lunes, 20 de mayo de 2024

1064- Nuevos limites en urocultivos pediatricos

Nader Shaikh; Sojin Lee; Janina A. Krumbeck; Marcia Kurs-Lasky. "Utlizando  nuevos límites de corte para definir un urocultivo positivo en niños". Pediatrics 2023; 152 (4): e2023061931. Children’s Hospital of Pittsburgh of UPMC

Resumen (ChatGPT)

En este artículo de Pediatrics, los investigadores proponen un nuevo umbral para definir un urocultivo positivo en niños. El estudio aborda el desafío de diagnosticar infecciones del tracto urinario (ITU) en niños, donde los límites tradicionales para el crecimiento bacteriano pueden conducir a un sobrediagnóstico y a un tratamiento innecesario. El límite propuesto tiene como objetivo reducir las prescripciones innecesarias de antibióticos y al mismo tiempo identificar con precisión las ITU. A través de su análisis, los investigadores proporcionan evidencia que respalda la efectividad de este nuevo umbral, que podría tener implicaciones significativas para la práctica clínica en la atención pediátrica. 

Resumen

Antecedentes:  El urocultivo convencional selecciona una gama limitada de organismos que crecen bien en condiciones aeróbicas. Por el contrario, el examen de secuencias de genes bacterianos en la orina proporciona una evaluación relativamente imparcial de los organismos presentes. Por lo tanto, al utilizar la secuenciación del amplicón del gen del ácido ribonucleico ribosómico (ARNr) 16S como estándar de referencia, ahora tenemos la capacidad de evaluar la precisión del urocultivo en el diagnóstico de la infección del tracto urinario (ITU).

Métodos: Se inscribieron niños febriles de 1 mes a 3 años de edad que se sometieron a cateterismo vesical por sospecha de ITU. Utilizando la secuenciación del amplicón del gen 16S rRNA como estándar de referencia, calculamos la precisión del urocultivo en varios puntos de corte (10 000, 50 000 y 100 000 unidades formadoras de colonias por mililitro). Los niños con una abundancia relativa ≥80 % de cualquier organismo en la secuenciación del amplicón del gen 16S rRNA con marcadores urinarios elevados de inflamación se definieron como portadores de una ITU.

Resultados:  Cuando se utilizó un límite de 10 000 UFC/mL, la sensibilidad y especificidad del urocultivo fueron del 98 % (intervalo de confianza [IC] del 95 %: 93 %–100 %) y del 99 % (IC del 95 %: 97 %–100 %). , respectivamente. El uso de un punto de corte de 50 000 unidades formadoras de colonias por ml disminuyó la sensibilidad al 80 % (IC del 95 %: 68 %–93 %) sin cambiar la especificidad. El uso de un punto de corte de 100 000 disminuyó aún más la sensibilidad al 70 % (IC del 95 %: 55 %–84 %).

Conclusiones: El cultivo convencional sigue siendo un método preciso para diagnosticar las ITU en niños pequeños; sin embargo, estos datos sugieren que un límite de 10 000 unidades formadoras de colonias por ml proporciona el equilibrio óptimo entre sensibilidad y especificidad para los niños sometidos a cateterismo vesical.

Lo que se conoce sobre este tema:  Para establecer el límite con la mayor precisión en la prueba de urocultivo se requiere una comparación con un estándar de referencia. Hasta la fecha, ningún estudio ha comparado el urocultivo con un estándar de referencia independiente del cultivo.

Qué agrega este estudio: Los datos de este estudio de precisión diagnóstica respaldan el uso de un límite de 10 000 unidades formadoras de colonias por ml para diagnosticar infección del tracto urinario en niños febriles sometidos a cateterismo vesical.

Introducción

La definición de urocultivo positivo ha sido objeto de controversia durante décadas. El uso de un límite de 100.000 unidades formadoras de colonias por mililitro (UFC/mL) para definir la infección del tracto urinario (ITU) en pacientes adultos se basó en gran medida en un pequeño estudio de casos y controles informado por Kass  en 1956 en el que comparó los resultados de los urocultivos. de mujeres con pielonefritis clínicamente diagnosticada y controles asintomáticos; la mayoría de las mujeres con pielonefritis tenían recuentos de colonias superiores a 100 000 UFC/ml y la mayoría de las mujeres asintomáticas tenían recuentos de colonias inferiores a 10 000 UFC/ml. 

Casi 30 años después, en un estudio transversal de niños pequeños sometidos a cateterismo vesical para descartar ITU,  Hoberman y col. compararon las características de niños que tenían un crecimiento de    10 000 a 49 000 UFC/ml y de 50 000 a 99 000 UFC/mL.  Entre las 35 muestras con un crecimiento entre 10 000 y 99 000 UFC/mL, se observaron con mayor frecuencia crecimiento mixto y/o cocos grampositivos entre niños con recuentos de colonias de 10 000 a 49 000 UFC/mL en comparación con niños con recuentos de colonias de 50 000 a 99 000 UFC/mL. 

Desde entonces, el límite de 50 000 ha sido el límite aceptado para la interpretación de los resultados de los cultivos de muestras recogidas mediante cateterismo en niños menores de 2 años.  Sin embargo, debido a que en ninguno de estos 2 estudios se utilizó un estándar de referencia independiente del cultivo, solo pueden considerarse explicativos  y no pueden proporcionar más que aproximaciones a un punto de corte que podría resultar útil en la práctica clínica. De hecho, ha habido informes de problemas con el límite pediátrico actualmente aceptado de 50 000 UFC/ml. 

Un ejemplo notable proviene de un estudio de Swerkersson et al  en el que una proporción considerable de niños pequeños con pielonefritis confirmada radiológicamente tenían recuentos de colonias por debajo del límite actualmente aceptado de 50 000 UFC/mL.

Para investigar las compensaciones entre sensibilidad y especificidad en varios puntos de corte, se necesita un estudio transversal en el que se realice tanto un urocultivo (la prueba índice) como un estándar de referencia independiente del cultivo en muestras no seleccionadas de sujetos en quienes es clínicamente sensato sospechar ITU. Los avances recientes en  secuenciación , que utiliza la secuencia exacta del gen altamente conservado del ARN ribosomal (ARNr) 16S para identificar las bacterias presentes en las muestras, permite disponer de un estándar de referencia sensible y relativamente imparcial para la identificación de organismos en la orina. 

En un estudio anterior, encontramos una alta concordancia entre la secuenciación del amplicón del gen 16S rRNA (en lo sucesivo denominada secuenciación 16S) y el urocultivo convencional en una cohorte de niños pequeños (sin superposición con la cohorte actual) que se estaban evaluando para detectar ITU.  En esta cohorte de niños pequeños y febriles sometidos a cateterismo vesical para descartar una ITU, utilizando la secuenciación 16S como estándar de referencia, calculamos la precisión del cultivo convencional en diferentes puntos de corte para identificar el que proporciona el equilibrio óptimo de sensibilidad y especificidad..........

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Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina