782- Covid-19- Reactivos para diagnostico uso in vitro

Bruna Aparecida Souza Machado, Katharine Valéria Saraiva Hodel, Valdir Gomes Barbosa-Júnior, Milena Botelho Pereira Soares, Roberto Badaró. Shan-Lu Liu, Academic Editor. Los principales métodos moleculares y serológicos para el diagnóstico de COVID-19: una descripción general basada en la literatura. Viruses. 2021; 13(1): 40. SENAI Institute of Innovation (ISI) in Health Advanced Systems (CIMATEC ISI SAS), University Center SENAI/CIMATEC, Salvador, Bahia, Brazil

Resumen

Las pruebas diagnósticas han sido consideradas como la principal alternativa para el control de la enfermedad por coronavirus (COVID-19), causada por el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2), ya que un diagnóstico correcto permite tomar decisiones a la hora de afrontar la enfermedad, en particular porque hay una falta de suficientes vacunas y protocolos terapéuticos eficaces. Por lo tanto, en esta revisión, resumimos los principales enfoques de diagnóstico actualmente disponibles para el diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2 en humanos según los estudios disponibles en las bases de datos de artículos. Las pruebas se pueden organizar en dos categorías principales: i) pruebas basadas en ácidos nucleicos, recomendadas para la detección inicial del virus, y ii) pruebas serológicas, recomendadas para evaluar la progresión de la enfermedad. Los estudios han demostrado que el rendimiento de los métodos de diagnóstico depende de diferentes factores, como el tipo de muestras y las características de cada ensayo. Se identificó que la positividad de las pruebas se relaciona principalmente con la aparición de síntomas. También observamos que los diagnósticos en el punto de atención se consideran una de las principales tendencias en esta área, debido al bajo costo y la simplicidad del ensayo; sin embargo, el desempeño analítico debe ser analizado críticamente. Por lo tanto, la pandemia de COVID-19 ha puesto de relieve el papel fundamental de las tecnologías de diagnóstico en el control de enfermedades infecciosas.

1. Introducción

La batalla contra las enfermedades infecciosas causadas por microorganismos, particularmente virus, sigue siendo una tarea desafiante e interminable a pesar de las enormes fuerzas y los importantes avances en la salud pública de diferentes partes del mundo. Debido a los avances de la medicina, varios investigadores y científicos creían que la batalla de la humanidad contra los agentes infecciosos estaba prácticamente terminada, con la humanidad como ganadora. Sin embargo, los repetidos brotes de las últimas dos décadas, incluidos coronavirus, influenza aviar y chikungunya, han demostrado la prematuridad de esa posición. 

Recientemente, a fines de 2019, se informó de una nueva enfermedad respiratoria de rápida propagación en Wuhan, en la provincia china de Hubei, y ahora ha afectado a más de 216 países en todo el mundo. Los datos completos del genoma viral sugirieron que la enfermedad es causada por un nuevo virus de ARN relacionado con la familia Coronaviridae , que luego fue designado como síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Posteriormente, la enfermedad se denominó enfermedad por coronavirus nuevo (COVID-19).

Los coronavirus (CoV) son virus de ARN de sentido positivo, esféricos, con envoltura, no segmentados y de gran tamaño (100-160 nm), que se sabe que se distribuyen ampliamente en humanos y otros mamíferos. El genoma de CoVs es el genoma viral de ARN más grande, con una longitud de entre 26 y 32 kb. Por lo general, dos tercios del ARN genómico codifica dos grandes poliproteínas superpuestas, el marco de lectura abierto (ORF) 1a y ORF1b, que se procesan en la polimerasa viral (RdRp) y otras proteínas no estructurales (Nsps) involucradas en la síntesis de ARN o la modulación de la respuesta del huésped. El otro tercio del genoma codifica cuatro proteínas estructurales (pico (S), envoltura (E), membrana (M) y nucleocápside (N) y otras proteínas accesorias (3a, 3b, p6, 7a, 7b, 8b, 9b y ORF14).

El análisis filogenético de todo el genoma indicó que el SARS-CoV-2 comparte una identidad de secuencia del 80% y 50% con el SARS-CoV y el coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV), respectivamente, que son otros coronavirus importantes que fueron responsables de endemias anteriores. Además, el SARS-CoV-2 presenta más del 90% de identidad de secuencia para enzimas esenciales y proteínas estructurales, lo que indica un mecanismo de patogénesis común y, por lo tanto, un objetivo terapéutico común con estos virus.

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ANMAT: Reactivos de Uso in Vitro para COVID-19 que se encuentran autorizados  en el marco de la emergencia sanitaria

Lista actualizada al 3 de junio de 2021  

(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Las páginas de este blog , se renuevan dentro de 5 días en forma automática. Cordiales saludos. 

Dr. Anibal E. Bagnarelli,

Bioquímico-Farmacéutico-UBA.

Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

781- Covid-19: nuevas variantes

David Adam. Editor Nature  News  article 24 May 2021. Lo que saben los científicos sobre las nuevas variantes de coronavirus de rápida propagación.

Sigue habiendo preguntas clave sobre la rapidez con la que se pueden propagar las variantes de B.1.617, su potencial para evadir la inmunidad y cómo podrían afectar el curso de la pandemia.

Desde que la variante SARS-CoV-2 conocida como B.1.617 se informó por primera vez en la India a fines del año pasado, se ha extendido a docenas de otros países, incluidos los Estados Unidos, Singapur y el Reino Unido, donde se ha vuelto dominante en algunas regiones. .

Desde entonces, los investigadores han identificado tres subtipos, conocidos como B.1.617.1 (el B.1.617 'original'), B.1.617.2 y B.1.617.3, cada uno con una estructura genética ligeramente diferente.

Ahora se apresuran a investigar estas variantes y averiguar cómo podrían afectar la trayectoria de la pandemia en los países donde se han afianzado. Quedan preguntas clave sobre la rapidez con la que se pueden propagar las variantes, su potencial para evadir la inmunidad y si causan una enfermedad más grave.

Gran parte de esta investigación adopta la forma de epidemiología estándar: confirma los casos de COVID-19 mediante pruebas, identifica las variantes responsables de las infecciones y hace referencias cruzadas de estos datos con los síntomas clínicos y los estados de vacunación de las personas. Los científicos también pueden obtener conocimientos de los datos de secuenciación genómica, identificando qué mutaciones están presentes en los subtipos B.1.617 y comparándolas con mutaciones en variantes anteriores cuyo comportamiento se comprende mejor.

Más transmisible

“Observo las mutaciones individuales porque cada una tiene propiedades individuales que creemos que pueden conferir una mayor transmisibilidad”, dice Julian Tang, virólogo consultor en Leicester Royal Infirmary, Reino Unido. Una mayor transmisibilidad, una medida de la rapidez con la que las variantes se pueden propagar de una persona a otra, podría acelerar los brotes, lo que podría ejercer más presión sobre los sistemas de atención médica y contramedidas como los programas de vacunación. Por ejemplo, la variante B.1.617.2 tiene mutaciones llamadas 452R y 478K, que según Tang están vinculadas a una mayor transmisibilidad. Ambas mutaciones alteran la proteína pico, que el virus usa para ingresar a las células humanas.

Los investigadores también han podido rastrear rápidamente la propagación de B.1.617.2 porque su genoma contiene un marcador del que carece la variante B.1.1.7 dominante. La presencia de este marcador, conocido como el 'objetivo del gen S', se puede ver en los resultados de algunas de las pruebas de PCR utilizadas para confirmar los casos de COVID-19, por lo que los investigadores pueden utilizar los resultados positivos del objetivo S como un proxy para rápidamente mapear la dispersión de B.1.617.2, sin necesidad de secuenciar completamente las muestras. Tanto las pruebas del gen S como los datos de secuenciación más detallados de las muestras de virus del Reino Unido indican que B.1.617.2 está superando a los otros dos subtipos B.1.617 y reemplazando a B.1.1.7, una variante identificada en el sureste de Inglaterra a fines de 2020 la variante más común que genera nuevas infecciones en el país...........

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780- COVID-19 : buscando nuevos marcadores

Editor, Smriti Mallapaty. Los científicos se concentran en el marcador buscado durante mucho tiempo sobre la eficacia de la vacuna COVID.  Nature  News  21 May 2021

Los datos de siete ensayos de vacunación ayudan a identificar un marcador sanguíneo para la protección contra la enfermedad 

Una vez que las personas han sido vacunadas contra COVID-19, según un modelo computacional los niveles de anticuerpos que bloquean la infección en su sangre son un fuerte indicador de cuánta protección han obtenido contra la enfermedad, . La investigación mostró que la presencia de incluso pequeñas cantidades de estos potentes "anticuerpos neutralizantes" indica que una vacuna es eficaz para proteger contra COVID-19. 

El estudio es el mejor intento hasta ahora para definir las características de la respuesta inmune que pueden actuar como un sustituto de la protección contra COVID-19, conocido como un "correlato de protección", dice Daniel Altmann, inmunólogo del Imperial College of London. “Encontrar el correlato de protección ha sido realmente un santo grial para esta enfermedad, como para otras. Es sorprendente lo difícil que es hacerlo".

Si los investigadores tienen un correlato de protección bien definido, pueden predecir a partir de los datos de los primeros ensayos qué tan efectiva será una vacuna, dice James Triccas, microbiólogo médico de la University of Sydney en Australia y coautor del estudio. Esto "alivia la necesidad de realizar ensayos de fase III más grandes, más costosos y que requieren más tiempo".

Triccas y sus colegas examinaron datos de anticuerpos neutralizantes de ensayos de siete vacunas ampliamente utilizadas. El equipo encontró un fuerte vínculo entre los niveles de anticuerpos de los participantes registrados en los ensayos en etapa inicial y los resultados de eficacia de la vacuna de los ensayos en etapa tardía. Los investigadores estiman que una vacuna tiene una eficacia del 50% incluso si induce niveles de anticuerpos un 80% más bajos que los encontrados, en promedio, en una persona que se ha recuperado del COVID-19.

Las vacunas que generaron las respuestas de anticuerpos neutralizantes más fuertes, como las vacunas basadas en ARNm fabricadas por Moderna y Pfizer-BioNTech, fueron las más protectoras. Las vacunas que indujeron una respuesta más débil, que incluyó el Oxford-AstraZeneca, proporcionaron niveles más bajos de protección. Los investigadores predicen que debido a que los niveles de anticuerpos disminuyen con el tiempo, es posible que se necesiten inyecciones de refuerzo en aproximadamente un año, pero la protección contra enfermedades graves podría durar muchos años incluso sin ellas.

Los hallazgos ayudan a explicar por qué, a pesar de que los estudios muestran que algunas variantes del coronavirus SARS-CoV-2 reducen la capacidad de neutralizar los anticuerpos para bloquear la infección, a la mayoría de las personas que se han vacunado, incluso con una sola dosis, no les va tan mal si está infectado con esas variantes, dice Altmann. "Incluso los niveles bajos de anticuerpos, más bajos de lo que pensamos, probablemente te ayudarán".

Se necesitan más estudios para precisar qué células o moléculas determinan el nivel de protección, dice Dan Barouch, del Center for Virology and Vaccine Research en el  Beth Israel Deaconess Medical Center, Boston, Massachusetts. . Esto podría diferir según la tecnología de la vacuna, .

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779- Serologia de la toxoplasmosis

Rochelle Haidee D. Ybañez,  Adrian P. Ybañez, Yoshifumi Nishikawa. Revisión sobre las tendencias actuales del serodiagnóstico de toxoplasmosis en humanos. Front Cell Infect Microbiol. 2020; 10: 204. National Research Center for Protozoan Diseases, Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine, Obihiro, Japan.

Resumen

La toxoplasmosis es una infección zoonótica de amplia distribución causada por el parásito apicomplexano intracelular obligado Toxoplasma gondii . Se transmite principalmente a través de la ingestión de ooquistes desprendidos por un gato infectado que actúa como su huésped definitivo. La clave para el control y el tratamiento eficaces de la toxoplasmosis es la detección rápida y precisa de T. gondiiinfección. Se han establecido varios métodos de diagnóstico de laboratorio, incluidos los ensayos serológicos más utilizados como la prueba de colorante (DT), prueba de aglutinación directa o modificada (DAT/MAT), prueba de hemaglutinación indirecta (IHA), prueba de aglutinación de látex (LAT), prueba de aglutinación indirecta prueba de inmunofluorescencia (IFAT), pruebas de inmunoabsorción ligada a enzimas (ELISA), pruebas inmunocromatográficas (ICT) y western blot. No obstante, la creación de enfoques específicos y fiables para el serodiagnóstico de T.gondiiin, y diferenciar entre las fases aguda y crónica de la infección sigue siendo un desafío. Esta revisión proporciona información sobre las tendencias actuales en el serodiagnóstico de la toxoplasmosis humana. Destaca las ventajas del uso de proteínas recombinantes para pruebas serológicas y proporciona información sobre la posible dirección futura de estos métodos.

Introducción

La toxoplasmosis es una infección zoonótica de amplia distribución causada por el parásito apicomplexano intracelular obligado Toxoplasma gondii. El T. gondii infecta a los seres humanos y a casi todos los animales de sangre caliente, por lo que es uno de los parásitos importantes que afectan la salud pública y la producción animal. Se transmite principalmente a través de la ingestión de ooquistes desprendidos por un gato infectado como hospedador definitivo. 

La toxoplasmosis afecta aproximadamente a un tercio de la población humana mundial. Sin embargo, generalmente es asintomático en individuos inmunocompetentes o puede manifestar síntomas similares a los de la gripe y otros signos clínicos inespecíficos. La enfermedad puede incluso ser grave o mortal en pacientes inmunodeprimidos . La transmisión vertical del parásito a través de la placenta de la madre infectada puede comprometer la vida del feto y de las madres infectadas . La clave para el control y el tratamiento eficaces de la toxoplasmosis depende de la detección precisa de la infección por T. gondii. 

La utilización de métodos de diagnóstico altamente sensibles y específicos es un paso vital en la prevención y el tratamiento de la enfermedad.  Debido a la falta de especificidad de los signos clínicos, el diagnóstico de la infección por T. gondii no se puede realizar mediante la evaluación de las manifestaciones clínicas. El diagnóstico de T. gondii para pacientes inmunodeprimidos generalmente se realiza mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), ensayos de hibridación, aislamiento y análisis histológico. Para los casos congénitos, el diagnóstico se realiza mediante la detección directa del organismo mediante inoculación en ratón, cultivo celular o PCR a partir de muestras extraídas de líquido amniótico, líquido cefalorraquídeo, sangre y orina  y mediante exámenes oftalmológicos y radiológicos. 

Sin embargo, la forma más común de infección por T. gondii es latente, en la que los parásitos generalmente no se encuentran en la circulación, y el aislamiento de los parásitos es particularmente desafiante). Pero como el T. gondii induce una respuesta inmune humoral intensa y a menudo persistente con títulos de anticuerpos detectables, independientemente de las manifestaciones clínicas en los individuos infectados, las pruebas serológicas que detectan respuestas de anticuerpos específicas son necesarias. 

A lo largo de los años, se han establecido varios métodos serológicos para el diagnóstico de la toxoplasmosis y muchos han arrojado resultados satisfactorios. Sin embargo, el desarrollo de enfoques específicos y fiables para el serodiagnóstico de la infección por T. gondii , que idealmente podría diferenciar entre las fases aguda y crónica de la infección, sigue siendo muy complicado. Esta revisión ofrece conocimientos actualizados sobre las tendencias actuales en el serodiagnóstico de la toxoplasmosis humana. Destaca las ventajas del uso de proteínas recombinantes para pruebas serológicas. Además, también se proporciona información sobre la posible dirección futura de estos métodos.

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778- Diagnóstico de Chagas

Fernando Abad-Franch. Editor Pierre Buekens. Diagnóstico y evaluación de la curación de la enfermedad de Chagas: jerarquizar formalmente un problema naturalmente jerárquico. PLoS Negl Trop Dis. 2020; 14(10): e0008751.  Núcleo de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de Brasília, Brazil. Tulane University, USA

Detección de patógenos en hosts infectados: una cuenta informal

En un artículo reciente de Viewpoint, Alonso-Padilla y sus colegas discuten las dificultades de clasificar con seguridad a un paciente con enfermedad de Chagas como "curado", o con "cura", definida como la "eliminación de los parásitos Trypanosoma cruzi del cuerpo del paciente después del tratamiento".  Este es, por supuesto, un caso particular de un problema mucho más general: los médicos deben clasificar con seguridad a los sujetos como infectados o no con un patógeno para tomar decisiones clínicas, comprender la epidemiología de las enfermedades infecciosas y medir los efectos de las intervenciones terapéuticas o preventivas. .

Sin embargo, la detección de patógenos en los cuerpos infectados no suele ser fácil. Un revés común es que el patógeno puede estar presente en algunas partes del cuerpo del sujeto (por lo que el sujeto está infectado ), pero ausente de la muestra específica utilizada para la prueba, digamos, una gota de sangre. En el caso de la enfermedad de Chagas, el T. cruzi está de hecho ausente del torrente sanguíneo de los sujetos infectados la mayor parte del tiempo, particularmente en la fase crónica, y los parásitos del torrente sanguíneo deberían volverse aún más raros después de que los pacientes tomen medicamentos para matar parásitos. Un resultado negativo de la prueba cuando el patógeno objetivo no estaba disponible para la detección en la muestra analizada difícilmente puede verse como un falso negativo "verdadero"; la prueba dio el resultado correcto a nivel de la muestra, a pesar de que el sujeto estaba infectado. 

Tenga en cuenta que el "objetivo" de detección puede ser el propio patógeno o un biomarcador sustituto, ya sea derivado de un patógeno, como proteínas o ácidos nucleicos, o derivado del huésped, como los anticuerpos.También producen un resultado negativo a pesar de que el objetivo está presente, y por lo tanto disponible para detección , en una muestra dada de un sujeto infectado; esto califica como un verdadero falso negativo. En la práctica, cualquier prueba puede no detectar un patógeno objetivo (o biomarcador) que está presente en una muestra porque todas las pruebas tienen una sensibilidad imperfecta (<1.0). Finalmente, una prueba puede arrojar un resultado positivo a partir de una muestra que no contenía el objetivo. Esto refleja el problema general de la especificidad de la prueba imperfecta. 

En lo que sigue, me centraré en la disponibilidad del objetivo y la sensibilidad de la prueba asumiendo temporalmente una especificidad del 100%; aunque es difícil de garantizar incluso con las mejores prácticas de muestreo y laboratorio, la especificidad puede ser cercana al 100% para la determinación directa de la presencia de patógenos (por ejemplo, a través de métodos parasitológicos basados ​​en microscopía, cultivo o xenodiagnóstico) y para algunas pruebas basadas en ADN (por ejemplo, usando PCR o amplificación isotérmica). Revisaré la especificidad imperfecta al final de mi argumento.......

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777- Neurocisticercosis-Taenia solium

Héctor H. García , Seth E. O'Neal , John Noh , Sukwan Handali, Colleen Suzanne Kraft, . Diagnóstico de laboratorio de neurocisticercosis (Taenia solium). J Clin Microbiol. 2018 Sep; 56 (9): e00424-18. Unidad de Cisticercosis, Instituto Nacional de Ciencias Neurológicas, Lima, Perú y Emory University, Atlanta-USA 

Resumen

La neurocisticercosis representa aproximadamente el 30% de todos los casos de epilepsia en la mayoría de los países en desarrollo. El inmunodiagnóstico de la cisticercosis es complejo y está muy influenciado por el curso de la infección, la carga de la enfermedad, la ubicación del quiste y la respuesta inmunitaria del huésped. Por tanto, el enfoque principal del inmunodiagnóstico debería consistir en evaluar si los resultados serológicos concuerdan con el diagnóstico sugerido por las imágenes. La detección de anticuerpos se realiza utilizando antígenos de parásitos purificados con lectina de lentejas en un formato de transferencia de inmuno-electrotransferencia ligado a enzimas, mientras que la detección de antígenos utiliza un ensayo de inmuno-absorción ligado a enzimas (ELISA) basado en anticuerpos monoclonales. Se han desarrollado nuevas configuraciones de ensayo prometedoras para la detección tanto de anticuerpos como de antígenos,

Introducción

La Taenia solium, o  tenia del cerdo, es endémica en la mayoría de los países en desarrollo donde se crían cerdos. La coexistencia de la cría de cerdos domésticos y las malas condiciones sanitarias permite el establecimiento del ciclo de vida del parásito, en el que los cerdos se infectan con la etapa quística larvaria (cisticerco) al ingerir huevos infecciosos de Taenia excretados en las heces de un ser humano portador de la tenia intestinal adulta. Los seres humanos, a su vez, se infectan con la etapa adulta de tenia al ingerir quistes en carne de cerdo mal cocida. Los seres humanos también pueden albergar la etapa larvaria y adquirir cisticercosis por contaminación fecal-oral. Si bien los quistes en la mayoría de los tejidos son asintomáticos y rara vez se notan, los quistes en el sistema nervioso (neurocisticercosis [NCC]) son una causa importante de epilepsia y otras morbilidades neurológicas en regiones de endemicidad. Los casos de NCC se observan en regiones donde no es endémica con una frecuencia cada vez mayor debido a los viajes y la migración. En los Estados Unidos, se estima que ocurren más de 1,800 hospitalizaciones relacionadas con NCC por año. Los costos de hospitalización por cisticercosis superan los de la malaria y todas las demás enfermedades tropicales desatendidas combinadas .

Infección por Cisticercosis

Se sabe muy poco sobre la evolución habitual de las infecciones por cisticercosis humana. En el modelo porcino, los embriones contenidos en los huevos de tenia ingeridos se liberan, atraviesan la mucosa intestinal, migran a través del sistema circulatorio y se convierten en cisticercos que alcanzan su tamaño definitivo en 3 a 4 meses. Los cisticercos se encuentran típicamente en el tejido muscular y subcutáneo y con menos frecuencia en el sistema nervioso. No hay razón para sospechar que este proceso inicial sea diferente en humanos que en cerdos.

Neurocisticercosis

En general, se acepta que, aunque la cisticercosis humana afecta a múltiples tejidos, el sistema inmunológico del huésped suele destruir el parásito y sobrevive principalmente en sitios inmunológicamente privilegiados como el cerebro o el ojo. Es más probable que la infección del sistema nervioso produzca síntomas prominentes y, por lo tanto, es más probable que se diagnostique que las infecciones de otros tejidos. A pesar de esto, la mayoría de las infecciones permanezcan sin diagnosticar durante meses o años. La evidencia de una gran serie de casos de NCC ocurridos en soldados británicos que sirvieron en la India durante un período definido demostró que en una proporción significativa de casos, los síntomas neurológicos se presentan años después de la infección.

El proceso por el cual los embriones invaden el sistema nervioso central no se ha dilucidado claramente. Sin embargo, una vez que se establece la infección, la evolución de los cisticercos en el sistema nervioso humano sigue un curso algo predecible. Los quistes cerebrales intraparenquimatosos viables se convierten en vesículas redondeadas compuestas por una fina membrana parasitaria llena de un líquido claro similar al líquido cefalorraquídeo y que contiene una cabeza de tenia retraída (escólex). 

Existe evidencia de que el parásito emplea múltiples mecanismos de evasión inmunitaria activa para evitar el reconocimiento. La inflamación periquística en esta etapa inicial es mínima o inexistente. En algún momento, el sistema inmunológico del huésped detecta el parásito y lanza una respuesta celular con inflamación perilesional local que conduce gradualmente a la muerte del quiste. El líquido dentro del quiste se vuelve turbio y denso, se encoge y el tejido parásito remanente finalmente se elimina o se reemplaza con una calcificación residual......

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,

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776- Tipificacion de giardias

Adriana Higuera, Marina Muñoz, Myriam Consuelo López, Patricia Reyes, Plutarco Urbano, Oswaldo Villalobos, Juan David Ramírez. Desarrollo de un esquema de tipificación de secuencias multilocus para Giardia.  Genes (Basel). 2020; 11(7): 764. Grupo de Investigaciones Microbiológicas-UR (GIMUR), Departamento de Biología, Facultad de Ciencias Naturales, Universidad del Rosario, Colombia

Resumen

La Giardia intestinalis es un protozoo intestinal que se encuentra con mayor frecuencia en los seres humanos. Se ha agrupado en 8 ensamblajes (AH). Los marcadores como el gen de la glutamato deshidrogenasa, la triosa fosfato isomerasa y la beta-giardina (beta-giardina) se han utilizado ampliamente para la genotipificación. Además, se han propuesto diferentes dianas genéticas como una alternativa valiosa para evaluar la diversidad y genética de este microorganismo. Así, nuestro objetivo fue evaluar nuevos marcadores para el estudio de la diversidad y estructura genética intra-taxa de G. intestinalisin silico y en ADN obtenido de muestras de heces. Analizamos nueve genes constitutivos en 80 secuencias genómicas completas y en un grupo de 24 muestras de heces de Colombia. La diversidad alélica se evaluó por locus y para la secuencia concatenada de nueve loci que podían discriminar hasta 53 alelos. Las reconstrucciones filogenéticas nos permitieron identificar conjuntos de AI, AII y B. Encontramos evidencia de eventos de recombinación intra e interensamblaje. El análisis de la estructura de la población mostró una diferenciación genética entre los conjuntos analizados.

1. Introducción

La Giardia intestinalis (sinónimo G. lamblia , G. duodenalis ), un protozoo eucariota unicelular, es la causa más común de diarrea parasitaria en humanos en todo el mundo. Infecta aproximadamente al 2% de los adultos y entre el 6% y el 8% de los niños en los países desarrollados. Aproximadamente el 33% de las personas han tenido giardiasis en los países en desarrollo. La transmisión de este protozoo se considera tanto zoonótica como zooantroponótica, ya que está presente en animales domésticos y salvajes. La frecuencia de transmisión entre los huéspedes no está clara . Aún así, se sabe que existe un riesgo de propagación masiva.

Se han utilizado diferentes herramientas moleculares  y marcadores genéticos  con diferentes tasas de mutación para evaluar la variación inter e intraespecífica de G. intestinalis , basándose  principalmente en 3 loci: β-giardina, triosa-fosfato-isomerasa y glutamato deshidrogenasa. Estos loci apoyaron la identificación de ocho ensamblajes, denominados de la A a la H. Estos ensamblajes pueden ser específicos del anfitrión  y han permitido la determinación de los ensamblajes A y B como los más frecuentes , siendo el ensamblaje B el más común en humanos . El ensamblaje B también se asocia con una enfermedad más grave y prolongada y se considera el más virulento . También se han establecido subconjuntos, como AI, AII, AIII, BIII y BIV , utilizando los loci anteriores. Sin embargo, a pesar de su utilidad, estos marcadores de tipificación han producido resultados contradictorios o de baja resolución al identificar ensamblajes en algunas muestras.

Algunos autores han propuesto el estudio de nuevos genes , que, cuando se añaden a los marcadores utilizados habitualmente, podrían dilucidar mejor la diversidad intraespecífica, junto con la heterocigosidad de nucleótidos, la divergencia alélica e incluso los procesos de recombinación e intercambio inter/intragenético. Esta posibilidad se estudia mediante polimorfismos de un solo nucleótido y análisis filogenéticos e incluso genómica comparativa. Dichos análisis indican que los procesos sexuales o meióticos pueden promover la generación de cepas más virulentas o ampliar su rango de hospedadores. Además, la exploración de otros marcadores genéticos permitirá la caracterización de subconjuntos no claramente establecidos en el ensamblaje E y quizás otros, y proporcionará la información necesaria sobre las subestructuras de los ensamblajes C, D, F y G.

Es necesaria la evaluación de regiones adicionales del genoma de G. intestinalis para identificar nuevos marcadores para comprender su diversidad y evolución. Dichos marcadores deben poseer suficiente poder discriminatorio para establecer agrupaciones relacionadas con factores epidemiológicos. Por lo tanto, la investigación de nuevos marcadores debe centrarse en la detección y tipificación, y permitir inferencias adicionales sobre la reproducción, la evolución, el potencial zoonótico y la estructura de la población.

Hay pocos estudios disponibles sobre G. intestinalis que buscaran abordar marcadores genéticos adicionales. Sin embargo, generar análisis multilocus es esencial para comprender las características genéticas de las cepas circulantes en diferentes regiones geográficas y monitorear su evolución y adaptación. Dicho análisis fomentará el diseño de estrategias para reducir la incidencia de infecciones . En el presente estudio, evaluamos diferentes loci codificadores de enzimas constitutivas involucradas en vías metabólicas, como la glucólisis y el ciclo del ácido tricarboxílico (TCA), enfocados en identificar características genotípicas de G. intestinalis,  probando en secuencias de genoma completo (WGS) disponibles públicamente y posteriormente analizar estos marcadores en el ADN de muestras de heces de algunas regiones de Colombia. Nuestros nuevos marcadores propuestos son capaces de dilucidar la diversidad, la estructura de la población y los posibles eventos de recombinación entre y dentro de los ensamblajes de G. intestinalis .......

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,

Bioquímico-Farmacéutico-UBA.

Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

11º Aniversario

Estimado/a  Colega,

El 15 de Mayo de 2010, inicie mis tareas en este blog y deseo celebrar su 11º Aniversario. Es un blog de actualización profesional destinado a colegas bioquímicos y médicos. Mi agradecimiento a todos sus lectores y en especial a la Asociación Bioquímica Argentina, que me honra al poner un link del mismo en su pagina Web. Solo me resta transcribir el contenidos de la pagina inicial donde me impuse los objetivos del mismo y que los he mantenido en el tiempo.          

...."Las nuevas técnicas de comunicación permiten poder escribir y transmitir inquietudes, sueños e ideales a otras personas que tienen similares o diferente punto de vista. El blog es una forma de hacerlo y lo que se expresa en ellos están fuera del control y el arbitrio de personas, grupos o instituciones de cualquier tipo y es exclusiva responsabilidad de su autor. Este  blog  está dedicado a Bioquímica Clínica y lo voy a desarrollar teniendo todo ello en cuenta. Adelanto que no me impondré límites en los temas que voy a tratar; serán tópicos de carácter científicos, técnicos, institucionales y habrá algunas publicaciones de mi autoría. Las páginas se renuevan automáticamente cada 3-5 días y será un placer compartir con ustedes lo que publique. También les agradeceré sus criticas y difusión"......
                                                                                                                       

Cordiales saludos. 

                                                                                           

Dr. Anibal E. Bagnarelli

Bioquímico-Farmacéutico, UBA. 
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

                                                                                              

                                                                                                                                         

775- Invasión del huésped por amebas

Abigail Betanzos, Cecilia Bañuelos, Esther Orozco. Invasión del huésped por amebas patógenas: alteración epitelial por proteínas parasitarias. Genes (Basel). 2019; 10(8): 618. Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), Mexico City, Mexico

Resumen

El epitelio representa la primera y más extensa línea de defensa contra patógenos, toxinas y agentes contaminantes en humanos. En general, los patógenos han desarrollado estrategias para superar esta barrera y utilizarla como entrada al organismo. La Entamoeba histolytica, Naegleria fowleri y el Acanthamoeba spp. son amebas principalmente responsables de disentería intestinal, meningo-encefalitis y queratitis, respectivamente. Estas amebas causan importantes tasas de morbilidad y mortalidad. Por lo tanto, la identificación, caracterización y validación de moléculas que participan en las interacciones huésped-parásito pueden proporcionar objetivos atractivos para intervenir oportunamente en el progreso de la enfermedad. En este trabajo presentamos un compendio de adhesinas, lectinas, proteasas, hidrolasas, quinasas y otras del parásito, que participan en eventos patogénicos clave. Se hace especial hincapié en el análisis de diversas moléculas y mecanismos implicados en la interacción de los parásitos con los receptores de la superficie epitelial, cambios en los marcadores de unión epitelial, implicaciones en la función de barrera, entre otros. Esta revisión permite la evaluación de la interacción inicial huésped-patógeno,

1. Introducción

Aproximadamente 15 millones de muertes anuales en todo el mundo están directamente relacionadas con enfermedades infecciosas. Las enfermedades desatendidas y las infecciones asociadas a la asistencia sanitaria, así como los patógenos nuevos y emergentes, son desafíos cada vez mayores . Por lo tanto, la investigación adicional debe abordar  lagunas existentes en el conocimiento de la biología de los parásitos, las interacciones huésped-parásito, los mecanismos de patogénesis, la evasión de la respuesta inmune del huésped y el desarrollo de parásitos fármaco-resistentes. La entrada de patógenos al huésped ocurre típicamente a través de cavidades naturales como la boca, ojos, nariz o aberturas genitales, o por heridas que rompen la barrera cutánea, en general cubiertas o revestidas por epitelios.

Los epitelios están formados por láminas de células fuertemente cohesivas, que cubren o recubren las superficies del cuerpo, como la piel, el intestino, la nariz y otras, y también funcionan como glándulas secretoras, como el tejido salival y el páncreas. Las funciones epiteliales se deben en gran medida a la disposición de las células, unidas firmemente entre sí mediante estructuras adhesivas, que anclan el cito-esqueleto de cada célula a sus vecinas y a los componentes de la matriz extracelular (MEC) subyacente o circundante . Estas estructuras adhesivas, conocidas como uniones intercelulares (IJ), se organizan principalmente en uniones estrechas (TJ), uniones adherentes (AJ) y desmosomas (DSM), y se localizan en la membrana celular lateral .

Las uniones estrechas son el contacto célula-célula más apicolateral y representan el primer desafío para los patógenos que penetran en el epitelio del huésped . Están compuestos de proteínas transmembrana (TM), como ocludina, claudinas y moléculas de adhesión de unión (JAM), que forman dimeros con sus proteínas equivalentes de las células vecinas; y por la placa citoplasmática, formada por proteínas de zonula occludens (ZOs), cingulina, guanilato quinasas asociadas a membrana con estructura de dominios invertidos y proteínas de partición defectuosa (PARs), que se unen al citoesqueleto de actina.  

Las uniones estrechas regulan el flujo de macromoléculas e iones a través de la ruta paracelular y también mantienen la polarización de lípidos y proteínas en la membrana plasmática. Detrás de los TJ, se encuentran AJ y DSM. Dan fuerza al epitelio y lo preservan como una valla fuerte y selectiva contra patógenos y compuestos dañinos. Las uniones adherentes mantienen la integridad de las TJ y la homeostasis tisular. Algunas proteínas AJ (afadina, nectina y β-catenina) participan en la señalización intracelular y la regulación transcripcional. Otros, como las glicoproteínas TM de la superfamilia cadherina (E-cadherina), tienen colas citoplasmáticas que se unen a cateninas, que interactúan con el citoesqueleto de actina, dando una actividad adhesiva completa a las células. Los desmosomas mantienen la integridad del epitelio mediante fuertes enlaces extracelulares unidos a los filamentos intermedios. También están constituidos por cadherinas (desmogleína y desmocolina) que establecen la interfaz adhesiva de estas estructuras e interactúan con las proteínas de la placa (desmoplaquina, placofilina y placoglobina) para permitir el contacto con proteínas intermedias de enlace de filamentos .

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Las páginas de este blog , se renuevan dentro de 5 días en forma automática. Cordiales saludos. 

Dr. Anibal E. Bagnarelli,

Bioquímico-Farmacéutico-UBA.

Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

774- Gestión de riesgos en el laboratorio clínico

Sarah W Njoroge, James H Nichols. Gestión de riesgos en el laboratorio clínico. Ann Lab Med. 2014 Jul; 34(4): 274–278. Department of Pathology, Microbiology, and Immunology, Vanderbilt University School of Medicine, Nashville, TN, USA.

Resumen

Las pruebas de laboratorio clínico juegan un papel integral en la toma de decisiones médicas y, como tales, deben ser confiables y precisas. Desafortunadamente, ninguna prueba o dispositivo de laboratorio es infalible y pueden ocurrir errores en las fases preanalítica, analítica y posanalítica de la prueba. Por lo tanto, evaluar las posibles condiciones que podrían conducir a errores y describir los pasos necesarios para detectar y prevenir errores antes de que causen daños al paciente es una parte importante de las pruebas de laboratorio. Esto se puede lograr mediante la práctica de la gestión de riesgos. EP23-A es una nueva directriz del CLSI que introduce los principios de gestión de riesgos en el laboratorio clínico. Esta guía toma prestados conceptos de la industria manufacturera y alienta a los laboratorios a desarrollar planes de gestión de riesgos que aborden los riesgos específicos inherentes a cada laboratorio. Una vez que se han identificado los riesgos, el laboratorio debe implementar procesos de control y monitorearlos y modificarlos continuamente para asegurarse de que el riesgo se mantenga en un nivel clínicamente aceptable. Esta revisión resume los principios de la gestión de riesgos en el laboratorio clínico y describe varias actividades de control de calidad empleadas por el laboratorio para lograr el objetivo de informar resultados de pruebas válidos, precisos y confiables.

Introducción 

Según la International Organization for Standardization (ISO) 14.971, la gestión de riesgos se describe como la aplicación sistemática de políticas, procedimientos y prácticas de gestión a las tareas de análisis, evaluación, control y seguimiento del riesgo. Es un proceso que implica anticipar lo que podría salir mal (errores), evaluar la frecuencia de ocurrencia de estos errores, así como las consecuencias o severidad del daño que causan y finalmente qué se puede hacer para reducir el riesgo de daño potencial a un nivel aceptable. La práctica de la gestión de riesgos se emplea habitualmente en las industrias aeroespacial y automotriz, donde los productos manufacturados se someten a rigurosas evaluaciones de riesgo antes de que estén disponibles para el público. Del mismo modo los fabricantes de dispositivos de diagnóstico in vitro (IVD) siguen protocolos de gestión de riesgos para determinar el mejor uso de sus dispositivos y luego describen las limitaciones e interferencias que pueden afectar a los dispositivos en los prospectos o manuales de usuario. La gestión de riesgos, sin embargo, es un concepto nuevo para los laboratorios clínicos. Debido a que la mayoría de las normas y directrices sobre gestión de riesgos están dirigidas a los fabricantes, existen pocos recursos sobre gestión de riesgos para los laboratorios clínicos. No obstante, los directores de laboratorio clinico pueden tomar prestados los principios industriales de la gestión de riesgos para reducir los errores en los mismos. Algunas directrices recientes, como el documento "Risk management techniques to identify and control error sources"  o el CLSI Guideline EP23-A, "Laboratory quality control based on risk management", introducen la gestión de riesgos en el laboratorio clínico. El propósito de esta revisión es destacar cómo se pueden utilizar los principios de gestión de riesgos en el laboratorio clínico para prevenir errores y minimizar el daño a los pacientes.

Definición del riesgo

Las pruebas de laboratorio de muestras de pacientes son un proceso complejo. Los errores pueden ocurrir en cualquier punto del proceso de prueba. Por lo tanto, los laboratorios deben tomar medidas para garantizar que se produzcan resultados fiables y precisos. El laboratorio debe examinar sus procesos en busca de debilidades o peligros donde puedan ocurrir errores y tomar acción para detectar y prevenir errores antes de que afecten los resultados de la prueba. Esto se puede hacer mapeando el proceso de prueba o siguiendo una muestra a través de las etapas de prueba preanalítica, analítica y posanalítica y examinando cada paso en el proceso para detectar el riesgo de peligros potenciales. El riesgo se define como la posibilidad de sufrir o sufrir daños o pérdidas. El riesgo puede estimarse mediante una combinación de la probabilidad de que ocurra un daño y la gravedad de ese daño. Existe un espectro de riesgo desde muy bajo hasta muy alto, y nunca se puede lograr un riesgo cero. Los eventos que ocurren con mayor frecuencia presentan un mayor riesgo y los eventos que causan un daño mayor son de mayor riesgo. Por lo tanto, nuestra función como directores de laboratorio es gestionar el riesgo en el laboratorio a un nivel clínicamente aceptable, un nivel que sea aceptable para nuestros médicos, nuestros pacientes y nuestra administración. El riesgo es esencialmente la probabilidad de que ocurra un error en el laboratorio que podría provocar daños. Un paciente puede sufrir daños, pero también pueden ser asumidos por el técnico, el director del laboratorio, el médico e incluso la organización del hospital como consecuencia de un error de laboratorio. El riesgo también se puede estimar a través de la detectabilidad, que tiene como objetivo detectar y prevenir errores antes de que salgan del laboratorio y toquen a un paciente.............

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773- Auto-Evaluación- 2

Q/A-2 Seminario AACC-(2015): Práctica profesional en bioquímica clínica: apoyo a la atención del paciente desde la cuna hasta la tumba 

a) Las Preguntas se presentan de acuerdo al interes vigente en nuestro medio y se editan en varios capítulos b) Las Respuestas que figuran al final de la presentación, son las que menciona el articulo original.

Capitulo  2

Departamento de Emergencias

1- En USA la certificación de un Centro Integral de Accidentes Cerebrovasculares requiere entre otros requisitos  la capacidad de lograr informacion de resultados de pruebas con menor tiempo de respuesta  (STAT) en un plazo de ?: A) menor de 30 minutos. B) menor de 45 minutos. C) menor de 60 minutos. D) menor de 90 minutos.

2- ¿Qué estrategia se puede utilizar para lograr  resultados de pruebas STAT en un Departamento de Emergencias,  ?. Prueba  A) Realizada en el laboratorio central B) Realizada en un laboratorio satélite en el servicio de urgencias. C) Pruebas POCT. D) Todo lo anterior.

3- ¿Cuál de los siguientes tipos de muestras puede causar un retraso prolongado en el procesamiento de muestras preanalíticas? A) Sangre entera. B) Plasma. C) Suero con activador de sílice. D) Suero con activador de trombina

Síndrome coronario agudo

4-¿Qué enfermedad NO se considera parte del síndrome coronario agudo?: A) Angina estable. B) Angina inestable. C) infarto de miocardio sin elevación del segmento ST (NSTEMI). D) Infarto de miocardio con elevación del segmento ST (STEMI).

5- ¿Cuál es el límite de troponina recomendado por la AHA / ACC de 2014 para considerar la necrosis miocárdica?: A) Valor al 10% CV del ensayo. B) Valor al 20% CV del ensayo. C) URL del percentil 99 con CV ≤ 10%. D) URL del percentil 99 con CV ≤ 20%

6- ¿Cuál de las siguientes afirmaciones describe mejor el rendimiento del ensayo de cTn de alta sensibilidad? A) Mayor sensibilidad clínica para la angina inestable. B) Mayor sensibilidad clínica para la isquemia miocárdica. C) Mayor sensibilidad analítica con detección equimolar de cTnT y cTnI. D) Mayor sensibilidad analítica con detección de cTn en ≥ 50% de la población de pacientes sanos.

Otras patologías

7- ¿Por qué deberían usarse umbrales de corte  más altos en las preubas de BNP y NTproBNP en pacientes con enfermedad respiratoria con disnea, que en pacientes con falla cardiaca cronica (CHF)?:  Porque A) La enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC) causa dificultad para respirar. B) Los pacientes de urgencias son personas mayores. C) La CHF puede existir sin dificultad para respirar. D) La ansiedad puede elevar los niveles de BNP y NTproBNP

8- ¿Cuál de los siguientes pacientes puede ser evaluados con niveles de D-Dimer como un medio para descartar trombosis venosa profunda (TVP) y/o embolia pulmonar (EP) ?: A) Un paciente hospitalizado. B) Un paciente con antecedentes de TVP y frecuencia cardíaca mayor de 100. C) Un paciente con una pierna hinchada y sensible. D) Un Paciente en quimioterapia por cáncer de mama

9-¿Cuál de las siguientes, es una ventaja al realizar pruebas de D-Dimer en la sala de emergencias?: A) Permite el ingreso de un mayor número de pacientes en los hospitales para un examen mas minuciosos. B) Permite disminuir el número de pacientes expuestos a radiación con estudio complementarios. C)  Aumenta  el numero de pacientes para realizar tomografia axial computada (ATC). D) No es necesario que los médicos evalúen cuidadosamente a los pacientes.

Drogas de abuso

10- ¿Cuál es la diferencia entre inmunoensayos heterogéneos (IH) y homogéneos? A) Los IH requiere mayor tiempo de incubación. B) En los IH no hay mezcla de reactivos. C) Los IH requiere la separación del anticuerpo unido y libre antes de la detección. D) Las procedimenos en los IH se pueden realizar en el mismo analizador que las pruebas químicas de rutina.

11- ¿Cuál es la ventaja de las pruebas de confirmación?: A) Menor costo. B) Especificidad. C) Uso de equipo de alta tecnología. D) Mayor eficiencia

12- Un paciente es positivo para 6-monoacetil morfina. ¿Esto indica la ingestión de qué fármaco?. A) Heroína. B) Metanfetamina. C) Cocaína. D) Marihuana

13- ¿Cómo encontraría el director del laboratorio la posibilidad de que un fármaco reaccione de forma cruzada en un inmunoensayo?: A) Preguntar su opinion al médico. B) Realizar un estudio de interferencia en su ensayo. C) Preguntar al paciente qué medicamentos ingirió. D) Leer el prospecto

14- ¿Qué toxidrome se caracteriza por salivación, lagrimeo, micción, diarrea, malestar gastrointestinal, emesis?: A) Síndrome SLUDGE. B) Anticolinérgico. C) Colinérgico. D) Simpatomemética. E) Sedante-hipnótico

15- ¿En cuánto aumentara una concentración de etanol en sangre de 130 mg/dL a la osmolalidad sérica? A) 2,8 mOsm/kg. B) 3,5 mOsm/kg. C) 28 mOsm/kg. D) 35 mOsm/ kg. E) 280 mOsm/kg.

16- ¿Mediante qué mecanismo ayuda la N-acetilcistina a prevenir el daño hepático en una sobredosis de acetaminofén? A) Bloquea la absorción de acetaminofén. B) Proporciona una fuente de glutatión. C) Evita la conjugación hepática del acetaminofén.

D) Bloquea los receptores de acetaminofén en los hepatocitos. E) Forma un complejo activo con acetaminofén.

17- ¿Cuál de las siguientes sustancias NO es una clase de anfetamina/catinona como nuevas sustancias psicoactivas?. A) Piperazinas. B) Fenetilaminas. C) Naftoil indoles. D) Tiptaminas

18- ¿Cuál de las siguientes opciones NO es una característica de un método de espectrometría de masas de alta resolución? A) Proporcionar información precisa sobre la masa, el tiempo de retención, el patrón de isótopos y la fragmentación de los fármacos y metabolitos en una muestra biológica. B) Adquiere datos de una manera no dirigida. C) El desarrollo del método es complejo debido a la necesidad de establecer múltiples parámetros del método. D) Los datos se pueden analizar mediante análisis de datos específicos, sospechosos o no específicos

19- ¿Cuál de los siguientes compuestos no es detectado por la mayoría de los inmunoensayos de opiáceos?: A) Morfina. B) Codeína. C) hidrocodona. D) Oxicodona. E) Fentanilo. F) Tanto D como E

Infección e inflamación

20- ¿Cuál de las siguientes pruebas se recomienda para la evaluación de la sepsis grave en las pautas establecidas en la Surviving Sepsis Campaign (SSC) 2012?: A) Cultivos de sangre. B) Procalcitonina. C) Proteina C reactiva (CRP). D) C. difficile

21- Los niveles de procalcitonina en suero pueden aumentar para todas las siguientes condiciones excepto?: A) Una cirugía. B) Neumonía bacteriana. C) Sepsis D) Pneumonías viral.

22-¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre la sepsis es correcta?. Es causada  A) Solo por infección. B) Por infección e inflamación. C) Solo por inflamación, D). Ninguna de las anteriores.

Respuestas 

1- B) Menor de 45 minutos. 2- D) Todo lo anterior. 3- C) Suero con activador de sílice. 4- A) Angina estable. 5- C) URL del percentil 99 con CV ≤ 10%. 6- D) Mayor sensibilidad analítica con detección de cTn en ≥ 50% de la población de pacientes sanos. 7- C) La CHF puede existir sin dificultad para respirar. 8- D) Paciente en quimioterapia por cáncer de mama. 9- B) Permite disminuir el número de pacientes expuestos a radiación. 10- C) Los I.H requiere la separación del anticuerpo unido y libre antes de la detección. 11- B) Especificidad. 12- A) Heroína. 13- D) Leer el prospecto.14- B) Anticolinérgico. 15- C) 28 mOsm/kg.16- B) Proporciona una fuente de glutatión. 17- C) Naftoil indoles. 18- C) El desarrollo del método es complejo debido a la necesidad de establecer múltiples parámetros del método. 19- F) Ambos D y E. 20- A) Cultivos de sangre. 21- D) Pneumonías viral. 22- B) Causado por infección e inflamación.

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772- Detección de infecciones por virus respiratorios

Naru Zhang,  Lili Wang, Xiaoqian Deng, Ruiying Liang,  Meng Su,  Chen He,  Lanfang Hu, Yudan Su, Jing Ren, Fei Yu. Avances recientes en la detección de infecciones por virus respiratorios en humanos. Med Virol. 2020 Apr; 92(4): 408–417  Department of Clinical Medicine, School of Medicine, Zhejiang University City College, Hangzhou China.

Resumen

Las infecciones virales del tracto respiratorio causada por virus o bacterias son una de las enfermedades más comunes en humanos en todo el mundo, mientras que las causadas por virus emergentes, como el nuevo coronavirus, nCoV 19 que causó el brote de neumonía en Wuhan, China más recientemente, han planteado grandes amenazas para la salud pública mundial. La identificación de los patógenos virales causantes de las infecciones virales del tracto respiratorio son importante para seleccionar un tratamiento adecuado, salvar la vida de las personas, detener las epidemias y evitar el uso innecesario de antibióticos. Las pruebas de diagnóstico convencionales, como los ensayos para la detección rápida de anticuerpos antivirales o antígenos virales, se utilizan ampliamente en muchos laboratorios clínicos. Con el desarrollo de tecnologías modernas, están surgiendo nuevas estrategias de diagnóstico, incluida la amplificación de ácidos nucleicos multiplex y los ensayos basados ​​en microarrays. Esta revisión resume los métodos de diagnóstico emergentes novedosos y actualmente disponibles para la detección de virus respiratorios comunes, como el virus de la influenza, el virus sincitial respiratorio humano, el coronavirus, el adenovirus humano y el rinovirus humano. Se prevé que estos datos ayudarán a los investigadores y profesionales de la salud a desarrollar estrategias de diagnóstico adecuadas para la detección oportuna y eficaz de las infecciones por virus respiratorios. 

1. Introducción

La enfermedad respiratoria aguda (ERA) representa una gran proporción de todas las morbilidades agudas, así como la mortalidad, en todo el mundo, entre las cuales la infección viral aguda del tracto respiratorio es la principal causa (80% apropiado).  Los principales patógenos virales incluyen el virus de la influenza, el virus respiratorio sincitial (VSR), el coronavirus, el adenovirus y el rinovirus. En los niños menores de cinco años, la mortalidad global combinada de solo la influenza y el VSR alcanza las 300.000 muertes cada año.  Otros virus respiratorios, como el adenovirus y el rinovirus, se asocian con una menor mortalidad, pero con una morbilidad significativa, lo que genera una enorme carga económica. 

Los coronavirus emergentes y re-emergentes altamente patógenos que pueden causar epidemias o pandemias, como el coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV) y el coronavirus del síndrome respiratorio del Medio Oriente (MERS-CoV), han representado una gran amenaza para la salud pública mundial. Más recientemente, un nuevo coronavirus 2019  nCoV ha causado neumonía en 41 casos confirmados de pacientes, incluidos 7 en estado grave, 1 muerto y 2 recuperados . La secuencia genómica completa de este coronavirus se publicó el 10 de enero de 2020, que es más idéntico en un  82% a los del SARS ‐ CoV y al coronavirus similar al SARS en murciélagos 

El diagnóstico rápido y preciso de los patógenos virales causantes es importante para seleccionar el tratamiento adecuado, salvar vidas, detener las epidemias y reducir el uso innecesario de antibióticos. Todos los virus mencionados anteriormente pueden causar infecciones del tracto respiratorio superior e inferior, así como presentaciones clínicas superpuestas, lo que dificulta a los médicos distinguir los agentes causantes sin un análisis de laboratorio sólido. 

Los métodos de diagnóstico convencionales, como el cultivo viral y el ensayo de inmunofluorescencia directa/indirecta (IFA), requieren mucho tiempo y trabajo con una sensibilidad limitada. El diagnóstico rápido y preciso de los virus respiratorios puede ayudar en el monitoreo epidemiológico, junto con la adopción de medidas de prevención efectivas y la implementación de terapias antivirales adecuadas. En las ultimas decadas, Se ha observado una evolución en las pruebas de diagnóstico viral, desde los enfoques convencionales hasta la detección rápida de antígenos. Más recientemente, se han desarrollado pruebas de amplificación de ácido nucleico de alta sensibilidad (NAAT) y pruebas en el lugar de atención (POCT). 

En esta revisión, describimos varios enfoques actualmente disponibles, o en desarrollo, para el diagnóstico de infecciones por virus respiratorios comunes en humanos. Se prevé que estos datos ayudarán a los laboratorios clínicos a diagnosticar con rapidez y precisión los virus respiratorios, proporcionando así a los médicos información esencial para el tratamiento oportuno y adecuado de los pacientes. Los enfoques de diagnóstico comúnmente utilizados para el virus de la influenza, RSV, coronavirus, adenovirus y rinovirus se resumen y describen en detalle en la siguiente revisión.

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771- Impacto del Covid-19 en las infecciones hospitalaria

Mohamad G. Fakih, Angelo Bufalino, Lisa Sturm , Ren-Huai Huang , Allison Ottenbacher, , Karl Saake., Angela Winegar, Richard Fogel, Joseph Cacchione. Infecciónes en el torrente sanguíneo relacionadas con vía central (CLABSI) e infección del tracto urinario relacionados con el catéter (CAUTI) durante la pandemia del COVID-19. Infect Control Hosp Epidemiol 2021,19;1. Clinical & Network Services, Ascension Healthcare, St Louis, Missouri

Resumen

Antecedentes: La pandemia de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) ha tenido un impacto considerable en las hospitalizaciones en EE. UU., Afectando los procesos y la población de pacientes.

Objetivo:  Evaluar el impacto de la pandemia de COVID-19 en las infecciones del torrente sanguíneo relacionadas con la vía central (CLABSI) y las infecciones del tracto urinario relacionadas con el catéter (CAUTI) en los hospitales.

Métodos: Realizamos un estudio retrospectivo de CLABSI y CAUTI en 78 unidades de  EE. UU. 12 meses antes de COVID-19 y 6 meses durante la pandemia de COVID-19.

Resultados:  Durante los 2 períodos de estudio, hubo 795,022 días de evaluación de vía central y 817,267 días de catéter urinario. En comparación con el período anterior a la pandemia de COVID-19, las tasas de CLABSI aumentaron en un 51,0% durante el período pandémico de 0,56 a 0,85 por 1000 días ( P<0,001) y en un 62,9% de 1,00 a 1,64 por 10000 días ( P<.001). Los hospitales con pacientes con COVID-19 mensuales que representan >10% de las admisiones tenían una tasa de infección estandarizada según el National Health Safety Network (NHSN) para CLABSI que era 2,38 veces mayor que los hospitales con una prevalencia <5% durante el período pandémico ( P=0,004). Los CLABSI de Staphylococcus coagulasa negativos aumentaron en un 130% de 0,07 a 0,17 eventos por 1000 días ( p <0,001), y Candida spp en un 56,9% de 0,14 a 0,21 por 1.000 días  ( p = 0,01). Por el contrario, no se identificaron cambios significativos para CAUTI (0,86 frente a 0,77 por 1.000 días; (p = 0,19).

Conclusiones: La pandemia de COVID-19 se asoció con aumentos sustanciales de CLABSI pero no de CAUTI. Nuestros hallazgos subrayan la importancia de los procesos de canalización para un cuidado óptimo de la línea y comentarios regulares sobre el rendimiento para mantener un entorno seguro.

Introducción

La pandemia de la enfermedad del coronavirus 2019 (COVID-19) ha tenido un impacto considerable en la atención médica de EE. UU que agotaron los recursos y las operaciones de los hospitales. A principios de diciembre de 2020, las hospitalizaciones por COVID-19 representaban aproximadamente el 14,5% de las camas de hospitalización ocupadas. El cuidado de pacientes con COVID-19 requiere procesos más complejos, desde el diagnóstico hasta las medidas de seguridad, y ejerce una enorme presión sobre los trabajadores de la salud, desde los desafíos de personal  hasta el riesgo de exposición e infección. Además, la población de pacientes hospitalizados ha cambiado con una caída vertiginosa de los casos quirúrgicos electivos y evitando que los pacientes sean admitidos por otras afecciones médicas, lo que da como resultado un índice de mezcla de casos más alto entre nuestras poblaciones de pacientes. Además, los pacientes con COVID-19 a menudo requerían un seguimiento estrecho y niveles más altos de atención, incluido el apoyo de ventilación mecanica y de cuidados intensivos.

Las infecciones asociadas a la atención médica inicial (HAI)  en el hospital son métricas clave de calidad y seguridad que se informan públicamente en el espacio de atención aguda y están vinculadas al reembolso hospitalario por parte de los Centers for Medicare and Medicaid Services (CMS). Los esfuerzos nacionales se han aplicado con éxito para reducir infección del torrente sanguíneo CLABSI  e infección del tracto urinario asociada al catéter (CAUTI)). Evaluamos el impacto de la pandemia de COVID-19 en los resultados de CLABSI y CAUTI de la National Health Safety Network (NHSN) del CDC en 78 hospitales de un gran sistema de atención médica multiestatal en los Estados Unidos. En particular, examinamos los cambios en la utilización de dispositivos, los eventos CLABSI y CAUTI, la microbiología asociada de estas infecciones y el impacto en los resultados reflejados por la tasa de infección estandarizada de la NHSN. ......

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770- Covid 19: el problema de algunos efectos secundarios.

Ariana Remmel. ¿Por qué es tan difícil investigar los efectos secundarios poco frecuentes de las vacunas COVID? Nature News  April 2021.

A mediados de marzo, varios países europeos detuvieron la distribución de la vacuna COVID-19 fabricada por la Universidad de Oxford, Reino Unido, y la empresa farmacéutica AstraZeneca, tras los informes de que algunas personas habían desarrollado trastornos de la coagulación de la sangre después de recibir la inyección.

Las decisiones se basaron en un grupo de alrededor de 20 millones de personas vacunadas en el Reino Unido y la Unión Europea, 25 de las cuales experimentaron coágulos sanguíneos graves asociados con recuentos de plaquetas reducidos, lo que resultó en 9 muertes. Sin embargo, una revisión de los casos por parte de la European Medicines Agency (EMA) no pudo decir definitivamente si los casos reportados estaban relacionados con la vacuna AstraZeneca y concluyó que los beneficios de la vacuna superan cualquier riesgo. Desde entonces, los países han reanudado las vacunaciones, aunque Alemania ha dejado de administrar la vacuna a los menores de 60 años después de que sus propios sistemas de control de seguridad informaron de 31 coágulos sanguíneos graves en un grupo de 2,7 millones de personas vacunadas.

Estos eventos ilustran cuán diabólicamente desafiante es demostrar que un problema médico posterior a la vacunación, conocido como evento adverso, fue causado por la propia vacuna. Los funcionarios de salud pública deben lograr un "equilibrio delicado" al comunicar el riesgo de efectos secundarios raros junto con los peligros de COVID-19 grave, dice la vacunóloga Kathryn Edwards de la Vanderbilt University School of Medicine in Nashville, Tennessee. Los médicos estan preocupaos por los movimientos contra las vacunas y en algunas comunidades ya están aumentando la duda sobre las mismas. Al mismo tiempo, es importante no descartar la posibilidad de efectos secundarios raros pero graves hasta que los investigadores puedan establecer la causalidad, un proceso que puede llevar años.

La correlación no es causalidad

En una situación ideal, un evento adverso estaría directamente relacionado con una vacuna mediante una prueba de laboratorio específica . Por ejemplo, una versión temprana de la vacuna contra la polio, que utilizaba una forma debilitada del virus para generar inmunidad, provocó que aproximadamente una persona desarrollara la enfermedad por cada 2,4 millones de dosis administradas. La cepa del virus utilizada en la vacuna podría aislarse del líquido cefalorraquídeo en estos casos, dice Edwards, por lo que estaba claro que la vacuna había causado la enfermedad.

Pero este tipo de prueba no es posible para la mayoría de los eventos adversos, ya sea porque no hay biomarcadores específicos para probar o porque tales pruebas no son prácticas. Al menos inicialmente, los eventos solo están vinculados por su momento: una persona recibe una vacuna y luego experimenta el efecto secundario en algún momento posterior. Esto hace que sea particularmente difícil probar si el evento adverso fue realmente causado por la vacuna, dice Edwards, especialmente cuando la reacción ocurre días o semanas después de la vacunación.

Para investigar el vínculo, los investigadores realizan estudios para determinar la tasa de eventos adversos en poblaciones vacunadas en comparación con la probabilidad de que ocurran por casualidad en personas que no han recibido la vacuna. También necesitan determinar el mecanismo que pudo haber causado la reacción.....

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a  bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Las páginas de este blog  se renuevan dentro de 3 días en forma automática. Cordiales saludos. 

Dr. Anibal E. Bagnarelli,

Bioquímico-Farmacéutico-UBA.

Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

769- Vacunas COVID-19

Guido Forni, Alberto Mantovani.  Vacunas COVID-19: dónde nos encontramos y desafíos futuros. Cell Death Differ. 2021; 28(2) : 626–639. Accademia Nazionale dei Lincei, Rome, Italy y otras Instituciones.

Resumen

En los once meses transcurridos desde la identificación del virus SARS-CoV-2 y su genoma, un esfuerzo excepcional de la comunidad científica ha llevado al desarrollo de más de 300 proyectos de vacunas. Más de 40 están ahora en evaluación clínica, diez de ellos están en ensayos clínicos de fase III, tres de ellos han finalizado la fase III con resultados positivos. Algunas de estas nuevas vacunas están siendo aprobadas para uso de emergencia. Los datos existentes sugieren que las nuevas vacunas candidatas pueden ser fundamentales para proteger a las personas y reducir la propagación de la pandemia. Las plataformas conceptuales y tecnológicas explotadas son diversas, y es probable que distintas vacunas demuestren que se adaptan mejor a distintos grupos de la población humana. Es más, queda por dilucidar si y en qué medida la capacidad de las vacunas en evaluación y de vacunas no relacionadas como BCG puede aumentar la aptitud inmunológica al entrenar la inmunidad innata al SARS-CoV-2 y la protección agnóstica de patógenos. Debido al corto tiempo de desarrollo y la novedad de las tecnologías adoptadas, estas vacunas se desplegarán con varias cuestiones pendientes que solo el paso del tiempo permitirá aclarar. Los problemas técnicos relacionados con la producción de miles de millones de dosis y los peoblemas éticos relacionados con la disponibilidad de estas vacunas también en los países más pobres, son desafíos inminentes que enfrentamos. Nuestro principio es que, a largo plazo, se necesitará más de una vacuna para garantizar un acceso global equitativo, la protección de diversos sujetos y la inmunidad contra las variantes virales.

Hechos

- El brote de COVID-19 ha llevado a científicos de todo el mundo a diseñar vacunas anti-SARS-CoV-2.

- La disponibilidad gratuita de datos científicos básicos ha permitido crear vacunas basadas en plataformas muy innovadoras y dirigidas a objetivos sensibles muy bien definidos.

- El elevado apoyo financiero tanto de consorcios privados como de los gobiernos de varias naciones ha hecho posible desarrollar las nuevas vacunas con extrema rapidez.

- La posibilidad de contar con numerosas vacunas basadas en diferentes tecnologías nos permitirá seleccionar aquellas que puedan ser más efectivas en fases específicas de la pandemia y en diferentes partes del mundo.

- La producción y distribución de miles de millones de dosis de vacunas COVID-19 es el nuevo y difícil desafío.

El esfuerzo creativo y tecnológico que condujo al desarrollo de las vacunas COVID-19 ha cambiado la forma de pensar y diseñar nuevas vacunas para otras enfermedades.

Preguntas pendientes de respuestas 

- ¿Podrán las nuevas vacunas controlar la pandemia de COVID-19?

- ¿Habrá vacunas que puedan proteger a los sectores más frágiles de la población humana?

- El desarrollo de vacunas en muy poco tiempo implica necesariamente que aún no es posible conocer su eficacia a largo plazo y sus posibles efectos secundarios.

- ¿Será posible superar los problemas económicos y políticos y permitir que las vacunas COVID-19 estén disponibles con equidad para toda la población del mundo?

Introducción

La esperanza y el revuelo que los medios de comunicación y el público en general están poniendo en tener lo antes posible una vacuna que proteja contra el COVID-19 es el resultado de los grandes triunfos que han tenido y están teniendo las vacunas en el control de las enfermedades infecciosas. Sin embargo, existe una larga serie de enfermedades infecciosas en las que las vacunas son sólo parcialmente efectivas y tenemos una serie de sensacionales derrotas con vacunas. De hecho, cada enfermedad es un problema inmunológico en sí mismo: incluso hoy, con todos los datos a disposición, es difícil predecir qué tipo de vacuna puede ser realmente eficaz. Esta dificultad es aún mayor para COVID-19, una nueva enfermedad en la que los estudios en curso en laboratorios de todo el mundo están agregando nuevos datos a un ritmo acelerado. El SARS-CoV2, y su  coronavirus responsable de COVID-19 es un virus de ARN, y estos virus generalmente tienen una alta tasa de mutación. Durante mucho tiempo se ha considerado que la inestabilidad genética representa un desafío para desarrollar vacunas eficaces contra los virus de ARN.

En muchos casos, la recuperación de una enfermedad viral se basa en la acción combinada de los anticuerpos en los fluidos biológicos que neutralizan las partículas virales y la actividad asesina de los linfocitos que rastrean y matan las células infectadas por el virus. Sin embargo, existen enfermedades virales cuya curación depende principalmente, si no exclusivamente, de la respuesta de los anticuerpos y otras en las que la acción destructiva de los linfocitos asesinos es fundamental. El caso de COVID-19 aún no está claramente definido, aunque varios datos sugieren que el principal efecto protector debe atribuirse a los anticuerpos contra la proteína Spike y, en particular, contra su dominio de unión al receptor. A menudo, los pacientes curados muestran títulos altos de anticuerpos neutralizantes del SARS-CoV-2. Los datos sobre el papel de la inmunidad de las mucosas y la IgA e IgM secretoras son escasos. Además, aún no podemos saber cuánto tiempo durará la protección adquirida por los pacientes recuperados. Este punto es de interés ya que, a menudo, la duración de la protección después de la cicatrización corresponde en cierto modo a la duración de la protección proporcionada por la vacuna......

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Como se fabrica una vacuna Covid-19

ANMAT: Vacunas  Covid-19 disponibles en el pais

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,

Bioquímico-Farmacéutico-UBA.

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