domingo, 26 de diciembre de 2021

840- Niveles de Ct en el Covid-19

Jen A. Miller. Cómo decir no a los informes de valores Ct. Clin Labor News. 2021; Dec 1. Audubon, Nueva Jersey.

La AACC ha abogado en contra del uso de valores de Ct para el manejo de pacientes con COVID-19, y la nueva evidencia respalda un enfoque cauteloso.

(N del E): El umbral del ciclo (Cycle threshold-Ct) hace referencia al número de ciclos necesarios en un ensayo de RT-PCR para amplificar el ARN viral hasta alcanzar un nivel detectable. El valor de Ct puede indicar el nivel relativo de ARN viral en una muestra; cuanto más bajos sean los valores del Ct reflejarían niveles virales más altos. Sin embargo, por regla general los laboratorios no proporcionan el valor del Ct con el resultado cualitativo en la RT-PCR.

Mientras el mundo lidia con la pandemia de COVID-19 en curso, las organizaciones de salud pública están tratando de ayudar a los médicos a comprender la mejor manera de tratar a sus pacientes con las pruebas más precisas y útiles posibles. Una recomendación propuesta, según lo establecido por la Organización Mundial de la Salud (OMS) es utilizar los valores de umbral del ciclos Ct) establecidos por la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (qPCR) como un objetivo de rendimiento para las tecnologías de diagnóstico recientemente desarrolladas.

De esta forma, la OMS utiliza los valores de Ct como sustituto del nivel de carga viral. La OMS ha propuesto un valor Ct de 25 como el nivel mínimo de virus que debe detectarse mediante una prueba de diagnóstico en el lugar de atención. Algunos también han propuesto que se use los Ct para determinar quién tiene una carga viral alta y podría tener un mayor riesgo de contraer una enfermedad grave, que podría ser infeccioso y probablemente propagar la enfermedad, y quién puede ser liberado de las cuarentenas.

La AACC se ha manifestado en contra del uso de valores de Ct para el manejo de pacientes con COVID-19. En una declaración publicada en julio de 2021, la AACC enfatizó que las pruebas de SARS-CoV-2 no están estandarizadas en ningún país, y mucho menos en todo el mundo (www.aacc.org/science-and-research/covid-19-resources). Por lo tanto, el mismo valor de Ct puede significar cosas muy diferentes para diferentes pruebas, lo que puede conducir a una atención inadecuada al paciente.

“Puedo entender por qué la gente querría comparar los valores de Ct, pero existe un potencial de daño cuando se mira un ensayo que no está validado para ser cuantitativo. Las pruebas de SARS-CoV-2 están validadas para ser cualitativas ”, dijo Deborah Payne, PhD (ASCP), consultora clínica y miembro del grupo AACC que redactó la declaración de valores de AACC-Ct.

 No hay dos fosas nasales iguales

Payne dijo que es natural pensar que los valores de Ct se pueden usar para determinar la gravedad de COVID-19. Esto se debe a que los valores de Ct se utilizan de forma rutinaria para detectar la carga viral en infecciones como el VIH y los virus de la hepatitis C y B. Ese número es valioso porque la recolección de orina o sangre es uniforme, dijo. Sin embargo, "la recolección de un hisopo no lo es".

Para empezar, no todos los hisopos, nariz o incluso cada fosa nasal de la misma persona son iguales. “Existe una variación biológica entre las cavidades nasales. Puede tener una fosa nasal con SARS-CoV-2 detectable y la otra fosa nasal sin detección, por lo que la recomendación es frotar ambos lados de la nariz ”, dijo.

Los profesionales del laboratorio clínico tampoco tienen aún los datos para comprender las condiciones óptimas para tomar muestras para una prueba de PCR para una enfermedad respiratoria. Algunos análisis de orina se toman mejor por la mañana, por ejemplo, y algunas muestras de sangre se extraen después de que el paciente ayuna. “Realmente no sabemos lo suficiente sobre el sistema respiratorio cuando se trata de este tipo de pruebas y cuál es el momento óptimo del día para recolectar una muestra”, dijo Payne. "No sabemos lo suficiente sobre la diseminación del virus respiratorio como para saber si hay un momento en particular en el que es mejor realizar una prueba, o si hay una diferencia entre la mañana y la noche, y cómo eso afectará los resultados".

Además de no poder ajustar las diferencias en los hisopos y las fosas nasales, y de no haber establecido las condiciones óptimas de muestreo, la gran cantidad de ensayos con autorización de uso de emergencia (EUA) en los EE. UU. y el equivalente en otros países significa que no existen estándares a través de plataformas de prueba y laboratorios. No están calibrados entre sí, por lo que un valor Ct de 25 en una prueba podría significar una carga viral alta en un paciente en California,  una carga viral baja en un paciente en Nueva Jersey y en algún punto intermedio en un paciente en Australia.

Sin calibración, un valor de Ct es "virtualmente insignificante", dijo Jim Francis Huggett, PhD, del Laboratorio Nacional de Medición del Reino Unido en LGC, y profesor de microbiología analítica en la Universidad de Surrey, quien se propuso descubrir cuán insignificante es. 

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Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina