1081-Virus de la Hepatitis D (Delta)

Calvin Pan, Robert Gish, Ira M. Jacobson, Ke-Qin Hu, Heiner Wedemeyer, Paul Martin. Diagnóstico y tratamiento de la infección por el virus de la hepatitis Delta. Dig Dis Sci. 2023; 68(8): 3237–3248. Guangzhou Eighth People’s Hospital, Guangzhou Medical University, Guangzhou, China. Gastroenterology and Hepatology, NYU Langone Health, NYU Grossman School of Medicine, New York, USA

Resumen  (ChatGPT)

El artículo ofrece una descripción general completa de los conocimientos y las estrategias actuales para abordar la infección por el virus de la hepatitis delta (VHD). El VHD es un virus defectuoso que requiere del virus de la hepatitis B (VHB) para su replicación, lo que da lugar a una forma más grave de hepatitis. El resumen abarca diversos aspectos de la infección por VHD, como la epidemiología, las vías de transmisión y las manifestaciones clínicas que a menudo exacerban la infección subyacente por VHB. Se destacan los métodos de diagnóstico, haciendo hincapié en la importancia de las pruebas serológicas y las técnicas moleculares para una detección precisa. Se analizan en detalle las estrategias de tratamiento, centrándose en la eficacia limitada de las terapias antivirales actuales contra el VHD y el papel potencial de los nuevos enfoques de tratamiento que se están investigando. El artículo también aborda desafíos como la falta de medicamentos antivirales específicos dirigidos al VHD y la necesidad de esfuerzos globales para mejorar el diagnóstico y los resultados del tratamiento. En general, el artículo subraya la complejidad de la infección por VHD y los esfuerzos en curso para mejorar las capacidades de diagnóstico y las opciones terapéuticas para un mejor manejo clínico.

Resumen

............" El virus de la hepatitis D (VHD) depende del virus de la hepatitis B (VHB) para entrar y salir de los hepatocitos y replicarse. A pesar de esta dependencia, el VHD puede causar enfermedad hepática grave. El VHD acelera la fibrosis hepática, aumenta el riesgo de carcinoma hepatocelular y acelera la descompensación hepática en comparación con la monoinfección crónica por VHB. The Chronic Liver Disease Foundation (CLDF) formó un panel de expertos para publicar pautas actualizadas sobre las pruebas, el diagnóstico y el tratamiento del virus de la hepatitis delta. El grupo del panel realizó una revisión de datos de la red sobre la transmisión, la epidemiología, la historia natural y las secuelas de la enfermedad de la infección aguda y crónica por VHD. Con base en la evidencia disponible actual, proporcionamos recomendaciones para la detección, las pruebas, el diagnóstico y el tratamiento de la infección por hepatitis D y revisamos los próximos agentes novedosos que pueden ampliar las opciones de tratamiento. La CLDF recomienda la detección universal del VHD para todos los pacientes que son positivos al antígeno de superficie de la hepatitis B. La detección inicial debe realizarse con un ensayo para detectar anticuerpos generados contra el VHD (anti-VHD). Los pacientes que dan positivo en la prueba de anticuerpos IgG anti-VHD deben someterse a una prueba cuantitativa de ARN del VHD. También proporcionamos un algoritmo que describe las recomendaciones de CLDF sobre la detección, el diagnóstico, las pruebas y el tratamiento inicial de la infección por hepatitis D.

Introducción

El virus de la hepatitis D (VHD) es un virus hepatotrópico que causa enfermedad hepática aguda y crónica. El VHD se describe de diversas formas como un “virus satélite”, un “virus incompleto” o un “virus defectuoso” porque solo puede completar su ciclo de vida con la ayuda del virus de la hepatitis B (VHB). El VHD depende del VHB para entrar en la célula y requiere enzimas del huésped para replicarse y, después de replicarse, también se requiere el VHB para que el virión completo del VHD se libere de los hepatocitos infectados .

A pesar de ser un virus “defectuoso”, el HDV puede causar enfermedad hepática grave. La infección crónica por HDV causa enfermedad hepática más grave que la monoinfección crónica por VHB, acelera la fibrosis hepática  aumenta el riesgo de carcinoma hepatocelular y conduce a una descompensación hepática más temprana que en pacientes infectados solo con VHB. En nuestra opinión, a diferencia del VHB y el virus de la hepatitis C (VHC), hay muy pocas manifestaciones hepáticas adicionales que sean clínicamente importantes.

Lamentablemente, el impacto clínico del VHD a menudo se ha pasado por alto. En referencia a la epidemiología del VHD en los Estados Unidos, la  Hepatitis B Foundation ha señalado que “la escasa concienciación, las pruebas y la falta de inclusión en la lista de enfermedades de declaración obligatoria contribuyen a la imagen poco clara de la prevalencia del VHD en los EE. UU.”. La falta de concienciación de la carga significativa del VHD ha llevado a subestimar la importancia de las pruebas de detección del VHD entre los pacientes con infección por VHB. Los médicos que desean realizar pruebas de detección del VHD pueden no estar al tanto de la vía de prueba adecuada y pueden tener dificultades para acceder incluso a las pruebas de anticuerpos, mucho menos a las pruebas de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) confirmatorias, o para conocer los umbrales de sensibilidad para dichas pruebas. Además, los médicos pueden tener dificultades para seleccionar pruebas de detección y confirmación debido a su complejidad y disponibilidad limitada, lo que conduce aún más al infradiagnóstico de la infección por VHD.

El tratamiento del VHD sigue siendo un desafío porque los pacientes suelen presentar una enfermedad avanzada, las opciones de tratamiento actuales son limitadas, con bajas tasas de eficacia y una toxicidad significativa, y, a diferencia del tratamiento para el virus de la hepatitis C (VHC), es posible una recaída tardía incluso cuando las pruebas virológicas son negativas 24 semanas después de la terapia antiviral. Además, hasta el momento la FDA no ha aprobado ningún tratamiento específicamente para el tratamiento de la infección por VHD....... .

Leer el articulo completo

(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. 
Nueva presentación el 28 de Julio. 
Cordiales saludos. Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

1080- Coccidioidomicosis: revisiòn

Royce H Johnson, Rupam Sharma, Rasha Kuran, Isabel Fong, Arash Heidari. Coccidioidomicosis: una revisión. BML-J Investig Med. 2021; 69(2): 316–323. Infectious Diseases, Kern Medical Center, Bakersfield, California, USA.

Resumen (ChatGPT)

El artículo proporciona una descripción general completa de la coccidioidomicosis, una infección fúngica causada por especies de Coccidioides, particularmente prevalente en las regiones áridas de las Américas. La revisión cubre la epidemiología, manifestaciones clínicas, diagnóstico, tratamiento y prevención de la enfermedad. Destaca la creciente incidencia de coccidioidomicosis debido a factores como el cambio climático y el movimiento de población hacia zonas endémicas. La presentación clínica varía desde síntomas respiratorios asintomáticos o leves hasta una enfermedad diseminada grave, lo que plantea desafíos en el diagnóstico y tratamiento. La terapia antimicótica sigue siendo la base del tratamiento, y los agentes más nuevos se muestran prometedores en casos graves. La revisión también analiza medidas preventivas, incluidas estrategias de salud pública y posibles vacunas en desarrollo. En general, destaca la importancia de la concientización entre los profesionales de la salud y el público para mitigar el impacto de esta infección fúngica emergente.

Resumen

......" La coccidioidomicosis es una infección fúngica del hemisferio occidental que es endémica del suelo en áreas con precipitaciones limitadas. Las infecciones humanas y animales se producen por inhalación de artroconidias. En la mayoría de los casos, se trata de un evento asintomático. Cuando ocurre una enfermedad, es principalmente una presentación neumónica. Una pequeña minoría de infecciones termina en enfermedad diseminada. Predominantemente se presenta como meningitis o enfermedad osteoarticular o tegumentaria. Es posible que no se requiera tratamiento para la enfermedad más leve. Generalmente se prescriben azoles. Las infecciones graves pueden requerir anfotericina B"

Introducción

La coccidioidomicosis (CM) es una infección fúngica diatérmica dimórfica endémica del hombre y los animales, exclusiva del hemisferio occidental. La enfermedad se describió por primera vez en Argentina y posteriormente en California. Es principalmente una enfermedad neumónica que a menudo se confunde con la neumonía adquirida en la comunidad (NAC). En una pequeña minoría, la enfermedad puede diseminarse prácticamente a cualquier parte del cuerpo. Los sitios incluyen tejidos blandos, huesos, articulaciones y meninges.

El diagnóstico se realiza habitualmente mediante pruebas serológicas. La sensibilidad y especificidad de estas pruebas varían ampliamente entre laboratorios, especialmente en las infecciones primarias tempranas (falsos negativos). El tratamiento actual consiste en compuestos de anfotericina B (AmB) y azoles. El fluconazol es el azol más utilizado. Los fracasos del fluconazol dan lugar al uso de prácticamente todos los azoles introducidos posteriormente y de AmB como tratamiento de rescate.

Epidemiología

Las especies de Coccidioides se encuentran en el suroeste de los Estados Unidos y el norte de México. Se encuentran focos adicionales en Utah, el este de Washington y América Central y del Sur. Incluso en las áreas más endémicas, el hongo está escasamente distribuido. Se lo ha encontrado comúnmente asociado con basurales de animales y humanos. 

La CM es infecciosa, pero no contagiosa. Se reconoce que en los Estados Unidos hay más de 150.000 infecciones al año. El 60% de las infecciones son asintomáticas y el 40% tienen una enfermedad similar a la gripe o neumónica. De estas últimas, una cuarta parte se diagnostica. Aproximadamente el 1% del total de infecciones se disemina. La infección tiene una estacionalidad, como se ha informado en California y Arizona. En California, la incidencia más alta se produce en otoño. Entre 1992 y 1995 hubo un gran aumento de casos en el sur del Valle de San Joaquín. Los casos notificados disminuyeron posteriormente, pero nunca alcanzaron las cifras anteriores a 1992. 

En la última década, ha habido un aumento constante de los casos notificados año tras año. Parte de este aumento puede deberse al aumento de la población, al aumento de la perturbación del suelo (construcción), a los cambios en las definiciones de casos (solo se notifican en laboratorio) y al aumento de los diagnósticos. Con toda probabilidad, todos estos factores no explican más que una minoría del aumento de las cifras. La incidencia anual de infecciones en las personas que viven en las zonas más endémicas (sur de Arizona y sur del valle central de California) es probablemente del 1% al 3%. La MC se encuentra cada vez más en personas que viven fuera de la zona endémica debido al aumento de los viajes de ocio y de trabajo.

Micología y patogénesis.

La Coccidioides fue descrita originalmente como una especie Coccidioides immitis  Más recientemente, el análisis genético ha definido dos especies separadas con distribuciones geográficas relativamente distintas. C. immitis se encuentra principalmente en California pero también en el estado del este de Washington. Prácticamente todos los casos en Texas y América Central y del Sur son C. posadasii . En este momento, no ha habido diferencias claras en el comportamiento fenotípico de las dos especies.

La Coccidioides requiere nutrientes animales para crecer; por lo tanto, su distribución natural está restringida en gran medida a áreas donde previamente habitaron humanos o animales, particularmente pequeñas madrigueras de roedores. Crecen micelios en el suelo (y en medios de laboratorio).. Después de un período variable, los micelios se septan y producen esporas conocidas como artroconidias. Las tabiques delgadas son frágiles y las artroconidias se transportan por el aire con una mínima alteración del suelo (viento y excavación). Las artroconidias pueden viajar 75 millas y en ocasiones una distancia mucho mayor. La infección casi siempre se debe a la inhalación de artroconidias.

La mayoría de estas inhalaciones no producen infección (no tenemos datos al respecto) o producen infecciones asintomáticas que se manifiestan como conversión de la prueba cutánea (60% de las infecciones).  Si no se controla, el artroconidio, bajo el efecto de la temperatura y otros factores, se transforma en esférulas que posteriormente se dividen internamente en endosporas. Con la lisis de las esférulas, las endosporas se liberan y se convierten en esférulas, lo que da lugar a la propagación exponencial del patógeno.......

Leer el articulo completo

(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. 
Nueva presentación el 25 de Julio. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

1079- Histoplasmosis pulmonar

Nicolas Barros, Joseph L. Wheat, Chadi Hage David S. Perlin, Academic Editor. Histoplasmosis pulmonar: actualización clínica.MDPI-J Fungi (Basel). 2023; 9(2): 236. Department of Medicine, Indiana University School of Medicine, Indianapolis, USA

Resumen (ChatGPT)

El artículo, brinda una descripción general de la histoplasmosis pulmonar, centrándose en los avances clínicos recientes y la comprensión de la enfermedad. La histoplasmosis es causada por el hongo Histoplasma capsulatum y afecta principalmente a los pulmones, aunque puede en casos graves extenderse a otros órganos..

La actualización cubre varios aspectos:

1) Epidemiología : Prevalencia y distribución de la histoplasmosis a nivel mundial, destacando las regiones endémicas donde el hongo prospera en suelos enriquecidos con excrementos de aves o murciélagos.

2) Presentación clínica : Descripciones detalladas de cómo se manifiesta clínicamente la histoplasmosis, incluidos síntomas como fiebre, tos, dolor en el pecho y, en casos graves, dificultad respiratoria.

3) Métodos de diagnóstico : Avances en las técnicas de diagnóstico, incluido el uso de pruebas serológicas, métodos moleculares como PCR y estudios de imágenes como radiografías de tórax y tomografías computarizadas para confirmar la afectación pulmonar.

4) Estrategias de tratamiento : opciones de tratamiento actuales, con énfasis en medicamentos antimicóticos como azoles y anfotericina B, adaptados a la gravedad de la infección y al estado inmunológico del paciente.

5) Pronóstico y complicaciones : debates sobre el pronóstico de la histoplasmosis pulmonar, posibles complicaciones como secuelas pulmonares crónicas y conocimientos sobre el manejo de los resultados a largo plazo.

En general, el artículo tiene como objetivo actualizar a los médicos y bioquimicos sobre los últimos conocimientos de la histoplasmosis pulmonar, ofreciendo información sobre el diagnóstico, el tratamiento y las estrategias de manejo para mejorar los resultados de los pacientes.

Resumen

…..” El Histoplasma capsulatum, agente etiológico de la histoplasmosis, es un hongo dimórfico que crece como moho en el medio ambiente y como levadura en los tejidos humanos. Las áreas de mayor endemicidad se encuentran dentro de los valles de los ríos Mississippi y Ohio en América del Norte y partes de América Central y del Sur. Las presentaciones clínicas más comunes incluyen histoplasmosis pulmonar, que puede parecerse a la neumonía adquirida en la comunidad, tuberculosis, sarcoidosis o neoplasia maligna; sin embargo, ciertos pacientes pueden desarrollar afectación mediastínica o progresión a enfermedad diseminada. Comprender la epidemiología, la patología, la presentación clínica y el desempeño de las pruebas de diagnóstico es fundamental para un diagnóstico exitoso. Si bien la mayoría de los pacientes inmunocompetentes con histoplasmosis pulmonar aguda o subaguda leve deben recibir tratamiento, todos los pacientes inmunocomprometidos y aquellos con enfermedad pulmonar crónica o enfermedad diseminada progresiva también deben recibir tratamiento. La anfotericina B liposomal es el agente de elección para la enfermedad grave o diseminada, y el itraconazol se recomienda en casos más leves o como terapia "regresiva" después de la mejoría inicial con anfotericina B. En esta revisión, analizamos la epidemiología, la patología, el diagnóstico y la evolución actuales. presentaciones clínicas y tratamiento de la histoplasmosis pulmonar".

1- . Introducción

El Histoplasma es un hongo dimórfico que crece como moho en el medio ambiente y como levadura en los tejidos humanos. La histoplasmosis humana es causada por dos organismos distintos: Histoplasma capsulatum var. capsulatum e Histoplasma capsulatum var. duboisii . Mientras que H. capsulatum var. duboisii ocurre exclusivamente en África, el H. capsulatum var. capsulatum ha sido identificado en todos los continentes excepto en la Antártida . En este estudio, describiremos los síndromes pulmonares asociados con H. capsulatum var. capsulatum , al que nos referiremos como Histoplasma capsulatum .

En América del Norte, las áreas de mayor endemicidad incluyen los valles de los ríos Mississippi y Ohio en el centro y este de los Estados Unidos. En estas áreas, se estima que la incidencia es de 6,1 casos por 100 000, y entre el 80 y el 90 % de la población estará expuesta a la histoplasmosis durante su vida. En las últimas décadas, las alteraciones ambientales, el cambio climático, el aumento de los viajes y la conectividad y el aumento de las condiciones inmunosupresoras han provocado cambios en la epidemiología de la histoplasmosis. Un estudio reciente ha demostrado que un número significativo de pacientes están siendo diagnosticados con histoplasmosis fuera de las distribuciones geográficas históricas.

La histoplasmosis también es endémica de América Central y del Sur, donde la prevalencia de la infección puede ser superior al 30% . Existe una amplia variabilidad regional con una seroprevalencia del 0,1% en Chile, 20% en Perú, 35-40% en Argentina y casi el 90% en ciertas áreas de Brasil.

La llegada de la pandemia del VIH ha puesto de relieve la epidemiología de la histoplasmosis, ya que los pacientes que viven con el VIH tienen un mayor riesgo de padecer una enfermedad sintomática. Se desconoce la incidencia de histoplasmosis sintomática en América Central y del Sur, ya que muchos casos se diagnostican erróneamente como tuberculosis. Sin embargo, los datos de modelización sugieren incidencias de hasta 1,5 casos por cada 100 personas que viven con el VIH. 

Esto es particularmente importante ya que la histoplasmosis diseminada ocurre en aproximadamente 2 a 5% de los pacientes con VIH avanzado, y en algunos países, incluidos Guyana Francesa y Colombia, la histoplasmosis diseminada es la enfermedad más común que define el SIDA. Un mejor acceso a la terapia retroviral activa invariablemente disminuye la morbilidad y mortalidad de la histoplasmosis.En China, el 75% de los casos notificados se produjeron en la cuenca del río Yangtze. La prevalencia de la reactividad de la prueba cutánea de histoplasmina oscila entre el 6% y el 50% . El sudeste asiático también es una zona hiperendémica, con una prevalencia de hasta el 33%.

Si bien el Histoplasma está ampliamente distribuido en todo el mundo, la falta de acceso universal a pruebas de diagnóstico sensibles probablemente lleve a una gran subestimación de la verdadera carga de enfermedad......

Leer el articulo completo

(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. 
Nueva presentación el 20 de Julio. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

1078- Mecanismos fúngicos de supervivencia

Peter V. Stuckey, Writing, Felipe H. Santiago, Karen M. Ottemann, Editor. Mecanismos fúngicos de supervivencia intracelular: ¿qué podemos aprender de los patógenos bacterianos?. Infect Immun. 2023; 91(9): e00434-22. Department of Biological Sciences, University of Notre Dame, Indiana, USA.

Resumen (Chat GPT)

El artículo explora los paralelismos entre las estrategias fúngicas y bacterianas para sobrevivir dentro de las células huésped. Revisa cómo los hongos, tradicionalmente considerados patógenos extracelulares, han desarrollado mecanismos similares a los de las bacterias patógenas para persistir dentro de las células huésped. Los autores analizan las adaptaciones de los hongos, como la evasión de las respuestas inmunitarias del huésped, la modulación de la maduración del fagosoma y la explotación de los nutrientes del huésped. Al hacer comparaciones con estrategias de supervivencia intracelular bacteriana, el artículo tiene como objetivo profundizar nuestra comprensión de la patogénesis de los hongos y potencialmente identificar nuevos objetivos terapéuticos contra sus infecciones.

Resumen

....." Las infecciones por hongos representan una amenaza importante para la salud pública, aunque desatendida, con graves cargas médicas y económicas a nivel mundial. Con tasas de mortalidad inaceptablemente altas, los hongos patógenos invasivos son responsables de millones de muertes cada año, con una incidencia en constante aumento principalmente en personas inmunocomprometidas. Las escasas opciones terapéuticas y el aumento de la resistencia a los fármacos antimicóticos plantean desafíos adicionales para controlar estas infecciones. Estos hongos patógenos se han adaptado para sobrevivir dentro de huéspedes mamíferos y pueden establecer nichos intracelulares para promover la supervivencia dentro de las células inmunes del huésped. Para ello, han desarrollado diversos métodos para burlar el ataque del sistema inmunológico innato. Esto incluye estrategias como alterar su morfología, contrarrestar la acción antimicrobiana de los macrófagos y la adaptación metabólica. Esto recuerda cómo los patógenos bacterianos se han adaptado para sobrevivir dentro de las células huésped y causar enfermedades. Sin embargo, en relación con la gran cantidad de información disponible sobre la patogénesis bacteriana intracelular, se sabe menos sobre los mecanismos que emplean los hongos patógenos. Por lo tanto, aquí revisamos nuestro conocimiento actual y los avances recientes en nuestra comprensión de cómo los hongos pueden evadir y persistir dentro de las células inmunes del huésped. Esta revisión se centrará en los principales hongos patógenos, incluidos Cryptococcus neoformans, Candida albicans y Aspergillus fumigatus, y el Histoplasma entre otros. A medida que descubrimos y entendemos las estrategias utilizadas por estos hongos, las similitudes con sus homólogos bacterianos se vuelven evidentes, por lo que podemos utilizar la abundante información de las bacterias permite guiar nuestros estudios en hongos. Al comprender estas estrategias, se abrirán nuevas líneas de investigación que pueden mejorar los tratamientos de estas devastadoras enfermedades fúngicas".

Introducciòn

Muchos de los microbios patógenos más exitosos en la historia humana se consideran patógenos intracelulares porque pueden sobrevivir, e incluso prosperar, dentro de las células huésped. Descifrar los mecanismos utilizados por los patógenos intracelulares, como Salmonella , Mycobacterium, Legionella  Listeria o Yersinia , para sobrevivir en las células huésped ha mejorado el manejo de sus infecciones. Además, la identificación de su nicho intracelular también ha descubierto una biología novedosa, que abarca desde los mecanismos de defensa del huésped, hasta los sistemas de secreción microbiana, pasando por la biología celular del citoesqueleto. 

Sin embargo, estos avances se han restringido principalmente al campo bacteriano y, en comparación, se sabe menos sobre las estrategias utilizadas por los patógenos fúngicos para sobrevivir intracelularmente. Aunque algunos de estos microbios son patógenos intracelulares obligados mientras que otros también pueden vivir de forma independiente, los beneficios de poder sobrevivir intracelularmente son los mismos para todos: acceso a nutrientes, evasión del sistema inmunológico, transporte libre a través de barreras celulares y diseminación sistémica, por mencionar algunos. 

El más obvio de los beneficios sería la supervivencia dentro de los fagocitos, las células inmunes destinadas a matar microbios, que inician respuestas inmunes y eventualmente controlan y eliminan la infección. Si nos centramos en los macrófagos y consideramos que todos los microbios se enfrentarían al mismo entorno y condiciones dentro de estas células huésped, no es sorprendente que encontremos muchas similitudes en las estrategias que emplean los microbios para sobrevivir. 

De hecho, todos los principales patógenos bacterianos intracelulares utilizan uno o más de los siguientes: detención de la maduración del fagosoma, remodelación de las membranas fagosomales, lisis del fagosoma o modulación de la acidificación fagosomal. Sostenemos que tanto las limitaciones evolutivas como las funcionales han limitado el número de mecanismos empleados por los patógenos intracelulares para sobrevivir dentro de los macrófagos. 

En los últimos años, se han identificado estrategias similares a las utilizadas por las bacterias en varios hongos. Al mismo tiempo, las grandes diferencias genéticas y fenotípicas entre bacterias y hongos han dado lugar a estrategias específicas para cada grupo. En cualquier caso, comprender las estrategias utilizadas por los microbios patógenos para causar enfermedades permitirá el desarrollo de nuevos tratamientos que se dirijan a dichas estrategias y las bloqueen. Esto es de suma importancia para las infecciones fúngicas, que son una de las enfermedades infecciosas más desafiantes y difíciles de tratar...

Leer el articulo completo

(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. 
Nueva presentación el 15 de Julio. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

1077- El Rincòn del Lector: J.S. Bach y las matematicas

Elise Cutts- Editor.  Patrones matemáticos: secretos revelados en la música de Bach . Scientific American-Springer Nature February 16, 2024. 

Resumen (Chat GPT)

En este artículo el autor explora cómo Johann Sebastian Bach incorporó sofisticadas estructuras matemáticas en sus composiciones, particularmente en su "Arte de la fuga" y sus "Variaciones Goldberg". Estas composiciones, analizadas por investigadores, revelan intrincadas simetrías, relaciones numéricas y patrones estructurales que sugieren la profunda comprensión y aplicación de principios matemáticos como la simetría, las proporciones y las secuencias numéricas por parte de Bach. El artículo destaca cómo estas ideas profundizan nuestra apreciación del genio de Bach y continúan inspirando tanto a músicos como a matemáticos a descubrir las complejidades ocultas dentro de su música eterna.

Principal

Los físicos descubrieron que la música de Johann Sebastian Bach contiene patrones matemáticos que ayudan a transmitir información .

El compositor barroco alemán Johann Sebastian Bach produjo música tan escrupulosamente estructurada que a menudo se la compara con las matemáticas. Aunque a pocos de nosotros nos afectan emocionalmente las matemáticas, las obras de Bach ( y la música en general) nos conmueven . Es más que sonido; es un mensaje. Y ahora, gracias a las herramientas de la teoría de la información, los investigadores están empezando a comprender cómo la música de Bach transmite ese mensaje .

Al representar las partituras como simples redes de puntos, llamados nodos, conectados por líneas, llamadas aristas, los científicos cuantificaron la información transmitida por cientos de composiciones de Bach. Un análisis de estas redes musicales publicado el 2 de febrero en Physical Review Research reveló que muchos estilos musicales de Bach, como los corales y las tocatas, diferían notablemente en la cantidad de información que comunicaban, y que las redes musicales contenían estructuras que podrían facilitar sus mensajes. para ser comprendidos por.oyentes humanos 

"La idea me pareció realmente genial", dice el físico Suman Kulkarni de la Universidad de Pensilvania, autor principal del nuevo estudio. "Utilizamos herramientas de la física sin hacer suposiciones sobre las piezas musicales, simplemente comenzamos con esta representación simple y vemos qué puede decirnos sobre la información que se transmite".

Los investigadores cuantificaron el contenido de información de todo, desde secuencias simples hasta redes enredadas utilizando la "entropía de la información" , un concepto introducido por el matemático Claude Shannon en 1948.

Como sugiere su nombre, la entropía de la información está matemática esta conceptualmente relacionada con la entropía termodinámica. Se puede considerar como una medida de cuán sorprendente es un mensaje, donde un “mensaje” puede ser cualquier cosa que transmita información, desde una secuencia de números hasta una pieza musical. Esa perspectiva puede parecer contradictoria, dado que, coloquialmente, la información a menudo se equipara con la certeza. Pero la idea clave de la entropía de la información es que aprender algo que ya sabes, no es aprender en absoluto.

Una conversación con una persona que sólo puede decir una cosa, como el personaje Hodor de la serie de televisión Game of Trons, sólo dice "Hodor", es predecible pero poco informativa. Una charla con Pikachu sería un poco mejor; En Pokémon sólo puede decir las sílabas de su nombre, pero puede reorganizarlas, a diferencia de Hodor. Del mismo modo, una pieza musical con una sola nota sería relativamente fácil de “aprender” para el cerebro o de reproducirla con precisión como modelo mental, pero la pieza tendría dificultades para transmitir cualquier tipo de mensaje. Ver lanzar una moneda de dos caras no proporcionaría ninguna información.

Por supuesto, empaquetar un mensaje lleno de información no sirve de mucho si quienquiera que lo reciba no puede comprender esa información con precisión. Y cuando se trata de mensajes musicales, los cientificos todavía están investigando cómo aprendemos lo que la música intenta decirnos.

"Hay algunas teorías diferentes", dice el científico cognitivo Marcus Pearce de la Universidad Queen Mary de Londres, que no participó en el reciente estudio de Physical Review Research . "Creo que lo principal en este momento se basa en el aprendizaje probabilístico".

En este marco, “aprender” música significa construir representaciones mentales precisas de los sonidos reales que escuchamos (lo que los investigadores llaman un modelo) a través de una interacción de anticipación y sorpresa. Nuestros modelos mentales predicen la probabilidad de que un sonido determinado venga a continuación, en función de lo que vino antes. Luego, dice Pearce, "descubres si la predicción fue correcta o incorrecta y luego puedes actualizar tu modelo en consecuencia".

Kulkarni y sus colegas son físicos, no músicos. Querían utilizar las herramientas de la teoría de la información para analizar la música en busca de estructuras informativas que pudieran tener algo que ver con la forma en que los humanos extraemos el significado de la melodía.

Entonces Kulkarni redujo 337 composiciones de Bach a redes de nodos interconectados y calculó la entropía de la información de las redes resultantes. En estas redes, cada nota de la partitura original es un nodo y cada transición entre notas es una arista. Por ejemplo, si una pieza incluyera una nota Mi seguida de un Do y un Sol tocados juntos, el nodo que representa Mi estaría conectado a los nodos que representan Do y Sol.......

Leer el articulo completo

(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. 
Nueva presentación el 12 de Julio. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

1076- Pronosticar escape viral y nuevas pandemias

Nicole N. Thadani, Sarah Gurev, Pascal Notin, Noor Youssef, Nathan J. Rollins, Daniel Ritter, Chris Sander, Yarin Gal, Debora S. Marks. Aprender de los datos prepandémicos para pronosticar el escape viral. Nature. 2023; 622 (7984): 818–825. Marks Group, Department of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA USA. Department of Electrical Engineering and Computer Science, MIT, Cambridge, MA USA

Resumen (Chat-GPT)

El artículo explora cómo los investigadores utilizan datos históricos anteriores a la pandemia de COVID-19 para predecir cómo los virus podrían evolucionar y escapar de la inmunidad. Al analizar datos de otros virus, como el de la gripe, y comprender las mutaciones que les permiten evadir las vacunas, los científicos pretenden desarrollar modelos que puedan anticipar patrones similares en futuros coronavirus. Este enfoque proactivo podría conducir a diseños de vacunas y estrategias de preparación más eficaces contra las amenazas virales emergentes. El artículo subraya la importancia de aprovechar el comportamiento viral pasado para informar las respuestas de salud pública y mejorar la preparación para una pandemia.

Resumen

....." La preparación eficaz para una pandemia se basa en anticipar mutaciones virales que sean capaces de evadir las respuestas inmunitarias del huésped para facilitar el diseño terapéutico y de vacunas. Sin embargo, las estrategias actuales para la predicción de la evolución viral no están disponibles al principio de una pandemia: los enfoques experimentales requieren que los anticuerpos policlonales del huésped se realicen pruebas, y los métodos computacionales existentes se basan en gran medida en la prevalencia de la cepa actual para hacer predicciones confiables de las variantes de interés . Para abordar esto, desarrollamos EVEscape, un marco modular generalizable que combina predicciones de aptitud a partir de un modelo de aprendizaje profundo de secuencias históricas con información biofísica y estructural. EVEscape cuantifica el potencial de escape viral de las mutaciones a escala y tiene la ventaja de ser aplicable antes de que estén disponibles la secuenciación de vigilancia, las exploraciones experimentales o las estructuras tridimensionales de complejos de anticuerpos. Demostramos que EVEscape, experimentado con secuencias disponibles antes de 2020, es tan preciso como los escaneos experimentales de alto rendimiento para anticipar la variación pandémica del SARS-CoV-2 y es generalizable a otros virus, incluidos la influenza, el VIH y virus poco estudiados con potencial pandémico como Lassa. y Nipa. Proporcionamos puntuaciones de escape revisadas continuamente para todas las cepas actuales de SARS-CoV-2 y predecimos probables mutaciones adicionales para pronosticar cepas emergentes como herramienta para continuar el desarrollo de vacunas 

Términos del tema: Evasión inmune, Modelos computacionales

EVEscape, es un marco flexible que utiliza aprendizaje profundo e información estructural biofísica, que permite la identificación temprana de mutaciones preocupantes en virus con potencial pandémico, lo que facilita el desarrollo de vacunas y terapias.

Principal

Las enfermedades virales implican una interacción compleja entre la detección inmune en el huésped y la evasión viral, lo que a menudo conduce a la evolución de proteínas antigénicas virales. Las mutaciones de escape de los anticuerpos afectan las tasas de reinfección viral y la duración de la eficacia de la vacuna. Por lo tanto, anticipar variantes virales que eviten la detección inmune con suficiente tiempo de anticipación es clave para desarrollar vacunas y terapias óptimas.

Idealmente, podríamos anticipar la evasión inmune viral utilizando métodos experimentales como ensayos de pseudovirus y escaneos mutacionales profundos de mayor rendimiento que miden la capacidad de las variantes virales para unirse a anticuerpos relevantes. Sin embargo, estos métodos experimentales requieren anticuerpos o sueros representativos de la selección inmune agregada impuesta al virus, que están disponibles solo cuando grandes franjas de la población están infectadas o vacunadas, lo que limita el impacto para la predicción temprana del escape inmunológico. 

Además, como los virus pandémicos pueden evolucionar rápidamente (en el  SARS-CoV-2 cada mes se secuencian decenas de miles de nuevas variantes), probar sistemáticamente todas las variantes a medida que surgen es practicamente imposible, incluso sin considerar los efectos de las posibles mutaciones en las cepas circulantes.

Por tanto, es interesante desarrollar métodos computacionales para predecir el escape viral que puedan usarse para identificar mutaciones que puedan surgir. Un modelo ideal sería capaz de evaluar la probabilidad de escape de variaciones aún no vistas en toda la proteína antigénica, informaría el diseño de experimentos específicos, se revisaría con información sobre la pandemia y haría predicciones con tiempo suficiente para el desarrollo de la vacuna (es decir, es decir, antes de que se observen respuestas inmunes al virus). 

Sin embargo, los métodos computacionales anteriores para pronosticar la aptitud viral o el escape inmunológico dependen críticamente de la secuenciación en tiempo real o de las estructuras de anticuerpos pandémicos, lo que limita su capacidad para predecir variantes invisibles y los hace poco prácticos para el desarrollo de vacunas durante el inicio de una pandemia.

En este trabajo, presentamos EVEscape, un marco flexible que aborda las debilidades de métodos anteriores mediante la combinación de un modelo generativo profundo experimentado  en secuencias virales históricas con restricciones estructurales y biofísicas. A diferencia de los métodos anteriores, EVEscape no se basa en la secuenciación pandémica reciente ni en anticuerpos, lo que lo hace aplicable tanto en las primeras etapas de un brote viral como para la evaluación continua de cepas emergentes del SARS-CoV-2............... 

Leer el articulo completo

(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. 
Nueva presentación el 10 de Julio. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

1075- Multiplex PCR assay para la detección de TP , HSV-1 y 2

Liufeng Yuan, Deju Xia , Qian Zhou , Wenqi Xu , Sihong Xu , Yueping Yin. Evaluación de un ensayo PCR múltiple para la detección de Treponema pallidum, HSV-1 y HSV-2. Diagn Microb and Infec Disea, 2023; 106 (3) :115958. Department of Dermatology, Beijing Ditan Hospital, Capital Medical University, Beijing, China.

Resumen (ChatGPT)

El artículo  evalúa la eficacia de un ensayo de PCR múltiple en la detección de tres patógenos de transmisión sexual: Treponema pallidum ( el agente causante de la sífilis) y el virus del herpes simple tipos 1 y 2 (HSV-1 y HSV-2, respectivamente). El estudio evalúa la sensibilidad y especificidad del ensayo en comparación con los métodos de diagnóstico tradicionales, como la serología y los ensayos de PCR de un solo objetivo. Su objetivo es determinar si el ensayo de PCR múltiple puede ofrecer ventajas en términos de precisión, eficiencia y rentabilidad para la detección simultánea de estos patógenos a partir de muestras clínicas. Los hallazgos clave probablemente incluyan información sobre las métricas de rendimiento del ensayo, como la sensibilidad (capacidad de detectar verdaderos positivos) y la especificidad (capacidad de evitar falsos positivos), así como sus posibles implicaciones clínicas para mejorar las capacidades de diagnóstico en el contexto de las infecciones de transmisión sexual.

Resumen

La Multiplex PCR assay puede utilizar material clínico limitado y es más rentable y se espera que se utilice para la detección de Treponema pallidum y virus del herpes simple tipo 1 y 2 (HSV-1,2). Se utilizo una reacción en cadena de la polimerasa múltiplex TP-HSV1-HSV2 (PCR múltiple) dirigida a las regiones conservadas del gen PolA de TP y el gen UL42 de HSV1 y HSV2 para probar lesiones cutáneas de 115 pacientes sospechosos de tener infecciones por TP y HSV1/2 . Para los 3 patógenos (300 copias/m), la sensibilidad y especificidad clínica general en las muestras de secreción para TP fueron del 91,7% y 100%, para HSV1 del 100% y 98%, y para HSV2 del 89,7% y 100%, respectivamente. El método parece superior en pacientes con sospecha de infección temprana por TP pero resultados negativos en las pruebas de anticuerpos no treponémicos, y el método también es útil para el diagnóstico diferencial de nuevas lesiones cutáneas en sitios genitales, perianales y orales de pacientes con antecedentes de sífilis previa .

1 . Introducción

Se ha estimado que cada año se producen en el mundo más de 340 millones de nuevos casos de enfermedades de transmisión sexual, y que la cifra más alta se registra en los países en desarrollo. Treponema pallidum (TP), y virus del herpes simple tipo 1 y 2 (HSV-1,2) son patógenos importantes que causan enfermedades de transmisión sexual, así como úlceras genitales, perianales y orofaríngeas, y lesiones cutáneas en otras partes superficiales del cuerpo . 

Las úlceras genitales son un factor de riesgo importante para la transmisión y adquisición del virus de inmunodeficiencia humana (VIH), y la identificación de patógenos de úlceras puede reducir eficazmente el riesgo de infección por VIH. Sin embargo, debido a la presentación clínica pleomórfica y a las infecciones mixtas , la identificación de diferentes patógenos según la presentación clínica no es confiable. Por lo tanto, existen importantes desafíos en las pruebas de laboratorio .

Los métodos estándar utilizados para diagnosticar la sífilis se basan principalmente en manifestaciones clínicas combinadas con pruebas serológicas; sin embargo, a pesar de su sensibilidad y especificidad potencialmente altas, estos métodos tienen limitaciones debido a la ventana de respuesta de anticuerpos y la reinfección. de sífilis. Entonces, la detección de patógenos a partir de determinadas muestras es un método directo para el diagnóstico definitivo de enfermedades infecciosas.

 Los métodos de detección de TP incluyen microscopía de campo oscuro e inmunofluorescencia directa, pero dichos métodos también enfrentan problemas como complejidad técnica, baja sensibilidad y limitaciones de muestreo, lo que dificulta su aplicación clínica . 

Los métodos tradicionales de detección del VHS incluyen cultivo y serología, pero los métodos de cultivo varían ampliamente según la duración y el estadio de la ulceración . Las pruebas serológicas también se ven afectadas negativamente por el período de ventana de presero-conversión temprana y la incapacidad de distinguir entre infecciones activas y latentes. En particular, la tecnología de PCR ha mejorado la velocidad y la sensibilidad del diagnóstico microbiano y ha permitido un uso más general de técnicas de muestreo mínimamente invasivas . 

Cuando se utilizan varias sondas por PCR, se pueden detectar varios patógenos en un solo pocillo. En China, a pesar de que la PCR se ha adoptado ampliamente para el diagnóstico del HSV-2 y de que el método de detección de ácido nucleico para la sífilis también se ha incluido en el estándar para el diagnóstico de la sífilis, ha habido escasez de aplicaciones en la práctica clínica. 

Teniendo en cuenta que la detección de ácido nucleico de un solo patógeno requiere hisopos separados y la recolección de hisopos de sífilis requiere un alto grado de sospecha clínica, junto con la transferencia de diferentes muestras a diferentes lugares, el tiempo de diagnóstico y tratamiento se retrasa hasta cierto punto y se incrementa el trabajo en el  procesamiento de muestras. Para superar estos problemas y mejorar la tasa de detección de sífilis temprana, desarrollamos un método de PCR fluorescente múltiple para el diagnóstico de TP, HSV-1 y HSV-2 en diferentes tipos de lesiones cutáneas. Además, buscamos investigar el rendimiento y la aplicación clínica del método.

2 . Materiales y métodos. 2.1 . Declaración de ética y temas.

El presente estudio fue aprobado por el Comité de Ética del Hospital Ditan de Beijing afiliado a la Universidad Médica Capital. Se invitó a participar en el estudio a los pacientes elegibles que visitaron el Departamento de Dermatología del Hospital Ditan de Beijing desde agosto de 2020 hasta octubre de 2021. 

Para recopilar datos médicos y sociodemográficos, los pacientes fueron entrevistados con un breve cuestionario y completaron formularios de consentimiento informado . Los criterios de inclusión fueron: (1) antecedentes de contacto sexual no matrimonial o antecedentes de infección del cónyuge; (2) las siguientes lesiones iniciales o recurrentes de la piel y las membranas mucosas en los genitales, el ano, la cavidad bucal: (a) las típicas ampollas, pústulas y úlceras; y (b) prepucio circuncidado, exudado inflamado y erupción maculopapular descamativa, eczema y condiloma plano sospechoso de sífilis secundaria ; y (3) edad del paciente ≥18 años. 

Criterio de exclusión: los que recibieron terapia con antibióticos sistémicos o tópicos durante 2 semanas antes de la inscripción. Todas las muestras se recolectaron utilizando hisopos flocados de nailon y se almacenaron a -20° C hasta la extracción del ADN y la amplificación por PCR en el National Institute for Food and Drug Control..

Leer el articulo completo

(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. 
Nueva presentación el 05 de Julio. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina