Chaowen Deng, Miaoling Qiu, Qingyan Yang, Lina Li , Baoling Liu , Jieling Liu , Ricky Wing-Tong Lau, Fanfan Xing Editor: Emmanuel Siddig. Detección rápida de criptococosis respiratoria mediante secuenciación dirigida de próxima. PLoS Negl Trop Dis. 2025; 19(11): e0013744. Department of Infectious Diseases and Microbiology, The University of Hong Kong–Shenzhen Hospital, Guangdong, China
Resumen
Cryptococcus neoformans, un patógeno fúngico desatendido y de prioridad crítica de la OMS, causa criptococosis principalmente por inhalación. Las manifestaciones clínicas varían desde infección asintomática hasta meningitis mortal; los diagnósticos subóptimos causan detección tardía y alta mortalidad por meningitis. Este estudio retrospectivo evaluó la utilidad clínica de la secuenciación dirigida de próxima generación (tNGS) para diagnosticar criptococosis pulmonar utilizando muestras respiratorias, en comparación con las pruebas de antígeno criptocócico sérico (CrAg) y cultivo fúngico. Durante 38 meses, se inscribieron 39 pacientes con criptococosis confirmada. La tNGS detectó Cryptococcus neoformans en el 92,3% (36/39) de las muestras respiratorias, superando significativamente al cultivo fúngico (23,1%, 9/39; P < 0,05). La prueba de CrAg sérico fue positiva en el 64,7% (22/34) de los pacientes evaluados. La tNGS identificó C. neoformans en 12 casos negativos para CrAg y en el 75 % (9/12) de los casos con cultivo negativo, lo que mejoró el rendimiento diagnóstico. El tiempo de respuesta medio para la tNGS (23 [RIC: 21-43] horas) fue sustancialmente más corto que para el cultivo fúngico (112 [RIC: 77,5-120,5] horas; prueba U de Mann-Whitney, P < 0,05). Los recuentos de lecturas de tNGS más altos se correlacionaron con la positividad del cultivo ( P < 0,05) pero no con el estado de CrAg. Se detectaron infecciones polimicrobianas en el 76,9 % (30/39) de las pruebas de tNGS, lo que subraya su utilidad en la identificación integral de patógenos. La tNGS de muestras respiratorias demuestra una sensibilidad superior y un tiempo de respuesta notablemente más corto que el cultivo fúngico para el diagnóstico de criptococosis. Fundamentalmente, su capacidad para detectar C. neoformans en pacientes negativos al CrAg sérico permite un diagnóstico más temprano en casos que no se detectan con la serología estándar.
Resumen del autor
En este estudio, evaluamos la tNGS para diagnosticar la criptococosis pulmonar en comparación con los métodos convencionales. Analizando 39 pacientes, la tNGS detectó C. neoformans en el 92,3% de las muestras respiratorias, superando ampliamente al cultivo fúngico. La tNGS también identificó el patógeno en algunos casos negativos para CrAg en suero y casos negativos para el cultivo, cerrando brechas diagnósticas críticas. Los resultados de la tNGS estuvieron disponibles mucho más rápido que el cultivo fúngico. Si bien las lecturas de la secuencia de tNGS se alinearon con la positividad del cultivo, no se correlacionaron con los resultados de CrAg, lo que sugiere que la tNGS refleja de forma independiente la carga fúngica respiratoria. Recomendamos integrar la tNGS en los flujos de trabajo de diagnóstico para la sospecha de criptococosis, especialmente cuando los resultados de CrAg o del cultivo son negativos o se retrasan. Este enfoque promete una detección más temprana, un tratamiento oportuno y mejores resultados.
Introducción
Cryptococcus neoformans , clasificado como un patógeno fúngico de prioridad crítica en la Lista de Patógenos Fúngicos Prioritarios de la OMS, existe en el medio ambiente como una levadura basidiomicetosa y encapsulada que se reproduce asexualmente por gemación. El tracto respiratorio sirve como la principal puerta de entrada, y la infección ocurre cuando los individuos inhalan basidiosporas aerosolizadas en los pulmones, lo que lleva a la criptococosis.
La presentación clínica de la criptococosis es diversa, desde una infección asintomática hasta una enfermedad diseminada grave, siendo el sistema nervioso central y los pulmones los principales sitios de infección. En particular, las infecciones criptocócicas en individuos inmunocompetentes a menudo permanecen asintomáticas, lo que resulta en un diagnóstico tardío hasta etapas avanzadas. El diagnóstico clínico actual de la criptococosis se basa en métodos de laboratorio que incluyen tinción con tinta china y PCR criptocócica de líquido cefalorraquídeo (LCR), cultivo fúngico de muestras clínicas y detección de antígeno criptocócico (CrAg) en suero o LCR. Sin embargo, cada uno tiene limitaciones notables. Por ejemplo, los cultivos fúngicos de fluidos corporales estériles muestran baja sensibilidad y las pruebas de CrAg se omiten con frecuencia durante las evaluaciones diagnósticas tempranas. En consecuencia, los retrasos en el diagnóstico a menudo conducen a meningitis y mayor mortalidad.
En los últimos años, la secuenciación de nueva generación (NGS) ha surgido como una tecnología poderosa para identificar rápidamente una amplia gama de patógenos directamente de muestras clínicas, mejorando significativamente la precisión diagnóstica para varias enfermedades infecciosas. Nuestros estudios previos han demostrado su utilidad para confirmar infecciones fúngicas, incluidas las causadas por Talaromyces marneffei y Pneumocystis jirovecii , así como infecciones que involucran patógenos fastidiosos o de crecimiento lento como Nocardia spp., Mycoplasma pneumoniae y Coxiella burnetii Además, la NGS ha facilitado cada vez más el diagnóstico de criptococosis, permitiendo la detección temprana de casos que de otro modo podrían pasarse por alto. Si bien la NGS ha sido reconocida como una valiosa herramienta de diagnóstico para infecciones, su validez clínica e impacto en el manejo del paciente con criptococosis cuando se utilizan muestras respiratorias sigue siendo incierto................
(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su traducción al idioma español Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma.
Nueva presentación el 18 de Enero
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Cordiales saludos.
Ciudada de Buenos Aires. R. Argentina
