lunes, 22 de agosto de 2022

909- IFCC- Troponina alta sensibilidad: percentil 99

Kristin M Aakre, Amy K Saenger, Rick Body, Paul Collinson, Ola Hammarsten, Allan S Jaffe, Pete Kavsak , Torbjørn Omland, Jordi Ordonez-Lianos, Fred S. Apple. Consideraciones analíticas para derivar los límites de referencia superiores del percentil 99 para los ensayos de troponina cardíaca de alta sensibilidad: recomendaciones educativas del Comité de la IFCC sobre la aplicación clínica de biomarcadores cardíacos. Oxford Academic Clin Chem 2022 ; 68(8):1022-1030. Department of Medical Biochemistry and Pharmacology and Department of Heart Disease, Haukeland University Hospital, Bergen, Norway.

Resumen

El International Federation of Clinical Chemistry Committee on Clinical Application of Cardiac Bio-Markers, proporciona documentos educativos basados ​​en evidencia para facilitar la interpretación y utilización uniformes de biomarcadores cardíacos en laboratorios clínicos y su práctica. Los objetivos del comité son mejorar la comprensión de ciertos aspectos analíticos y clínicos clave de los biomarcadores cardíacos y cómo estos pueden interactuar en la práctica clínica. La medición de los ensayos de troponina cardíaca de alta sensibilidad (hs-cTn) es una piedra angular en la evaluación clínica de pacientes con síntomas y/o signos de isquemia cardíaca aguda. Para definir el infarto de miocardio, la definición universal de infarto de miocardio requiere que los pacientes que manifiestan características sugestivas de isquemia miocárdica aguda tengan al menos una concentración de cTn por encima del límite superior de referencia (URL) del percentil 99 específico del sexo) para ensayos de hs-cTn y un patrón dinámico de concentraciones de cTn para cumplir los criterios diagnósticos de IM. Este informe especial proporciona una descripción general de cómo se deben establecer las URL del percentil 99 de hs-cTn, incluidas las recomendaciones sobre la pre-selección y la cantidad de personas requeridas en la cohorte de referencia, cómo se deben realizar los análisis estadísticos, protocolos analíticos y preanalíticos óptimos y métodos analíticos/biológicos, interferencias y factores de confusión que pueden afectar la determinación precisa de las URL del percentil 99. Este documento también proporciona orientación y soluciones a muchos de los problemas planteados.

Introducción

Las mediciones de troponina cardíaca (cTn) desempeñan un papel fundamental en la definición de infarto de miocardio (IM) según las directrices de la definición universal de infarto de miocardio (UDMI). Se recomiendan ensayos de cTn de alta sensibilidad (hs-cTn). La prueba de hs-cTn permite la exclusión temprana y rápida de IM en el servicio de urgencias en un número considerable de pacientes, además de identificar a aquellos con una probabilidad muy alta de IM. La prueba de hs-cTn también proporciona una clasificación de las personas con riesgo a corto y largo plazo de eventos cardiovasculares adversos importantes y mortalidad, incluso en ausencia de infarto de miocardio. El límite superior de referencia (URL) del percentil 99 ha sido aprobado como el umbral recomendado de hs-cTn en la UDMI y la comunidad de laboratorio de medicina durante más de 20 años. Los criterios de diagnóstico clínico incluyen un aumento y/o disminución de las concentraciones de hs-cTn con al menos un valor por encima del percentil 99 de las URL, específicas del sexo, todo junto con los hallazgos clínicos que se consideran indicativos de isquemia aguda.

El percentil 99 se deriva de las mediciones de cTn en una cohorte aparentemente sana y depende de la selección de participantes, los análisis estadísticos y la variabilidad analítica y biológica. Estas métricas no están estandarizadas entre estudios; por lo tanto, se pueden recomendar diferentes percentiles 99 para el mismo ensayo de hs-cTn, lo que potencialmente puede conducir a una falta de uniformidad con la forma en que se diagnostica el infarto de miocardio agudo. Este problema se acentúa por el hecho de que muchos centros ni siquiera utilizan la URL del percentil 99. Esto es problemático para el paciente individual que puede recibir un diagnóstico diferente según la URL que haya implementado el hospital local.... 

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Las páginas de este blog, se renuevan el  27 de Agosto. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires. R. Argentina


 

sábado, 20 de agosto de 2022

908- Metagenómica clínica

Charles Y. Chiu, Steven A. Miller. Metagenomica Clinica. Nat Rev Genet. 2019; 20(6): 341–355. Department of Laboratory Medicine, Department of Medicine, Division of Infectious Diseases, University of California, San Francisco, CA USA.

Resumen

La secuenciación metagenómica clínica de próxima generación (mNGS), el análisis integral del material genético microbiano y del huésped (ADN y ARN) en muestras de pacientes, está pasando rápidamente de la investigación a los laboratorios clínicos. Este enfoque emergente está cambiando la forma en que los médicos diagnostican y tratan las enfermedades infecciosas, con aplicaciones que abarcan una amplia gama de áreas, incluida la resistencia a los antimicrobianos, el microbioma, la expresión génica del huésped humano (transcriptómica) y la oncología. Aquí, nos enfocamos en los desafíos de implementar mNGS en el laboratorio clínico y abordamos posibles soluciones para maximizar su impacto en la atención al paciente y la salud pública.

Introducción

El campo de la microbiología clínica comprende tanto la microbiología de diagnóstico, la identificación de patógenos a partir de muestras clínicas para guiar las estrategias de manejo y tratamiento de pacientes con infección, como la microbiología de salud pública, la vigilancia y el seguimiento de brotes de enfermedades infecciosas en la comunidad. 

Las técnicas de diagnóstico tradicionales en el laboratorio de microbiología incluyen el crecimiento y aislamiento de microorganismos en cultivo, detección de anticuerpos específicos de patógenos (serología) o antígenos e identificación molecular de ácidos nucleicos microbianos (ADN o ARN), más comúnmente a través de PCR. 

Si bien la mayoría de los ensayos moleculares se enfocan solo en un número limitado de patógenos utilizando cebadores o sondas específicos, los enfoques metagenómicos caracterizan todo el ADN o ARN presente en una muestra, lo que permite el análisis de todo el microbioma .así como el genoma o transcriptoma del huésped humano en muestras de pacientes. Los enfoques metagenómicos se han aplicado durante décadas para caracterizar varios nichos, que van desde ambientes marinos hasta suelos tóxicos,  vectores de enfermedades de artrópodos y el microbioma humano. Estas herramientas también se han utilizado para identificar infecciones en restos antiguos, descubrir nuevos patógenos virales y caracterizar el viroma humano tanto en estado sano como enfermo y para aplicaciones forenses 12 .

La capacidad de detectar todos los patógenos potenciales (bacterias, virus, hongos y parásitos) en una muestra y, al mismo tiempo, interrogar las respuestas del huésped tiene una gran utilidad potencial en el diagnóstico de enfermedades infecciosas. La metagenómica para aplicaciones clínicas tiene sus raíces en el uso de micromatrices a principios de la década de 2000. Algunos de los primeros éxitos del uso de esta tecnología incluyen el descubrimiento del coronavirus del SARS, el perfil genético de mutaciones en el cáncer y el análisis detallado del microbioma de diferentes sitios del cuerpo humano. Sin embargo, fue el advenimiento de las tecnologías de secuenciación de próxima generación (NGS) en 2005 lo que impulsó el campo de la metagenómica.

Por primera vez, se podrían generar de millones a miles de millones de lecturas en una sola ejecución, lo que permite el análisis de todo el contenido genético de una muestra clínica o ambiental. La proliferación de instrumentos de secuenciación disponibles y las disminuciones exponenciales en los costos de secuenciación durante la década siguiente impulsaron la rápida adopción de la tecnología NGS.

Hasta la fecha, varios estudios han brindado una idea de la promesa de NGS en entornos clínicos y de salud pública. Por ejemplo, la NGS se utilizó para el diagnóstico clínico de neuroleptospirosis en un niño de 14 años en estado crítico con meningoencefalitis; este caso fue el primero en demostrar la utilidad de la NGS metagenómica (mNGS) para proporcionar información procesable clínicamente, ya que el diagnóstico exitoso impulsó el tratamiento antibiótico específico adecuado y la eventual recuperación del paciente. Los ejemplos en microbiología de la salud pública incluyen el uso de NGS, en combinación con el análisis de redes de transmisión , para investigar brotes de la cepa O104:H4 de Escherichia coli (ref. 21) y para la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en el suministro de alimentos mediante la secuenciación del genoma bacteriano completo ..... 

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires. R. Argentina



lunes, 15 de agosto de 2022

907- Diabetes Tipo II y enfermedad renal crónica

Neil S. Skolnik, Alyssa J. Style. Importancia de la detección temprana y diagnóstico de la enfermedad renal crónica en pacientes con diabetes tipo 2. Springer-Diabetes Ther. 2021; 12(6): 1613–1630. Abington Family Medicine, Jenkintown, PA USA

Resumen-Puntos claves

  • Las recomendaciones basadas en la evidencia para el tratamiento de pacientes con enfermedad renal crónica (ERC) y diabetes tipo 2 (T2D) actualmente se siguen en menos del 50 % de las personas.
  • Se recomienda el cribado de la ERC utilizando la relacion de albúmina/creatinina en orina puntual y la tasa de filtración glomerular estimada en todos los pacientes con DT2 en el momento del diagnóstico, y al menos una vez al año.
  • La detección permite el diagnóstico temprano de la ERC, el asesoramiento, la intervención farmacológica y, cuando corresponda, la derivación a un nefrólogo.
  • Los medicamentos que disminuyen la progresión de la CKD incluyen inhibidores del sistema renina-angiotensina, inhibidores del cotransportador de sodio-glucosa-2, agonistas del receptor del péptido 1 similar al glucagón y, más recientemente, antagonistas del receptor de mineralocorticoides no esteroideos.

Introducción

Los pacientes con diabetes mellitus tienen un mayor riesgo de desarrollar enfermedad renal crónica (ERC). En los EE. UU., la nefropatía diabética es la principal causa de insuficiencia renal. La presencia de ERC concomitante en pacientes con diabetes tipo 2 (T2D) se asocia con un riesgo significativamente mayor de enfermedad cardiovascular (ECV), incluido infarto de miocardio, accidente cerebrovascular isquémico/ataques isquémicos transitorios y mortalidad por todas las causas, en comparación con el riesgo en pacientes con T2D sin ERC. Existen terapias que pueden retrasar la progresión de la ERC en personas con diabetes; por lo tanto, la detección e intervención tempranas para la ERC son importantes.

En esta revisión, evaluamos la carga de la ERC en pacientes de EE. UU. con DT2 y describimos cómo los médicos pueden usar la detección y el diagnóstico tempranos, junto con las estrategias de manejo recomendadas por las guías proporcionadas por la  American Diabetes Association (ADA) para optimizar los resultados de los pacientes. Este artículo se basa en estudios realizados previamente y no contiene ningún estudio con participantes humanos o animales realizado por ninguno de los autores.

Carga en el presupuesto de Salud Publica

Las estimaciones actuales sugieren que aproximadamente 463 millones de personas en todo el mundo tienen diabetes mellitus, y se prevé que este número aumente a unos 700 millones para 2045. En 2018, aproximadamente el 10,5 % de la población estadounidense tenía diabetes. Hasta el 40% de los pacientes con diabetes también desarrollan ERC, que se asocia con una morbilidad significativa, déficits en la calidad de vida y una mayor carga de atención médica. La progresión de la ERC puede provocar insuficiencia renal (enfermedad renal en etapa terminal [ESKD]), y los pacientes requieren diálisis o un trasplante de riñón para sobrevivir. En 2015, 661.000 estadounidenses tenían ESKD; aproximadamente el 71 % recibía hemodiálisis o diálisis peritoneal, y el 29 % vivía con un trasplante de riñón funcionante. De las personas con ESKD, aproximadamente entre el 44 y el 45 % tenían diabetes como la principal causa de ESKD. Los costos por persona para pacientes mayores de 65 años con ERC y diabetes son un 51 % más altos que para los pacientes con diabetes que no tienen ERC. Además, la calidad de vida relacionada con la salud disminuye a medida que avanza la ERC.

La detección permite el diagnóstico temprano de la ERC

La enfermedad renal crónica es asintomática en sus etapas iniciales y se diagnostica mediante la estimación de la tasa de filtración glomerular (TFGe), que evalúa la función renal, y la detección de albuminuria, un marcador de daño renal. Los estándares de atención de la ADA 2020 recomiendan que los pacientes con diagnóstico reciente de DT2 deben someterse a pruebas de detección de ERC con albúmina urinaria (p. ej., cociente entre albúmina y creatinina en la orina [UACR]) y eGFR . A partir de entonces, deben volver a analizarse anualmente, y la frecuencia de las nuevas pruebas depende del nivel de daño y función renal. Para los pacientes con una UACR > 30 mg/g de albúmina/creatinina y/o una TFGe < 60 ml/min/1,73 m2 , se debe realizar un seguimiento dos veces al año para guiar el tratamiento

Cabe destacar que, en 2013, the American College of Physicians recomendó que los pacientes con diabetes tipo 2 y enfermedad renal crónica (etapas 1 a 3) que reciben un inhibidor de la enzima convertidora de angiotensina (ACEi) o un bloqueador del receptor de angiotensina II (ARB) no necesitan someterse a pruebas anuales para proteinuria. Esta recomendación se ha retirado y, por lo tanto, es importante que los médicos de atención primaria tomen nota de este cambio y ajusten su práctica en consecuencia. De acuerdo con las pautas de la ADA, los pacientes con ERC en estadio 1 a 3 deben someterse a exámenes de detección entre una y tres veces al año según su nivel de albuminuria...


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Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires. R. Argentina


sábado, 13 de agosto de 2022

906- Comunicación científica y desinformación publica

Michael A Vera, Joe M El-Khoury, Holden Thorp, Richard J Tofel, Joseph S Ross, Apoorva Mandavilli, Eric Topol. Desinformación pública y comunicación científica en tiempos de crisis en la salud pública. Oxford Academic- Clinical Chemistry, 2022; 68 (8):1008–1014. Department of Laboratory Medicine, Yale University, New Haven, CT, USA.

La historia está llena de lecciones de civilizaciones que colapsaron después de que sus ciudadanos no percibieron los problemas que se desarrollaban a su alrededor o, si lo hicieron, luego no pudieron resolver los que eventualmente causarían su desaparición. 

A principios de 2022, casi 2 años después de una pandemia, todavía estamos asimilando cómo terminamos en la situación actual: solo en los Estados Unidos, más de 950.000 muertes totales llegando a más de 1 millón de casos nuevos por día, sin precedentes y niveles de hospitalización que están quebrando un sistema de salud ya frágil. 

Ciertamente sentimos que nuestra forma de vida se esta derrumbando frente a nuestros ojos, y no podemos evitar pensar que seguramente esto se pudo haber evitado. Después de todo, los científicos pudieron desarrollar, probar y obtener vacunas altamente efectivas aprobadas a un ritmo récord, pero cuando se trataba de aceptación y adopción pública, las cosas no eran tan estelares.

Desde el principio, la confusión con respecto a la transmisibilidad y la gravedad del virus condujo a desafíos generalizados para enmascarar los mandatos y las políticas de distanciamiento social. Peligrosamente, el grado de desinformación generalizada ha llevado a que varios medicamentos como la ivermectina, y artículos domésticos comunes, como la lejía, sean defendidos como tratamientos para el COVID-19 sin ninguna evidencia científica. Este problema persiste, ya que la adopción de vacunas en la población continúa rezagada debido a la falta de confianza en las instituciones gubernamentales y científicas. El problema general se volvió aún más complicado con la aparición de "malos actores" que intentaron capitalizar esta situación difundiendo información errónea y socavando la ciencia por razones políticas, financieras o promocionales. 

Sin embargo, es importante comprender cómo la comunidad científica contribuyó a estos problemas y qué podemos aprender que puede ayudar a dar forma a nuestras respuestas actuales y futuras a amenazas similares para nuestra sociedad, incluida quizás la mayor de todas, la desinformación pública. 

El desarrollo de estrategias para abordar este problema ha llevado a algunos profesionales, como el Dr. John Holdren, ex-asesor científico del presidente Obama, a pedir a todos los ellos que se conviertan en comunicadores capacitados en un ejército de embajadores de los Estados Unidos. Pero esto no es tan fácil como parece, ya que algunos, como el Dr. Holden Thorp, editor en jefe de Science, cuestionan este enfoque quien propuso mejorar la asociación entre investigadores y comunicadores públicos, para que cada uno pueda aprovechar su propia experiencia y capacitación en profundidad.

En conjunto, pueden surgir preguntas sobre las responsabilidades de los científicos al compartir información científica, no solo con sus pares sino también con el público, así como su papel en la lucha contra la difusión de información errónea en línea. Para explorar más a fondo este concepto y adquirir sus perspectivas sobre la evolución del papel de los científicos en el siglo XXI, invitamos a un grupo de científicos, médicos y periodistas que también son líderes en la comunicación científica para responder preguntas clave sobre este tema.

Preguntas a considerar

  • ¿Qué limitaciones ha expuesto la pandemia en las formas en que se comunica la ciencia hoy?
  • ¿Cómo equilibra la entrega de información al público a partir de pequeños estudios, que potencialmente podrían crear confusión, y la espera de los definitivos?
  • ¿Qué responsabilidades, si es que tienen alguna, los científicos cuando se trata de comunicar su ciencia al público? ¿Y por qué?
  • ¿Tienen los científicos la responsabilidad de desacreditar la información errónea que se difunde en línea? En caso afirmativo, ¿por qué y cómo? Si no, ¿por qué no?
  • ¿Cómo podemos mejorar la confianza del público en la ciencia?
  • ¿Utiliza las redes sociales para comunicar o consumir material científico? En caso afirmativo, ¿qué plataformas, cómo y por qué? Si no, ¿por qué no?
  • ¿Qué consejo puede compartir con los científicos que están interesados ​​en mejorar la forma en que se comunica la ciencia, incluidos aquellos que quizás aún no estén activos en las redes sociales?

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Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires. R. Argentina


lunes, 8 de agosto de 2022

905-Serologia en enfermedades fungicas

Cornelia Lass-Fl€orl, Eldina Samardzic, Miriam Knoll. Serología año 2021 para infecciones fúngicas invasivas y crónicas. Elsevier-Clinical Microbiology and Infection. on behalf of European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. 2021;27: 1230-1241. Institute of Hygiene and Medical Microbiology, Medical University of Innsbruck, Austria

Resumen

Antecedentes: el diagnóstico de infecciones fúngicas invasivas o crónicas es un desafío, particularmente importante en el huésped inmunocomprometido. La microscopía y el cultivo siguen siendo el estándar de referencia, pero son poco sensibles. En esta presentación se recomienda el uso de técnicas no basadas en cultivos junto con métodos convencionales, para mejorar el rendimiento diagnóstico.

Objetivos: el objetivo es proporcionar un inventario actualizado hasta 2021 de antígenos fúngicos y pruebas serológicas para el diagnóstico de infecciones fúngicas invasivas y crónicas; el enfoque principal se centró en las especies de Aspergillus , Candida y Cryptococcus .

Bibliografía: se busco  en Pubmed publicaciones con las palabras clave: pruebas de antígeno fúngico, diagnóstico de laboratorio de aspergilosis pulmonar invasiva, aspergilosis pulmonar crónica, candidiasis invasiva, infecciones fúngicas invasivas e infecciones criptocócicas publicadas entre 2017 y 2020.

Contenido: los ensayos de antígenos como los sistemas de detección de galactomanano (GM) y β-d- glucano se usan con frecuencia, pero estas pruebas varían en sensibilidad y especificidad, según la población de pacientes involucrada, las muestras inspeccionadas, los puntos de corte definidos, la estrategia de prueba aplicada y la inclusión o exclusión de posibles definiciones en casos de hongos. Están disponibles múltiples sistemas de detección diferentes, con nuevas pruebas de punto de atención introducidas recientemente, como el dispositivo y el ensayo de flujo lateral. A pesar de una amplia heterogeneidad en las poblaciones evaluadas, los estudios indican un mejor rendimiento diagnóstico de lavado broncoalveolar con GM en comparación con suero GM, y una especificidad subóptima de lavados broncoalveolares GM (punto de corte ≥1) y suero β- d-glucano en individuos no neutropénicos. Las pruebas de antígeno criptocócico en el punto de atención muestran un rendimiento excelente.

Importancia: hay pruebas de detección de antígenos fúngicos disponibles con un rendimiento clínico excelente a razonable para diagnosticar infecciones fúngicas invasivas. Solo unos pocos ensayos son útiles para monitorear la respuesta terapéutica. Hay múltiples pruebas de anticuerpos IgG comercializadas para detectar anticuerpos contra Aspergillus fumigatus, donde los títulos varían ampliamente y el rendimiento difiere significativamente. En general, las pruebas de diagnóstico son vulnerables a verse afectadas por el huésped, el microbio y el entorno del laboratorio.

Introducción

Las infecciones fúngicas tienen una incidencia e importancia crecientes en pacientes inmuno-comprometidos e inmuno-competentes. Las enfermedades fúngicas son infecciones oportunistas devastadoras que afectan a casi 1.000 millones de personas y causan más de 1 millón de muertes cada año. La carga de la enfermedad es mayor en pacientes inmuno-deprimidos, siendo la aspergilosis invasiva (AI) o la candidiasis invasiva (CI) las más importantes. 

El diagnóstico de infecciones fúngicas en pacientes inmuno-comprometidos es un desafío porque los métodos de diagnóstico actuales pueden carecer de sensibilidad y especificidad, o pueden tardar demasiado en producir un resultado clínicamente útil. Los signos y síntomas son inespecíficos, la colonización fúngica es difícil de diferenciar de una enfermedad invasiva, los hemocultivos suelen ser negativos y es posible que los pacientes no se sometan a intervenciones diagnósticas invasivas. Como los hongos pueden formar parte de la microflora endógena, se requiere precaución en la interpretación de cultivos superficiales y pruebas serológicas y/o antigénicas positivas. 

La microscopía y el cultivo siguen siendo el patrón de referencia. No obstante se recomienda el uso de técnicas no basadas en cultivos junto con métodos convencionales para mejorar el rendimiento diagnóstico. Durante el crecimiento fúngico, los polisacáridos o las proteínas (antígenos fúngicos) pueden liberarse en los diversos fluidos corporales y, por lo tanto, son adecuados para detectarse tanto en individuos inmuno-competentes como inmuno-comprometidos. 

La detección de anticuerpos es útil para el diagnóstico de infección en individuos inmuno-competentes, y más importante para hongos dimórficos. Hay disponible una variedad de técnicas para pruebas serológicas directas e indirectas, pero la interpretación de los resultados puede verse confundida por una variedad de factores. La interacción entre el huésped, el microbio y el entorno del laboratorio puede afectar el rendimiento de la prueba. 

Un primer paso racional recomienda el uso de biomarcadores séricos (galactomanano (GM) y β- d-glucano (BDG)), y/u obtención de muestras de lavado broncoalveolar (BAL) para tinción de hongos, cultivo y detección de antígenos. Conocer el patógeno fúngico guiará el tratamiento antifúngico apropiado, la dosis y la duración de la terapia...........

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sábado, 6 de agosto de 2022

904- Pensar en un nuevo CV

Chris Woolston, Editor. Hora de repensar el CV científico. Nature  career 05 Ap 2022

Los nuevos formatos  muestran el trabajo de los investigadores de manera más efectiva.

En diciembre de 2021, el  UK Research and Innovation (UKRI), que es el mayor financiador público de la ciencia del Reino Unido, anunció que abandonaría el uso del CV convencional (currículum vitae) en las solicitudes de financiación. El organismo de financiación dijo que adoptaría un nuevo tipo de CV para "permitir que las personas demuestren mejor sus contribuciones a la investigación, los equipos y la sociedad en general".

A medida que las instituciones y los financiadores de todo el mundo reevalúan su enfoque de las evaluaciones de los investigadores, existe un llamado cada vez mayor para renovar los currículos académicos que se utilizan para respaldar las solicitudes de empleo, financiamiento, promociones y premios. Los investigadores deben encontrar nuevas formas de documentar sus logros y valor más allá de una mera lista de publicaciones, y los comités que supervisan las promociones y subvenciones deben cambiar sus protocolos y expectativas, dice Needhi Bhalla, biólogo celular de la Universidad de California, Santa Cruz. “Los currículos deben reflejar la experiencia auténtica de ser un científico”, dice, incluida la tutoría, el trabajo en comités, la divulgación y muchas otras contribuciones que no resultan en publicaciones. “Estoy emocionado de que estemos en el proceso de repensarlos”.

Los currículos han sido durante mucho tiempo parte de la moneda de la promoción científica. Los científicos que buscan un puesto, o una subvención, a menudo se sienten obligados a enumerar cada publicación, presentación y premio en un solo documento destinado a influir en los comités por su gran extensión y volumen. El currículum típico sigue una plantilla desgastada por el tiempo, dice Robert Morrell, investigador en educación y ex-director del Programa de Nueva Generación de Académicos de la Universidad de Ciudad del Cabo en Sudáfrica. “'Yo nací, fui a la escuela aquí, tuve estas publicaciones, estos son los alumnos de los que me gradué'. Las personas que escriben CV como ese están perdiendo el tren”.

El UKRI no está solo en la búsqueda de repensar el CV en respuesta a un enfoque renovado en la ciencia del equipo y la equidad, la diversidad y la inclusión (EDI). Modeló su nuevo formato de CV en 'Résumé for Researchers', presentado en 2019 por la Royal Society de Londres. Los consejos de investigación de los Países Bajos y Luxemburgo han dado a conocer iniciativas similares.

En respuesta, los investigadores están aprendiendo cómo re-elaborar los currículos para enfatizar la calidad sobre la cantidad e incluir narrativas sobre su impacto más amplio. Mientras tanto, los paneles de contratación y los evaluadores de subvenciones deben repensar cuál es la mejor manera de evaluar estos documentos.

El problema central con los CV estándar es que tienden a reducir a los científicos a números, dice Rebecca Pillai Riddell, científica del comportamiento y vicepresidenta asociada de investigación de la Universidad de York en Toronto, Canadá. Evaluar a los investigadores sobre la base de la gran cantidad de publicaciones o el uso de medidas relacionadas, como los factores de impacto de las revistas en las que publican, ignora muchas cosas que intervienen en una carrera científica, dice Pillai Riddell. Los CV convencionales "se supone que son resúmenes rápidos y groseros", dice. Como alguien que ha visto muchos a lo largo de los años, sabe que esos resúmenes pueden contener información valiosa, incluso si el énfasis a menudo está fuera de lugar. “Se enfocan en contar, no en lo que es importante”..........

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lunes, 1 de agosto de 2022

903- Diagnostico de helmintos transmitidos por el suelo

Sumeetha Khurana , Shreya Singh, Abhishek Mewara.Técnicas de diagnóstico para helmintos transmitidos por el suelo: avances recientes. DovesPreess-Res Rep Trop Med. 2021; 12: 181–196. Department of Medical Parasitology, Post Graduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, India.

Resumen

Las infecciones por helmintos transmitidos por el suelo (HTS) (anquilostomiasis, Trichuris, Ascaris ) y Strongyloidesspp. se asocian con una carga global sustancial y una alta morbilidad. Los métodos sensibles y específicos para el diagnóstico de estas infecciones son esenciales para mapear la carga en las comunidades, y la evaluación precisa de los niveles de infección para guiar las intervenciones y monitorear el éxito de los programas de control. A pesar del progreso considerable para controlar la STH durante varias décadas, todavía estamos lejos de identificar una prueba diagnóstica completamente adecuada. Los métodos convencionales basados ​​en microscopía, como el frotis directo de Kato-Katz o los montajes después de técnicas de concentración basadas en centrifugación/flotación de heces, han sido el pilar del diagnóstico, especialmente en países de escasos recursos donde abundan estas infecciones. Sin embargo, recientemente, estos se están adaptando a formatos digitales cerrados y fáciles de realizar, mejorando así la sensibilidad y la aplicabilidad en un entorno remoto y de recursos limitados. El uso de sistemas de análisis de imágenes para identificar y cuantificar huevos de helmintos, con potencial adaptación a teléfonos inteligentes, también es prometedor. Las pruebas de detección de anticuerpos tienen un papel limitado sobre todo en el caso de la hiperinfección por Strongyloides. Las pruebas de detección de coproantígenos se han desarrollado y utilizado en la práctica veterinaria para la detección de STH, pero no se han evaluado para uso en humanos. Los diagnósticos moleculares más sensibles, incluidos los ensayos desarrollados con nuevas herramientas y técnicas bioinformáticas, como la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), la PCR cuantitativa (qPCR) y el ensayo de amplificación mediada por bucle, pueden ayudar en la evaluación clara y precisa de la carga de STH durante la fase de eliminación y son de inmenso valor para el diagnóstico en áreas con baja endemicidad y en viajeros a regiones endémicas. Además, las técnicas moleculares ayudarán a detectar nuevas especies que puedan surgir. La conservación de muestras y la extracción eficiente de ADN son críticas y afectan significativamente la eficiencia de las pruebas de diagnóstico molecular. Además del diagnóstico de infección clínica o asintomática en humanos, la detección de huevos de STH en muestras ambientales es imprescindible para impulsar los esfuerzos de control de STH. En general, el rendimiento diagnóstico, la rentabilidad, la facilidad de ejecución, la rapidez y la aplicabilidad en el campo de cualquier prueba deben tenerse en cuenta al elegir entre los diversos ensayos de diagnóstico en áreas con diferente endemicidad, además de esforzarse por el desarrollo de nuevas tecnologías y la optimización. de los métodos existentes.

Introducción

Más de 1500 millones de personas, que comprenden casi una cuarta parte de la población mundial, están infectadas con helmintos transmitidos por el suelo (HTS).Las infecciones por geohelmintos están ampliamente distribuidas en áreas tropicales y subtropicales del mundo, con la prevalencia más alta reportada en África subsahariana, China, América del Sur y Asia. Más de 267 millones de niños en edad preescolar y 568 millones de niños en edad escolar residen en estas áreas y necesitan intervenciones terapéuticas y preventivas. Estas infecciones se notifican con mayor frecuencia en personas que residen o viajan a regiones con poco acceso a agua potable, saneamiento e higiene, generalmente en países de ingresos bajos o medios; o en poblaciones vulnerables en países de altos ingresos. La OMS ha reconocido infecciones causadas por cuatro especies de STH, a saber. Ascaris lumbricoides, Necator americanus, Ancylostoma duodenale y Trichuris trichiura entre las enfermedades tropicales desatendidas (ETD).  Más recientemente, algunas áreas en el sudeste asiático han informado sobre la anquilostomiasis zoonótica del Ancylostoma ceylanicum además de la anquilostomiasis humana.  Aunque el Strongyloides stercoralisaún no está considerada en esta lista de ETD por la OMS, también es una HTS importante dada la importante morbilidad de la enfermedad que provoca  su superposición geográfica con las demás HTS. Se estima que más de 600 millones de personas están infectadas por S. stercoralis en todo el mundo. 

Las infecciones por geohelmintos suelen ser clínicamente asintomáticas, aunque pueden observarse síntomas gastrointestinales inespecíficos y/o eosinofilia. Dado que las HTS rara vez causan mortalidad, su impacto en la salud se mide utilizando los años de vida ajustados por discapacidad (AVAD). Las infecciones por geohelmintos representan una alta carga global con una morbilidad sustancial. Datos recientes han demostrado que la HTS causó 2.090 muertes en 2019 con 1,97 millones (1,26–3,00) AVAD, en los que la anquilostomiasis fue la causa predominante. De hecho, la morbilidad es directamente proporcional a la intensidad de la infección y se observan resultados debilitantes como anemia, obstrucción intestinal, retraso en el desarrollo físico o cognitivo en personas muy infectadas, especialmente en niños. La anemia por deficiencia de hierro causada por la anquilostomiasis durante el embarazo se ha relacionado con resultados maternos y fetales adversos, incluidos bebés prematuros y con bajo peso al nacer, lactancia deficiente, etc............

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires. R. Argentina



jueves, 28 de julio de 2022

902- Toxoplasmosis congénita

Archana S. Kota; Nadeem Shabbir.Toxoplasmosis congénita, Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2022 Jan. Nassau University Medical Center

Resumen: La toxoplasmosis es una infección parasitaria en humanos y animales. La infección en adultos sanos inmunocompetentes es asintomática en aproximadamente el 50% de los casos, aunque también puede causar una enfermedad inespecífica leve autolimitada que se presenta con signos y síntomas como fiebre, malestar general, erupción maculopapular, dolor de cabeza, fatiga y linfadenopatía dolorosa. En individuos inmunocomprometidos y recién nacidos, provoca una infección grave con secuelas devastadoras.

Objetivos: Revisar los factores de riesgo para adquirir toxoplasmosis congénita y conocer su fisiopatología, pruebas diagnosticas y tratamientos.

Introducción

La toxoplasmosis es una infección parasitaria en humanos y animales. La infección en adultos sanos inmunocompetentes es asintomática en aproximadamente el 50% de los casos, aunque también puede causar una enfermedad inespecífica leve autolimitada que se presenta con signos y síntomas como fiebre, malestar general, erupción maculopapular, dolor de cabeza, fatiga y linfadenopatía dolorosa. En individuos inmunocomprometidos y recién nacidos, provoca una infección grave con secuelas devastadoras.

La toxoplasmosis congénita, como resultado de la transmisión vertical de madres infectadas, es una causa importante de morbilidad y mortalidad en fetos, recién nacidos y niños a medida que avanzan hacia la edad adulta. Dado que la infección asintomática es más común, es necesario un alto índice de sospecha y el diagnóstico se puede realizar fácilmente mediante pruebas serológicas.

Etiología: La toxoplasmosis congénita resulta de un protozoario, un parásito intracelular ubicuo obligado, Toxoplasma gondii................

Evaluación

Las pruebas de toxoplasmosis congénita en el feto deben realizarse cuando la madre ha confirmado la infección o hay hallazgos ecográficos sugestivos, como calcificaciones intracraneales o dilatación ventricular cerebral.La PCR positiva para ADN deT. Gondii en el líquido amniótico confirma el diagnóstico en el feto.

La toxoplasmosis congénita debe sospecharse en los recién nacidos en las siguientes situaciones:

  • Infección materna primaria porT. gondii durante el embarazo
  • Madres inmuno-comprometidas con infección previa porT. gondii
  • Recién nacidos con características clínicas indicativas de toxoplasmosis congénita
  • Recién nacidos con cribado neonatal positivo para toxoplasma

El diagnóstico resulta de una combinación de hallazgos clínicos y de laboratorio.

Pruebas serológicas

Los anticuerpos específicos de toxoplasma(IgG, IgM e IgA) requieren pruebas en todos los casos de sospecha de infección. La vida media de los anticuerpos Toxoplasma IgM e IgA es de 5 y 10 días. Cuando existe la preocupación de falsos positivos debido a la contaminación materna de la sangre fetal durante el trabajo de parto, se deben repetir las pruebas serológicas 10 días después del nacimiento. El ADN de T. gondii por PCR también es posible en LCR, orina o sangre periférica.

Los criterios de diagnóstico para la infección confirmada son uno de los siguientes:

  • Presencia de anticuerpos Ig M y/o Ig A específicos de Toxoplasma 10 días después del nacimiento
  • Título de IgG persistente o en aumento sin tratamiento en lactantes de 1 año de edad o más
  • PCR positiva para ADN de T. Gondii o anticuerpos IgM o Ig A contra Toxoplasma positivos en el LCR

La IgG positivo es indicativo de infección materna anterior o actual. En presencia de otras características sugestivas pero anticuerpos IgM e IgA negativos, la prueba de toxoplasma IgG requiere repetición cada 4 a 6 semanas hasta la desaparición completa.

Los anticuerpos IgM e IgA negativos no excluyen la infección.Si la madre se ve afectada más adelante en su embarazo, hay un retraso en la producción de anticuerpos en el recién nacido. Cuando se sospecha una infección, los anticuerpos deben repetirse cada 2 a 4 semanas hasta por lo menos los 3 meses de edad.

La interpretación de las pruebas serológicas es compleja. Por lo tanto, la confirmación deben realizarse en un Laboratorio Nacional de Referencia para Toxoplasmosis. 

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires. R. Argentina




lunes, 25 de julio de 2022

901- Enfermedad de Chagas en USA

Rachel Marcus, Andrés F. Henao-Martínez, Melissa Nolan, Elizabeth Livingston, Stephen A. Klotz, Robert H. Gilman, Monica Miranda-Schaeubinger, and Sheba Meymandi.  Detección de la enfermedad de Chagas en USA. Ther Adv Infect Dis. 2021 Jan-Dec; 8: 20499361211046086. MedStar Union Memorial Hospital, Baltimore, USA

Resumen

La enfermedad de Chagas (EC), causada por el protozoario Trypanosoma cruzi , es un problema de salud pública, principalmente en los países de América del Sur y Central. Sin embargo, a pesar de la gran cantidad de inmigrantes de países endémicos que viven en los EE. UU., la conciencia de la EC es escasa en la comunidad médica y, por lo tanto, está significativamente infradiagnosticada. Para evitar las complicaciones cardíacas catastróficas de la EC y prevenir la transmisión maternofetal, se necesitan con urgencia programas educativos generalizados que destaquen la necesidad del diagnóstico.

Introducción

La enfermedad de Chagas (EC) es un problema de salud pública en países endémicos y no endémicos. Aunque se han realizado muchos esfuerzos en diferentes frentes para mitigar la carga de esta enfermedad (es decir, estrategias de fumigación, tratamiento antiparasitario, mejoramiento de viviendas y desarrollo de vacunas), las complejidades que rodean a esta enfermedad no se han abordado con éxito. La epidemiología de la EC en los EE. UU. no está bien definida debido a la falta de conciencia en las comunidades de atención médica y de riesgo y los perfiles de diagnóstico deficientes de los ensayos de EE. UU. disponibles comercialmente, lo que genera desafíos de diagnóstico clínico en las poblaciones de riesgo identificadas. Este documento representa el resultado de una reunión de expertos multidisciplinarios de 2017 para evaluar oportunidades para mejorar la detección de EC. Usando esta discusión inicial como punto de partida, brindamos una breve descripción general de la EC y destacamos los desafíos actuales y las posibles soluciones para la detección y la prevención.

Antecedentes de la enfermedad

La EC es una zoonosis parasitaria transmisible a muchos mamíferos, incluido el hombre, causada por el protozoario Trypanosoma cruzi. El T. cruzi consta de siete subtipos genéticos principales, clasificados como unidades de tipificación discretas (DTU) TcI–VI y TcBat, cuya prevalencia varía geográficamente. Existen más de 140 vectores de triatomas competentes (insectos Triatominae, una subfamilia de Reduviidae) de T. cruzi , y 11 especies de 'kissing bugs', también conocidas como chinches, chinches, vinchucas, pitos, piks y barbeiros, capaces de transmitir la EC,  que se encuentran en la mitad sur de los Estados Unidos.Varios mamíferos, incluidos perros, mapaches, zarigüeyas, ratas de bosque y armadillos, pueden actuar como reservorios. 

Debido principalmente a la falta de conocimiento del profesional de salud o a la limitada cobertura de seguro, menos del 1 % de la población estimada de pacientes con EC en los EE. UU. tiene acceso al diagnóstico y tratamiento.  La mayoría de las personas involucradas no saben que están infectadas debido al largo período asintomático asociado con la EC. Además, la familiaridad con la EC entre el público en general, así como entre los grupos de riesgo y entre los medicos es baja.

Sin embargo, las campañas de educación médica han demostrado ser exitosas en los EE. UU., y los esfuerzos futuros deberían trabajar para expandir estas campañas dirigidas entre los médicos que trabajan de cerca con las poblaciones hispanas. 

La diversidad genética intraespecies del parásito podría influir en la variación de las manifestaciones de la enfermedad y el rendimiento del diagnóstico en diferentes regiones geográficas. Las TcII, TcV y ​​TcVI son más prevalentes en el Cono Sur (Uruguay, Chile y Argentina), mientras que TcI es más común en el Cono Norte. En EE. UU., se han identificado TcI y TcII en casos autóctonos, y el tipo TcIV se ha identificado en especies de vectores, lo que sugiere su potencial en humanos. Si bien el origen geográfico subyacente es relevante, la probabilidad de tener un paciente en los EE. UU. con cualquier DTU es grande, lo que destaca la necesidad de tener un diagnóstico integral.

Epidemiología

Con más de 70 millones de personas en riesgo de infección, se estima que 6 millones de personas se ven afectadas en todo el mundo, con una mortalidad anual estimada de 11.000 a 13.000.  Aproximadamente 250.000 personas infectadas residen en los EE. UU.  Los países endémicos tradicionalmente incluyen los 21 países desde los 42°N hasta los 40°S de latitud de las Américas, excluyendo las islas del Caribe y los EE. UU.  La distribución mundial de la EC está impulsada por la presencia del vector, las condiciones de vida, el cambio climático y la migración.  Las tasas de prevalencia dentro de los países endémicos varían según la región, dadas las diferentes condiciones climáticas, la vivienda, el nivel socioeconómico y los esfuerzos de detección y control. (Ver Tabla 1)

La mayoría de los casos informados son de EC crónica, predominantemente en personas mayores, ya que la población anciana infectada con el parásito desarrolla síntomas.  A medida que se han implementado métodos exitosos de control de vectores en países endémicos, la transmisión congénita y oral se han convertido en mecanismos de transmisión más importantes. El T. cruzi también puede transmitirse en menor medida a través de donaciones de sangre y trasplantes de órganos no controlados, accidentes de laboratorio y compartir agujas.................................

Diagnóstico y evaluación continua

El diagnóstico de EC en el paciente con infección aguda o en la reactivación de la enfermedad se realiza mediante la visualización directa del parásito en la preparación de la capa leucocitaria o mediante la prueba de infección mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Los ensayos convencionales son el ensayo de inmunoabsorción ligado a enzimas basado en lisado de epimastigoto o antígenos recombinantes, ensayo de hemaglutinación indirecta, pruebas de inmunofluorescencia indirecta e inmunotransferencia con antígenos tripomastigotes excretados-secretados de T. cruzi. Se requieren dos pruebas positivas de diferentes plataformas u objetivos de diagnóstico para confirmar el diagnóstico. Estas pruebas serológicas de inmunoglobulina sérica (IgG) también se recomiendan para el diagnóstico de EC crónica en adultos y niños mayores y se pueden usar con mujeres embarazadas para identificar qué bebés deben someterse a pruebas de detección al nacer. (ver Bibliogradía)......


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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires. R. Argentina


 

sábado, 23 de julio de 2022

900- Editor de bases geneticas

Katie Kingwell, Editora. Nature reviews News 3 July 2022. Los editores de base llegan a la clínica

(N.E) El Editor de Bases, es decir la introducción de variantes de un solo nucleótido (SNV) en el ADN o el ARN en células vivas, es uno de los avances más recientes en el campo de la edición del genoma. Dado que alrededor de la mitad de las variantes genéticas patógenas conocidas se deben a los SNV, la edición de bases tiene un gran potencial para el tratamiento de numerosas enfermedades genéticas, ya sea a través de alteraciones temporales de las bases del ARN o del ADN. Se espera que la corrección de mutaciones de un solo punto sea un enfoque importante de la medicina de precisión en el futuro.

Los medicamentos de edición del genoma que realizan correcciones precisas en el ADN están entrando en ensayos clínicos para enfermedades cardiovasculares y hematológicas. 

El primer paciente recibió una dosis de un editor de bases, la última tecnología de edición del genoma que ingresa a la clínica, y pronto comenzarán otros ensayos. Estas terapias están diseñadas para cambiar permanentemente una sola letra en el código genético de un paciente en un lugar específico, brindando nuevas oportunidades para silenciar, reparar, modular y regular al alza los genes.

“Hay una forma casi infinita de pensar en el uso de estas herramientas”, dice John Evans, director ejecutivo de Beam Therapeutics, la empresa líder en edición de bases. 

Los editores básicos se basan en una creciente cartera de nucleasas con huellas de zinc TALENS y editores de genes basados ​en CRISPR-Cas9 en ensayos clínicos.  Pero mientras que esos enfoques codifican los genes defectuosos cortando el ADN, los editores básicos tienen capacidades más sofisticadas y potencialmente más seguras.  Los editores básicos combinan la precisión de la maquinaria CRISPR-Cas9 con enzimas desaminasas que pueden modificar el genoma, cambiando la citosina por timina (C→T) o la adenina por guanina (A→G).

El primero en la clínica es VERVE-101 de Verve Therapeutics, un editor base silenciador de PCSK9 dirigido al hígado y desarrollado en colaboración con Beam. El ensayo de fase Ib en hipercolesterolemia familiar heterocigota se inició en Nueva Zelanda el 12 de julio de 2022.

El candidato principal de Beam, BEAM-101, aumenta la producción de hemoglobina fetal para el tratamiento de la enfermedad de células falciformes y la β- talasemia.  Beam se está preparando para comenzar los ensayos clínicos de este fármaco, que edita células madre hematopoyéticas (HSC) derivadas de pacientes ex vivo, en los EE. UU. a finales de este año.

Los resultados de los ensayos comenzarán a proporcionar información sobre cómo estos editores se comparan con otras herramientas de edición del genoma.

La creciente cartera de editores de base (Tabla 1) muestra el potencial diverso de estos medicamentos, pero también destaca las limitaciones de entrega.  Al igual que con otros enfoques de edición del genoma, dominan las oportunidades dirigidas al hígado y ex vivo.  “La entrega sigue siendo un gran desafío”, dice Evans.  “Ahora dedicamos casi tanto tiempo, si no más, a innovar en el lado de la entrega que en el lado de la carga útil”.

Biología de edición básica

Los editores de base constan de tres componentes: un ARN guía (ARNg) de aproximadamente 20 nucleótidos que se une al ADN en un sitio de aterrizaje adyacente a la base objetivo; una enzima Cas9 modificada que desenrolla y 'corta' el esqueleto del ADN en la hebra opuesta a la base objetivo; y una enzima desaminasa editora de bases que transforma el objetivo de una base a otra. Los mecanismos de reparación del ADN de la célula para reparar la muesca, luego hacen coincidir la nueva base con su contraparte, completando la edición en ambas hebras.

Este enfoque fue iniciado por el investigador de Harvard y cofundador de Beam, David Liu, y sus colegas. En 2016, dieron a conocer una citidina desaminasa de rata acoplada a la plataforma CRISPR-Cas9 que podía lograr ediciones básicas . Un año después, diseñaron un editor de base de adenina a partir de una enzima que realiza una reacción relacionada con el ARN. Desde entonces, varios equipos de investigación han creado editores básicos con mayor eficiencia y precisión de edición.

Los editores de base actuales solo pueden activar los interruptores C→T o A→G. Pero, las cuatro ediciones que pueden hacer colectivamente, al editar cualquiera de las cadenas de ADN, pueden abordar más del 60% de las mutaciones patógenas de un solo punto conocidas.

La edición básica podría proporcionar beneficios de seguridad clave sobre los enfoques de corte.  Las nucleasas, incluida la Cas9 'estándar', crean roturas de ADN de doble cadena para alterar los genes diana. Pero cuando las células reparan estas rupturas, pueden hacer que los extremos no coincidan, lo que provoca grandes reordenamientos en el ADN. Un solo evento de corte puede dar como resultado cientos de posibles genotipos dependiendo de cómo la célula resuelva la ruptura de doble cadena, Liu menciona que  “No podemos dictar cuáles son. La célula dicta”. El resultado final es otra preocupación sobre la toxicidad y la oncogenicidad de las herramientas de edición de genes.

La edición básica simplifica el proceso. “Si cortas un hilo, la doble hélice aún se mantiene unida. La célula no tiene que darse cuenta, ahora, ¿qué extremo va con qué extremo? explica Liu.

Entonces, aunque CRISPR-Cas9 y otras nucleasas ahora están más avanzadas, los editores básicos aún podrían ponerse al día. "A la larga, probablemente haya más promesa para las tecnologías que no provocan la rotura de doble cadena, ya que el riesgo de seguridad es menor", dice David Schaffer, profesor de UC Berkeley que estudia terapia génica y edición del genoma. “El potencial para hacer ediciones reales, en lugar de bloquear, deja abierta la posibilidad de tratar más enfermedades”, agrega.

Este perfil de edición más limpio también ofrece la oportunidad de apilar más ediciones en un solo tratamiento.......

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lunes, 18 de julio de 2022

899- Diagnostico automatizado en parasitología

Sandra Valéria Inácio, Jancarlo Ferreira Gomes, Alexandre Xavier Falcão,  Bianca Martins dos Santos,  Felipe Augusto Soares,  Saulo Hudson Nery Loiola,  Stefani Laryssa Rosa,  Celso Tetsuo Nagase Suzuki, Katia Denise Saraiva Bresciani. Diagnóstico Automatizado: Avances en el Diagnóstico de Infecciones Parasitarias Intestinales en Humanos y Animales. Front Vet Sci. 2021; 8: 715406. São Paulo State University (Unesp), School of Veterinary Medicine, Araçatuba, Brazil.

Resumen

La proximidad cada vez mayor entre personas y animales es motivo de gran preocupación para la salud pública, dado el riesgo de exposición a enfermedades infecciosas transmitidas a través de animales, que son portadores de más de 60 agentes zoonóticos. Estas enfermedades, que están incluidas en la lista de Enfermedades Tropicales Desatendidas, causan pérdidas en países con climas tropicales y subtropicales, y en regiones con climas templados. De hecho, afectan a más de mil millones de personas en todo el mundo, una gran proporción de las cuales están infectadas por uno o más helmintos parásitos, lo que provoca pérdidas anuales de miles de millones de dólares. Se están realizando varios estudios en busca de diagnósticos diferenciados, más sensibles y con menos errores. Estos estudios, que involucran el examen automatizado de parásitos intestinales, aún enfrentan desafíos que deben superarse para asegurar la correcta identificación de los parásitos. Esto incluye un protocolo que permite la eliminación de la mayoría de los desechos en las muestras, la tinción satisfactoria de las estructuras del parásito y una sólida base de datos de imágenes. Nuestro objetivo aquí es, por tanto, ofrecer una descripción crítica de las técnicas actualmente en uso para el diagnóstico automatizado de parásitos intestinales en muestras fecales, así como los avances en estas técnicas.

Introducción

Las enfermedades infecciosas parasitarias plantean un importante problema de salud pública, particularmente en los países en desarrollo, donde los servicios básicos de saneamiento suelen ser deficientes y las enfermedades se agravan por factores ambientales como la temperatura, el tipo de suelo, las precipitaciones estacionales y el clima general de cada región geográfica.

La proximidad cada vez mayor entre las personas y sus mascotas, que se mantienen como compañía, entretenimiento y apoyo emocional, también aumenta el riesgo de exposición a enfermedades infecciosas, ya que los animales son portadores de más de 60 agentes zoonóticos. A pesar de los avances en herramientas para el manejo y control de enfermedades parasitarias, los veterinarios y otros profesionales de la salud aún consideran muy importante la aparición de parásitos intestinales en animales de compañía.

Estas enfermedades están incluidas en la lista de “Enfermedades Tropicales Desatendidas”, causando pérdidas en países de clima tropical y subtropical y en regiones de clima templado y afectando a más de mil millones de personas, una sexta parte de la población mundial, una gran proporción de las cuales son infectados por uno o más helmintos, causando pérdidas de miles de millones de dólares cada año.

Los agentes responsables de la amebiasis, ascariasis, anquilostomiasis y trichuriasis se encuentran entre los diez parásitos infecciosos más prevalentes en la población humana en todo el mundo. Sin embargo, aunque su tasa de mortalidad es baja, las complicaciones son comunes y muchos casos requieren hospitalización.

Malabsorción, diarrea, hemorragia, el deterioro de la capacidad de trabajo, la reducción de la tasa de crecimiento y el deterioro de las habilidades cognitivas son problemas sociales y de salud graves vinculados a las infecciones parasitarias intestinales que causan graves cargas económicas a las poblaciones.

Los parásitos gastrointestinales son comunes en perros y gatos y pueden causar daños importantes en el tracto gastrointestinal, aunque algunos animales pueden ser asintomáticos. Los endoparásitos más comunes de perros y gatos, que pueden ser fuente de transmisión a humanos y se consideran zoonóticos y de preocupación para la salud pública, son Giardia spp., Toxocara spp. y Ancylostoma spp.

La giardiasis puede ser asintomática, pero también puede causar diarrea aguda o crónica, además de retraso en el crecimiento en humanos y animales, así como disminución de las funciones cognitivas y fatiga crónica. También puede conducir a trastornos gastrointestinales funcionales posinfecciosos, como el síndrome del intestino irritable y la dispepsia funcional.

Los parásitos del género Toxocara causan infecciones que muchas veces son asintomáticas, pero cuando sus larvas migran desde el intestino delgado al torrente sanguíneo, llegan a los tejidos y provocan el síndrome denominado Visceral Larva Migrans (VLM), que puede migrar a los ojos y provocar Síndrome de Larva Migratoria Ocular (OLM). Otras patologías asociadas a este parásito son la neurotoxocariasis y la toxocariasis encubierta. Los órganos comúnmente afectados son el hígado, los pulmones, el corazón, el cerebro y los ojos, lo que provoca una intensa respuesta inflamatoria, eosinofilia y altos niveles de IgE total.

Además, los parásitos de las especies Ancylostoma braziliense y Ancylostoma caninum pueden causar Larva Migrans Cutánea , con larvas infectantes que penetran en la piel y se trasladan a la dermis, causando inflamación con prurito severo......

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sábado, 16 de julio de 2022

898- Q/A Rol del bioquímico clínico en investigación y ciencias aplicadas

Q&A: Moderators: Christopher Farnsworth, Zhen Zhao, Experts: Fred Apple, Paul Collinson, Mari L DeMarco, Ann Gronowski, David B. Sacks, Yusheng Zhu. Rol crítico del laboratorista clínico en la investigación traslacional y las ciencias aplicadas: percepciones y experiencias de los expertos. Oxford Academic Clin Chem, 2022; 68 (7): 877–883. Clinical Pathology & Laboratory Medicine, Weil Cornell Medical College, New York, NY, USA.

Introducción

Los laboratoristas clínicos han estado a la vanguardia de la traducción de la ciencia a la práctica clínica, desempeñando papeles cruciales en el desarrollo de técnicas, instrumentación y tecnologías que ayudan en la atención del paciente. Algunos avances notables de los laboratoristas incluyen el descubrimiento del método Jaffe para medir la creatinina, el método Folin-Wu para determinar las concentraciones de glucosa en sangre y el instrumento de análisis volumétrico de gas de dióxido de carbono de Van-Slyke. Más recientemente, los laboratoristas han sido fundamentales en el desarrollo de ensayos para la detección de lesiones miocárdicas, enfoques basados ​​en la informática para detectar errores de laboratorio y han estado a la vanguardia de los enfoques de diagnóstico basados ​​en la ómica. En definitiva, los laboratoristas clínicos han sido esenciales para el avance de la medicina y para brindar servicios oportunos,

El laboratorio clínico de hoy en día se ve radicalmente diferente de los laboratorios de épocas anteriores. La gran mayoría de las pruebas desarrolladas en laboratorio han sido reemplazadas por instrumentos y ensayos aprobados por la FDA de los EE. UU. La implementación de la automatización del laboratorio ha desconcetrado aún más el proceso de prueba y ha eliminado el desarrollo de ensayos de las manos del laboratorista. La nueva estructura de los laboratorios también ha requerido un cambio en la forma en que se capacita a los directores de los laboratorios, requiriendo un mayor énfasis en la regulación y la gestión, a veces en detrimento de la investigación y el desarrollo de métodos. Incluso en las instituciones académicas, los laboratoristas clínicos tienen un tiempo protegido limitado para la investigación. 

El panorama en constante cambio del laboratorio clínico y el papel cada vez más clínico/gerencial plantea preguntas importantes sobre el futuro del laboratorista clínico en la investigación, el desarrollo y la traducción de las pruebas de laboratorio. Además, requiere que las nuevas generaciones de laboratoristas clínicos estén capacitadas y preparadas para satisfacer estas necesidades. En esta sesión de preguntas y respuestas, expertos internacionales comparten sus experiencias en la creación de programas de investigación traslacional y el establecimiento de liderazgo en subespecialidades científicas con el objetivo de determinar el papel futuro del laboratorista clínico en la investigación traslacional.

Preguntas y tópicos a considerar

  • ¿Puede compartir su experiencia en la creación de programas de investigación y el establecimiento de liderazgo en especialidades científicas y clínicas específicas.?
  • ¿Cómo equilibra las demandas clínicas y administrativas y dedica tiempo a la investigación?
  • ¿Cree que los laboratoristas deberían especializarse en un área específica de investigación o ser más diversos en sus esfuerzos de investigación? (¿Cómo estableció y se enfoco en su área de investigación?)
  • ¿Cuáles ha encontrado que son las formas más efectivas de realizar colaboraciones en la academia y la industria?
  • ¿Cuál cree que será el papel del laboratorio de medicina en la investigación durante los próximos 10 a 20 años?

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lunes, 11 de julio de 2022

897- Enfermedad celiaca en pediatria

Julia María Cabo del Riego y col. Evaluación de la enfermedad celíaca mediante biomarcadores mínimamente invasivos en una población pediátrica española. Int J Environ Res Public Health. 2022;19(9):5020. Clinical Analysis Laboratory, Department of Inmunology, Hospital Universitario Lucus Augusti, Lugo, España 

Resumen

Antecedentes: El diagnóstico de la enfermedad celíaca (EC) ha mejorado sustancialmente con la disponibilidad de IgA-TG2, Ig-GDP e IgA-EMA altamente sensibles y específicos para EC. The European Society for Pediatric Gastroenterology, Hepatology, and Nutrition (ESPGHAN)  publicó em 2012 y actualizó en 2020 los criterios diagnósticos de EC para simplificar el diagnóstico de EC y evitar biopsias en pacientes seleccionados. 

Métodos: Se realizó un estudio prospectivo que incluyó a 5641 pacientes pediátricos (0-16 años) desde enero de 2012 hasta enero de 2019. El diagnóstico de EC se realizó según el algoritmo ESPGHAN. El objetivo de este estudio fue evaluar la utilidad de los biomarcadores y la relación entre los títulos de TGA-IgA y EMA. 

Resultados: se confirmaron diagnósticos de EC en 113 pacientes: 110 fueron IgA-TG2 positivos y 3 (2,7%) tenían deficiencia de IgA. El diagnóstico se realizó mediante pruebas serológicas en 95 (84,1%) pacientes. Solo 18 (15,9%) pacientes fueron sometidos a biopsia intestinal. Obtuvimos 100% de concordancia entre IgA-EMA y resultados positivos para IgA-TG2 ≥ 10 ULN con título de anticuerpos IgA-EMA ≥ 1:80. 

Conclusiones: Este estudio proporciona evidencia de una correlación positiva entre los niveles séricos de anticuerpos IgA-TG2 y IgA-EMA. El diagnóstico podría garantizarse con la aplicación estricta de valores de IgA-TG2 ≥ 10 LSN (confirmados por estudios posteriores) más la respuesta serológica a la dieta sin gluten (DSG). 

1. Introducción

La enfermedad celíaca (EC) se considera uno de los trastornos relacionados con la alimentación más comunes a lo largo de la vida. Esta es una enfermedad sistémica inmunomediada desencadenada por la exposición al gluten con presentaciones clínicas multifacéticas como manifestaciones gastrointestinales y/o extraintestinales, anticuerpos específicos de EC y enteropatía, cuyo único tratamiento efectivo es una dieta libre de gluten (DLG) de por vida. 

El diagnóstico de la enfermedad ha mejorado sustancialmente con la disponibilidad de anticuerpos transglutaminasa tisular tipo 2 específicos de EC altamente sensibles (IgA-TG2), anticuerpos IgG contra péptidos de gliadina desamidados (IgG-DGP) y anticuerpos antiendomisio IgA (IgA- EMA) con correlaciones entre la atrofia severa de las vellosidades duodenales y los títulos elevados de IgA-TG2 e IgA-EMA.

Uno de los eventos más importantes de los últimos años fue la publicación  the European Society of Pediatric Gastroenterology, Hepatology, and Nutrition (ESPGHAN) Guidelines for Diagnosing Coeliac Disease en 2012. Estas guías se centraron en simplificar el diagnóstico de EC y evitar la biopsia en pacientes seleccionados. Se recomendó que los niños y adolescentes con síntomas sugestivos de EC e IgA-TG2 ≥10 veces el límite superior de la normalidad, confirmado por positividad de IgA-EMA en una segunda prueba serológica, y con positividad para antígeno leucocitario humano (HLA) haplotipo DQ2 o DQ8 debe diagnosticarse sin biopsia de intestino delgado. En cualquier caso, el diagnóstico debía confirmarse mediante la normalización serológica tras una DLG. Recientemente, se publicaron las pautas actualizadas y ampliadas basadas en la evidencia.

Tras la publicación de las Guías ESPGHAN 2012, nuestro grupo de investigación inició un estudio con el objetivo de aplicar sus guías en una amplia población pediátrica con sospecha de EC, del noroeste de España. Nuestros objetivos fueron: (a) analizar el papel de los marcadores serológicos bioquímicos y genéticos para reducir el número de biopsias realizadas, y (b) establecer los resultados serológicos después de 2 años de una DLG.......

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Las páginas de este blog, se renuevan el  16 de Julio. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires. R. Argentina


sábado, 9 de julio de 2022

896- Intervalos de referencia

 Dustin Bunch. Intervalos de referencia modernos. Clinical Laboratory News  Jul.1.2021 

Al desarrollar intervalos de referencia, los laboratorios clínicos deben considerar entre otros factores.  qué fuentes de datos y métodos estadísticos utilizar, 

Históricamente, los laboratorios clínicos se han referido a los intervalos de referencia (IR) como rangos normales y los han desarrollado utilizando muestras de una población "normal o saludable". Sin embargo, este enfoque de IR encuentra rápidamente un obstáculo. A saber: ¿Cómo definimos quién es normal? En la era moderna, definiríamos "normal" lo que es bioquímicamente normal, pero esta es una débil definición , ya que utiliza la lógica circular.

Reconociendo esta deficiencia, la comunidad de laboratorio adoptó el término IR en lugar de rango normal, y en 1987 the International Federation of Clinical Chemistry and Laboratory Medicine (IFCC) publicó una definición detallada de IR, que establece que un IR es "el intervalo creado a partir de una población de referencia que incluye el límite de referencia”. Esta definición más inclusiva permite la determinación de un IR en una población de referencia compuesta por individuos que no están sanos, como aquellos con enfermedades crónicas que afectan gravemente al IR, o pacientes que tienen una elevación crónica que podría oscurecer un evento agudo. Desde que se produjo el cambio de rangos normales a IR, también han surgido diferentes tipos de IR, conocidos como continuos, comunes y personalizados, que afinan aún más el concepto de IR, así como la capacidad de los laboratorios para identificar resultados de pruebas patológicas.

El IR tiene en cuenta las variables del paciente que los médicos conocen, como la edad y el sexo, así como las variables de laboratorio que es poco probable que los médicos conozcan, como qué proveedor y ensayo se utiliza en un laboratorio en particular. Los IR desempeñan un papel fundamental en la atención al paciente al permitir que los médicos interpreten los datos de laboratorio con precisión y vinculen esos datos con la acción clínica. Sin el IR que lo acompaña, un resultado de laboratorio es solo un número. Por lo tanto, es esencial que los laboratorios clínicos establezcan IR que sean precisos y apropiados para sus poblaciones locales de pacientes.

Para facilitar esto, varias organizaciones profesionales han publicado recomendaciones para realizar estudios de IR, incluido the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) y la IFCC. Según el CLSI, el IR se puede determinar a través de dos procesos: métodos directos, que utilizan muestras de pacientes y se consideran el enfoque preferido, y métodos indirectos, que utilizan datos del sistema informático de laboratorio (LIS) o la historia clínica electrónica (EHR) 

Intervalos de referencia directos

La guía actual recomienda desarrollar IR que sean específicos para la población a la que atiende un laboratorio clínico y para el ensayo que está utilizando el laboratorio. Para hacer esto con el método directo, los laboratorios deben usar muestras de una población de pacientes "saludables". Estas muestras pueden provenir de pacientes que fueron prospectivamente reclutados, o pueden ser muestras de pacientes almacenados y/o residuales. Los laboratorios pueden confirmar el estado de salud de los participantes del estudio IR con cuestionarios directos en el caso de reclutamiento prospectivo y/o mediante revisión de expedientes. El objetivo debe ser recopilar un mínimo de 120 puntos de datos para cada partición, lo cual es necesario para determinar el intervalo de confianza del 90 % alrededor de un IR Las particiones pueden incluir sexo, edad, etapa de Tanner y día del ciclo menstrual, por nombrar algunas.

Hay tres obstáculos comunes para determinar el IR Directo que los laboratorios suelen encontrar: no poder reclutar suficientes personas para llenar cada partición, una población incorporada que no refleja la población atendida por el laboratorio clínico y los factores preanalíticos que no logran recapitular los que se encuentran en las operaciones estándar................. 

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Las páginas de este blog, se renuevan el  11 de Julio. 
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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires. R. Argentina