lunes, 20 de diciembre de 2021

839- JCTLM: estandarizacion de resultados

Mauro Panteghini, Federica Braga, Johanna E Camara, Vincent Delatour, Katleen Van Uytfanghe, Hubert W Vesper, Tianjiao Zhang. Optimización de las herramientas disponibles para lograr la estandarización de resultados: valor agregado por el Joint Committee on Traceability in Laboratory Medicine (JCTLM). Oxford Clin Chem, 2021; 67 (12):1590–1605. ‘L.Sacco’ Department of Biomedical and Clinical Sciences, Research Centre for Metrological Traceability in Laboratory Medicine (CIRME), University of Milan, Milano, Italy.

Resumen

Antecedentes:  El JCTLM creó un grupo de trabajo sobre la implementación del sistema de medición de referencia (TF-RMSI) para proporcionar orientación en la aplicación de la trazabilidad metrológica para la comunidad de diagnóstico in vitro (IVD).

Contenido:  TF-RMSI investigó los sistemas de medición de referencia (RMS) para 13 mensurandos comunes aplicando los siguientes pasos de procedimiento: (a) extracción de la base de datos JCTLM de materiales de referencia certificados (CRM) disponibles y procedimientos de medición de referencia (RMP); (b) describir el RMS al que pertenece cada CRM o RMP controlado; (c) identificar el uso previsto de los CRM y, si se utiliza como un calibrador común para los sistemas de medición de IVD y/o se incluyó la evaluación de la veracidad de los métodos de campo, verificar el certificado del CRM para obtener información sobre la conmutabilidad con muestras clínicas; (d) comprobar si la incertidumbre de medición (MU) de CRM o RMP tiene el potencial de ser lo suficientemente pequeña para evitar afectar significativamente las especificaciones de rendimiento analítico (APS) para MU de los resultados de muestras clínicas cuando la MU del calibrador IVD y de la medición del usuario final se combinaron el sistema.

Conclusion:  Producimos una sinopsis de los CRM y RMP de orden superior enumerados en JCTLM para los mensurandos seleccionados, incluidas sus características principales para implementar la trazabilidad y cumplir (o no) el APS para MU adecuada. Los resultados mostraron que los fabricantes de IVD pueden establecer la trazabilidad a referencias de orden superior dentro del APS definido para la mayoría de los 13 mensurandos seleccionados. Sin embargo, algunos mensurandos aún no tienen CRM adecuados para su uso como calibradores comunes. Para estos mensurandos, dividir las muestras clínicas con un laboratorio que realice el RMP puede proporcionar una alternativa práctica para establecer una jerarquía de calibración.

Joint Committee on Traceability in Laboratory Medicine (JCTLM)

La comunidad de laboratorios de medicina está trabajando hacia la estandarización global para obtener la equivalencia de los resultados de las pruebas en el espacio y el tiempo. Lograr esto eliminaría la necesidad de límites de referencia y niveles de decisión específicos del método que permitan un uso adecuado de la información basada en la evidencia en la práctica clínica. 

La aplicación de principios metrológicos se considera actualmente la mejor herramienta para lograr la estandarización de la medición. Esto se basa en la implementación de un sistema de medición de referencia (RMS), cuyos componentes esenciales son la definición del mensurando con respecto al uso clínico previsto, junto con la caracterización de materiales y métodos de referencia de orden superior apropiados. 

El JCTLM, creado en 2002, representa una parte de este movimiento internacional hacia la comparabilidad, confiabilidad y equivalencia de los resultados de las mediciones en los laboratorios. En los últimos 20 años, el principal objetivo de JCTLM ha sido identificar, a través de un proceso de revisión transparente, materiales de referencia y procedimientos de medición que cumplen con la definición de “orden superior” y laboratorios que ofrecen un servicio de referencia. 

Para lograr este objetivo, el JCTLM está utilizando las normas apropiadas de la International Organization for Standardization (ISO) y la experiencia de sus miembros extraída de todas las partes interesadas internacionales que apoyan las actividades de normalización. El resultado de este trabajo es una base de datos disponible públicamente que enumera materiales de referencia, métodos y servicios de medición que cumplen con los estándares ISO. 

La base de datos JCTLM es un recurso muy valioso para implementar la trazabilidad metrológica por parte de los fabricantes de dispositivos de diagnóstico in vitro (IVD), tanto comerciales como desarrollados en laboratorio, a nivel mundial, como se describe en la norma ISO 17511: 2020. Algunos países o regiones tienen regulaciones que requieren trazabilidad metrológica a referencias de orden superior, por ejemplo, European Union Regulation 2017/745........

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a profesionales bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. Las páginas de este blog , se renuevan dentro de 4 días en forma automática. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina



sábado, 18 de diciembre de 2021

838- Transformacion log de los resultados

Robert M West. Mejores prácticas en estadística: el uso de la transformación log. SAGE Annals of Clinical Biochemistry 2021; 0(0): 1–4. University of Leeds, Leeds, UK.

Resumen

La transformación logarítmica se utiliza a menudo para reducir la asimetría de una variable de medición. Si después de la transformación, la distribución es simétrica, entonces la prueba t de Welch podría usarse para comparar grupos. Si además, la distribución se acerca a lo normal, entonces podría determinarse un intervalo de referencia.

Introducción

El objetivo de este artículo es mostrar buenas prácticas en el uso de una transformación adecuada para datos asimétricos, mediante un ejemplo. El National Health and Nutrition Examination Study (NHANES) proporciona un gran conjunto de datos de acceso abierto.  Se seleccionaron datos de 2017 a 2018. Para las personas de 18 a 29 años, la prevalencia de la enfermedad renal es baja y se considera que la muestra está compuesta por sujetos sanos (494 hombres y 524 mujeres).

El uso principal de la relación albúmina/creatinina en orina es proporcionar evidencia temprana de enfermedad renal microvascular en pacientes con diabetes; los valores muy por encima de 3 mg/mmol se consideran clínicamente significativos. Desde una perspectiva estadística, existen problemas con las relacion de las variables, que se identificarán en este artículo. Aquí, solo se explorará la medición de la albúmina.

La  Figura 1 del articulo muestra que la distribución de la albúmina en orina está sesgada hacia con una cola larga a la derecha. Los estadísticos de resumen adecuados son la mediana y el rango intercuartílico (IQR). El IQR especifica los percentiles del 25% y 75% y, por lo tanto, la mitad de la distribución se encuentra entre ellos. Para los hombres, la mediana de los resultados de albúmina en orina es de 10.30  μg/ml, con un IQR de 4.55 a 15.47  μg/ml y para las mujeres, la mediana es de 9.10 μg/mL, con IQR 5.35-19.30  μg/mL (aunque se podrían calcular las medias y las desviaciones estándar, estos parametros no son útiles ya que la distribución está lejos de la normal).

También puede ser útil, estadísticamente, establecer el rango de valores en la muestra. Para los hombres, el rango es de 0.60 a 102.30  μg/mL y para las mujeres, de 0.60 a 244.00 μg/mL. Los valores más bajos están por encima del límite de detección; no es necesario establecer mediciones en un valor mínimo después de caer por debajo del límite de detección (LOD). Esto es importante porque los valores cero y los valores por debajo del LOD a veces pueden causar dificultades con las transformaciones.

¿Qué transformación? 

Los datos de albúmina son típicos de los valores informados para muchos ensayos. Los valores son positivos o cero, nunca negativos, y hay una cola larga a la derecha de los valores más altos. Una transformación adecuada podría ser la raíz cuadrada. Es importante destacar que esto es válido incluso si hay valores cero. Cuando no hay valores cero, puede ser útil una transformación recíproca (1/por el valor) o una transformación logarítmica. El objetivo de todas las transformaciones es producir una distribución razonablemente simétrica. Esto proporciona una buena base para otras técnicas estadísticas. La distribución transformada no tiene por qué ser totalmente normal, aunque si lo es, eso permitiría una mayor confianza en las pruebas basadas en muestras más pequeñas y podría simplificar el modelado estadístico de la albúmina....

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina



lunes, 13 de diciembre de 2021

837- Q/A: Investigacion de opioides

Q/A. Christine L H Snozek, Leland B Baskin, Jessica M Boyd, Brian N Kelly, Matthew D Krasowski, S M Hossein Sadrzadeh, Danyel H Tacker. ¿Cómo pueden los laboratorios clínicos de rutina mantenerse al día con la crisis de los opioides? Oxford Clin Chem, 2021; 67(2): 338–344. Department of Laboratory Medicine and Pathology, Mayo Clinic Arizona, Scottsdale, USA.

Las sobredosis y muertes relacionadas con los opioides han crecido hasta alcanzar proporciones epidémicas en todo Estados Unidos y Canadá, y también están aumentando en otras partes del mundo. A pesar de los esfuerzos específicos, como la distribución de naloxona y los programas de control de medicamentos recetados, el progreso hacia la reversión de estas tendencias ha sido lento. Por el contrario, muchas áreas están informando incrementos asombrosos de sobredosis y muertes relacionadas con las drogas durante la pandemia de COVID-19.

Las pruebas de laboratorio, como la detección de drogas en orina, desempeñan un papel importante en el manejo clínico del uso lícito e ilícito de opioides y otras sustancias controladas. Las indicaciones para las pruebas de drogas de abuso varían desde necesidades urgentes, como identificar sustancias involucradas en intoxicación o sobredosis, hasta entornos diversos, incluida la evaluación del cumplimiento de los medicamentos recetados o la abstinencia en el lugar de trabajo o en poblaciones de alto riesgo. A medida que aumenta la necesidad de estas pruebas, los laboratorios están bajo una presión cada vez mayor para ampliar el apoyo a los departamentos de emergencia, el manejo del dolor, la rehabilitación, la atención primaria y otras prácticas que requieren pruebas de drogas para la atención del paciente.

Satisfacer esta demanda puede ser particularmente desafiante para los laboratorios clínicos de rutina, que a menudo carecen de los recursos disponibles en los laboratorios especializados o de referencia. Estas últimas instituciones pueden responder a los cambios en las tendencias del uso indebido de drogas mediante el desarrollo de pruebas para drogas nuevas y la incorporación de tecnología reciente  como la espectrometría de masas de alta resolución (HRMS). Sin embargo, con la crisis de los opioides generalizada en América del Norte y en otros lugares, son los laboratorios de rutina con menos recursos y menos experiencia técnica los que soportan una parte sustancial de la carga clínica. Entonces, ¿cómo pueden los laboratorios que enfrentan limitaciones de recursos apoyar mejor sus prácticas clínicas para combatir esta crisis?

Los panelistas que abordaron esta pregunta tienen una amplia experiencia en pruebas e interpretación de drogas, en entornos de laboratorio que van desde grandes y sofisticados hasta pequeños y básicos. Todos comprenden las limitaciones que enfrentan los laboratorios de rutina y la presión para optimizar el apoyo a las prácticas que manejan todos los aspectos del uso lícito e ilícito de opioides.

Preguntas a considerar

  1. Con la epidemia de opioides en curso, ¿qué pruebas de drogas recomienda para prácticas como atención de emergencia/urgencia, atención primaria y manejo del dolor?
  2. ¿Qué pruebas de drogas de abuso deben tener disponibles los laboratorios clínicos de rutina en el lugar y qué es aceptable para enviar a un laboratorio de referencia?
  3. ¿Cómo pueden los laboratorios que enfrentan limitaciones de recursos aumentar su capacidad para responder a los cambios en las tendencias del uso indebido de drogas?
  4. ¿Qué recursos recomienda para realizar un seguimiento de las tendencias locales en el uso indebido de opioides y otras drogas?
  5. ¿Cómo pueden los laboratorios centralizados optimizar el apoyo a las instalaciones remotas que requieren pruebas de detección de drogas?
  6. ¿Recomendaría que los laboratorios clínicos de rutina implementen tecnologías como LC-MS/MS o HRMS para pruebas de drogas y, de ser así, cómo pueden hacerlo con éxito?
  7. ¿Qué papel juega la colaboración entre el laboratorio y las prácticas clínicas para mejorar la atención de los pacientes en riesgo de abuso de estas sustancias?
  8. ¿Tiene algún otro consejo para los laboratorios clínicos de rutina que luchan por encontrar la mejor forma de apoyar la atención al paciente en la epidemia de opioides?

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina



sábado, 11 de diciembre de 2021

836- Bioética en el laboratorio clínico

Nilda E. Fink, Editora invitada. Prólogo: Ética en el laboratorio de medicina. EJIFCC. 2020 Nov; 31(4): 260–261. IFCC-Task Force on Ethics (TF-E). PROES Program Biochemical, Foundation of Argentina

El campo de la ética involucra conceptos y reglas de comportamiento correctos e incorrectos. La bioética se define como una rama de la ética aplicada que estudia las cuestiones filosóficas, sociales y legales que surgen en la medicina y en las ciencias de la vida. Actualmente es obligatorio que las diferentes áreas de la Medicina cumplan con los estándares éticos, y el campo del Laboratorio de Medicina no es una excepción. No obstante, existe variabilidad en la educación ética dentro de las profesiones de la salud.(1)

Aunque existen publicaciones recientes sobre el tema de la ética, los miembros del Grupo de Trabajo sobre Ética de la IFCC (TF-E) (2) contribuyen aún más al objetivo de la educación ética en el campo del Laboratorio de Medicina en colaboración con la eJIFCC en forma de este número temático específico. Este número especial de la eJIFCC presenta una serie de manuscritos que resumen aspectos relevantes de la Ética. Se incluyen siete manuscritos, cuatro de ellos se están actualizando sobre temas éticos clásicos, dos hacen referencia a desafíos más recientes en Ética y finalmente, pero igualmente importante, un artículo de opinión.

En el primero de estos cuatro artículos, Davey presenta un análisis de los Códigos de ética para  laboratorio de medicina incluyendo aspectos como su definición, estructura y procedimientos. Como se destaca en el título, es una revisión narrativa basada en códigos nacionales existentes que complementan su trabajo anterior disponible en el sitio web de la IFCC (3).

Actualmente, el diagnóstico y el tratamiento de los pacientes depende en gran medida de los diagnósticos de laboratorio, ya que la utilidad de los datos obtenidos de los pacientes exige acciones éticas dependientes de las pautas. Los estándares y prácticas éticas varían y dependen de los recursos. 

Datta, analiza los desafíos éticos para el laboratorio de medicina en entornos con recursos limitados.

Beshir ha compilado un artículo para una mejor comprensión de los Comités de Ética en Investigación (REC) en el laboratorio de medicina . Las directrices y declaraciones éticas internacionales garantizan la autonomía, la dignidad y el bienestar de los sujetos de investigación, así como la integridad y credibilidad de los resultados de la investigación. Aquí, el autor define los REC en el laboratorio de medicina y describió sus roles basándose en el examen de los requisitos de la investigación ética.

Los conflictos de intereses (COI) existen con frecuencia en la medicina y la ciencia. Los médicos en la atención al paciente, y los profesionales de la salud en la industria farmacéutica y biomédica, en puestos gerenciales, en la docencia o en la investigación, deben aplicar principios éticos rígidos. Es probable que las comunidades de interés se apoyen en numerosos entornos. Todas las acciones relevantes deben cumplir con los principios esenciales de la Bioética. 

En el artículo de Fink se describen varios aspectos sobre el conflicto de intereses, en cuanto a su definición, clasificación, aplicaciones, gestión y otros desafíos.

Como mencionamos anteriormente, otros dos artículos abordan temas desafiantes desde el punto de vista ético. Uno de ellos es el segundo artículo de este número escrito por Beshir y está relacionado con hallazgos incidentales (FI). Con el avance en las áreas de genética y genómica, se deben hacer consideraciones éticas especiales y adicionales, ya que la investigación genética puede revelar información sobre la susceptibilidad de un individuo a la enfermedad. Se discute el deber de los investigadores de divulgar los IF a los participantes bajo pautas éticas y se recomienda un enfoque para su divulgación.

En el artículo de Verona se describe el Sistema Integrador de Historia Clínica Electrónica aplicado a nivel de ciudad en un país latinoamericano. Se analizaron consideraciones éticas detalladas que se tuvieron en cuenta a medida que se empleó la concepción centrada en el paciente.

Finalmente, Banys presenta en un artículo de opinión, en forma de respuesta a una pregunta referida al Código de Práctica Empresarial Ética de MedTech Europe creado por la industria de la tecnología médica, y cómo influye en las actividades de las sociedades profesionales en el laboratorio de medicina  Describió la experiencia de una Sociedad Nacional, la Sociedad Lituana de Laboratorio de Medicina (LLMD). Aborda la importancia de un uso ético de los recursos y la gestión justa de las subvenciones educativas, la divulgación pública de las subvenciones educativas proporcionadas, el cumplimiento de las conferencias con el Sistema de verificación de conferencias y otras asignaciones de recursos como ejemplos.

El TF-E con este tema temático, busca promover la enseñanza de la Ética, catalizar la discusión entre las partes interesadas, y quizás también pueda resultar útil para mejorar las guías y documentos a nivel local o nacional.

Leer bibliografia adjunta

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lunes, 6 de diciembre de 2021

835- Investigacion de hemoglobina fecal

Craig Mowat, Jayne Digby, Judith A Strachan, Rebecca K McCann, Francis A Carey, Callum G Fraser, Robert JC Steele. Umbrales de concentración de hemoglobina fecal en la investigación de rutina y de urgencia del cáncer colorrectal, basados ​​en una prueba inmunoquímica en pacientes sintomáticos en atención primaria. Ann Clin Biochem. 2021 May; 58(3): 211–219. Department of Gastroenterology, University of Dundee, School of Medicine Ninewells Hospital and Medical School, Dundee, Scotland, UK

Resumen 

La concentración de hemoglobina fecal (f-Hb), estimada mediante una prueba inmunoquímica fecal, se puede implementar de forma segura en la atención primaria para evaluar el riesgo de cáncer colorrectal (RCC). Los resultados clínicos de los pacientes que presentaban síntomas de enfermedad gastrointestinal inferior se examinaron utilizando una amplia gama de umbrales de f-Hb para decidir si los tranquilizaban o los derivaban para una investigación adicional.

Métodos: Fueron examinados todos los pacientes que acudieron a atención primaria y que se testearon con una única muestra fecal (prueba inmunoquímica HM-JACKarc) en el primer año en el servicio de rutina; se obtuvieron umbrales de f-Hb de <2 a ≥ 400 µg Hb/g heces (µg / g) .

Resultados: Con umbrales bajos de f-Hb de <2, <7, <10 y <20 µg/g dieron respectivos riesgos de RCC de 0,1, 0,3, 0,3 y 0,4%, números necesarios para alcanzar un RCC de 871, 335, 300 y 249, y tasas de "falsos negativos" del 2,9, 11,4, 13,3 y 17,1%. Con umbrales de <2, <7, <10 y <20 µg/g, para alcanzar un RCC 48,6, 74,6, 78,1 y 83,2%, respectivamente, los pacientes sintomáticos podrían tratarse sin más investigación. Con umbrales de tranquilidad de <2 µg/g, <7µg/gy <10µg/g, los umbrales para la derivación para una investigación urgente serían > 400 µg/g, ≥200µg/g ≥100 µg/g. Sin embargo, a los pacientes con una concentración de f-Hb <10 o <20 µg / g con anemia ferropénica, o con síntomas graves o persistentes, no les debe realizar una mayor investigación.

Conclusiones: En la atención primaria, la f-Hb, junto con la evaluación clínica, puede determinar de manera segura y objetiva el riesgo individual de RCC y decidir si se trata de un simple alivio o una derivación urgente o de rutina.

Introducción

Los síntomas del tracto gastrointestinal inferior (GI) son malos predictores de cáncer colorrectal (RCC) y otras enfermedades intestinales graves.  Cuando se introdujo en Inglaterra una guía sobre la 'espera de dos semanas' para la derivación urgente para una mayor investigación de los pacientes con síntomas sospechosos de RCC, se produjo un gran aumento de las derivaciones, pero ningún cambio en la etapa del diagnóstico de RCC. Además, en un estudio reciente, los pacientes de consultorios de atención primaria con las tasas más altas de derivación urgente por sospecha de cáncer no tenían menor probabilidad de diagnóstico en etapa tardía que los de consultorios con tasas de derivación más bajas.

El problema de depender únicamente de los síntomas es que todos los potencialmente causados ​​por el RCC a menudo se deben a trastornos funcionales o no significativos. A esto se suma el hecho de que la guía actual, tanto del Gobierno de Escocia  como del National Institute for Health and Care Excellence (NICE) en Inglaterra, tiene serias limitaciones, ya que se basa principalmente en los síntomas de presentación y, en este último, muy dependiente de la edad. Además, NICE está actualmente considerando el desarrollo de una guía sobre pruebas inmunoquímicas fecales cuantitativas (FIT) para guiar la derivación de RCC para pacientes que se presentan en atención primaria con un cambio en el hábito intestinal o dolor abdominal. 

La guía actual disponible en el Reino Unido es compleja y está abierta a una amplia interpretación por parte de los médicos generales (GP). Sin embargo, existe una creciente evidencia de que el uso de la concentración de hemoglobina fecal (f-Hb), según lo estimado por la FIT cuantitativa, permite un enfoque racional y universal para identificar a los pacientes sintomáticos que se beneficiarían más de una mayor investigación y aquellos que pueden ser tratados de forma segura con lo que pensamos se denomina apropiadamente una estrategia de "tranquilidad". 

Esta estrategia implica advertir a los pacientes de que es poco probable que sus síntomas se deban a una enfermedad gastrointestinal significativa, pero deben buscar asesoramiento si los síntomas reaparecen, continúan o empeoran. Además, ahora está claro que la FIT puede emplearse en este contexto para todos los pacientes sintomáticos, no solo los de bajo riesgo como se recomienda en NICE NG12  y DG30, si no también aquellos que reportan síntomas de alto riesgo, especialmente hemorragia rectal..... 

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sábado, 4 de diciembre de 2021

834. PRACE en Covid-19

Núria López, y otros. Lecciones aprendidas en Europa sobre la necesidad urgente de aplicar la informática en la pandemia del COVID-19.  Proc Natl Acad Sci U S A . 2021 Nov 16; 118(46). PRACE. Advanced Computing in Europe Bruxelles, Belgium y otros. 

Resumen

El PRACE (Partnership for Advanced Computing in Europe), es una asociación internacional sin fines de lucro que reúne a los cinco centros de supercomputación más grandes de Europa e involucra a 26 países europeos, ha asignado más de 500 millones de horas centrales a simulaciones por computadora para combatir la pandemia del COVID 19. Junto a los experimentos, estas simulaciones son un pilar de investigación para evaluar los riesgos de diferentes escenarios e investigan estrategias de mitigación. Mientras el mundo se deberá enfrentr a oleadas posteriores de la pandemia, presentamos una reflexión sobre el uso de la supercomputación urgente para los desafíos sociales globales y la gestión de crisis.

Introducción

En esta perspectiva presentamos un análisis de varios esfuerzos científicos realizados en Europa para combatir la pandemia de COVID-19 basados ​​en simulaciones numéricas avanzadas y computacionalmente intensivas que requieren el uso de computadoras a gran escala. Los cinco centros de supercomputación europeos más grandes apoyaron algunos de estos esfuerzos con recursos computacionales gratuitos, a través de la PRACE. 

Este artículo presenta una serie de modelos y métodos computacionales relevantes para la lucha contra la pandemia COVID-19, incluidos estudios bioestructurales, acoplamiento y detección para aplicaciones farmacéuticas, dinámica de fluidos computacional para estudiar la propagación y transmisión de gotitas del virus, modelado de órganos para respaldar el diagnóstico. y tratamiento de la enfermedad y epidemiología. Discutimos el uso de inteligencia artificial (IA) en estas áreas y la preparación de los códigos para ejecutarse en computadoras de alto rendimiento.

La pandemia de COVID-19 comenzó entre finales de 2019 y principios de 2020 en la ciudad de Wuhan, Hubei, China. La identificación del virus se produjo con relativa rapidez. El perfil genético del virus y el modelo cristalográfico de sus proteínas de pico se publicaron como ciencia abierta a la comunidad en cuestión de semanas, proporcionando la información estructural crucial necesaria para desarrollar biomodelos  que finalmente llevaron a la formulación de la vacuna de ARN mensajero. Al mismo tiempo, el análisis científico de la enfermedad comenzó rápidamente a diferentes niveles:

• A nivel molecular, los investigadores comenzaron a ejecutar simulaciones de estas estructuras inmediatamente después de que se dispuso de los datos estructurales básicos.

• A nivel mundial, se probaron y perfeccionaron modelos epidemiológicos, sobre la propagación del virus y los grupos de investigación compartieron ampliamente estos datos.

Reconociendo la importancia fundamental de los enfoques informáticos para estos problemas urgentes, los centros europeos de supercomputación han establecido el acceso urgente a las computadoras a través de PRACE, poniendo en práctica por primera vez una idea planificada desde hace mucho tiempo de un programa de vía rápida para situaciones de crisis. Para ello un pequeño comité científico, que aprovechó la experiencia del Comité Directivo Científico de PRACE y el Comité de Acceso de PRACE existentes, comenzó a trabajar el 21 de marzo de 2020. 

Las primeras solicitudes de tiempo de cómputo llegaron solo un par de días después. El sistema de solicitud fue simple y rápido para atraer el mayor número posible de proyectos. La Figura 1 de este articulo, muestra una descripción esquemática del proceso. Los principales requisitos para que a los solicitantes le fueran otorgados estos tiempos fueron un argumento convincente de que la investigación propuesta ayudaría con la crisis del COVID-19 y el compromiso de poner el conocimiento científico resultante a disposición de la comunidad científica en general, gracias a los recursos de Fenix ​​ICEI, BioExcel, y EMBL-EBI. Por parte del comité científico, el objetivo de PRACE era implementar un proceso de revisión por pares riguroso y rápido......

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lunes, 29 de noviembre de 2021

833- Gammapatías monoclonales de importancia clínica

Angela Dispenzieri. Gammapatías monoclonales de importancia clínica. Hematology Am Soc Hematol Educ Program. 2020 Dec 4; 2020(1): 380–388. Division of Hematology and Division of Clinical Chemistry, Mayo Clinic, Rochester, MN-USA

Resumen

“Gammapatía monoclonal de importancia clínica” (MGCS) es el término utilizado para describir las gammapatías monoclonales no malignas que causan una enfermedad importante. MGCS es el diagnóstico diferencial para cualquier paciente que se presente con lo que parece ser una gammapatía monoclonal de significado indeterminado, pero que también experimenta otros síntomas inexplicables. En términos generales, estas afecciones se pueden dividir en síntomas y signos que se refieren a los nervios, los riñones y la piel. El primer paso para realizar estos diagnósticos es considerarlos. Con una condición particular en mente, el siguiente paso es solicitar las pruebas que pueden ayudar a confirmar o descartar un diagnóstico en particular. Casi todas las afecciones renales y dermatológicas se diagnostican mediante biopsias renales y cutáneas, respectivamente. No se puede subestimar la importancia de un patólogo renal y un dermatopatólogo altamente competentes. La biopsia es menos específica para las condiciones neuropáticas. Debido a que varios de los MGCS son síndromes, reconocer otras manifestaciones también es clave. Las recomendaciones de tratamiento para muchas de estas afecciones son anecdóticas debido a su rareza, pero para varias de las afecciones, la inmunoglobulina intravenosa, el rituximab y la terapia dirigida a células plasmáticas son las mejores opciones.

Objetivos de aprendizaje: • Reconocer el diagnóstico diferencial de una gammapatía monoclonal con neuropatía periférica, anomalías cutáneas o enfermedad renal. • Diagnosticar MGCS

Caso clínico

Aproximadamente 18 meses antes del diagnóstico y a los 67 años, un hombre comenzó a experimentar anorexia, náuseas, vómitos y pérdida de peso. A los 12 meses antes del diagnóstico, había perdido 25 kg. Se realizó una evaluación no diagnóstica extensa, que incluyó tirotropina, autoanticuerpos anticitoplasma de neutrófilos, anticuerpos antinucleares, endoscopias, estudios de vaciamiento gástrico y tomografía por emisión de positrones-tomografía computarizada. Siete meses antes del diagnóstico se encontró una gammapatía monoclonal por inmunoglobulina Aλ. Durante los meses siguientes, este paciente desarrolló neuropatía periférica sensitivomotora, debilidad muscular progresiva, sobrecarga de volumen y seudogota. Fue ingresado en nuestro hospital, donde se le hizo un diagnóstico. Además de las presentaciones anteriores, tuvo desnutrición y anasarca (tabla 1). Su estado funcional del Eastern Cooperative Oncology Group fue 4.

Introducción

El término "gammapatía monoclonal de importancia clínica" (MGCS) se acuñó después de la gammapatía monoclonal de importancia renal (MGRS) cuando se hizo cada vez más evidente que se requería un término para un paciente con un clon pequeño de células B y pequeñas proteínas monoclonales que estaban causando enfermedades graves e incluso potencialmente mortales. La gammapatía monoclonal de "significado indeterminado" (MGUS) es un nombre inapropiado para estas afecciones. Algunos pacientes con MGCS tienen una carga clonal suficiente para satisfacer la definición de mieloma múltiple latente o macroglobulinemia de Waldenstrom latente. En resumen, MGCS es una gammapatía monoclonal que presenta dos características principales: un clon subyacente inactivo y síntomas relacionados con la inmunoglobulina monoclonal o con el clon en sí por mecanismos distintos de la carga tumoral. Los MGCS se dividen mejor en diferentes sistemas que se ven afectados, los más comunes de los cuales son el riñón, el nervio y la piel, reconociendo que en algunos casos hay superposición debido a una presentación y/o curso sistémico y multiorgánico.

MGCS neurológico

Las principales consideraciones de MGCS para un paciente con neuropatía incluyen amiloidosis de cadena ligera amiloide (AL), síndrome POEMS (polirradiculoneuropatía, organomegalia, endocrinopatía, trastorno de células plasmáticas monoclonales y cambios en la piel), crioglobulinemia, neuropatía atáxica crónica, oftalmoplejía, inmunoglobulina M [IgM] paraproteína, paraproteína y aglutina fría anticuerpos disialosil y neuropatía simétrica desmielinizante adquirida distal con proteína M [anteriormente conocida como "neuropatía periférica asociada a GMSI"]). Las tres primeras son enfermedades con múltiples manifestaciones sistémicas, mientras que las dos últimas se encuentran principalmente en el sistema nervioso únicamente.........

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sábado, 27 de noviembre de 2021

832- SARS-CoV-2- variante Nu (Omicron)

Nature News- Ewen Callaway, Editor. 25 November 2021. La variante Omicron fuertemente mutada pone a los científicos en alerta

Los investigadores se apresuran a determinar si una variante de rápida propagación en Sudáfrica representa una amenaza para la eficacia de las vacunas COVID.

Investigadores en Sudáfrica están corriendo para rastrear el preocupante aumento de una nueva variante del coronavirus SARS-CoV-2 que causa COVID-19. La variante alberga una gran cantidad de mutaciones encontradas en otras variantes, incluida Delta, y parece que se está extendiendo rápidamente por Sudáfrica.

Una de las principales prioridades es seguir más de cerca la variante a medida que se propaga: se identificó por primera vez en Botswana a principios de este mes y desde entonces ha aparecido en un viajero que llega a Hong Kong desde Sudáfrica. Los científicos también están tratando de comprender las propiedades de la variante, como si puede evadir las respuestas inmunitarias desencadenadas por las vacunas y si causa una enfermedad más o menos grave que otras variantes.

“Volamos a gran velocidad”, dice Penny Moore, viróloga de la Universidad de Witwatersrand en Johannesburgo, Sudáfrica, cuyo laboratorio está evaluando el potencial de la variante para esquivar la inmunidad de vacunas e infecciones previas. Hay informes anecdóticos de reinfecciones y de casos en personas vacunadas, pero “en esta etapa es demasiado pronto para decir algo”, agrega Moore.

"Hay muchas cosas que no entendemos sobre esta variante", dijo Richard Lessells, médico de enfermedades infecciosas de la Universidad de KwaZulu-Natal en Durban, Sudáfrica, en una rueda de prensa organizada por el departamento de salud de Sudáfrica el 25 de noviembre. "El perfil de la mutación nos preocupa, pero ahora tenemos que hacer el trabajo para comprender la importancia de esta variante y lo que significa para la respuesta a la pandemia".

Un grupo de expertos de la Organización Mundial de la Salud (OMS) se reunirá el 26 de noviembre y probablemente etiquetará la cepa, actualmente conocida como B.1.1.529, como una variante de preocupación o variante de interés. Tulio de Oliveira, bioinformático de la Universidad. de KwaZulu-Natal, dijo en la sesión informativa que la variante probablemente se llamará Nu (Omicron), la siguiente letra disponible en el sistema de nomenclatura del alfabeto griego para las variantes del coronavirus, si está marcada por el grupo de la OMS.

Los investigadores también quieren medir el potencial de la variante para propagarse a nivel mundial, posiblemente provocando nuevas olas de infección o exacerbando los aumentos en curso impulsados ​​por Delta.

Cambios en el pico

Los investigadores detectaron la B.1.1.529 en datos de secuenciación del genoma de Botswana. La variante se destacó porque contiene más de 30 cambios en la proteína de pico, la proteína SARS-CoV-2 que reconoce las células huésped y es el principal objetivo de las respuestas inmunitarias del cuerpo. Muchos de los cambios se han encontrado en variantes como Delta y Alpha, y están relacionados con una mayor infectividad y su capacidad de evadir los anticuerpos que bloquean la infección.

El aparente fuerte aumento de casos de la variante en la provincia sudafricana de Gauteng, hogar de Johannesburgo, también está haciendo sonar las alarmas. Según Lessells los casos aumentaron rápidamente en la provincia en noviembre, particularmente en las escuelas y entre los jóvenes,  La secuenciación del genoma y otros análisis genéticos del equipo de De Oliveira encontraron que la variante B.1.1.529 era responsable de las 77 muestras de virus que analizaron en Gauteng, recolectadas entre el 12 y el 20 de noviembre. Se están analizando cientos de muestras más...................

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Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina



lunes, 22 de noviembre de 2021

831- Covid-19: predecir la progresión de la enfermedad

Jianjun Xu , Yang Gao, Shaobo Hu, Suzhen Li, Weimin Wang, Yuzhe Wu, Zhe Su, Xing Zhou, Xiang Cheng, Qichang Zheng. Un modelo de riesgo compuesto predice la progresión de la enfermedad en las primeras etapas de COVID-19: un estudio cohorte de pareamiento por puntajes de propensión. SAGE- Ann Clin Biochem . 2021; Sept 21, 58(5): 434-444. Department of Hepatobiliary Surgery, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China.

(N del E): En el análisis estadístico de los estudios realizados, el "pareamiento por puntaje de propensión" (Propensity score matching (PSM), es una técnica estadística de coincidencia, que intenta estimar el efecto de un tratamiento​ u otra intervención en base a la predicción de covariables de los que recibe el tratamiento. El PSM intenta reducir el sesgo debido a la confusión de las variables que se pueden encontrar en una estimación, del efecto del tratamiento obtenido mediante la simple comparación de los resultados entre unidades que recibieron el tratamiento frente a los que no lo recibieron.

Resumen

Antecentes: Recientemente, los estudios sobre COVID-19 se han centrado en la epidemiología de la enfermedad y las características clínicas de los pacientes, así como en los factores de riesgo asociados a la mortalidad durante la hospitalización en casos críticos de COVID-19. Sin embargo, se han realizado pocas investigaciones sobre la predicción de la progresión de la enfermedad en un grupo particular de pacientes en las primeras etapas de COVID-19.

Métodos: El estudio incluyó a 338 pacientes con COVID-19 tratados en dos hospitales en Wuhan, China, de diciembre de 2019 a marzo de 2020. Los predictores de la progresión de COVID-19 de etapas leves a graves se seleccionaron mediante el análisis de regresión logística.

Resultados: La progresión de COVID-19 a estadios graves y críticos se confirmó en 78 (23,1%) pacientes. El valor promedio de la proporción de neutrófilos a linfocitos (NLR) fue mayor en los pacientes del grupo de progresión de la enfermedad que en el grupo de mejoría. El análisis de regresión logística multivariable reveló que los niveles elevados de NLR, LDH e IL-10 eran predictores independientes de la progresión de la enfermedad. El valor de corte óptimo de NLR fue 3,75. Los valores del área bajo la curva, que reflejan la precisión de la predicción de la progresión de COVID-19 por NLR, fueron 0,739 (IC del 95%: 0,605-0,804). El modelo de riesgo basado en NLR, LDH e IL-10 tuvo el área más alta bajo la curva ROC.

Conclusiones:  El análisis realizado demuestra que altas concentraciones de NLR, LDH e IL-10 eran factores de riesgo independientes para predecir la progresión de la enfermedad en pacientes en la etapa temprana de COVID-19. El modelo de riesgo combinado de NLR, LDH e IL-10 mejoró la precisión de la predicción de la progresión de la enfermedad en pacientes en las primeras etapas de COVID-19.

Introducción

El nuevo coronavirus, llamado así por la Organización Mundial de la Salud como agudo y grave coronavirus del síndrome respiratorio 2 (SARS-CoV-2), se identificó por primera vez en la ciudad de Wuhan, China, en diciembre de 2019. Dado el rápido inicio de la enfermedad del coronavirus 2019 (COVID-19) causada por el SARS-CoV-2 en China y su rápida propagación de la pandemia en todo el mundo, han surgido preocupaciones globales. El alcance y gravedad del COVID-19 son particularmente evidentes en países que carecen de recursos médicos adecuados. Hasta el 24 de abril de 2020, 84.312 pacientes habían sido diagnosticados con COVID-19 en China, y 4.642 (5,5%) de ellos murieron.

El análisis de 44.672 casos confirmados de COVID-19 en China reveló que la mayoría de las infecciones por esta patología eran de tipo leve,  1,2% eran asintomáticas, 13,8% graves, y 4,7% eran casos críticos. La tasa de mortalidad en casos críticos de COVID-19 fué aproximadamente del 49%. Los pacientes graves suelen desarrollar disnea o hipoxemia una semana después del inicio de la enfermedad y los pacientes críticos con COVID-19 desarrollan rápidamente síndrome de dificultad respiratoria aguda, choque séptico, acidosis metabólica refractaria, trastornos de la coagulación e insuficiencia multiorgánica.

En los primeros días de la propagación del COVID-19 en Wuhan, los pacientes grave o crítico fueron ingresados ​​en un hospital, mientras que a los pacientes leves o general se les recomendó que se aislaran en casa. Con una mayor conciencia de la propagación y progresión de COVID-19, se han realizado esfuerzos en toda China para admitir y tratar a todos los pacientes confirmados o sospechosos de COVID-19..........

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sábado, 20 de noviembre de 2021

830- Covid-19- Preparándose para lo que viene

 Emily Waltzm, Editor. Los fabricantes de vacunas COVID se preparan para una variante peor que la Delta. Nature News. 20 October 2021

Las empresas están actualizando las vacunas y aprobándolas en las personas para prepararse para lo que venga a continuación en la pandemia.

El director ejecutivo de Pfizer, Albert Bourla, hizo una promesa audaz en junio. De pie junto al presidente de los Estados Unidos, Joe Biden, en una conferencia de prensa en St Ives, Reino Unido, justo antes de la reunión cumbre del G7, Bourla dijo que si surgiera la necesidad de una nueva vacuna COVID-19, su compañía podría preparar una en 100 días.

La necesidad a la que se refería es la posible aparición de una 'variante de escape': una cepa dominante del SARS-CoV-2 que evade la inmunidad incipiente establecida a través de vacunas e infecciones previas. Aún no se ha identificado tal cepa, pero Pfizer y otros fabricantes líderes de vacunas COVID-19 se están preparando para ese escenario.

¿Qué se necesita para ser lo suficientemente ágil como para diseñar y probar una vacuna actualizada contra una cepa viral desconocida, en un tiempo récord? Nature habló con tres fabricantes de vacunas COVID-19, Pfizer, Moderna y AstraZeneca, para saber exactamente cómo se están preparando.

Ensayo general

En los últimos meses, las tres compañías han realizado ensayos generales practicando con variantes conocidas del SARS-CoV-2. Esto implica actualizar sus vacunas para que coincidan con variantes como Beta y Delta, probarlas en estudios clínicos, ajustar sus flujos de trabajo internos y coordinarse con los reguladores. Su objetivo es aprender de estas pruebas de calentamiento y suavizar los problemas en sus procesos, para que puedan moverse rápidamente si surge una verdadera variante de escape.

"En algún momento, inevitablemente, tendremos que fabricar vacunas variantes, si las vacunas son la forma en que se mantendrá la inmunidad de la población, pero no estamos en el punto en el que podamos predecir con seguridad la evolución del virus", dice. Paul Bieniasz, virólogo de la Universidad Rockefeller en la ciudad de Nueva York. "Practicar con variantes existentes parece un enfoque razonable".

La primera generación de vacunas COVID-19 parece resistir contra Delta y otras variantes conocidas, al menos en la prevención de enfermedades graves y hospitalizaciones . Pfizer, Moderna y AstraZeneca dicen que sus vacunas, que se basan en la cepa SARS-CoV-2 original que se detectó por primera vez en Wuhan, China, aún ofrecen la mejor protección contra todas las variantes conocidas. “Realmente no hay necesidad en este momento de hacer una nueva vacuna que sea más efectiva, porque parece que las viejas funcionan muy bien [contra] la variante Delta”, dice Kathryn Edwards, directora científica de Vanderbilt Vaccine. Programa de investigación en el Centro Médico de la Universidad de Vanderbilt en Nashville, Tennessee.

Si surge una variante de escape, los fabricantes de vacunas de ARN como Pfizer y Moderna probablemente podrían diseñar y sintetizar un prototipo inicial en contra ella en unos pocos días . Las vacunas de vectores virales, como la de AstraZeneca, podrían seguirlas  de cerca. Hacer una vacuna de ARN generalmente implica generar una nueva secuencia genética y encapsularla en una sustancia grasa como un lípido. Las vacunas de vectores virales se generan insertando la secuencia genética clave en un virus portador inofensivo, cultivando grandes cantidades del virus en un biorreactor y purificándolos.....

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lunes, 15 de noviembre de 2021

829- Hematuria

Muhammad O. Saleem; Karim Hamawy. Hematuria. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; March 22, 2021. Augusta University Medical Center, Augusta GA-USA  Lahey Hospital & Medical Center,Burlington, Massachusetts USA

Resumen

Hematuria es la presencia de sangre en la orina. La hematuria puede ser macroscópica o microscópica; la hematuria macroscópica es sangre visible en la orina, mientras que la hematuria microscópica se refiere a la detección de sangre en el análisis de orina o en el microscopio de orina. Esta presentación actualiza el tema sobre evaluación, diagnóstico, tratamiento, el control  de la hematuria y la importancia de un enfoque de equipo.   

Objetivos:

  • Identificar las diferencias entre la hematuria macroscópica y la hematuria microscópica.
  • Revisar la evaluación secuencial que debe realizarse para la hematuria macroscópica versus la hematuria microscópica.
  • Explicar las opciones de manejo para las diversas etiologías de hematuria macroscópica y microscópica.
  • Describir el papel de los miembros del equipo interprofesional en la optimizan de la colaboración y comunicación para garantizar que los pacientes con hematuria sean reconocidos precozmente y se hagan todos los esfuerzos posibles para brindar una atención óptima, lo que conducirá a mejores resultados.

Introducción

La hematuria es la presencia de sangre en la orina. La hematuria puede ser macroscópica o microscópica. La hematuria macroscópica es sangre visible en la orina. La hematuria microscópica se refiere a la detección de sangre en análisis de orina o microscopía de orina. La hematuria puede ser intermitente o persistente. La hematuria se define como la presencia de al menos 5 glóbulos rojos/HPF (campo de alta resolución) en 3 de 3 muestras centrifugadas consecutivas obtenidas con al menos 7 días de diferencia. La hematuria puede ser asintomática o sintomática y puede estar asociada con otras anomalías del tracto urinario. La hematuria a menudo la detecta por primera vez el médico de atención primaria.

Etiología

La hematuria suele ser causada por una enfermedad genitourinaria, aunque las enfermedades sistémicas también pueden manifestarse con sangre en la orina. La hematuria se divide en hematuria glomerular y no glomerular para ayudar en la evaluación y el tratamiento.

Causas glomerulares comunes son: Síndrome de Alport, enfermedad de la membrana basal delgada, glomerulonefritis posestreptocócica, mefropatía por IgA, menor glomerulonefritis inmunitaria, nefritis lúpica, glomerulonefritis membrano-proliferativa, Síndrome de Goodpasture, Síndrome nefrótico, rnfermedad poliqistica en los riñones

Las causas no glomerulares incluyen: enfermedad febril, ejercicio, menstruación, nefrolitiasis, cistitis, uretritis, prostatitis, malignidad: carcinoma de células renales, cáncer de vejiga, cáncer de próstata, lesión de la mucosa genitourinaria por instrumentación, trauma, tendencia al sangrado: trombocitopenia, coagulopatía, uso de anticoagulantes, trastornos hematológicos como anemia falciforme.

Epidemiología

La hematuria es una de las presentaciones más frecuentes en los servicios de urgencias y ambulatorios y se cree que la hematuria asintomática es mucho más prevalente que la hematuria sintomática. En aproximadamente el 50% de los casos, se puede identificar una causa. Cuando la hematuria se presenta con proteinuria, esto generalmente indica una enfermedad renal de moderada a grave. En lactantes y niños pequeños, la hematuria puede indicar tumor de Wilms, mientras que la glomerulonefritis postinfecciosa y la neoplasia maligna son más frecuentes en personas mayores.

Fisiopatología

La hematuria a menudo ocurre como resultado de alteraciones estructurales debido a una lesión, infección o masa. La integridad de la membrana basal glomerular puede resultar dañada por procesos inmunológicos y/o inflamatorios. Algunos fármacos, cálculos y sustancias químicas pueden causar erosión de la superficie mucosa del tracto urinario, lo que lleva a hematuria..................

Evaluación

El análisis de orina es la prueba inicial y más útil a realizar. Aunque la tira reactiva de orina está ampliamente disponible y se puede realizar rápidamente, puede dar resultados falsos positivos o falsos negativos y justifica el análisis de orina y la microscopía de orina para establecer el diagnóstico. La presencia de 3 o más glóbulos rojos por campo de alta esolucion en los sedimentos urinarios se define como hematuria microscópica, aunque no existe un límite inferior "seguro" de hematuria.  Es útil la apariencia de la orina, el pH, la presencia de proteínas, glóbulos blancos, nitritos, esterasa leucocitaria, cristales y cilindros. Una muestra de orina con leucocitos significativos y nitritos positivos y esterasa leucocitaria sugiere una infección del tracto urinario y una causa probable de hematuria. La presencia de un exceso de proteínas con hematuria favorece la glomerulonefritis.

La microscopía de orina examina los sedimentos de orina para determinar la morfología de los glóbulos rojos, y los cilindros de glóbulos rojos son la prueba más importante que puede diferenciar entre hemorragia glomerular y no glomerular.  Los glóbulos rojos dismórficos > 25% por campo de alta potencia son muy específicos (> 96%) con un valor predictivo positivo alto (94,6%) pero no muy sensibles (20%) para la glomerulonefritis. Los cilindros de glóbulos rojos son raros de encontrar, pero casi son diagnósticos de patología glomerular.

Imágenes: las imágenes iniciales pueden tomar la forma de una ecografía de los riñones, los uréteres y la vejiga. Puede ayudar a diagnosticar causas anatómicas de hematuria, como cálculos renales, vejiga o masa renal. También puede detectar quistes renales. La TC abdominopélvica con o sin contraste es la modalidad preferida para detectar cálculos renales y otras anomalías morfológicas de los riñones. La resonancia magnética del abdomen y la pelvis es otra modalidad útil si la tomografía computarizada está contraindicada o no es útil.................


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domingo, 14 de noviembre de 2021

828- Reinfeccion de COVID-19

Lynne Peeples Editora. Proponen los modelos por reinfecciones probables de COVID para dentro de uno o dos años,  Nature NEWS 19 October 2021

Estimaciones basadas en la evolución viral, pronostican un riesgo del 50% de nueva infección a los 17 meses después de la primera infección, si no se continúan con medidas como la utilización del barbijo y la vacunación. Las personas que han sido infectadas con SARS-CoV-2 pueden esperar volver a infectarse dentro de uno o dos años, a menos que tomen precauciones como las ya mencionadas. Esa es la predicción del modelado basado en las relaciones genéticas entre el SARS-CoV-2 y otros coronavirus.

Los hallazgos también advierten que las personas podrían reinfectarse en solo unos meses si no se vacunan. "La inmunidad es relativamente efímera", dice el coautor del estudio Jeffrey Townsend, bioinformático de la Escuela de Salud Pública de Yale en New Haven, Connecticut. "Aún debe vacunarse aunque se haya infectado".Se necesitarán más datos en los próximos meses y años para saber con precisión cuánto dura la inmunidad natural. “Pero no queremos esperar por eso. Y no tenemos que hacerlo ”, dice Townsend.

Para estimar la durabilidad de la inmunidad al SARS-CoV-2, él y sus colegas querían comprender cómo los niveles de anticuerpos de una infección previa afectan el riesgo de reinfección. Los datos de un estudio anterior  permitieron al equipo trazar este efecto durante años para los coronavirus 'endémicos', o que circulan continuamente, y que causan el resfriado común. Pero el SARS-CoV-2 es demasiado nuevo para que haya datos a largo plazo disponibles.

Para llenar el vacío, los científicos combinaron datos genéticos del SARS-CoV-2, tres coronavirus endémicos y los coronavirus estrechamente relacionados SARS-CoV y MERS-CoV para construir un árbol genealógico viral. Luego, los autores usaron ese árbol para modelar cómo los rasgos virales han evolucionado con el tiempo. Juntos, estos rasgos proporcionaron una estimación de la disminución de los niveles de anticuerpos después de la infección por SARS-CoV-2 y de otros factores necesarios para comprender el riesgo de reinfección. Los resultados sugieren que el riesgo de reinfección promedio aumenta desde alrededor del 5% cuatro meses después de la infección inicial al 50% a los 17 meses. En general, la protección natural parece durar menos de la mitad del tiempo que dura para los tres coronavirus del resfriado común. Townsend dice que estaba "sorprendido y desanimado" por sus hallazgos, que sugieren que es probable que el COVID-19 pase de una enfermedad pandémica a una endémica .

Comodines COVID-19

Aún así, quedan muchas incógnitas, incluida la probable gravedad de la enfermedad cuando alguien se vuelve a infectar. Los individuos también pueden variar significativamente tanto en su susceptibilidad a la reinfección como si se reinfectan, en el curso de su enfermedad, incluso  es probable que tengan un COVID prolongado .

Sarah Cobey, bióloga evolutiva de la Universidad de Chicago en Illinois, advierte que la nueva investigación se basa en la suposición de que las similitudes genéticas de los virus predicen similitudes en rasgos relevantes para la reinfección. Ella señala que podría ser demasiado pronto para hacer una declaración segura sobre la rapidez con la que disminuye la protección después de una infección por SARS-CoV-2. Pero agrega que la ciencia sugiere que la protección de hecho disminuirá: "Nadie esperaría que la inmunidad dure tanto tiempo con un virus que está evolucionando específicamente para escapar de la inmunidad".

Cobey también subraya la necesidad de que las personas que han sido infectadas refuercen su protección con una vacuna, un punto que se desprende de una investigación publicada por los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de EE. UU. En agosto. El estudio analizó a las personas que contrajeron COVID-19 en 2020, algunas de las cuales se reinfectaron en mayo o junio de 2021. Encontró que las personas que no habían recibido una vacuna tenían más del doble de probabilidades de volver a infectarse en ese período que las que sí lo habían hecho. tanto el virus como 

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miércoles, 10 de noviembre de 2021

827- Predecir el parto prematuro

Deborah Levenson. Predecir el parto prematuro. Clinical Laboratory News. 2021: July College Park, Maryland. USA

Los laboratorios clínicos deben colaborar estrechamente con los obstetras para garantizar la utilización óptima de los análisis actuales

El parto prematuro es la segunda causa más común de muerte infantil en los Estados Unidos y una de las principales causas de problemas sociales y de salud, a veces de por vida. Como resultado, los médicos y los laboratorios tienen un gran interés en detectar mujeres en riesgo. Una nueva guía de la AACC no recomienda medir de manera rutinaria la interleucina 6 (IL-6), la alfa microglobulina 1 placentaria (PAMG-1) o la fibronectina fetal (fFN) en mujeres embarazadas con síntomas compatibles con el parto prematuro. Según la Guia estos biomarcadores tienen valores predictivos positivos (VPP) bajos y proporcionan una utilidad limitada en los algoritmos de diagnóstico más comúnmente utilizados en los EE. UU.

A pesar de la postura negativa de la guía sobre el uso rutinario de los marcadores, sus autores dicen que los laboratorios no deberían emitir opiniones unilaterales sobre estas pruebas. "Las decisiones deben tomarse con los obstetras en un esfuerzo de colaboración", dijo el autor principal Robert D. Nerenz, PhD, DABCC, director asistente, de química clínica y profesor asistente de patología y medicina de laboratorio en la Escuela de Medicina Geisel y Dartmouth-Hitchcock Medical Center en Lebanon, New Hampshire.

El parto prematuro es un problema Nacional

Los mecanismos precisos involucrados en el parto prematuro no se conocen completamente, pero según la Guia las etiologías propuestas que conducen al parto prematuro incluyen estrés fetal, inflamación, hemorragia decidual y distensión uterina patológica. Cada una de las pruebas mide una sola proteína asociada con una etiología específica para predecir el parto prematuro: la IL-6 para infección e inflamación, la fFN para degradación de la matriz extracelular y el PAMG-1 para presencia de líquido amniótico.

Predecir el parto prematuro implica  considerara bajo peso al nacer, dificultad respiratoria, órganos subdesarrollados, discapacidades del desarrollo neurológico, deterioro cognitivo, deficiencias visuales y auditivas, trastornos de coordinación del desarrollo y dificultades emocionales y de comportamiento. El parto prematuro, representaron el 10% de todos los nacimientos en EE. UU. y en 2018 y afectaron de manera desproporcionada a las minorías raciales y étnicas, especialmente a los afroamericanos.

Algunos tratamientos pueden mejorar los resultados para los bebés de pacientes que presentan signos y síntomas de trabajo de parto prematuro. “Sin embargo, el 90% de estos pacientes no darán a luz prematuramente. Es útil tener herramientas para ver quién está realmente en riesgo ”, dijo Phillip R. Bennett, MD, PhD, investigador de biomarcadores de PTB y profesor de obstetricia y ginecología en los hospitales Queen Charlotte y Hammersmith en Londres. Sin embargo, agregó que algunas terapias pueden ser perjudiciales cuando los síntomas no están relacionados con el parto prematuro.

Recomendaciones sobre marcadores de nacimiento prematuro

Las pautas dicen que es poco probable que los biomarcadores proporcionen mucho valor clínico en poblaciones con una probabilidad previa a la prueba de menos del 5%. "En una población con una probabilidad de prueba previa baja, estos marcadores no tienen mucha utilidad clínica", dijo Nerenz. “Si bien los tres marcadores tienen valores predictivos negativos altos, un resultado negativo no cambia sustancialmente la incertidumbre del diagnóstico, ya que la mayoría de las mujeres de la población evaluada no darán a luz prematuramente. Para distinguir la pequeña proporción de mujeres que darán a luz prematuramente de un grupo más grande con signos y síntomas similares que no lo harán, se necesita una prueba con un VPP alto ".

Limitar las pruebas de biomarcadores a solo las mujeres de alto riesgo identificadas sobre la base de la longitud del cuello uterino u otras características aumentará la probabilidad de la prueba previa en la población analizada y mejorará el VPP, agregó Nerenz.......

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sábado, 6 de noviembre de 2021

826- Proyecto PAIS- SARS-CoV-2

Proyecto Argentino Interinstitucional de genómica de SARS-CoV-2. Desarrollado por el Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2. 

Financiado, a tráves del subsidio FONARSEC IP COVID-19 N° 247, por la Agencia Nacional de la Promoción de la Investigación, el Desarrollo Tecnológico y la Innovación del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación, Argentina.

Objetivo del proyecto

Como objetivo general proponemos analizar la trayectoria evolutiva de las cepas del SARS-CoV-2 que circulan en Argentina para estudiar su origen y dispersión en el país, en el contexto de las cepas mundiales, como así también analizar las mutaciones que pudieran afectar el diagnóstico, la transmisión y la virulencia del virus.

Para ello realizaremos un muestreo en todo el país de aproximadamente 1000 genomas de SARS-CoV-2. Las muestras obtenidas serán secuenciadas por NGS para obtener sus secuencias genómicas, y así caracterizarlas y analizarlas desde varios enfoques.

Etapas del proyecto

1- Realizar la secuenciación del genoma completo de cepas de SARS-CoV2 que circulan en nuestro país a partir de muestras clínicas provenientes de centros de diagnóstico localizados en distintos puntos del país. Estas secuencias serán analizadas, primeramente a nivel local por el consorcio (etapas 2-5). También serán enviadas, mediante su reporte a la base de datos GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data), donde serán analizadas en tiempo real y formarán parte de un estudio a nivel global a cargo del grupo de Evolución viral de la Universidad de Edimburgo (Andrew Rambaut), y el proyecto Nextstrain (Real-time tracking of pathogen evolution).

2- Monitorear los cambios nucleotídicos y aminoacídicos de las cepas secuenciadas, especialmente en las regiones genéticas de importancia en:

- el diagnóstico: análisis de sustituciones nucleotídicas que podrían impactar en la sensibilidad de los métodos de detección de ácidos nucleicos (RT-PCRs u otros en desarrollo) y monitoreo de sustituciones aminoacídicas con posible impacto en métodos de detección de antígenos virales (proteínas S, N u otra) o anticuerpos.

- la respuesta al tratamiento: análisis de sustituciones aminoacídicas en genes que codifican para la polimerasa viral (RdRp), proteasas, exoribonucleasa (o cualquier otro gen blanco de acción de las drogas que se vayan a utilizar).

- la adaptación al hospedador: análisis de sustituciones aminoacídicas en el dominio de unión al receptor (RBD) de la proteína S o en otras regiones genéticas de relevancia.

3- Identificar los linajes virales presentes en nuestro país que han ingresado a través de los pacientes con antecedente de viaje a zonas afectadas. También se buscarán otros puntos de ingreso de zonas no reportadas como riesgosas en el alerta inicial sistema de salud pero que lograron establecer clusters locales de transmisión (transmisión críptica). Mediante análisis filogeográficos discretos podrá estimarse el origen geográfico y temporal más probable de estos linajes y se los podrá relacionar a nivel global con los linajes que circulen en otros países.

4- En cuanto a la circulación viral autóctona sostenida proponemos evaluar los factores poblacionales y virales que pudieron asociarse con establecimiento de los clusters locales de transmisión, mediante análisis multivariados de asociación que integren información genética y datos epidemiológicos. Entre estos factores pudieran encontrarse mutaciones marcadoras de los virus establecidos en nuestro país.

5- Analizar la diseminación viral a través de análisis filogeográficos continuos, analizados por regiones geográficas, a fin de trazar mapas de dispersión viral en el tiempo.

6- Realizar estudios de correlación genómico-clínico en pacientes pediátricos y adultos con Covid-19 considerando grados de severidad, presentación clínica, entre otras cosas.......

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viernes, 5 de noviembre de 2021

825- Pancreatitis aguda

Guillermo García-Rayado, Karina Cárdenas-Jaén, Enrique de-Madaria. Hacia una atención personalizada basada en la evidencia de la pancreatitis aguda. United European Gastroenterol J. 2020; 8(4):403-409. Service of Digestive Diseases, University Clinic Hospital Lozano Blesa, Aragón Health Research Institute, Zaragoza, Spain

Resumen

La pancreatitis aguda es una enfermedad heterogénea. La mayoría de los pacientes experimentan un curso leve de la enfermedad, pero un tercio desarrollará complicaciones locales y/o insuficiencia orgánica asociada con una mayor morbilidad y riesgo de mortalidad. El diagnóstico de pancreatitis aguda se basa en el dolor epigástrico típico, la elevación de los niveles séricos de lipasa o amilasa y/o hallazgos característicos en las imágenes. Es necesario un tratamiento personalizado en pacientes con pancreatitis aguda. Actualmente, la analgesia, la reanimación con líquidos dirigida por objetivos basada en la solución de lactato de Ringer y la realimentación oral temprana que brindan nutrición enteral si no se tolera son las piedras angulares para el manejo temprano. Los antibióticos profilácticos o la colangiopancreatografía retrógrada endoscópica en ausencia de colangitis se consideran inútiles. Los ensayos clínicos futuros deben abordar la reanimación con líquidos óptima, la administración temprana de antiinflamatorios y el papel exacto del soporte nutricional en la pancreatitis aguda grave. A continuación, presentamos un caso de paciente y revisamos el diagnóstico, tratamiento y pronóstico de la pancreatitis aguda.

Breve caso clínico:  Un paciente masculino de 45 años acudió a urgencias con dolor epigástrico de inicio agudo y vómitos. El paciente era un fumador activo y consumía hasta una unidad de alcohol por día. El paciente no refirió enfermedades crónicas ni intervenciones quirúrgicas previas........

Cómo diagnosticar la pancreatitis aguda: De acuerdo con la clasificación revisada de Atlanta (RAC), para el diagnóstico de pancreatitis aguda (PA), el paciente debe cumplir al menos dos de los siguientes  tres criterios: i) dolor abdominal típico (inicio agudo de dolor epigástrico que a menudo se irradia a la espalda), ii) lipasa o amilasa sérica al menos tres veces el límite superior de la normalidad (LSN) y iii) los hallazgos característicos de la PA en las imágenes.

Síntomas: El síntoma cardinal de la PA es el dolor abdominal epigástrico agudo de aparición repentina, que a menudo se irradia a la espalda. Las náuseas y los vómitos son muy frecuentes.

Análisis de sangre y orina.

La amilasa y/o la lipasa séricas se han utilizado para diagnosticar la PA durante más de siete décadas. Las dos fuentes principales de amilasa sérica son el páncreas y las glándulas salivales; las isoformas específicas de la amilasa pancreática se pueden medir en la sangre y algunos laboratorios solo determinan esas isoformas para descartar la influencia de la amilasa salival. Su actividad sérica comienza a aumentar dentro de las seis horas posteriores al inicio de la PA, alcanza su punto máximo a las 48 horas y se normaliza en cinco a siete días. La lipasa proviene casi exclusivamente del páncreas, por lo que se considera más específica para la PA.  Se eleva después de cuatro a ocho horas, alcanza su punto máximo a las 24 horas y permanece en niveles altos por más tiempo que la amilasa (8 a 14 días).

En cuanto a los marcadores de orina, podemos medir la amilasa urinaria o realizar la prueba rápida con tira reactiva de tripsinógeno-2. Ambos tienen una buena sensibilidad y especificidad. Sin embargo, la prueba con tira reactiva de trisinógeno-2 tiene una disponibilidad limitada. Marcadores de la orina puede ser más útil cuando hay alta sospecha diagnóstica de AP y amilasa sangre o los niveles normales de lipasa, por ejemplo, en los casos de hipertrigliceridemia. Curiosamente, no hay evidencia de una prueba analítica que sea más precisa que otras pruebas. Las mediciones repetidas de los niveles de enzimas pancreáticas en sangre u orina no son útiles para predecir la gravedad o monitorear el curso de la enfermedad.

Otras causas de inflamación y dolor abdominal agudo están asociadas con un aumento de la amilacemia o lipasemia, que incluyen colecistitis aguda, colangitis, perforación, isquemia mesentérica aguda o problemas ginecológicos. La diarrea inflamatoria y la cetoacidosis diabética son otras causas de aumentos agudos de las enzimas pancreáticas en la sangre y la orina. Estos diagnósticos alternativos suelen estar asociados con signos o síntomas atípicos......... 

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina


lunes, 1 de noviembre de 2021

824- Enfermedad celiaca

Ewa B. Posner, Muhammad Haseeb. Celiac Disease. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2021. August 11, 2021. Jan-University Hospital of North Durham,UK. University of Pittsburgh. USA

La enfermedad celíaca, también conocida como enteropatía sensible al gluten, es una enfermedad autoinmune del intestino delgado. La enfermedad celíaca es una condición en la que el cuerpo responde al gluten con una respuesta inmune inapropiada que causa inflamación y daño al intestino delgado. Esta presentación ilustra la evaluación y el manejo de la enfermedad celíaca y revisa el papel del equipo interprofesional en la mejora de la atención de los pacientes con esta afección.............................

Introducción

La enfermedad celíaca es una enteropatía del intestino delgado. Se desencadena por la exposición al gluten en la dieta de personas susceptibles. La susceptibilidad está determinada genéticamente. La afección es crónica y, en la actualidad, el único tratamiento consiste en la exclusión permanente del gluten de la ingesta alimentaria. Los pacientes con enfermedad celíaca pueden presentar diarrea y retraso del crecimiento; algunos pueden ser asintomáticos.

Etiología: Los síntomas de la enfermedad celíaca se deben al daño de los enterocitos en el intestino delgado. En el cuadro clínico completo, las características típicas del intestino delgado son la inflamación crónica y la atrofia de las vellosidades.

Un individuo debe tener genes HLA dominantes DQ2 o DQ8. La enfermedad es el resultado de la reacción adversa del sistema inmunológico al gluten, y una de las proteínas importantes involucradas es un anticuerpo contra la transglutaminasa tisular. Sin embargo, se proponen otras vías que contribuyen a la enfermedad. La glicoproteína gliadina (presente en el gluten) tiene un efecto tóxico directo sobre los enterocitos mediante la regulación positiva de la producción de IL-15.

Algunos estudios indican que las infecciones gastrointestinales en la primera infancia son relevantes para el desarrollo posterior de la enfermedad celíaca. Esto no es sorprendente considerando el órgano afectado, pero es probable que también sea directamente destacado el hecho de que la enfermedad celíaca es causada por un trastorno de la función inmunológica.

Los anticuerpos IgA contra el endomisio del músculo liso y la transglutaminasa tisular se utilizan a menudo para diagnosticar la enfermedad celíaca. Sin embargo, solo alrededor del 5% de los pacientes con enfermedad celíaca tienen una deficiencia de esta inmunoglobulina.

Epidemiología: La prevalencia de la enfermedad celíaca en la población general es de aproximadamente 0,5% a 1%. Tanto la prevalencia real como la detección y el diagnóstico han aumentado en los últimos 10 a 20 años. La incidencia es mayor entre las personas con trastornos autoinmunes como la diabetes tipo 1. En familiares de primer grado de personas afectadas por la enfermedad celíaca, el riesgo es de 1 de cada 10.

Fisiopatología:  Un péptido derivado del gluten llamado gliadina causa daño al intestino delgado. Hay inflamación local y el proceso conduce a la destrucción de las vellosidades del intestino delgado. Esta destrucción, a su vez, conduce a la disminución de la funcionalidad de la superficie intestinal y a mal absorción. La falta de absorción de nutrientes impacta directamente en el sistema digestivo pero también indirectamente en todos los sistemas del cuerpo. Este impacto resulta en una mala salud en general y es la razón por la cual la enfermedad celíaca puede tener signos y síntomas que surgen de casi cualquier sistema del cuerpo, no solo del sistema gastrointestinal.

Histopatología: La enfermedad celíaca solo afecta la mucosa del intestino delgado. Las vellosidades pueden estar ausentes o atróficas y esta presente la hiperplasia de las criptas. Se observa una mayor proliferación de linfocitos y células plasmáticas en la lámina propia.

Toxicocinética: Durante mucho tiempo hubo dudas sobre la toxicidad de la avena para un paciente con enfermedad celíaca. Recientemente, los estudios han demostrado que la avena no es dañina, y es probable que esas dudas se deban porque comúnmente se procesa junto con el trigo y, por lo tanto, la contaminación cruzada era muy alta.

Evaluación Diagnostica

La evaluación diagnóstica suele comenzar con pruebas serológicas. Los dos anticuerpos medidos son anticuerpos anti-transglutaminasa tisular (por ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas-ELISA- medido numéricamente) y anticuerpos anti-endomisiales que generalmente se informan como negativos, débilmente positivos o positivos. Tradicionalmente, el siguiente paso y el estándar de oro para el diagnóstico es la biopsia de la mucosa duodenal porque en la enfermedad celíaca, esto muestra atrofia vellositaria. Es importante que estas pruebas se realicen mientras el paciente sigue una dieta regular que contenga gluten.

Otra prueba útil es la del antígeno leucocitario humano (HLA). Los genotipos específicos de HLA se han asociado fuertemente con la enfermedad celíaca. Las pruebas de HLA se pueden utilizar en el proceso de diagnóstico. Por ejemplo, las pautas conjuntas BSPGHAN y Celiac UK publicadas en 2013 indican que las pruebas serológicas positivas con tipificación de HLA positiva en presencia de síntomas típicos pueden aceptarse como confirmación del diagnóstico sin necesidad de una biopsia.

Tanto los diabéticos tipo 1 como el síndrome de Down tienen una alta incidencia de enfermedad celíaca; por lo que se requiere un trabajo apropiado. Los electrolitos pueden revelar hipocalcemia, hipopotasemia, acidosis metabólica. También pueden estar presentes la anemia por deficiencia de folato, hierro o vitamina B12; el tiempo de protrombina puede prolongarse y las heces son grasosas y tienen un olor rancio......

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico-UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina