Bruna Aparecida Souza Machado, Katharine Valéria Saraiva Hodel, Valdir Gomes Barbosa-Júnior, Milena Botelho Pereira Soares, Roberto Badaró. Shan-Lu Liu, Academic Editor. Los principales métodos moleculares y serológicos para el diagnóstico de COVID-19: una descripción general basada en la literatura. Viruses. 2021; 13(1): 40. SENAI Institute of Innovation (ISI) in Health Advanced Systems (CIMATEC ISI SAS), University Center SENAI/CIMATEC, Salvador, Bahia, Brazil
Resumen
Las pruebas diagnósticas han sido consideradas como la principal alternativa para el control de la enfermedad por coronavirus (COVID-19), causada por el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2), ya que un diagnóstico correcto permite tomar decisiones a la hora de afrontar la enfermedad, en particular porque hay una falta de suficientes vacunas y protocolos terapéuticos eficaces. Por lo tanto, en esta revisión, resumimos los principales enfoques de diagnóstico actualmente disponibles para el diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2 en humanos según los estudios disponibles en las bases de datos de artículos. Las pruebas se pueden organizar en dos categorías principales: i) pruebas basadas en ácidos nucleicos, recomendadas para la detección inicial del virus, y ii) pruebas serológicas, recomendadas para evaluar la progresión de la enfermedad. Los estudios han demostrado que el rendimiento de los métodos de diagnóstico depende de diferentes factores, como el tipo de muestras y las características de cada ensayo. Se identificó que la positividad de las pruebas se relaciona principalmente con la aparición de síntomas. También observamos que los diagnósticos en el punto de atención se consideran una de las principales tendencias en esta área, debido al bajo costo y la simplicidad del ensayo; sin embargo, el desempeño analítico debe ser analizado críticamente. Por lo tanto, la pandemia de COVID-19 ha puesto de relieve el papel fundamental de las tecnologías de diagnóstico en el control de enfermedades infecciosas.
1. Introducción
La batalla contra las enfermedades infecciosas causadas por microorganismos, particularmente virus, sigue siendo una tarea desafiante e interminable a pesar de las enormes fuerzas y los importantes avances en la salud pública de diferentes partes del mundo. Debido a los avances de la medicina, varios investigadores y científicos creían que la batalla de la humanidad contra los agentes infecciosos estaba prácticamente terminada, con la humanidad como ganadora. Sin embargo, los repetidos brotes de las últimas dos décadas, incluidos coronavirus, influenza aviar y chikungunya, han demostrado la prematuridad de esa posición.
Recientemente, a fines de 2019, se informó de una nueva enfermedad respiratoria de rápida propagación en Wuhan, en la provincia china de Hubei, y ahora ha afectado a más de 216 países en todo el mundo. Los datos completos del genoma viral sugirieron que la enfermedad es causada por un nuevo virus de ARN relacionado con la familia Coronaviridae , que luego fue designado como síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Posteriormente, la enfermedad se denominó enfermedad por coronavirus nuevo (COVID-19).
Los coronavirus (CoV) son virus de ARN de sentido positivo, esféricos, con envoltura, no segmentados y de gran tamaño (100-160 nm), que se sabe que se distribuyen ampliamente en humanos y otros mamíferos. El genoma de CoVs es el genoma viral de ARN más grande, con una longitud de entre 26 y 32 kb. Por lo general, dos tercios del ARN genómico codifica dos grandes poliproteínas superpuestas, el marco de lectura abierto (ORF) 1a y ORF1b, que se procesan en la polimerasa viral (RdRp) y otras proteínas no estructurales (Nsps) involucradas en la síntesis de ARN o la modulación de la respuesta del huésped. El otro tercio del genoma codifica cuatro proteínas estructurales (pico (S), envoltura (E), membrana (M) y nucleocápside (N) y otras proteínas accesorias (3a, 3b, p6, 7a, 7b, 8b, 9b y ORF14).
El análisis filogenético de todo el genoma indicó que el SARS-CoV-2 comparte una identidad de secuencia del 80% y 50% con el SARS-CoV y el coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV), respectivamente, que son otros coronavirus importantes que fueron responsables de endemias anteriores. Además, el SARS-CoV-2 presenta más del 90% de identidad de secuencia para enzimas esenciales y proteínas estructurales, lo que indica un mecanismo de patogénesis común y, por lo tanto, un objetivo terapéutico común con estos virus.
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Lista actualizada al 3 de junio de 2021
