ciertas enfermedades como la angina de pecho, trastornos neuroconductuales como el síndrome de piernas inquietas y el deterioro cognitivo en los niños. Esta deficiencia se puede atribuir a múltiples causas subyacentes y para determinar su etiológia los pacientes deben ser investigados de acuerdo con las directivas existentes 

Los pacientes con deficiencia de hierro pueden subdividirse en:

·     Deficiencia de hierro absoluta:  es debida a la insuficiencia de las reservas de hierro
·     Deficiencia funcional de hierro: cuando la demanda de un aumento de la eritropoyesis sobrepasa temporalmente el suministro
·  Secuestro: cuando las reservas de hierro existentes son suficientes, pero dejan de estar disponibles. El secuestro suele ser una consecuencia del estados de enfermedad proinflamatorias tales como la enfermedad renal crónica, la autoinmunidad, las infecciones y los tumores malignos. El reemplazo de hierro no es necesaria y es potencialmente dañino.

Estos mecanismos no son mutuamente excluyentes y la Gastroenterology Society of Australia ha elaborado Directivas para realizar una apropiada investigación...........

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