sábado, 17 de julio de 2021

792- Mecanismos de propagación de las variantes del SARS-CoV-2

¿Por qué las nuevas variantes del SARS-CoV-2 se propagan más fácilmente? Julio 15, 2021. The Economist:  Alok Jha, corresponsal científico.  Zanny Minton Beddoes- Editor en jefe

Las mutaciones aleatorias permiten que las nuevas formas del virus se unan mejor a las células humanas.

Los virus al igual que todos los otros organismos, tienen su ciclos de vida. En este caso son parasitos parásitos, comenzando cuando un virus padre infecta a otra criatura y secuestra sus células para hacer copias de sí mismo. En el caso del SARS-CoV-2, el virus que está causando la pandemia, esto sucede cuando se adhiere a una enzima llamada ACE2 en la membrana de algunas células humanas y desliza su genoma a través de la célula. Esta invasión celular es ayudada por una proteína que se clava en la superficie del virus, conocida como pico. Los cambios en el pico, impulsados ​​por cambios genéticos por mutación , alteran las propiedades generales del virus, particularmente su capacidad para propagarse a través de las poblaciones.

La naturaleza mutable de los virus se basa en la aleatoriedad inherente al proceso de producir copias de cualquier objeto, lo que hace que los errores sean inevitables. A medida que las células huésped producen copias de SARS-CoV-2, ocurren errores, llamados mutaciones. La gran mayoría de los virus no sobreviven a los errores de replicación. Pero algunos lo hacen, e incluso pueden prosperar como resultado de los cambios, superando a los virus ancestrales y propagándose de manera más eficiente a través de la población de acogida. 

Hay algunas partes de la estructura del virus que son más capaces de resistir las mutaciones: la proteína de pico es la más tolerante a los cambios. Los virus mutados que sobreviven y prosperan se denominan variantes.. Estos comenzaron a emerger en serio del SARS-CoV-2 en noviembre de 2020, con la aparición de la variante Alpha y su posterior detección en Kent, en el sureste de Inglaterra. Las nuevas variantes deben tener alguna ventaja sobre las antiguas para que se conviertan en la forma dominante del virus. Esa ventaja podría obtenerse de muchas formas diferentes, pero para una enfermedad respiratoria como el covid-19, uno de los factores más importantes es la transmisibilidad, la facilidad con la que el virus pasa de una persona a otra.

Una de las primeras mutaciones en aumentar la transmisibilidad se denominó N501Y, a veces conocida como "Nelly", una de las ocho mutaciones que caracterizaron la proteína de pico de la variante Alfa. El nombre técnico de la mutación es relativamente sencillo una vez que se comprende que se refiere a cambios en el genoma del virus, y esto a la estructura de aminoácidos que codifica. 

El "501" significa que el cambio está sucediendo en el aminoácido 501 en una cadena de 1273 que comprende el pico. El orden y la composición de estos aminoácidos viene dictado por una secuencia de genoma coincidente, de modo que "501" se refiere tanto a la posición en el genoma como a la posición en la cadena de aminoácidos. "N" es la abreviatura de asparagina, que en N501Y se cambia por "Y", que es tirosina. Dado que los diferentes aminoácidos tienen propiedades químicas ligeramente diferentes, este intercambio tiene un impacto en la estructura de la proteína de pico. 

Como resultado, cambia la forma en que se distribuye la carga eléctrica a través de él. Esto altera ligeramente la forma de la proteína, ya que las áreas de carga eléctrica positiva atraen áreas de carga negativa. Gracias a esta dinámica, N501Y permite que una parte crucial del pico gire unos 20 grados, lo que le permite encontrar máyor  ajuste con el receptor ACE2. Como consecuencia, se produce una mejor unión, lo que significa que es más probable que cualquier copia de la variante que ingrese al cuerpo encuentre su objetivo y comience a replicarse. Esto aumenta la transmisibilidad.

Otras mutaciones realizan un truco similar, liberando diferentes partes del pico de diferentes maneras para que pueda unirse de manera más efectiva a ACE2. la forma en que se distribuye la carga eléctrica a través de él cambia. Esto altera ligeramente la forma de la proteína, ya que las áreas de carga eléctrica positiva atraen áreas de carga negativa. Gracias a esta dinámica, N501Y permite que una parte crucial del pico gire unos 20 grados, lo que le permite encontrar un ajuste más ajustado con el receptor ACE2. Como consecuencia, se produce una mejor unión, lo que significa que es más probable que cualquier copia de la variante que ingrese al cuerpo encuentre su objetivo y comience a replicarse. Esto aumenta la transmisibilidad. 

Los cambios en la forma de la espiga no son la única forma de aumentar la transmisibilidad. Delta, la variante que se detectó por primera vez en India y que actualmente se está extendiendo por el mundo, parece ser incluso más transmisible que Alpha y las otras variantes. El motivo no está claro, ya que los estudios estructurales detallados del pico de Delta aún no se han completado. 

Pero Ravindra Gupta, virólogo molecular de la Universidad de Cambridge, y sus colegas argumentan que el aumento de la transmisibilidad de Delta se debe, en parte, a una mutación en el sitio 681. Este es el punto del pico donde, después de unirse a ACE2, la proteína está hendido en dos. El Dr. Gupta dice que P681R, ayudado por dos mutaciones que modifican la forma en otros lugares, facilita que la proteína se corte y, por lo tanto, ingrese a las células. Su presencia también significa que, una vez que una célula comienza a producir partículas, sus proteínas de punta pueden llegar a la superficie de la célula precortada. Eso puede conducir a partículas de virus que no tienen las partes que los anticuerpos reconocen y están listas para fusionarse con cualquier célula cercana.

Hay otras mutaciones teóricas que hacen que el virus sea más transmisible y a las que aún no ha llegado (es posible que nunca lo haga, ya que pueden representar contorsiones de la proteína de la punta que no son físicamente posibles). Otros todavía lo ayudan a evadir los anticuerpos que el sistema inmunológico le arroja para proteger al cuerpo de las infecciones, al igual que un pico que se desplaza por un conjunto de mutaciones puede unirse mejor a ACE2. A su vez , otros cambios también pueden dificultar que los anticuerpos se unan al pico. 

Actualmente, Delta está tomando el relevo de otras variantes en todo el mundo, su conjunto de mutaciones le permite superarlos en el entorno evolutivo que le presentan los cuerpos humanos. Para que otra variante supere a Delta, necesitará nuevos trucos.

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. La página de este blog, se renueva dentro de 1 día en forma automática. Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina


jueves, 15 de julio de 2021

791- Q/A: Estrategias serologicas SARS-CoV-2 en USA

Mark A Cervinski, M Laura Parnas, Barton P Buxton, Justin Choi, Omai Garner, Sean X Neath, Jennifer L Zreloff. Q/A: Estrategias de prueba actuales para el SARS-CoV-2 en los Estados Unidos. Oxford-Clinical Chemistry, 2021; 67 (7):935–940, 

Introducción

Desde el descubrimiento y reconocimiento del síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) y la declaración oficial de la pandemia de la enfermedad por coronavirus-2019 (COVID-19) a principios de 2020, se han desarrollado varias metodologías de prueba diferentes en el registro. velocidades y disponibles para el diagnóstico, la detección, la vigilancia y el tratamiento de la infección por SARS-CoV-2 y la enfermedad por COVID-19. Los rápidos avances científicos en la búsqueda de aprender y definir los mecanismos de transmisión, enfermedad y recuperación del SARS-CoV-2, en combinación con los desafíos de salud pública de un virus que se propaga rápidamente, han obligado a la comunidad de atención médica a adaptarse continuamente al desarrollo. pandemia.

Las pautas oficiales de prueba y los algoritmos propuestos continúan evolucionando, a medida que aprendemos más sobre la variedad de síntomas al comienzo de la infección, los cambios en las necesidades de salud pública y la necesidad de volver a las actividades prepandémicas que incluyen asistencia escolar en persona, viajes, deportes, y otras actividades económicas y sociales. Las pautas de prueba iniciales se centraron en la detección del virus SARS-CoV-2 utilizando técnicas moleculares, pero a medida que la pandemia ha progresado, han surgido otras tecnologías, como las pruebas de antígeno del SARS-CoV-2, que están logrando una mayor aceptabilidad y disponibilidad.

Coincidiendo con la evolución de las diferentes metodologías de prueba, los cambios en las técnicas de muestreo, desde hisopos nasofaríngeos hasta hisopos nasales y, potencialmente, los hisopos recolectados por el paciente, complican aún más el desarrollo de estrategias y pautas de prueba.

Si bien los métodos moleculares de alta complejidad para el ARN viral son el estándar de oro para el diagnóstico, se ha hecho evidente un cuello de botella en la capacidad y la velocidad de las pruebas. Este cuello de botella ha llevado al reconocimiento de que las pruebas rápidas del antígeno del SARS-CoV-2 en el lugar de atención o en el laboratorio pueden desempeñar un papel importante en la detección y la vigilancia de la enfermedad por COVID-19.

Para ayudar a responder algunas de las preguntas sobre cómo se están utilizando las pruebas y cómo la industria del diagnóstico in vitro puede ayudar a satisfacer las necesidades de las pruebas de diagnóstico, se convocó a un panel de expertos con el objetivo de obtener información crítica sobre las diferentes estrategias de prueba para el SARS-CoV-2. en una variedad de entornos de atención médica, comunitarios, congregados y de salud pública

Hemos invitado a un grupo selecto de expertos que participaron en el Comité Asesor Científico para compartir sus perspectivas y proporcionar una actualización sobre el estado actual de las estrategias de prueba para el SARS-CoV-2 desde sus respectivos puntos de vista

Preguntas/Respuestas

  1. Describa brevemente las estrategias de prueba actuales para el SARS-CoV-2 empleadas en su institución. ¿Cómo ha cambiado esto desde el comienzo de la pandemia?
  2. ¿Qué papel desempeñaría una prueba rápida de antígenos en el punto de atención (POC) o en el laboratorio en la toma de decisiones de admisión y alta? ¿Qué papel juegan las pruebas de antígenos en la reapertura y vigilancia de escuelas, universidades e instalaciones de cuidados a largo plazo?
  3. ¿Cuáles son las ventajas de las pruebas multiplex para otros virus respiratorios además del SARS-CoV-2?
  4. ¿Qué información adicional se necesita para determinar la utilidad clínica de las pruebas de anticuerpos? ¿Se necesitan criterios separados para las pruebas de anticuerpos cualitativas y cuantitativas?  
  5. ¿Cómo se pueden incorporar las muestras auto-recolectadas (líquido nasal, nasofaríngeo u oral) en algoritmos de prueba sintomáticos y asintomáticos?
  6. En comparación con los Consejos Asesores anteriores en los que ha trabajado, ¿qué aspectos del formato virtual le parecieron limitantes? ¿Cree que estas limitaciones afectaron la calidad de las opiniones que se compartieron a través de la sesión virtual / remota?

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina


martes, 13 de julio de 2021

790- Pruebas serológicas del SARS-CoV-2

Ronald W McLawhon, Robert L Fitzgerald. Pruebas serológicas del SARS-CoV-2: hechos, ficción y falacias. Oxford-Clinical Chemistry, 2021; 67,(7):924–926. Department of Pathology, University of California San Diego, San Diego, CA, USA

Editorial

Durante el año pasado, la pandemia de COVID-19 impuso demandas sin precedentes a los proveedores de laboratorios clínicos, fabricantes de diagnósticos in vitro y agencias de salud pública para responder a las necesidades de pruebas de una emergencia de salud pública internacional. Estos esfuerzos incluyeron el desarrollo e implementación de una amplia gama de estrategias de prueba para detectar infecciones sintomáticas y asintomáticas, monitorear las fases aguda y convaleciente y determinar las respuestas inmunes adaptativas al SARS-CoV-2. Hasta la fecha, se estima que se han realizado más de 400 millones de pruebas de SARS-CoV-2 con fines de diagnóstico, detección y vigilancia solo en los Estados Unidos..

El método de referencia para diagnosticar una infección por SARS-CoV-2 siguen siendo las pruebas de amplificación de ácido nucleico. Desafortunadamente, la disponibilidad inicial limitada de estas pruebas (agravada por la escasez de la cadena de suministro), los largos tiempos de respuesta y los gastos impulsaron los esfuerzos para encontrar otras alternativas adecuadas para aumentar la capacidad de prueba de COVID-19, tanto dentro del laboratorio clínico como en el punto de atención.

Los métodos serológicos (prueba de anticuerpos) que se han utilizado eficazmente en el manejo de otras enfermedades infecciosas pronto se introdujeron en todo el mundo y se promocionaron como una posible solución para ayudar a abordar los desafíos de las pruebas COVID-19. Sin embargo, el uso de estas pruebas y su adopción clínica generalizada fueron cuestionados casi de inmediato. 

Estas preocupaciones se centraron en la calidad y precisión de las pruebas y la ausencia de datos para respaldar las afirmaciones de desempeño analítico y clínico. También hubo una falta general de comprensión de cómo utilizar e interpretar adecuadamente estas pruebas en diferentes poblaciones objetivo. En particular, la mayoría de los médicos subestimó el impacto de la prevalencia de la enfermedad en los valores predictivos.

En la actualidad, se comercializan a nivel mundial más de 440 pruebas diferentes de anticuerpos contra el SARS-CoV-2, pero solo 75 de estas pruebas han recibido formalmente la autorización de uso de emergencia (EUA) de la Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. (FDA). Estas pruebas van desde simples ensayos inmunocromatográficos basados ​​en cartuchos, de un solo paso (exentos de de las aprobación CLIA) hasta inmunoensayos inmunoabsorbentes enzimáticos basados ​​en placas e inmunoensayos basados ​​en quimioluminiscencia en autoanalizadores de acceso aleatorio de alto rendimiento. 

Muchos de los formatos de ensayo iniciales detectaron cualitativamente la presencia o ausencia de anticuerpos dirigidos contra una o más de las proteínas virales del SARS-CoV-2. Los principales objetivos son las proteínas de la nucleocápside y la espiga. Más recientemente, los ensayos de anticuerpos de SARS-CoV-2 semicuantitativos y cuantitativos recibieron EUA que reconocen estos objetivos de proteínas virales con un mayor grado de sensibilidad y especificidad. También se han utilizado algunas pruebas de anticuerpos neutralizantes desarrolladas y comercializadas en laboratorio para evaluar la función de las respuestas de anticuerpos........

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Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
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sábado, 10 de julio de 2021

789- Errores en el proceso total de las pruebas

Cornelia Mrazek, Giuseppe Lippi, Martin H Keppel, Thomas K Felder, Hannes Oberkofler, Elisabeth Haschke-Becher, Janne Cadamuro. Errores dentro del proceso total de pruebas de laboratorio, desde la selección de la prueba hasta la toma de decisiones médicas: una revisión de las causas, consecuencias, vigilancia y soluciones. Biochem Med. 2020; 30 (2): 020502. Department of Laboratory Medicine, Paracelsus Medical University, Salzburg, Austria. Section of Clinical Chemistry, University of Verona, Verona, Italy

Resumen

Los análisis de laboratorio son cruciales para las decisiones de diagnóstico, seguimiento y tratamiento. Dado que los errores en cada paso del proceso de prueba total pueden afectar potencialmente la seguridad del paciente, un conocimiento amplio y una evaluación sistemática de los errores de laboratorio es esencial para futuras mejoras. En esta revisión, nuestro objetivo es discutir los tipos y frecuencias de errores potenciales en el proceso de prueba total, las opciones de gestión de la calidad, así como las soluciones tentativas para la mejora. A diferencia de la mayoría de las revisiones actualmente disponibles sobre este tema, también incluimos errores en la selección de pruebas, informes e interpretación/acción de los resultados de las pruebas. Creemos que los especialistas de laboratorio deberán volver a centrarse en muchos pasos del proceso que pertenecen a las fases extraanalíticas, intensificando las colaboraciones con los médicos y apoyando la selección e interpretación de las pruebas.

Introducción

La atención médica moderna depende inevitablemente de los resultados de laboratorio para el diagnóstico, el pronóstico y / o las decisiones de tratamiento. Por lo tanto, la ejecución precisa de todos los pasos incluidos dentro del circuito tradicional cerebro a cerebro, es decir, pedido/selección de pruebas, recolección de muestras, identificación, transporte, preparación de muestras, análisis, informes de pruebas, interpretación y acción es importante- 

Desafortunadamente, cada uno de estos pasos es vulnerable a errores, que luego pueden generar potencialmente resultados erróneos y finalmente poner en peligro la seguridad del paciente. Por mencionar sólo algunos ejemplos, la muestra puede provenir del paciente equivocado; los niveles bajos de calcio y fosfatasa alcalina erróneos pueden malinterpretarse cuando no se identifica la contaminación del K-EDTA); la pseudo-hyperkalaemia debido a leucocitosis extrema puede conducir a un tratamiento innecesario e incluso potencialmente peligroso..

En la actualidad existe evidencia incontrovertible de que la gran mayoría de los errores de laboratorio ocurren en la fase pre analítica (61,9 - 68,2%), que luego son seguidos por errores en las partes post analítica (18,5 - 23,1%) y analítica (13,3 - 15%) de la proceso de prueba total (TTP). Utilizando el mismo diseño de estudio en 1996 y 2006, Carraro y Plebani atribuyeron la disminución de la tasa de error de las muestras contaminadas por fluidos de infusión del 20,6% al 1,9 % a acciones correctivas. Junto con la afirmación de que el 73% de los errores en el TTP parecen prevenibles, esto refuerza la necesidad de vigilancia y seguimiento de la vulnerabilidad del laboratorio. 

Como las tasas de error se informan tradicionalmente desde la extracción de sangre hasta el informe de resultados, se ha dado menos énfasis a la idoneidad en la selección de la prueba, la interpretación de los resultados y las fases de acción médica, algunos autores se refieren como fase "pre-pre" - y "post-post" analítica . Para una mejor comprensión, nos abstendremos de utilizar estos términos, ya que los procesos respectivos pueden subsumirse en las fases pre o posanalítica. Sin embargo, los especialistas de laboratorio no deben descuidar estos pasos del TTP, por lo que muchos estudios muestran altas frecuencias de selección de prueba inapropiada e incertidumbre en la interpretación de los resultados. Además, la selección inadecuada de pruebas parece ser especialmente más frecuente que todos los demás errores que se han identificado hasta ahora. 

En esta revisión, por lo tanto, queremos describir los tipos y frecuencias de errores que pueden ocurrir durante el TTP ( es decir , el ciclo de cerebro a cerebro), incluida la selección de pruebas y la interpretación/acción médica. Debido a los diferentes diseños de los estudios, las frecuencias de los errores están relacionadas con los datos adquiridos de forma heterogénea y, por lo tanto, no son completamente comparables. Sin embargo, para obtener una descripción general de los números mencionados en la revisión, los representamos en cifras, separados en porcentajes relacionados con análisis/pruebas, encuestados, diagnósticos perdidos de reclamos por negligencia, errores, muestras y flebotomías de un estudio observacional segun Figuras 1-6 del articculo..

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Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina



miércoles, 7 de julio de 2021

788- Auto-Evaluación 3

Q/A Seminario AACC-2015: Práctica profesional en bioquímica clínica: apoyo a la atención del paciente desde la cuna hasta la tumba

a) Las Preguntas se presentan de acuerdo al interes vigente en nuestro medio. Se editaran en varias sesiones. b) Las Respuestas que figuran al final de la presentación, son las que menciona el articulo original.

Capitulo 3

Diagnóstico rápido de enfermedades infecciosas

1- Las ventajas de pruebas de diagnóstico rápido de la influenza (RIDTs) incluyen las siguientes excepto?. A) Tiempo de respuesta (TAT) rápido. B) Valor predictivo positivo (PPV) alto. C) Baja complejidad. D) Valor negativo (NPV) alto

2- ¿Cuál de los siguientes tipos de influenza no suele incluirse en los análisis de diagnóstico de rutina?. A) Influenza A. B) Influenza B. C) Influenza C. D) Influenza B y C

3- ¿El diagnóstico de C. difficile puede basarse en los síntomas solo con alta precisión?.A) Verdadero. B) Falso

4- ¿Cuál de las siguientes es una limitación de los ensayos moleculares para el diagnóstico de la enfermedad por C. difficile?. A) Alta complejidad. B) Detección de infección. C) Detección de colonización. D) Alto valor predictivo negativo

Medio interno y gases

5- ¿Cuál es el mejor indicador de la concentración de oxígeno en sangre?. A) PO2. B) Hematocrito. C) Contenido de O2. D) Saturación de O2.

6- ¿Cual de los siguientes es verdadero?. A) Una PO2 alveolar normal es más alta en Denver que en Boston porque el aire es más limpio. B) Una oxihemoglobina fraccionada normal es más alta en Denver que en Boston porque tiene menos contaminación del aire.C) Los oxímetros de pulso típicos proporcionan mediciones confiables de la "saturación de oxígeno" para su uso en pacientes con inhalación de humo. D) Se debe usar sangre arterial para obtener una evaluación precisa de las concentraciones de metahemoglobina.

7- ¿Qué principio de método está involucrado en la medición de los porcentajes de oxihemoglobina?. A) Cromatografía de gases. B) Electrodos selectivos de iones. C) Ley de Beer. D) Electrodo de O2, seguido de interpolación de la curva de disociación de oxihemoglobina.

8- ¿Cuál de los siguientes representa los hallazgos típicos en una alcalosis respiratoria?. A) aumento de PCO2, disminución de HCO3. B) aumento de PCO2, aumento de HCO3. C) disminución de PCO2, disminución de HCO3. D) disminuye la PCO2, aumenta el HCO3.

9- ¿Cuál de las siguientes es una causa de una acidosis metabólica con brecha aniónica normal?.A) diarrea. B) cetoacidosis diabética. C) vómitos. D) acidosis láctica

10- La pseudohiponatremia puede ser causada por cuál de los siguientes: A) altas concentraciones de glucosa. B) recuentos bajos de plaquetas. C) altas concentraciones de proteínas séricas (por ejemplo, mieloma múltiple). D) altas concentraciones de ADH.

Medicina transfucional

11- ¿Cuál de los siguientes factores aumenta el riesgo de hemorragia después de la derivación cardiopulmonar?. A) Edad del paciente mayor de 60 años. B) Cirugía de revisión por cardiopatía congénita compleja. C)Necesidad de una disminución sustancial de la temperatura corporal durante la cirugía. D) Historia de sangrado después de una cirugía de rodilla previa. E) Todo lo anterior.

12- ¿Cuál de los siguientes defectos de coagulación requiere el uso de pruebas viscoelásticas de coagulación para una detección rápida?.A) Trombocitopenia. B) Deficiencia de factor de coagulación. C) Heparinización persistente. D) Fibrinólisis. E) Disfunción plaquetaria.

13- Los estudios de algoritmos de transfusión demuestran éxito en la disminución de transfusiones, pero no siempre disminuyen la pérdida de sangre posoperatoria medida por el drenaje del tubo torácico. A) Verdadero. B) Falso

Inmunoensayos en fase sólida en transplantes

14- ¿Cuál de los siguientes es un factor de riesgo para la aloinmunización HLA? (elija todo lo que corresponda). A) Transfusión de sangre. B) Embarazo. C) Trasplante. D) Trauma

15- ¿Que  NO es necesario para establecer la compatibilidad entre el posible receptor y la pareja de donantes?. A) Tipificación de HLA del receptor. B) Tipificación de HLA del donante. C) Prueba de anticuerpos anti-HLA del receptor. D) Prueba de anticuerpos anti-HLA del donante.

16- Los 2 tipos principales de ensayos de anticuerpos son celulares y inmunoensayo en fase solida (SPI). Se recomienda realizar tanto un ensayo SPI como celular. ¿Qué 2 métodos cumplen con esta recomendación? (elija todo lo que corresponda). A) AHG-CDC y citometría de flujo. B) Luminex y ELISA. C) AHG-CDC y Luminex. D) Citometría de flujo y ELISA

17- ¿Cuál de los siguientes puede causar una interferencia falsa negativa en el SPI que puede afectar la interpretación de los resultados y resultar en el trasplante de un órgano incompatible? (elija todo lo que corresponda). A) Rituximab. B) IgM. C) ATG. D) Complemento.

Proteinas 

18- La mejor combinación de pruebas para detectar proteínas monoclonales es: A) Concentraciones de inmunoglobulina sérica (IgG, IgA, IgM) B) Electroforesis de proteínas séricas y electroforesis por inmunofijación. C) Electroforesis de proteínas en suero y orina. D) Electroforesis de proteínas en orina y electroforesis por inmunofijación

19- Los hallazgos típicos en el mieloma de cadenas ligeras incluyen todos los siguientes EXCEPTO: A) Una banda discreta en la electroforesis de proteínas séricas. B) Hipogammaglobulinemia (sérica). C) Una banda discreta en la electroforesis de proteínas urinarias. D) Una tira reactiva de orina negativa para proteínas.

20- ¿Cuál es el diagnóstico más común asociado a las proteínas monoclonales?. A) Amiloidosis. B) Mieloma múltiple. C) Gammapatía monoclonal de significado indeterminado. D) Macroglobulinemia de Waldenstrom

Respuestas según el articulo original   

1-D) Valor negativo (NPV) alto .2-C) Influenza C. 3- B) Falso. 4- C) Detección de colonización. 5- C) Contenido de O2. 6- B) Una oxihemoglobina fraccionada normal es más alta en Denver que en Boston porque tiene menos contaminación del aire.7- C) Ley de Beer.8- C) Disminución de PCO2, y HCO3. 9- A) Diarrea. 10-C) Altas concentraciones de proteínas séricas (por ejemplo, mieloma múltiple) 11- E) Todo lo anterior.12- D) Fibrinólisis.13- B) Falso.14- A), B) C).15-D) Prueba de anticuerpos anti-HLA del donante.16-C) AHG-CDC y Luminex.  D) Citometría de flujo y ELISA. 17-B) IgM. C) ATG. D) Complemento.18-C) Electroforesis de proteínas en suero y orina.19-A) Una banda discreta en la electroforesis de proteínas séricas. 20-C) Gammapatía monoclonal de significado indeterminado.

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domingo, 4 de julio de 2021

787- Fabricas de "fake-papers"

Holly Else & Richard Van Noorden. La lucha contra las fábricas de papeles falsos que producen ciencia falsa. Nature  News feature  article 23 March 2021.

Algunos editores dicen que están luchando contra las trampas industrializadas. Un análisis del Nature examina el problema de la "fábrica de papel" y cómo los editores están tratando de afrontarlo.

Cuando Laura Fisher notó sorprendentes similitudes entre los trabajos de investigación presentados a RSC Advances , comenzó a sospechar. Ninguno de los artículos tenía autores o instituciones en común, pero sus gráficos y títulos parecían en forma alarmante similares, dice Fisher, editor ejecutivo de la revista. "Estaba decidido a intentar llegar al fondo de lo que estaba pasando".

Un año después, en enero de 2021, Fisher se retractó de 68 artículos de la revista, y los editores de otros dos títulos de la Royal Society of Chemistry (RSC) se retractaron cada uno por sospechas similares; 15 aún están bajo investigación. Fisher había encontrado lo que parecían ser productos de "fábricas de papel": empresas que producen manuscritos científicos falsos por encargo. El editor de las revistas, el RSC de Londres, anunció en un comunicado que había sido víctima de lo que se creía que era “la producción sistémica de investigaciones falsificadas”.

Lo sorprendente de esto no fue la actividad de la fábrica de papel en sí: los detectives sobre integridad en la investigación habían advertido repetidamente que algunos científicos compran papeles de firmas de terceros para ayudarles en sus carreras. Más bien, era extraordinario que un editor hubiera anunciado públicamente algo sobre lo que las revistas generalmente guardan silencio. “Creemos que es una fábrica de papel, por eso queremos ser abiertos y transparentes”, dice Fisher.

El RSC no estaba solo, agregó su declaración: "Somos uno de los varios editores que se han visto afectados por dicha actividad". Desde enero pasado, las revistas se han retractado de al menos 370 artículos que han sido vinculados públicamente a las fábricas de papel, según un análisis de Nature , y se espera que sigan muchas más retractaciones.

Gran parte de esta limpieza de la literatura se debe a que, el año pasado, detectives externos señalaron públicamente documentos que creen que provienen de fábricas de papel debido a sus características sospechosamente similares. En conjunto, las listas de artículos marcados suman más de 1.000 estudios. Los editores están tan preocupados por el tema que en septiembre pasado, el Comité de Ética de Publicaciones (COPE), un órgano asesor de editores en Londres, celebró un foro dedicado a debatir sobre la “manipulación sistemática del proceso de publicación a través de las fábricas de papel”. Su oradora invitada fue Elisabeth Bik, una analista de integridad de la investigación en California conocida por su habilidad para detectar imágenes duplicadas en documentos, y una de las "detectives" que publica en línea sus preocupaciones sobre las fábricas de papel.

Elizabeth Bik cree que hay miles más de estos artículos en la literatura. El anuncio de RSC es significativo por su apertura, dice. “Es bastante vergonzoso que tantos papeles sean falsos. Felicitaciones a ellos por admitir que han sido engañados ".

En algunas revistas que han tenido una serie de presentaciones aparentes de fábricas de papel, los editores ahora han renovado sus procesos de revisión, con el objetivo de no dejarse engañar de nuevo. La lucha contra las trampas industrializadas requiere una revisión más estricta: decirle a los editores que soliciten datos sin procesar, por ejemplo, y contratar personas específicamente para verificar las imágenes. La publicación científica necesita un "esfuerzo concertado y coordinado para erradicar la investigación falsificada", dijo la RSC.

Detectives de la fábrica de papel

En enero de 2020, Bik y otros detectives de imágenes que trabajan con seudónimos, Smut Clyde, Morty y Tiger BB8, publicaron, en un blog dirigido por el periodista científico Leonid Schneider, una lista de más de 400 artículos publicados que dijeron que probablemente provenían de una fábrica de papel. Bik lo apodó la fábrica de papel 'renacuajo', debido a las formas que aparecían en los análisis de Western blot, que es un tipo de prueba que se utiliza para detectar proteínas en muestras biológicas. Siguió una serie de titulares de los medios. A lo largo del año, los detectives (no siempre trabajando juntos) publicaron hojas de cálculo de otros documentos sospechosos, recogiendo características similares en múltiples estudios. Para marzo de 2021, habían enumerado colectivamente más de 1300 artículos, según el recuento de Nature, como posiblemente provenientes de fábricas de papel.........

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Recomendacions de la NIH Funded Research

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
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miércoles, 30 de junio de 2021

786- Q/A: POCT vs. no-POCT en enfermedades infecciosas

Sheldon Campbell, Neil Anderson, Esther Babady, Thomas J S Durant, Ann Fisher, Norman Moore. Q/A: Pruebas de enfermedades infecciosas moleculares centralizadas frente a las pruebas descentralizadas. Oxford-Clin Chem, 2021; 67 (5): 713–719.

Las plataformas moleculares simples y compactas con un rendimiento similar al de las pruebas de laboratorio han creado nuevas oportunidades para acercar las pruebas al paciente, junto con desafíos para el uso inteligente de tales tecnologías. Si bien ha habido pruebas en el lugar de atención (POCT) durante casi 40 años (o más de 3000 años, según sus criterios), para muchos profesionales de laboratorio, el POCT es como un mapa medieval, con océanos y áreas vagamente definidos marcadas “aquí como ser dragones ".

Hubo un tiempo en que los estudiantes de medicina eran responsables de dar a luz a los bebés; era una era diferente en la educación médica. Hoy en día, cualquier mujer sensata querría un obstetra de verdad mirando por encima del hombro de un estudiante. En las pruebas de laboratorio, incluso en las pruebas de rutina simples, la comunidad de laboratorios debe mantener su presencia; pero queda por ver. qué tipo de presencia, y a qué distancia, 

La pandemia de la enfermedad por coronavirus-2019 (COVID-19) ha llevado las pruebas de laboratorio a la conciencia pública como nunca antes. Las escuelas, los lugares de trabajo e incluso los equipos deportivos quieren servicios de prueba rápidos y accesibles. Esta experiencia moldeará las expectativas de los médicos y los pacientes en el futuro. En el mundo posterior a COVID, los modelos de prueba descentralizados se explorarán como nunca antes. Las nuevas tecnologías vienen con oportunidades, riesgos, posibilidades y limitaciones. 

En esta presentación, se les pidió a 5 expertos de diversos entornos clínicos y áreas de especialización que mapeen este nuevo territorio y describan "dónde podrían estar los dragones" para ayudar a los profesionales de laboratorio, medicos y administradores a evaluar los posibles impactos clínicos de las pruebas de enfermedades infecciosas,en pacientes cercanos 

Preguntas a considerar:

1-¿Qué tan completo es el menú de POCT molecular para las enfermedades infecciosas?. 

2- ¿Dónde se utilizan en su sistema de salud y qué impacto han tenido?. 

3- ¿Cuáles son los inconvenientes de las pruebas descentralizadas en las enfermedades infecciosas?. 

4- ¿Existen oportunidades o riesgos específicos para descentralizar las pruebas de COVID-19?. 

5- ¿Cuáles son las limitaciones importantes para su implementación/impacto?. 

6- ¿Cuáles son las probables tendencias futuras en las pruebas descentralizadas de enfermedades infecciosas?


(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Las páginas de este blog , se renuevan dentro de 4 días en forma automática. Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina


viernes, 25 de junio de 2021

785- Mucormicosis: actualización

Anna Skiada, Ioannis Pavleas, Maria Drogari-Apiranthitou. Epidemiología y diagnóstico de la mucormicosis: actualización. J Fungi (Basel). 2020 Dec; 6(4): 265. First Department of Medicine, Laiko Hospital, National and Kapodistrian University of Athens, Greece

Resumen

La mucormicosis es una micosis angioinvasiva, debida a hongos del orden Mucorales. Su incidencia no se puede medir con exactitud, ya que hay pocos estudios basados ​​en la población, pero múltiples estudios han demostrado que está aumentando. La prevalencia de mucormicosis en la India es aproximadamente 80 veces mayor que la prevalencia en los países desarrollados, aproximadamente 0,14 casos por 1000 habitantes. La diabetes mellitus es la principal enfermedad subyacente a nivel mundial, especialmente en los países de ingresos bajos y medianos. En los países desarrollados, las enfermedades subyacentes más comunes son las neoplasias hematológicas y el trasplante. La epidemiología de la mucormicosis está evolucionando a medida que se utilizan nuevos agentes inmuno-moduladores en el tratamiento del cáncer y enfermedades autoinmunes, y a medida que las herramientas de diagnóstico modernas conducen a la identificación de géneros/ especies previamente poco comunes como Apophysomyces o complejo Saksenaea . Además, se informan nuevos factores de riesgo de Asia, incluida la tuberculosis pospulmonar y la enfermedad renal crónica. Las nuevas especies emergentes incluyen Rhizopus homothallicus, Thamnostylum lucknowense, Mucor irregularis y Saksenaea erythrospora. El diagnóstico de mucormicosis sigue siendo un desafío. El enfoque clínico del diagnóstico tiene una sensibilidad y una especificidad bajas; sin embargo, ayuda a generar sospechas y a impulsar el inicio de las pruebas de laboratorio. La histopatología, el examen directo y el cultivo siguen siendo herramientas esenciales, aunque los métodos moleculares están mejorando. La región del espaciador transcrito interno (ITS) es la región de ADN más secuenciada para hongos y se recomienda como método de primera línea para la identificación de especies de Mucorales. Se están investigando nuevas plataformas moleculares y se están explorando nuevos objetivos genéticos de hongos. Los métodos de base molecular han ganado aceptación para la confirmación de la infección es cuando se aplican en tejidos. Los métodos de detección de ADN de Mucorales en sangre han mostrado resultados prometedores para un diagnóstico más temprano y rápido y podrían usarse como pruebas de detección en pacientes de alto riesgo, pero deben validarse en estudios clínicos. Se están desarrollando más métodos rápidos y muy necesarios que no requieren procedimientos invasivos, como las pruebas de aliento basadas en la serología o en el punto de atención basado en la metabolómica, y se espera que se evalúen en un futuro próximo.

1. Introducción

La mucormicosis es una micosis angioinvasiva debida a hongos del orden Mucorales. Dependiendo de la presentación clínica se clasifica en rinocerebral, pulmonar, cutánea, gastrointestinal, diseminada u otras, lo que incluye formas raras poco frecuentes, como endocarditis, osteomielitis, peritonitis, renal, etc. La enfermedad fue descrita por primera vez en 1876 cuando Fürbinger describió en Alemania un paciente que murió de cáncer y en el que el pulmón derecho mostró un infarto hemorrágico con hifas fúngicas y algunos esporangios. En 1885, Arnold Paltauf publicó el primer caso de mucormicosis diseminada, al que denominó “Micosis mucorina”. Sus dibujos del agente etiológico mostraron la presencia de esporangióforos y estructuras similares a rizoides, lo que llevó a la conclusión de que la infección probablemente fue causada por el Lichtheimia corymbifera. Con el tiempo, se diagnosticaron más casos y la incidencia de la enfermedad ha aumentado. Actualmente, los hongos Mucorales son los siguientes patógenos de moho más comunes después de Aspergillus , lo que conduce a una enfermedad fúngica invasiva en pacientes con neoplasias malignas o trasplantes. 

La incidencia de mucormicosis también ha aumentado significativamente en pacientes con diabetes, que es el factor de riesgo subyacente más común a nivel mundial. La epidemiología de la mucormicosis está evolucionando a medida que se utilizan nuevos agentes inmunomoduladores en el tratamiento del cáncer y las enfermedades autoinmunes, y a medida que las herramientas de diagnóstico modernas conducen a la identificación de géneros/especies previamente poco comunes, como el Apophysomyces o el complejo Saksenaea . El objetivo de este artículo es presentar una actualización sobre la epidemiología y los métodos de diagnóstico disponibles para esta enfermedad potencialmente letal....

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Las páginas de este blog , se renuevan dentro de 4 días en forma automática. Cordiales saludos. 
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Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina


domingo, 20 de junio de 2021

784- Pruebas IVD para Aspergillus

Jeffrey D. Jenks, Marisa H. Miceli, Juergen Prattes, Toine Mercier, Martin Hoenigl. Ensayo de flujo lateral de Aspergillus para el diagnóstico de aspergilosis invasiva: actualización. Curr Fungal Infect Rep. 2020 Dec 4 : 1–6. Division of General Internal Medicine, University of California San Diego, La Jolla, CA USA

Resumen

Propósito: Revisar los datos del ensayo de flujo lateral de Aspergillus para el diagnóstico de aspergilosis invasiva.

Hallazgos recientes:  El Aspergillus spp. causan un amplio espectro de enfermedades con aspergilosis invasiva (IA) como su manifestación más grave. El diagnóstico temprano y confiable de la enfermedad es crucial para disminuir la morbilidad y la mortalidad asociadas y permitir el inicio rápido del tratamiento para la AI. Más recientemente, las pruebas no basadas en cultivos, como Aspergillus galactomannan (GM), han sido útiles en la identificación temprana y el tratamiento de pacientes con IA. Sin embargo, el costo, el tiempo de respuesta y el rendimiento variable de las poblaciones en riesgo de IA siguen siendo inconvenientes importantes para el uso de esta prueba. Se han desarrollado varias pruebas de diagnóstico para IA, incluida la prueba rápida de ensayo de flujo lateral  Aspergillus GM (GM-LFA) que ha demostrado un rendimiento excelente para el diagnóstico de IA en pacientes con neoplasias hematológicas y puede ser una opción viable para entornos donde la prueba ELISA GM no es factible. La evaluación adicional del GM-LFA en el entorno no hematológico está en curso, incluso en receptores de trasplantes de órganos sólidos y pacientes en la unidad de cuidados intensivos.

Introducción

El Aspergillus spp. es un  hongos ambientales que causan un amplio espectro de infecciones en humanos, incluida la aspergilosis invasiva (IA), la manifestación más grave de la enfermedad. A nivel mundial, la AI causa más de 300.000 infecciones diagnosticadas anualmente, con una tasa de mortalidad que oscila entre el 30 y el 80%. Recientemente, IA también surgió como una complicación en pacientes con enfermedad grave por coronavirus 2019, lo que resultó en altas tasas de mortalidad.

El diagnóstico de AI sigue siendo difícil, especialmente en pacientes que reciben antifúngicos activos contra el moho. El  Aspergillus galactomannan (GM) es un ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA) que detecta el polisacárido GM que existe principalmente en la pared celular de las especies de Aspergillus. El ELISA GM se utiliza como criterio micológico para el diagnóstico de IA y se utiliza en muestras de suero o líquido broncoalveolar (BALF). 

En todas las poblaciones de pacientes, ELISA GM es más sensible que el cultivo, con una sensibilidad y especificidad de la sangre del 82% y 81%, respectivamente, mientras que el ELISA GM en BALF ha mostrado un mejor rendimiento diagnóstico que en sangre, con una sensibilidad y especificidad del 88% y 81%, respectivamente . El rendimiento de GM BALF, en comparación con el suero, también es superior en determinadas poblaciones de pacientes, como los que reciben agentes activos antimoho y los que no tienen neutropenia, que suelen desarrollar enfermedad invasiva de las vías respiratorias. 

A pesar de que ELISA GM ha estado disponible comercialmente durante más de dos décadas, muchos laboratorios de micología en todo el mundo no tienen acceso a las pruebas ELISA GM, y solo el 23% de los laboratorios encuestados en Asia pueden ofrecer esta prueba. Las pruebas ELISA GM adolecen de muchas limitaciones, incluido el coste y el tiempo de respuesta, especialmente en entornos donde no se realizan habitualmente pruebas a granel o las muestras se envían a un laboratorio central. 

Las pruebas moleculares como la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) se utilizan ampliamente para diagnosticar AI , aunque hay una falta de estandarización entre las pruebas  y una gran variación en el rendimiento diagnóstico entre estudios y entornos. La PCR de Aspergillus de la sangre muestra un rendimiento particularmente deficiente para el diagnóstico de infecciones irruptivas en entornos que utilizan profilaxis activa contra el moho. 

Los ensayos de diagnóstico con un rendimiento mejorado y resultados más rápidos se pueden realizar más fácilmente en instalaciones con una infraestructura limitada para permitir un tratamiento dirigido más temprano de la aspergilosis invasiva (IA). La siguiente revisión proporciona una actualización sobre el rendimiento del ensayo de flujo lateral (LFA) de Aspergillus Galactomannan (IMMY, Norman, Oklahoma, EE. UU.), Una prueba rápida para el diagnóstico rápido de AI....

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miércoles, 16 de junio de 2021

783- El laboratorio en enfermedades fungicas

Chadi A. Hage, Eva M. Carmona, Oleg Epelbaum, Scott E. Evans, Luke M. Gabe, Qusay Haydour, Kenneth S. Knox, Jay K. Kolls, M. Hassan Murad, Nancy L. y  Wengenack en nombre de la American Thoracic Society Assembly on Pulmonary Infections and Tuberculosis. Pruebas de laboratorio microbiológicas en el diagnóstico de infecciones fúngicas en la práctica pulmonar y  cuidados intensivos. Una guía de práctica clínica oficial de la American Thoracic Society.  Pulmonary and Critical Care, Mayo Clinic, Rochester MN-USA

Resumen

Antecedentes:  las infecciones fúngicas tienen una incidencia e importancia cada vez mayores en pacientes inmunodeprimidos e inmunocompetentes. El diagnóstico oportuno se basa en el uso apropiado de pruebas de laboratorio en pacientes susceptibles.

Métodos: Se revisó sistemáticamente la literatura relevante relacionada con el diagnóstico de aspergilosis pulmonar invasiva, candidiasis invasiva y micosis endémicas comunes. Se realizó un metanálisis cuando fue apropiado. Las recomendaciones se desarrollaron utilizando el enfoque de evaluación, desarrollo y evaluación de la clasificación de recomendaciones.

Resultados: Esta guía incluye recomendaciones específicas sobre el uso de la prueba de galactomanano en suero y BAL y para el diagnóstico de aspergilosis pulmonar invasiva, el papel de la PCR en el diagnóstico de aspergilosis pulmonar invasiva, el papel de los análisis de β-d-glucano en el diagnóstico de candidiasis invasiva, y la aplicación de serología y pruebas de antígenos en el diagnóstico de micosis endémicas.

Conclusiones: El diagnóstico rápido y preciso de las infecciones por hongos se basa en la aplicación adecuada de las pruebas de laboratorio, incluidas las pruebas de antígenos, las pruebas serológicas y las pruebas basadas en PCR.

Resumen de recomendaciones

• En pacientes con inmunodepresión grave, como aquellos con neutropenia o neoplasias hematológicas malignas o receptores de trasplantes de células madre hematológicas o de órganos sólidos que presentan infiltrados pulmonares inexplicables sospechosos de IPA, recomendamos el uso de pruebas de GM en suero ( fuerte recomendación, evidencia de alta calidad).

• En pacientes con sospecha de enfermedades fúngicas invasivas, incluidos aquellos con GM sérico negativo pero con fuertes factores de riesgo de aspergilosis invasiva o GM sérico positivo, pero factores de confusión para resultados falsos positivos de GM (p. Ej., Pacientes sometidos a quimioterapia o con riesgo de mucositis, en qué epítopos de reacción cruzada de otros hongos o bacterias pueden penetrar en la mucosa intestinal, causando positividad de la prueba), recomendamos la prueba de BAL con GM (fuerte recomendación, evidencia de alta calidad)

.• En pacientes con inmunodepresión grave, como aquellos con neoplasias hematológicas o receptores de trasplantes de células madre hematológicas o de órganos sólidos, que se sospecha que tienen IPA, recomendamos el uso de pruebas de PCR de Aspergillus en sangre o suero (fuerte recomendación, evidencia de alta calidad).

• En pacientes con inmunodepresión grave, como aquellos con neoplasias hematológicas malignas o receptores de trasplantes de células madre hematológicas o de órganos sólidos que se sospecha que tienen IPA, recomendamos la inclusión de Aspergillus PCR en las pruebas de BAL como parte de la evaluación (fuerte recomendación, alta evidencia de calidad ).

• En pacientes con inmunodepresión grave, como aquellos con neoplasias hematológicas malignas o receptores de trasplantes de células madre hematológicas o de órganos sólidos con fuerte sospecha de tener IPA pero en quienes el resultado de la prueba de PCR para Aspergillus es negativo, sugerimos considerar la biopsia y / o pruebas adicionales con o sin pruebas adicionales de PCR o GM (recomendación condicional, evidencia de baja calidad)

.• En pacientes críticamente enfermos en los que existe preocupación clínica por la CI, sugerimos no depender únicamente de los resultados de la prueba de BDG en suero para la toma de decisiones diagnósticas (recomendación condicional, evidencia de baja calidad ).

• Recomendamos el uso de antígeno de Histoplasma en orina o suero para el diagnóstico rápido de histoplasmosis pulmonar aguda y diseminada sospechada cuando el diagnóstico y el tratamiento oportunos son de suma importancia para el resultado ( fuerte recomendación, evidencia de alta calidad).

• Sugerimos el uso de serologías de Histoplasma en pacientes inmunocompetentes con sospecha de histoplasmosis pulmonar. Agregar antígeno de histoplasma a las pruebas serológicas podría mejorar el rendimiento diagnóstico ( recomendación condicional, evidencia de calidad moderada).

• En pacientes con exposición geográfica apropiada y enfermedad compatible con infección o neumonía debido a blastomicosis, sugerimos utilizar más de una prueba de diagnóstico, incluida la visualización directa y el cultivo de BAL de esputo u otro material de biopsia, prueba de antígeno en orina y prueba de anticuerpos en suero. La evidencia actual no puede respaldar una sola mejor prueba como lo suficientemente sensible como para solicitarla aisladamente de otras pruebas. El enfoque debe adaptarse en función de la gravedad de la enfermedad, el contexto clínico y la disponibilidad de pruebas ( recomendación condicional, evidencia de calidad moderada ).

• En pacientes con sospecha de blastomicosis, sugerimos que las pruebas de anticuerpos séricos dirigidas específicamente contra el antígeno anti-BAD-1 (anti-adhesina1 de Blastomyces) para blastomicosis se utilicen junto con datos clínicos y epidemiológicos para establecer el diagnóstico          (recomendación condicional, baja evidencia de calidad).

• En pacientes con sospecha de blastomicosis, particularmente en pacientes inmunodeprimidos, sugerimos que se utilicen pruebas de antígenos urinarios para blastomicosis junto con datos clínicos y epidemiológicos para establecer el diagnóstico (recomendación condicional, evidencia de calidad moderada ).

• En pacientes con exposición geográfica apropiada y enfermedad compatible con infección o neumonía debida a coccidioidomicosis, sugerimos utilizar más de una prueba de diagnóstico, incluida la visualización directa y el cultivo de BAL de esputo u otro material de biopsia, pruebas de antígenos en orina y suero, y serología (suero prueba de anticuerpos). La evidencia actual no puede respaldar una sola prueba.  El enfoque debe adaptarse en función de la gravedad de la enfermedad, el contexto clínico y la disponibilidad de pruebas (recomendación condicional, evidencia de calidad moderada).

• En pacientes con sospecha de coccidioidomicosis, particularmente en pacientes inmunodeprimidos, sugerimos realizar pruebas de antígenos urinarios y séricos para ayudar a establecer el diagnóstico (recomendación condicional, evidencia de calidad moderada).

• En pacientes con sospecha de neumonía adquirida en la comunidad (NAC) del área endémica de coccidioidomicosis, sugerimos pruebas serológicas iniciales con seguimiento clínico cercano y pruebas seriadas (recomendación condicional, evidencia de calidad moderada ).

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jueves, 10 de junio de 2021

782- Covid-19- Reactivos para diagnostico uso in vitro

Bruna Aparecida Souza Machado, Katharine Valéria Saraiva Hodel, Valdir Gomes Barbosa-Júnior, Milena Botelho Pereira Soares, Roberto Badaró. Shan-Lu Liu, Academic Editor. Los principales métodos moleculares y serológicos para el diagnóstico de COVID-19: una descripción general basada en la literatura. Viruses. 2021; 13(1): 40. SENAI Institute of Innovation (ISI) in Health Advanced Systems (CIMATEC ISI SAS), University Center SENAI/CIMATEC, Salvador, Bahia, Brazil

Resumen

Las pruebas diagnósticas han sido consideradas como la principal alternativa para el control de la enfermedad por coronavirus (COVID-19), causada por el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2), ya que un diagnóstico correcto permite tomar decisiones a la hora de afrontar la enfermedad, en particular porque hay una falta de suficientes vacunas y protocolos terapéuticos eficaces. Por lo tanto, en esta revisión, resumimos los principales enfoques de diagnóstico actualmente disponibles para el diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2 en humanos según los estudios disponibles en las bases de datos de artículos. Las pruebas se pueden organizar en dos categorías principales: i) pruebas basadas en ácidos nucleicos, recomendadas para la detección inicial del virus, y ii) pruebas serológicas, recomendadas para evaluar la progresión de la enfermedad. Los estudios han demostrado que el rendimiento de los métodos de diagnóstico depende de diferentes factores, como el tipo de muestras y las características de cada ensayo. Se identificó que la positividad de las pruebas se relaciona principalmente con la aparición de síntomas. También observamos que los diagnósticos en el punto de atención se consideran una de las principales tendencias en esta área, debido al bajo costo y la simplicidad del ensayo; sin embargo, el desempeño analítico debe ser analizado críticamente. Por lo tanto, la pandemia de COVID-19 ha puesto de relieve el papel fundamental de las tecnologías de diagnóstico en el control de enfermedades infecciosas.

1. Introducción

La batalla contra las enfermedades infecciosas causadas por microorganismos, particularmente virus, sigue siendo una tarea desafiante e interminable a pesar de las enormes fuerzas y los importantes avances en la salud pública de diferentes partes del mundo. Debido a los avances de la medicina, varios investigadores y científicos creían que la batalla de la humanidad contra los agentes infecciosos estaba prácticamente terminada, con la humanidad como ganadora. Sin embargo, los repetidos brotes de las últimas dos décadas, incluidos coronavirus, influenza aviar y chikungunya, han demostrado la prematuridad de esa posición. 

Recientemente, a fines de 2019, se informó de una nueva enfermedad respiratoria de rápida propagación en Wuhan, en la provincia china de Hubei, y ahora ha afectado a más de 216 países en todo el mundo. Los datos completos del genoma viral sugirieron que la enfermedad es causada por un nuevo virus de ARN relacionado con la familia Coronaviridae , que luego fue designado como síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Posteriormente, la enfermedad se denominó enfermedad por coronavirus nuevo (COVID-19).

Los coronavirus (CoV) son virus de ARN de sentido positivo, esféricos, con envoltura, no segmentados y de gran tamaño (100-160 nm), que se sabe que se distribuyen ampliamente en humanos y otros mamíferos. El genoma de CoVs es el genoma viral de ARN más grande, con una longitud de entre 26 y 32 kb. Por lo general, dos tercios del ARN genómico codifica dos grandes poliproteínas superpuestas, el marco de lectura abierto (ORF) 1a y ORF1b, que se procesan en la polimerasa viral (RdRp) y otras proteínas no estructurales (Nsps) involucradas en la síntesis de ARN o la modulación de la respuesta del huésped. El otro tercio del genoma codifica cuatro proteínas estructurales (pico (S), envoltura (E), membrana (M) y nucleocápside (N) y otras proteínas accesorias (3a, 3b, p6, 7a, 7b, 8b, 9b y ORF14).

El análisis filogenético de todo el genoma indicó que el SARS-CoV-2 comparte una identidad de secuencia del 80% y 50% con el SARS-CoV y el coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV), respectivamente, que son otros coronavirus importantes que fueron responsables de endemias anteriores. Además, el SARS-CoV-2 presenta más del 90% de identidad de secuencia para enzimas esenciales y proteínas estructurales, lo que indica un mecanismo de patogénesis común y, por lo tanto, un objetivo terapéutico común con estos virus.

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ANMAT: Reactivos de Uso in Vitro para COVID-19 que se encuentran autorizados  en el marco de la emergencia sanitaria

Lista actualizada al 3 de junio de 2021  

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lunes, 7 de junio de 2021

781- Covid-19: nuevas variantes

David Adam. Editor Nature  News  article 24 May 2021. Lo que saben los científicos sobre las nuevas variantes de coronavirus de rápida propagación.

Sigue habiendo preguntas clave sobre la rapidez con la que se pueden propagar las variantes de B.1.617, su potencial para evadir la inmunidad y cómo podrían afectar el curso de la pandemia.

Desde que la variante SARS-CoV-2 conocida como B.1.617 se informó por primera vez en la India a fines del año pasado, se ha extendido a docenas de otros países, incluidos los Estados Unidos, Singapur y el Reino Unido, donde se ha vuelto dominante en algunas regiones. .

Desde entonces, los investigadores han identificado tres subtipos, conocidos como B.1.617.1 (el B.1.617 'original'), B.1.617.2 y B.1.617.3, cada uno con una estructura genética ligeramente diferente.

Ahora se apresuran a investigar estas variantes y averiguar cómo podrían afectar la trayectoria de la pandemia en los países donde se han afianzado. Quedan preguntas clave sobre la rapidez con la que se pueden propagar las variantes, su potencial para evadir la inmunidad y si causan una enfermedad más grave.

Gran parte de esta investigación adopta la forma de epidemiología estándar: confirma los casos de COVID-19 mediante pruebas, identifica las variantes responsables de las infecciones y hace referencias cruzadas de estos datos con los síntomas clínicos y los estados de vacunación de las personas. Los científicos también pueden obtener conocimientos de los datos de secuenciación genómica, identificando qué mutaciones están presentes en los subtipos B.1.617 y comparándolas con mutaciones en variantes anteriores cuyo comportamiento se comprende mejor.

Más transmisible

“Observo las mutaciones individuales porque cada una tiene propiedades individuales que creemos que pueden conferir una mayor transmisibilidad”, dice Julian Tang, virólogo consultor en Leicester Royal Infirmary, Reino Unido. Una mayor transmisibilidad, una medida de la rapidez con la que las variantes se pueden propagar de una persona a otra, podría acelerar los brotes, lo que podría ejercer más presión sobre los sistemas de atención médica y contramedidas como los programas de vacunación. Por ejemplo, la variante B.1.617.2 tiene mutaciones llamadas 452R y 478K, que según Tang están vinculadas a una mayor transmisibilidad. Ambas mutaciones alteran la proteína pico, que el virus usa para ingresar a las células humanas.

Los investigadores también han podido rastrear rápidamente la propagación de B.1.617.2 porque su genoma contiene un marcador del que carece la variante B.1.1.7 dominante. La presencia de este marcador, conocido como el 'objetivo del gen S', se puede ver en los resultados de algunas de las pruebas de PCR utilizadas para confirmar los casos de COVID-19, por lo que los investigadores pueden utilizar los resultados positivos del objetivo S como un proxy para rápidamente mapear la dispersión de B.1.617.2, sin necesidad de secuenciar completamente las muestras. Tanto las pruebas del gen S como los datos de secuenciación más detallados de las muestras de virus del Reino Unido indican que B.1.617.2 está superando a los otros dos subtipos B.1.617 y reemplazando a B.1.1.7, una variante identificada en el sureste de Inglaterra a fines de 2020 la variante más común que genera nuevas infecciones en el país...........

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sábado, 5 de junio de 2021

780- COVID-19 : buscando nuevos marcadores

Editor, Smriti Mallapaty. Los científicos se concentran en el marcador buscado durante mucho tiempo sobre la eficacia de la vacuna COVID.  Nature  News  21 May 2021

Los datos de siete ensayos de vacunación ayudan a identificar un marcador sanguíneo para la protección contra la enfermeda

Una vez que las personas han sido vacunadas contra COVID-19, según un modelo computacional los niveles de anticuerpos que bloquean la infección en su sangre son un fuerte indicador de cuánta protección han obtenido contra la enfermedad, . La investigación mostró que la presencia de incluso pequeñas cantidades de estos potentes "anticuerpos neutralizantes" indica que una vacuna es eficaz para proteger contra COVID-19. 

El estudio es el mejor intento hasta ahora para definir las características de la respuesta inmune que pueden actuar como un sustituto de la protección contra COVID-19, conocido como un "correlato de protección", dice Daniel Altmann, inmunólogo del Imperial College of London. “Encontrar el correlato de protección ha sido realmente un santo grial para esta enfermedad, como para otras. Es sorprendente lo difícil que es hacerlo".

Si los investigadores tienen un correlato de protección bien definido, pueden predecir a partir de los datos de los primeros ensayos qué tan efectiva será una vacuna, dice James Triccas, microbiólogo médico de la University of Sydney en Australia y coautor del estudio. Esto "alivia la necesidad de realizar ensayos de fase III más grandes, más costosos y que requieren más tiempo".

Triccas y sus colegas examinaron datos de anticuerpos neutralizantes de ensayos de siete vacunas ampliamente utilizadas. El equipo encontró un fuerte vínculo entre los niveles de anticuerpos de los participantes registrados en los ensayos en etapa inicial y los resultados de eficacia de la vacuna de los ensayos en etapa tardía. Los investigadores estiman que una vacuna tiene una eficacia del 50% incluso si induce niveles de anticuerpos un 80% más bajos que los encontrados, en promedio, en una persona que se ha recuperado del COVID-19.

Las vacunas que generaron las respuestas de anticuerpos neutralizantes más fuertes, como las vacunas basadas en ARNm fabricadas por Moderna y Pfizer-BioNTech, fueron las más protectoras. Las vacunas que indujeron una respuesta más débil, que incluyó el Oxford-AstraZeneca, proporcionaron niveles más bajos de protección. Los investigadores predicen que debido a que los niveles de anticuerpos disminuyen con el tiempo, es posible que se necesiten inyecciones de refuerzo en aproximadamente un año, pero la protección contra enfermedades graves podría durar muchos años incluso sin ellas.

Los hallazgos ayudan a explicar por qué, a pesar de que los estudios muestran que algunas variantes del coronavirus SARS-CoV-2 reducen la capacidad de neutralizar los anticuerpos para bloquear la infección, a la mayoría de las personas que se han vacunado, incluso con una sola dosis, no les va tan mal si está infectado con esas variantes, dice Altmann. "Incluso los niveles bajos de anticuerpos, más bajos de lo que pensamos, probablemente te ayudarán".

Se necesitan más estudios para precisar qué células o moléculas determinan el nivel de protección, dice Dan Barouch, del Center for Virology and Vaccine Research en el  Beth Israel Deaconess Medical Center, Boston, Massachusetts. . Esto podría diferir según la tecnología de la vacuna, .

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domingo, 30 de mayo de 2021

779- Serologia de la toxoplasmosis

Rochelle Haidee D. Ybañez,  Adrian P. Ybañez, Yoshifumi Nishikawa. Revisión sobre las tendencias actuales del serodiagnóstico de toxoplasmosis en humanos. Front Cell Infect Microbiol. 2020; 10: 204. National Research Center for Protozoan Diseases, Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine, Obihiro, Japan.

Resumen

La toxoplasmosis es una infección zoonótica de amplia distribución causada por el parásito apicomplexano intracelular obligado Toxoplasma gondii . Se transmite principalmente a través de la ingestión de ooquistes desprendidos por un gato infectado que actúa como su huésped definitivo. La clave para el control y el tratamiento eficaces de la toxoplasmosis es la detección rápida y precisa de T. gondiiinfección. Se han establecido varios métodos de diagnóstico de laboratorio, incluidos los ensayos serológicos más utilizados como la prueba de colorante (DT), prueba de aglutinación directa o modificada (DAT/MAT), prueba de hemaglutinación indirecta (IHA), prueba de aglutinación de látex (LAT), prueba de aglutinación indirecta prueba de inmunofluorescencia (IFAT), pruebas de inmunoabsorción ligada a enzimas (ELISA), pruebas inmunocromatográficas (ICT) y western blot. No obstante, la creación de enfoques específicos y fiables para el serodiagnóstico de T.gondiiin, y diferenciar entre las fases aguda y crónica de la infección sigue siendo un desafío. Esta revisión proporciona información sobre las tendencias actuales en el serodiagnóstico de la toxoplasmosis humana. Destaca las ventajas del uso de proteínas recombinantes para pruebas serológicas y proporciona información sobre la posible dirección futura de estos métodos.

Introducción

La toxoplasmosis es una infección zoonótica de amplia distribución causada por el parásito apicomplexano intracelular obligado Toxoplasma gondii. El T. gondii infecta a los seres humanos y a casi todos los animales de sangre caliente, por lo que es uno de los parásitos importantes que afectan la salud pública y la producción animal. Se transmite principalmente a través de la ingestión de ooquistes desprendidos por un gato infectado como hospedador definitivo. 

La toxoplasmosis afecta aproximadamente a un tercio de la población humana mundial. Sin embargo, generalmente es asintomático en individuos inmunocompetentes o puede manifestar síntomas similares a los de la gripe y otros signos clínicos inespecíficos. La enfermedad puede incluso ser grave o mortal en pacientes inmunodeprimidos . La transmisión vertical del parásito a través de la placenta de la madre infectada puede comprometer la vida del feto y de las madres infectadas . La clave para el control y el tratamiento eficaces de la toxoplasmosis depende de la detección precisa de la infección por T. gondii. 

La utilización de métodos de diagnóstico altamente sensibles y específicos es un paso vital en la prevención y el tratamiento de la enfermedad.  Debido a la falta de especificidad de los signos clínicos, el diagnóstico de la infección por T. gondii no se puede realizar mediante la evaluación de las manifestaciones clínicas. El diagnóstico de T. gondii para pacientes inmunodeprimidos generalmente se realiza mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), ensayos de hibridación, aislamiento y análisis histológico. Para los casos congénitos, el diagnóstico se realiza mediante la detección directa del organismo mediante inoculación en ratón, cultivo celular o PCR a partir de muestras extraídas de líquido amniótico, líquido cefalorraquídeo, sangre y orina  y mediante exámenes oftalmológicos y radiológicos. 

Sin embargo, la forma más común de infección por T. gondii es latente, en la que los parásitos generalmente no se encuentran en la circulación, y el aislamiento de los parásitos es particularmente desafiante). Pero como el T. gondii induce una respuesta inmune humoral intensa y a menudo persistente con títulos de anticuerpos detectables, independientemente de las manifestaciones clínicas en los individuos infectados, las pruebas serológicas que detectan respuestas de anticuerpos específicas son necesarias. 

A lo largo de los años, se han establecido varios métodos serológicos para el diagnóstico de la toxoplasmosis y muchos han arrojado resultados satisfactorios. Sin embargo, el desarrollo de enfoques específicos y fiables para el serodiagnóstico de la infección por T. gondii , que idealmente podría diferenciar entre las fases aguda y crónica de la infección, sigue siendo muy complicado. Esta revisión ofrece conocimientos actualizados sobre las tendencias actuales en el serodiagnóstico de la toxoplasmosis humana. Destaca las ventajas del uso de proteínas recombinantes para pruebas serológicas. Además, también se proporciona información sobre la posible dirección futura de estos métodos.

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Las páginas de este blog , se renuevan dentro de 5 días en forma automática. Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina




martes, 25 de mayo de 2021

778- Diagnóstico de Chagas

Fernando Abad-Franch. Editor Pierre Buekens. Diagnóstico y evaluación de la curación de la enfermedad de Chagas: jerarquizar formalmente un problema naturalmente jerárquico. PLoS Negl Trop Dis. 2020; 14(10): e0008751.  Núcleo de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de Brasília, Brazil. Tulane University, USA

Detección de patógenos en hosts infectados: una cuenta informal

En un artículo reciente de Viewpoint, Alonso-Padilla y sus colegas discuten las dificultades de clasificar con seguridad a un paciente con enfermedad de Chagas como "curado", o con "cura", definida como la "eliminación de los parásitos Trypanosoma cruzi del cuerpo del paciente después del tratamiento".  Este es, por supuesto, un caso particular de un problema mucho más general: los médicos deben clasificar con seguridad a los sujetos como infectados o no con un patógeno para tomar decisiones clínicas, comprender la epidemiología de las enfermedades infecciosas y medir los efectos de las intervenciones terapéuticas o preventivas. .

Sin embargo, la detección de patógenos en los cuerpos infectados no suele ser fácil. Un revés común es que el patógeno puede estar presente en algunas partes del cuerpo del sujeto (por lo que el sujeto está infectado ), pero ausente de la muestra específica utilizada para la prueba, digamos, una gota de sangre. En el caso de la enfermedad de Chagas, el T. cruzi está de hecho ausente del torrente sanguíneo de los sujetos infectados la mayor parte del tiempo, particularmente en la fase crónica, y los parásitos del torrente sanguíneo deberían volverse aún más raros después de que los pacientes tomen medicamentos para matar parásitos. Un resultado negativo de la prueba cuando el patógeno objetivo no estaba disponible para la detección en la muestra analizada difícilmente puede verse como un falso negativo "verdadero"; la prueba dio el resultado correcto a nivel de la muestra, a pesar de que el sujeto estaba infectado. 

Tenga en cuenta que el "objetivo" de detección puede ser el propio patógeno o un biomarcador sustituto, ya sea derivado de un patógeno, como proteínas o ácidos nucleicos, o derivado del huésped, como los anticuerpos.También producen un resultado negativo a pesar de que el objetivo está presente, y por lo tanto disponible para detección , en una muestra dada de un sujeto infectado; esto califica como un verdadero falso negativo. En la práctica, cualquier prueba puede no detectar un patógeno objetivo (o biomarcador) que está presente en una muestra porque todas las pruebas tienen una sensibilidad imperfecta (<1.0). Finalmente, una prueba puede arrojar un resultado positivo a partir de una muestra que no contenía el objetivo. Esto refleja el problema general de la especificidad de la prueba imperfecta. 

En lo que sigue, me centraré en la disponibilidad del objetivo y la sensibilidad de la prueba asumiendo temporalmente una especificidad del 100%; aunque es difícil de garantizar incluso con las mejores prácticas de muestreo y laboratorio, la especificidad puede ser cercana al 100% para la determinación directa de la presencia de patógenos (por ejemplo, a través de métodos parasitológicos basados ​​en microscopía, cultivo o xenodiagnóstico) y para algunas pruebas basadas en ADN (por ejemplo, usando PCR o amplificación isotérmica). Revisaré la especificidad imperfecta al final de mi argumento.......

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