Diana Kwon. Se encontró que estudios genéticos muy citados contienen errores de secuencia. Nature News article 10 February 2023.
Un análisis de dos revistas destacadas revela docenas de artículos con aparentes errores en sus reactivos de detección de nucleótidos.
La prevalencia de errores en la investigación genética publicada podría estar más extendida de lo que se pensaba, según un análisis de artículos sobre genética del cáncer en dos revistas de alto impacto.
Al revisar la información complementaria de cientos de artículos, un equipo dirigido por la investigadora del cáncer Jennifer Byrne de la Universidad de Sydney en Australia ha identificado algunos estudios muy citados que contienen errores en los reactivos en las secuencias de ADN o ARN . Los científicos usan estos reactivos por varias razones, por ejemplo, para estudiar la función de un gen o secuencia genética determinada en una enfermedad, y si las secuencias se informan incorrectamente, podría afectar la reproducibilidad de la investigación.
No está claro si los errores son accidentales o indican mala conducta. El estudio, publicado en el servidor de pre-impresión bioRxiv el 3 de febrero, no ha sido revisado por pares. Algunos investigadores también cuestionan hasta qué punto los errores a nivel de nucleótidos individuales podrían afectar las conclusiones de los artículos. Sin embargo, la mayoría coincide en que la presencia de tales errores en la literatura científica es preocupante.
“Ciertamente es desalentador ver este tipo de errores”, dice Jeremy Wilusz, biólogo molecular del Baylor College of Medicine en Houston, Texas. “Si es solo un problema de informes o algo más grande, eso no lo sé, pero no debería estar sucediendo”.
Buscando errores
Byrne y su equipo han estado investigando la literatura científica en busca de errores en las secuencias genéticas desde que encontraron un puñado de artículos con este problema en 2015. En 2021, Byrne y sus colegas analizaron casi 12.000 artículos en las revistas Gene and Oncology Reports usando Seek & Blastn, una herramienta de software que extrae secuencias cortas de nucleótidos mencionadas en artículos, que detecta posibles errores y los compara con una base de datos pública de nucleótidos conocida como Blastn. Encontraron más de 700 artículos que informaban sobre reactivos experimentales que tenían errores en sus secuencias de ARN o ADN.
En el último estudio, el equipo quería investigar revistas con un factor de impacto relativamente alto, una medida, basada en citas, que algunos utilizan como indicador del alcance y prestigio de una revista. “Posiblemente, es la literatura de alto factor de impacto a la que la gente le presta más atención”, dice Byrne.
Los investigadores se centraron en artículos sobre genética del cáncer publicados en dos revistas: Molecular Cancer, en la que habían encontrado algunos artículos con secuencias incorrectas durante análisis anteriores, y Oncogene . (Ambas revistas son publicadas por Springer Nature; el equipo de noticias de Nature es independiente de su editor).
Byrne y sus colegas examinaron manualmente los reactivos que afirman apuntar a genes humanos no modificados o secuencias genómicas en 334 artículos sobre el cáncer molecular publicados en 2014, 2015, 2018 y 2020. (Debido a que los reactivos de secuencia de nucleótidos en los artículos se informaron en los archivos complementarios, en lugar de el texto principal, el equipo no pudo usar la herramienta Seek & Blastn).
El equipo encontró errores en 253 (3,8%) de las 6.647 secuencias de nucleótidos analizadas. Los errores se distribuyeron en 92 de los 334 manuscritos y la mediana de secuencias problemáticas fue de 2 por artículo. La proporción de artículos con errores en la secuencia de nucleótidos osciló entre el 10 % de los artículos en 2016 y el 38 % en 2020. “La mayor sorpresa para nosotros fue la proporción de artículos con errores en 2020”, dice Byrne. “No esperábamos eso”.
(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Nueva presentación el 10 de Marzo.
Cordiales saludos.
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires. R. Argentina
