lunes, 5 de febrero de 2024

1038- Convertir el tipo de sangre A en tipo universal O mediante tecnología CRISPR/Cas9 .

Paolo Petazzi, Laia Miquel Serra, Sergio Huertas,  Cecilia González, Neus Boto, Eduardo Muñiz Diaz, Pablo Menéndez, Ana Sevilla,Núria Nogués .Edición del gen ABO para la conversión del tipo sanguíneo A al tipo universal O en células madre pluripotentes inducidas por humanos derivadas de donante Rh nulo. Clin Transl Med. 2022; 2(10): e1063. Josep Carreras Leukemia Research Institute and Immunohematology Laboratory, Barcelona Spain 

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Interesante artículo de investigación sobre la edición del gen ABO para la conversión del tipo sanguíneo A al tipo O universal en células madre pluripotentes inducidas por humanos, derivadas de donantes Rh nulo. Este innovador estudio, presenta un enfoque prometedor para abordar potencialmente los problemas de compatibilidad de tipos sanguíneos en la medicina transfusional.

¿Cuáles son las posibles implicaciones de esta técnica de edición de genes para el campo de la medicina transfusional?

La técnica de edición de genes descrita en el artículo de investigación tiene implicaciones importantes para el campo de la medicina transfusional. Al demostrar la viabilidad de convertir el tipo de sangre A al tipo universal O utilizando la tecnología CRISPR/Cas9, el estudio abre varias implicaciones potenciales:  1). Abordar la compatibilidad del tipo de sangre 2). Mejor suministro de sangre 3). Aplicaciones de diagnóstico 4). Potencial terapéutico futuro. 

En general, la técnica de edición de genes descrita en el estudio tiene el potencial de revolucionar la medicina transfusional al abordar los desafíos de compatibilidad del tipo de sangre, mejorar la disponibilidad de sangre compatible y abrir nuevas posibilidades para aplicaciones diagnósticas y terapéuticas en el campo.

¿Cómo contribuye el uso de la tecnología CRISPR/Cas9 al éxito de este enfoque de edición de genes?

1- El uso de la tecnología CRISPR/Cas9 es un factor clave en el éxito del enfoque de edición de genes descrito en el artículo de investigación. CRISPR/Cas9 es una poderosa herramienta de edición de genes que permite modificaciones precisas, eficientes y específicas de secuencias de ADN. En el contexto de este estudio, se utilizó CRISPR/Cas9 para editar el gen ABO en células madre pluripotentes inducidas por humanos (hiPSC) derivadas de un donante Rh nulo, con el objetivo de convertir el tipo de sangre A en tipo universal O.

2- Los investigadores diseñaron dos estrategias diferentes de edición de genes utilizando la tecnología CRISPR/Cas9: knock-in (KI) y knock-out (KO). La estrategia KI implicó introducir una deleción de un solo nucleótido (c.261delG) en el gen ABO, imitando el alelo ABO*O.01 (O1) inactivo más común. La estrategia KO implicó apuntar al tercer exón del gen ABO, generando un cambio de marco y truncando la proteína. Ambas estrategias fueron diseñadas para anular la expresión de la α-1,3-N-acetilgalactosamina transferasa (A-transferasa), que es responsable de la expresión del antígeno A en los glóbulos rojos.

3- El uso de la tecnología CRISPR/Cas9 permitió una edición precisa y eficiente del gen ABO en hiPSC, lo que resultó en la conversión exitosa del tipo de sangre A al tipo universal O. Los investigadores pudieron aislar y seleccionar clones con las ediciones genéticas deseadas utilizando Sanger-secuenciación y confirmó la ausencia de objetivos no deseados mediante análisis in silico y el ensayo de endonucleasa T7.

¿Cuáles son los próximos pasos para una mayor investigación y desarrollo en esta área?

La demostración exitosa de la edición del gen ABO utilizando la tecnología CRISPR/Cas9 en este estudio abre varias vías para una mayor investigación y desarrollo en el campo de la medicina transfusional. Algunos posibles próximos pasos incluyen:  1. Optimización de la eficiencia de la edición de genes 2. Producción in vitro de glóbulos rojos 3. Estudios de seguridad y eficacia 4. Expansión a otros antígenos de grupos sanguíneos

En general, la demostración exitosa de la edición del gen ABO utilizando la tecnología CRISPR/Cas9 en este estudio abre varias posibilidades interesantes para una mayor investigación y desarrollo en el campo de la medicina transfusional.

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español. Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. 
Nueva presentación el 10 de Febrero. 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina

martes, 30 de enero de 2024

1037- Hepcidin: fisiopatologia y optimización de la prueba

Elizabeta Nemeth and Tomas Ganz. Hepcidin y hierro en la salud y la enfermedad. Annu Rev Med. 2023; 74: 261–277. Center for Iron Disorders, Department of Medicine, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, California, USA

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Este documento proporciona una descripción general  del papel de la hepcidina en la regulación de los niveles de hierro en el cuerpo y cómo los desequilibrios pueden provocar diversos trastornos del hierro.

Algunas preguntas :

¿Cuáles son algunos síntomas comunes de la sobrecarga de hierro y cómo se diagnostica?

La sobrecarga de hierro puede provocar una afección conocida como hemocromatosis, que puede causar una variedad de síntomas. Los síntomas comunes de la sobrecarga de hierro pueden incluir fatiga, dolor en las articulaciones, dolor abdominal, pérdida de la libido y coloración de la piel bronceada o gris.

El diagnóstico de sobrecarga de hierro suele involucrar una combinación de análisis de sangre y estudios de imagen. Los análisis de sangre pueden incluir mediciones de ferritina sérica, saturación de transferrina y niveles de hierro sérico. En algunos casos, también se pueden realizar pruebas genéticas para detectar mutaciones asociadas con la hemocromatosis. Tambien se pueden utilizar estudios de imágenes como resonancia magnética o tomografía computarizada para evaluar el grado de acumulación de hierro en órganos como el hígado, el corazón y el páncreas. Es importante consultar con un  medico especialista para un diagnóstico preciso y un manejo adecuado de la sobrecarga de hierro.

¿Se pueden utilizar los niveles de hepcidina para predecir el riesgo de desarrollar anemia por inflamación?

Sí; los niveles de hepcidina se pueden utilizar para predecir el riesgo de desarrollar anemia por inflamación. La anemia de inflamación, también conocida como anemia de enfermedad crónica, es un tipo común de anemia que ocurre en el contexto de afecciones inflamatorias crónicas como infecciones, enfermedades autoinmunes y cáncer. La hepcidina es un regulador clave del metabolismo del hierro y se sabe que está elevada en el contexto de la inflamación. Los niveles elevados de hepcidina en el contexto de inflamación contribuyen al desarrollo de anemia al reducir la absorción de hierro de la dieta y secuestrarlo dentro de las células, limitando así su disponibilidad para la producción de glóbulos rojos. Por lo tanto, las mediciones de hepcidina sérica (ver la siguiente publicación-(2) pueden ser útiles en el diagnóstico diferencial de la anemia por inflamación versus otros tipos de anemia y en la predicción del riesgo de desarrollar anemia en el contexto de afecciones inflamatorias crónicas.

¿Existen tratamientos actuales disponibles que se dirijan a los niveles de hepcidina en pacientes con trastornos del hierro?

Sí, actualmente existen tratamientos disponibles que apuntan a los niveles de hepcidina en pacientes con trastornos del hierro. Por ejemplo, se están desarrollando agonistas de hepcidina como tratamiento potencial para los trastornos por sobrecarga de hierro, como la hemocromatosis hereditaria y la betatalasemia. Los agonistas de hepcidina actúan aumentando la producción endógena de hepcidina o administrando hepcidina exógena o agonistas de hepcidina, lo que se esperaría que revirtiera la sobrecarga de hierro observada en estos trastornos.

Por otro lado, se están desarrollando antagonistas de la hepcidina como posible tratamiento para la anemia por inflamación. Los antagonistas de la hepcidina actúan bloqueando la actividad de la hepcidina, lo que se esperaría que aumentara la disponibilidad de hierro para la producción de glóbulos rojos y mejorara la anemia.

Es importante señalar que estos tratamientos aún se encuentran en etapa experimental y aún no han sido aprobados para uso clínico. Además, el uso de estos tratamientos dependerá del tipo específico y la gravedad del trastorno del hierro y debe ser determinado por un medico especialista.

​1) Leer el articulo completo

2) Optimizar la prueba de hepcidin

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
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jueves, 25 de enero de 2024

1036- Calculo de intervalos de referencia hematológicos en el embarazo

Vilte E Barakauskas, Mary Kathryn Bohn, Emma Branch, Amelie Boutin, y col.  Derivar intervalos de referencia de parámetros hematológicos en el embarazo, utilizando conjuntos de datos clínicos. Oxfor Academ-Clin Chem 2023; 69 (12) :1374–1384. Department of Pathology and Laboratory Medicine,  BC Children’s and Women’s Hospital, Vancouver, Canada.

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Articulo sobre cómo derivar intervalos de referencia del embarazo para parámetros hematológicos utilizando conjuntos de datos clínicos- Este estudio proporciona información valiosa para que los profesionales de la salud interpreten con precisión los resultados de laboratorio de personas embarazadas.

Algunos preguntas

¿Cuáles fueron los principales hallazgos del estudio?

Los principales hallazgos del estudio fueron que los eritrocitos, leucocitos y plaquetas cambian durante el embarazo y que existe la necesidad de interpretar una prueba de embarazo específica. El estudio también demostró que la combinación de información de bases de datos clínicas integrales con datos de sistemas de información de laboratorio proporciona un medio sólido y confiable para derivar intervalos de referencia del embarazo. Además, el estudio ilustró las limitaciones del uso de bloques de datos trimestrales convencionales durante el embarazo, lo que respalda el uso de la edad gestacional o bloques derivados empíricamente para definir los valores normales del hemograma completo durante el embarazo.

¿Cómo se calcularon los intervalos de referencia del embarazo?

Los intervalos de referencia del embarazo se calcularon mediante un enfoque de extracción de datos retrospectivo. El estudio definió una cohorte de embarazos sanos de 5 años del British Columbia Perinatal Data Registry y la vinculó con datos de dos laboratorios. Después de aplicar criterios de exclusión clínica y realizar la detección y eliminación de valores atípicos estadísticos, se calcularon los intervalos de referencia (RI) utilizando el método de clasificación directo no paramétrico. 

Se evaluaron varias estrategias de partición, incluido el cálculo de los RI para cada trimestre por separado y la estimación de los RI para cada semana de gestación. Se utilizó una regresión lineal por partes para investigar los cambios en los resultados de laboratorio con la edad gestacional. Los RI derivados se compararon con los calculados utilizando métodos indirectos de establecimiento de RI. El estudio también evaluó el impacto de las características maternas y del embarazo, como la edad, el índice de masa corporal y el origen étnico, en los valores de laboratorio.

¿Qué impacto tuvieron las características maternas y del embarazo en los valores de laboratorio?

El estudio evaluó el impacto de diversas características maternas y del embarazo, como la edad materna, el indice de masa corporal (IMC) previo al embarazo, el tabaquismo, el estreptococo materno del grupo B, el origen étnico y el uso de fertilización in vitro (FIV), en los valores de laboratorio. El impacto de estas características se evaluó mediante regresión lineal de efectos mixtos, ajustando el efecto de la edad gestacional y los resultados múltiples del hemograma dentro de un embarazo. 

El estudio encontró asociaciones significativas entre varias covariables y parámetros de glóbulos rojos, aunque estas asociaciones eran muy pequeñas y es poco probable que fueran clínicamente significativas. También se evaluó el impacto del laboratorio en los resultados del hemograma y el estudio destacó la necesidad de realizar más investigaciones sobre la influencia de covariables como la edad materna, el origen étnico y el IMC en los índices hematológicos durante el embarazo. ,

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sábado, 20 de enero de 2024

1035- Resultados de hematologia poco confiables

Gene Gulati, Guldeep Uppal, Jerald Gong. Resultados del hemograma completo automatizado poco confiables: causas, reconocimiento y resolución. Ann Lab Med 2022;42:515-530. Division of Hematopathology, Department of Pathology, Anatomy, and Cell Biology, Sidney Kimmel Medical College, Thomas Jefferson University, Philadelphia, PA, USA

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Los analizadores automatizados de hematología generan resultados precisos y confiables de recuentos sanguíneos completos (CBC) en casi todas las muestras. Este artículo de revisión proporciona una descripción general concisa de las causas conocidas de resultados CBC automatizados poco confiables, las formas de reconocerlos y los medios comúnmente utilizados para obtener resultados confiables.

Algunas preguntas:

¿Cuáles son algunas de las causas comunes de resultados de CBC automatizados poco confiables?

Las causas comunes de resultados de CBC automatizados poco confiables incluyen:

1. Características de la muestra que interfieren con la medición de uno o más parámetros CBC.

2. Células anormales y/o fenómenos celulares que imitan a otras células anormales o normales y, por lo tanto, se identifican y cuentan erróneamente.

3. Interferentes que generan resultados de hemograma inexactos, como lipemia, hemólisis, hiperbilirrubinemia y aglutininas de glóbulos rojos.

Aún se desconocen otros factores que pueden afectar negativamente a los resultados del CBC automatizado. Estos factores pueden dar lugar a resultados de hemograma completo inexactos, lo que puede afectar negativamente a la atención del paciente y, por lo tanto, requerir la atención de profesionales de laboratorio.

¿Cómo pueden los profesionales de laboratorio reconocer resultados poco fiables y obtener resultados fiables en dichas muestras?

Los profesionales de laboratorio pueden reconocer resultados no confiables y obtener resultados confiables en dichas muestras a través de los siguientes medios:

1. Reconocimiento de Resultados No Confiables:

    - Utilizar fallas de verificación delta, resultados inesperados y revisión de indicadores, histogramas y diagramas de dispersión generados por el analizador para reconocer resultados de CBC no confiables.

    - Estar familiarizado con las formas de reconocer resultados de CBC automatizados no confiables y comprender las causas potenciales de los resultados no confiables.

    - Reconocer los efectos adversos de diversos agentes causales en los resultados del CBC y utilizar los manuales operativos de los fabricantes para manipular muestras problemáticas.

2. Obtención de resultados confiables:

    - Solicitar una nueva muestra de sangre extraída correctamente cuando pequeños coágulos u otras características de la muestra interfieren con los parámetros del hemograma completo.

    - Estar consciente de las formas de obtener resultados confiables en muestras que no informan resultados o informan resultados inexactos para uno o más parámetros CBC.

    - Utilizar información específica del analizador que se encuentra en los manuales de funcionamiento de los fabricantes para manejar muestras problemáticas.

Al reconocer resultados poco confiables y comprender las causas potenciales, los profesionales de laboratorio pueden tomar las medidas adecuadas para obtener resultados de hemograma completo confiables, garantizando la precisión de la atención al paciente.

¿Puede proporcionar algunos ejemplos de resultados de CBC automatizados no confiables y cómo se resolvieron?

Algunos ejemplos de resultados de CBC automatizados no confiables y cómo se resolvieron:

1. Hemólisis: La hemólisis puede causar valores de MCV, MCH y MCHC falsamente elevados. Para resolver este problema, se debe recolectar y analizar una nueva muestra de sangre.

2. Lipemia: La lipemia puede causar recuentos de glóbulos blancos y glóbulos rojos falsamente elevados, así como valores de hemoglobina y hematocrito falsamente disminuidos. Para resolver este problema, la muestra debe centrifugarse para eliminar la capa lipídica antes del análisis.

3. Aglutinación de glóbulos rojos: la aglutinación de glóbulos rojos puede provocar una disminución falsa del recuento de glóbulos rojos y de los valores de hemoglobina. Para resolver este problema, se debe recolectar y analizar una nueva muestra de sangre, o la muestra debe tratarse con una solución salina de reemplazo para romper los aglutinados antes del análisis.

4. Aglomeración de plaquetas: la aglomeración de plaquetas puede provocar una disminución falsa del recuento de plaquetas. Para resolver este problema, se debe recolectar y analizar una nueva muestra de sangre, o la muestra debe tratarse con EDTA para evitar la acumulación de plaquetas antes del análisis.

5. Células anormales: las células anormales, como blastos o linfocitos atípicos, pueden identificarse y contarse erróneamente mediante analizadores hematológicos automatizados, lo que genera resultados de hemograma completo inexactos. Para resolver este problema, se debe realizar un recuento diferencial manual para identificar y contar con precisión las células anormales.

En resumen, reconocer las posibles causas de resultados de hemograma completo poco confiables y tomar las medidas adecuadas, como recolectar una nueva muestra de sangre o realizar un recuento diferencial manual, puede ayudar a resolver problemas y obtener resultados de hemograma completo confiables.

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jueves, 18 de enero de 2024

1034- ¿Porque la orina es amarilla?

Brantley Hall and Sophia Levy. Editors.¿Qué hace que la orina sea amarilla? Científicos de la UMD descubren la enzima responsable. 2024  January 3 University of Maryland

Sus hallazgos podrían aplicarse a futuros estudios sobre la salud intestinal, incluidas afecciones como la ictericia y la enfermedad inflamatoria intestinal.

Según un nuevo estudio publicado en la revista Nature Microbiology  el 3 de enero de 2024, investigadores de la Universidad de Maryland y los Institutos Nacionales de Salud han identificado la enzima microbiana responsable de darle a la orina su tono amarillo, 

El descubrimiento de esta enzima, llamada "bilirrubina reductasa", allana el camino para futuras investigaciones sobre el papel del microbioma intestinal en dolencias como la ictericia y la enfermedad inflamatoria intestinal.

"Esta enzima revela finalmente el misterio detrás del color amarillo de la orina", dijo el autor principal del estudio,Brantley Hall Departamento de Biología Celular y Genética Molecular de la Universidad de Maryland. "Es sorprendente que un fenómeno biológico cotidiano haya permanecido sin explicación durante tanto tiempo, y nuestro equipo está entusiasmado de poder explicarlo".

Cuando los glóbulos rojos se degradan después de su vida útil de seis meses, se produce como subproducto un pigmento de color naranja brillante llamado bilirrubina. La bilirrubina normalmente se secreta en el intestino, donde está destinada a ser excretada, pero también puede reabsorberse parcialmente. El exceso de reabsorción puede provocar una acumulación de bilirrubina en la sangre y causar ictericia, una afección que provoca el color amarillento de la piel y los ojos. Una vez en el intestino, la flora residente puede convertir la bilirrubina en otras moléculas.

"Los microbios intestinales codifican la enzima bilirrubina reductasa que convierte la bilirrubina en un subproducto incoloro llamado urobilinógeno", explicó Hall, que tiene un puesto conjunto en el Instituto de Estudios Informáticos Avanzados de la Universidad de Maryland. "El urobilinógeno luego se degrada espontáneamente en una molécula llamada urobilina, que es responsable del color amarillo que todos conocemos". 

La urobilina se ha relacionado durante mucho tiempo con el tono amarillo de la orina, pero el descubrimiento por parte del equipo de investigación de la enzima responsable responde a una pregunta que ha eludido a los científicos durante más de un siglo.

Además de resolver un misterio científico, estos hallazgos podrían tener importantes implicaciones para la salud. El equipo de investigación descubrió que la bilirrubina reductasa está presente en casi todos los adultos sanos, pero a menudo falta en los recién nacidos y en las personas con enfermedad inflamatoria intestinal. Plantean la hipótesis de que la ausencia de bilirrubina reductasa puede contribuir a la ictericia infantil y la formación de cálculos biliares pigmentados.

"Ahora que hemos identificado esta enzima, podemos comenzar a investigar cómo las bacterias en nuestro intestino afectan los niveles de bilirrubina circulante y las condiciones de salud relacionadas, como la ictericia", dijo el coautor del estudio e investigador de los NIH, Xiaofang Jiang. "Este descubrimiento sienta las bases para comprender el eje intestino-hígado".

Además de la ictericia y la enfermedad inflamatoria intestinal, el microbioma intestinal se ha relacionado con diversas enfermedades y afecciones, desde alergias hasta artritis y psoriasis. Este último descubrimiento acerca a los investigadores a lograr una comprensión holística del papel del microbioma intestinal en la salud humana.

"El enfoque multidisciplinario que pudimos implementar, gracias a la colaboración entre nuestros laboratorios, fue clave para resolver el enigma fisiológico de por qué nuestra orina aparece amarilla", dijo Hall. "Es la culminación de muchos años de trabajo de nuestro equipo y destaca otra razón más por la que nuestro microbioma intestinal es tan vital para la salud humana".

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2) Trabajo original

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lunes, 15 de enero de 2024

1033- Interpretación de ensayos aleatorios con control activo

David T. Dunn, Oliver T. Stirrup, Sheena McCormack, David V. Glidden. Interpretación de ensayos aleatorios con control activo: el argumento a favor de una nueva perspectiva analítica que involucre eventos evitados. BMC Med Res Methodol. 2023; 23: 149. Institute for Global Health, University College London, London, UK

Resumen 

Los ensayos de control activo, en los que se compara un tratamiento experimental con un tratamiento establecido, se realizan cuando la inclusión de un grupo de control con placebo se considera poco ética. Para los resultados de tiempo transcurrido hasta el evento, la estimación principal suele ser el índice de tasas, o el índice de riesgo estrechamente relacionado, que compara el grupo experimental con el grupo de control. En este artículo describimos los principales problemas en la interpretación de esta estimación, utilizando ejemplos de ensayos de profilaxis previa a la exposición a la vacuna COVID-19 y al VIH. En particular, cuando el tratamiento de control es muy eficaz, la relación de tasas puede indicar que el tratamiento experimental es claramente inferior desde el punto de vista estadístico, incluso cuando vale la pena desde una perspectiva de salud pública. 

Sostenemos que es de crucial importancia considerar los eventos evitados así como los eventos observados en la interpretación de los ensayos de control activo. Se propone y ejemplifica una métrica alternativa que incorpora esta información, la proporción de eventos evitados. Su interpretación es simple y conceptualmente atractiva: es decir, la proporción de eventos que se evitarían utilizando el tratamiento experimental en lugar del tratamiento de control. 

La proporción de eventos evitados no puede estimarse directamente a partir del ensayo de control activo y requiere una suposición adicional sobre: ​​(a) la incidencia que se habría observado en un grupo hipotético de placebo (la incidencia contrafactual) o (b) la eficacia de el tratamiento de control (en relación con ningún tratamiento) que pertenecía al ensayo de control activo. 

Aunque la estimación de estos parámetros no es sencilla, debe intentarse para poder sacar inferencias racionales. Hasta la fecha, este método se ha aplicado sólo en la investigación de prevención del VIH, pero tiene una aplicabilidad más amplia en ensayos de tratamiento y otras áreas de enfermedades.

Introducción

Los ensayos de control activo, en los que se compara un tratamiento experimental con un tratamiento establecido, se realizan cuando la inclusión de un grupo de control con placebo se considera poco ética. Para los resultados de tiempo transcurrido hasta el evento, la estimación principal suele ser el índice de tasas o el índice de riesgo estrechamente relacionado. Aquí presentamos ejemplos que demuestran que esta estimación puede ser clínicamente engañosa y resaltamos la importancia de considerar los eventos evitados así como los eventos observados. Proponemos una métrica alternativa que incorpora el número de eventos evitados, evitando así las limitaciones del ratio de tasas. Introducimos el problema con un hipotético ensayo de control activo de la vacuna COVID-19.

Ensayo hipotético de la vacuna COVID-19

Se descubrió que la primera vacuna contra la COVID-19 autorizada, BNT162b2 (BioNTech/Pfizer), reducía la incidencia de la COVID-19 en aproximadamente un 95%. Imaginemos que quisiéramos evaluar la eficacia clínica de una nueva vacuna contra la COVID-19 poco después de obtener la licencia de BNT162b2. Dada una eficacia clínica tan alta, llevamos a cabo un gran ensayo de control activo con 10.000 persona-año de seguimiento por brazo, utilizando BNT162b2 como comparador . En este ensayo observamos 20 casos de COVID-19 en el grupo de BNT162b2 y 80 casos en el grupo de vacuna experimental. El índice de tasas es muy alto (4,00; IC del 95 %: 2,42 a 6,90); a primera vista, esto sugiere que la vacuna experimental es notablemente inferior a la BNT162b2, lo que es un fuerte argumento en contra de su aprobación......

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miércoles, 10 de enero de 2024

1032- Aplicaciones del aprendizaje automático en el laboratorio clínico

Naveed Rabbani, Grace Y. E. Kim, Carlos J. Suarez, Jonathan H. Chen. Aplicaciones del aprendizaje automático en el  laboratorio clinico de rutina: estado actual y direcciones futuras. Clin Biochem. 2022 May; 103: 1–7. Department of Clinical Informatics, Lucile Packard Children’s Hospital, Palo Alto, CA, Department of Pediatrics, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA

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Este documento proporciona una descripción general completa del estado actual y las direcciones futuras del aprendizaje automático en el  laboratorio de medicina, incluido su potencial para automatizar tareas, optimizar su utilización y proporcionar rangos de referencia personalizados e interpretación de pruebas. Se esperamos que esta información resulte útil para el futuro de la tecnología médica.

 Algunas preguntas

¿Cómo se ha utilizado el aprendizaje automático (AA), para automatizar las tareas del laboratorio de medicina  (LM) en la actualidad?

El AA se ha utilizado para automatizar las tareas del LM de rutina mediante el desarrollo de algoritmos que pueden validar con precisión los resultados de las pruebas y clasificar las muestras para su revisión manual. Por ejemplo, se han desarrollado algoritmos de AA para validar automáticamente los resultados de las pruebas de química clínica, como los niveles de glucosa y creatinina, y señalar cualquier resultado anormal para su posterior revisión por parte del personal del laboratorio. Además, se ha utilizado el aprendizaje automático para  la interpretación de los resultados de los análisis de orina, como la identificación de la presencia de bacterias o glóbulos rojos en esas muestras. Estas tareas automatizadas pueden ayudar a mejorar la eficiencia y precisión de las pruebas de laboratorio y, en última instancia, conducir a una mejor atención al paciente.

¿Cuáles son algunos ejemplos de cómo el AA ha optimizado la utilización de las pruebas de laboratorio?

El AA ha optimizado la utilización de las pruebas de laboratorio de varias maneras. Un ejemplo es el desarrollo de algoritmos predictivos para mejorar la eficiencia de la monitorización continua de la glucosa en pacientes con diabetes. Estos algoritmos pueden analizar datos históricos de glucosa para predecir niveles futuros de glucosa, lo que permite intervenciones más específicas y oportunas.

El AA se ha utilizado para identificar patrones en las prácticas de pedido de pruebas de laboratorio, lo que lleva a la optimización de la utilización de las pruebas. Al analizar grandes conjuntos de datos de pedidos de pruebas históricos y resultados de pacientes, los algoritmos de AA pueden identificar paneles de pruebas redundantes o innecesarios, lo que lleva a estrategias de pruebas más eficientes y rentables.

Además, el AA tiene el potencial de predecir los resultados de las pruebas de laboratorio, lo que puede ayudar a optimizar la utilización de las pruebas al guiar a los médicos en la selección de las pruebas más relevantes en función de los resultados previstos. Estas aplicaciones del AA en el LM tienen el potencial de mejorar la eficiencia y la rentabilidad de las pruebas de laboratorio, beneficiando en última instancia a la atención al paciente,

¿De qué manera se pueden mejorar los rangos de referencia personalizados y la interpretación de las pruebas mediante la aplicación del AA en el LM?

El AA puede mejorar los rangos de referencia personalizados y la interpretación de pruebas  mediante el análisis de grandes conjuntos de datos de información del paciente para identificar patrones y correlaciones entre los resultados de las pruebas de laboratorio y los resultados clínicos. Al considerar las características individuales de un paciente, como la edad, el sexo y el historial médico, los algoritmos de AA pueden desarrollar rangos de referencia personalizados que sean más precisos y relevantes para el estado de salud específico del paciente.

Además, el AA puede ayudar en la interpretación de los resultados de las pruebas de laboratorio al identificar patrones y correlaciones entre los resultados de las pruebas y los resultados clínicos. Por ejemplo, los algoritmos de aprendizaje automático pueden analizar grandes conjuntos de datos de resultados de pruebas de laboratorio y resultados clínicos para identificar patrones que puedan indicar la presencia de una enfermedad o afección en particular. Esto puede ayudar en el diagnóstico y tratamiento de los pacientes, lo que conducirá a mejores resultados de salud.

En general, la aplicación del AA en el LM tiene el potencial de mejorar la precisión y relevancia de los rangos de referencia personalizados y la interpretación de las pruebas, lo que en última instancia conduce a una mejor atención al paciente.

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viernes, 5 de enero de 2024

1031- Tecnologias emergentes en el laboratorio clínico

Ronda Greaves, Larry Kricka, Damien Gruson, Maurizio Ferrari, Helen Martin, Tze Ping Loh and Sergio Bernardini, en representacion de the IFCC Emerging Technologies Division.  Directivas y recomendaciones: Conjunto de herramientas para tecnologías emergentes en el laboratorio de medicina. De Gruyter-Clin Chem Lab Med 2023; 61(12): 2102–2114. Victorian Clinical Genetics Services, Murdoch Children’s Research Institute, Parkville and Department of Paediatrics, University of Melbourne, VIC, Australia.

Resumen

Una tecnología emergente (TE) para el laboratorio de medicina (LM) se puede definir como un método analítico (incluidos biomarcadores ) o dispositivo ( software, aplicaciones y algoritmos) que, por su etapa de desarrollo, su traducción a una práctica clínica rutinaria amplia o su adopción e implementación geográfica, tiene el potencial de agregar valor al diagnóstico clínico. Teniendo en cuenta la definición específica del LM, este documento examina ocho herramientas (Hs) claves, que abarcan aspectos clínicos, analíticos, operativos y financieros, utilizadas durante todo el ciclo de vida de la TE. Estas Hs proporcionan un enfoque sistemático que comienza: con H1: identificación de la necesidad insatisfecha o la identificación de oportunidades de mejora, H2: la previsión, H3: evaluación de la preparación de la tecnología, H4:  evaluación de la tecnología sanitaria, H5; el mapa de impacto organizacional, H6: gestión de cambios, H7: lista de verificación del camino total hacia la evaluación de métodos y H8: adquisiciones . Si bien existen diferencias en las prioridades clínicas entre diferentes entornos, el uso de este conjunto de herramientas ayudará a respaldar la calidad general y la sustentabilidad de la implementación de TE.

Introducción

Las tecnologías emergentes (TE) y el laboratorio de medicina (LM)  pasaron a ser el centro de atención en 2019 con las pruebas de la enfermedad por coronavirus (COVID-19). Tras el informe inicial de un grupo de enfermedades atípicas similares a la neumonía en diciembre de 2019, la secuencia genómica del entonces desconocido virus se publicó como “Wuhan-Hu-1” (MN908947) en Genbank un mes después gracias a la colaboración internacional. La secuencia genómica permitió el rápido desarrollo y despliegue de pruebas moleculares internas (desarrolladas en laboratorio) para detectar este virus de rápida propagación y contribuyó a la respuesta global a esta pandemia emergente. Un año más tarde estuvieron disponibles varias pruebas comerciales. 

La primera prueba rápida de diagnóstico molecular para autoevaluación del síndrome respiratorio agudo severo-coronavirus-2 (SARS-COV-2) (Lucira COVID-19 All-In-One Test Kit) fue aprobada por la Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. (FDA) bajo el esquema de Autorización de uso de emergencia (EUA) el 11 de noviembre de 2020, y a esto le siguió la primera prueba de antígeno de diagnóstico casera de venta libre aprobada por la FDA para el SARS-COV-2 (Ellume COVID-19 Home Prueba) el 15 de diciembre de 2020. A partir de 2023, ahora existen en total cientos de pruebas de antígenos, moleculares y de anticuerpos para el SARS-COV-2 . Recientemente se ha publicado un ejemplo de evaluación rápida de tecnologías sanitarias (ETS) relacionada con pruebas serológicas para el SARS-COV-2.

 Este rápido ritmo de introducción de TE relacionados con el SARS-COV-2 en el LM no tiene paralelo y demuestra la importancia de la colaboración internacional, el desarrollo y la implementación de pruebas dirigidas por laboratorios e impulsados ​​por las necesidades clínicas, la capacidad de respuesta comercial y los marcos regulatorios ágiles para abordar una novel amenaza global.

Generalmente, el laboratorio clínico encuentra un TE en las últimas etapas de su ciclo de vida. Por lo general, el primer encuentro es en la fase de prueba beta, cuando los usuarios finales evalúan una TE maduro en un entorno de laboratorio clínico para descubrir cualquier problema operativo o técnico de última instancia antes de un lanzamiento general. Un matiz para los TE es que una tecnología que se consideraría como una tecnología desarrollada en un área de aplicación, podría considerarse una TE en el LM. La aplicación de las computadoras en los laboratorios clínicos es un ejemplo de ello. Los ordenadores ya estaban bien establecidos en muchas áreas de aplicación antes de su entrada en el laboratorio clínico en las décadas de 1960 y 1970. Asimismo, el momento de introducción de un TE depende de factores locales...... 

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(*) Una vez que esta en la pagina del articulo, pulsando el botón derecho puede acceder a su  traducción al idioma español.Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. 
Nueva presentación el 10 de Enero 
Cordiales saludos. 
Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina



lunes, 1 de enero de 2024

1030- El Rincón del Lector: Filosofía y Medicina

Editor: Dr A.E. Bagnarelli
Fuente: Chat-Bots.

Introducción

1- Desde sus orígenes, la medicina y la filosofía se han entrelazado. La medicina proporciona datos empíricos que pueden informar sobre la investigación filosófica involucrada, mientras que la filosofía proporciona un marco para comprender la naturaleza de la enfermedad, la salud y la condición humana. Esta relación, que involucra al filósofo y también no solo al médico, sino a todo el personal sanitario, es compleja, multifacética y abarca aspectos éticos, epistemológicos cuestiones existenciales, y bioéticos.

i) La Etica es una de las conexiones más directas entre la medicina y la filosofía. Cuestiones como la autonomía del paciente, el consentimiento informado, la eutanasia y la asignación de recursos están profundamente arraigadas en consideraciones éticas; las investigaciones filosóficas sobre la ética ayudan a establecer los principios morales que guían su práctica.

ii) La Epistemología es una rama de la filosofía que estudia el conocimiento científico, su naturaleza, posibilidad, alcance, fundamentos y métodos utilizados para adquirirlo. También incluye preguntas sobre la práctica basada en la evidencia, la confiabilidad de los ensayos diagnósticos y la naturaleza del conocimiento médico.

iii) Las Cuestiones Existenciales permiten definir que se considera un estado saludable, un trastorno o una enfermedad e implican asociarlos con una reflexión filosófica sobre los conceptos de sufrimiento y muerte que se cruzan con la práctica médica en el cuidado al final de la vida o cerca de ella.

iv) La Bioética es una rama de la filosofía y la medicina que se ocupa de cuestiones éticas derivadas de los avances en biología y medicina. Incluye temas como ingeniería genética, trasplante de órganos y tecnologías emergentes en la atención sanitaria como la inteligencia artificial.

2- Esta disciplina se puede dividir en diferentes periodos según el criterio histórico o cultural que se utilice. Cada periodo también puede dividirse en corrientes específicas según las preferencias de sus autores. La clasificación adoptada en esta presentación se basa en datos proporcionados por los ChatBots

3- Además, dada la extensa historia de esta relación y del gran número de pensadores y sus obras, hacer una lista completa de los mismos es una tarea desafiante; sin embargo, se puede mencionar una breve biografía de sus autores, información que se presentará en otra oportunidad.

4- Finalmente, es importante recordar que la ABA tiene una Comisión de Cultura, y estas páginas que son sin fines de lucro, se brindan como una contribución a la misma.

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(*) Este blog de bioquímica-clínica está destinado a bioquímicos y médicos; la información que contiene es de actualización y queda a criterio y responsabilidad de los mencionados profesionales, el uso que le den a la misma. 
Nueva presentación el  04 de Enero 2024 
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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
Bioquímico-Farmacéutico,UBA.
Ciudad de Buenos Aires, R. Argentina




viernes, 29 de diciembre de 2023

1029- Errores de diagnostico clínico

Zunaid Ismail Vally, Razia A.G. Khammissa, Gal Feller, Raoul Ballyram, Michaela Beetge, Liviu Feller. Errores en el diagnóstico clínico: una revisión narrativa. Faculty of Health Sciences, University of Pretoria, Pretoria, South Africa

Resumen de la publicación generada por ChatGPT-3.5;
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Este archivo informativo sobre errores de diagnóstico clínico, proporciona elementos valiosa sobre los factores que contribuyen a los mismos y ofrece estrategias prácticas para poder minimizarlos.

Preguntas de ejemplo:

1-  ¿Cuáles son algunos sesgos cognitivos comunes de los médicos que pueden conducir a errores de diagnóstico?

Algunos sesgos cognitivos comunes que pueden conducir a errores de diagnóstico incluyen: sobre-estimar el riesgo de eventos improbables, buscar y retener en la memoria nueva información que confirme creencias previas y respalde conceptos preexistentes, "cerrar" el proceso de un diagnóstico antes de que se haya completado, construir un diagnóstico sobre la base de conceptos no fundamentados, evidencia clínica o estadística débil o primeras impresiones subjetivas, subestimar el papel del azar, centrarse en lo obvio e ignorar evidencia menos obvia centrándose en detalles menores no esenciales en lugar de los principales, y no considerar alternativas de diagnóstico plausibles.

2- ¿Cómo pueden los médicos utilizar múltiples fuentes de información para mejorar la precisión del diagnóstico?

Se estima que la tasa de aparición de errores de diagnóstico clínicos asociados con resultados adversos para el paciente oscila entre el 10% y el 15% y que aproximadamente el 75% de estos, están relacionados con errores cognitivos cometidos en el proceso de diagnóstico.  A pesar de esto, el fenómeno del error de diagnóstico está subestimado y ha recibido poca atención por parte de las autoridades de salud pública y las instituciones académicas de enseñanza. Los médicos pueden utilizar múltiples fuentes de información para mejorar la precisión del diagnóstico basándose en información basada en evidencia, pautas establecidas y un enfoque probabilístico. Es importante señalar que los datos disponibles basados en evidencia recopilados de estudios aleatorios y metanálisis brindan una guía científica útil relacionada con el diagnóstico y el tratamiento de un paciente "promedio aleatorio", pero esta información no toma en consideración a muchos pacientes con características específicas como factores de riesgo y co-morbilidades, que son elementos importantes que influyen en el juicio clínico y la toma de decisiones. Por lo tanto, los médicos también deben tener en cuenta la naturaleza inherente contingente y ambigua de la práctica clínica, los resultados de los estudios observacionales, la experiencia personal de los médicos, la opinión clínica de expertos y las características personales únicas del paciente.

3- ¿Cuáles son algunas prácticas reflexivas y metacognitivas que pueden ayudar a fortalecer las habilidades de diagnóstico?

Algunas prácticas reflexivas y metacognitivas que pueden ayudar a fortalecer las habilidades de diagnóstico incluyen una reflexión crítica, consciente y frecuente sobre la experiencia clínica diaria y sobre los procesos cognitivos que gobiernan los procedimientos de diagnóstico, lo que puede impulsar la incorporación y retención de conocimientos y reconocimiento de patrones recién adquiridos. aumentando así el banco mental de prototipos anclados en la memoria. Estas actividades cognitivas deberían mejorar la capacidad y las habilidades de diagnóstico de los médicos y reducir el riesgo de errores de diagnóstico. Además, dominar las habilidades metacognitivas permite a los médicos autocontrolar su razonamiento clínico, juicio y toma de decisiones en el proceso de diagnóstico, identificar posibles falacias lógicas y sesgos cognitivos, y evaluar y criticar constructivamente su propio desempeño diagnóstico. De esta forma, si es necesario, se puede revisar un diagnóstico, reduciendo el riesgo de error de diagnóstico....

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Dr. Anibal E. Bagnarelli,
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martes, 26 de diciembre de 2023

1028- Estrategias en el laboratorio clínico

Mahesheema Ali. Planificación estratégica en el laboratorio de medicina. ADLM -Clinical Laboratory News Nov-Dec 2023.

Las iniciativas estratégicas son una parte esencial en el laboratorio de medicina. Implica tomar decisiones de alto nivel que se alinean con la misión y la visión de la organización. A diferencia de la planificación táctica, que se centra en las operaciones del día a día, la planificación estratégica tiene una visión a largo plazo y considera el impacto global en todos los niveles de las operaciones del laboratorio.

Implementar el cambio es un desafío, especialmente para las organizaciones pequeñas y medianas que carecen de recursos para la gestión del cambio. En la mayoría de los casos, se deben contratar consultores externos para facilitar el proceso de gestión del cambio. Además, hay varias etapas de planificación estratégica, que incluyen la recopilación de información, el análisis de datos, la formulación,  implementación y evaluación de estrategias.

A diferencia de la planificación táctica, la planificación estratégica también implica recopilar datos apropiados mediante la observación de las condiciones actuales y proyectadas a partir de factores sociales, tecnológicos, económicos, ambientales y de políticas. Las herramientas para la recopilación de información incluyen  ideas, grupos focales y entrevistas.

Para facilitar el proceso de planificación estratégica, los laboratorios pueden utilizar varias técnicas para analizar datos, incluidos histogramas, gráficos, diagramas de dispersión, diagramas de espina de pescado, guiones gráficos, análisis de Pareto y análisis  Delphi. Una planificación estratégica exitosa requiere una comprensión profunda de las fortalezas, debilidades, oportunidades y amenazas de la organización, o un análisis FODA. Este proceso clasifica los factores internos como fortalezas y debilidades y los factores externos como oportunidades y amenazas. El análisis FODA ayuda a guiar las estrategias de marketing y es particularmente útil al implementar nuevas tecnologías o procesos.

Análisis FODA para implementar un nuevo programa

El siguiente es un ejemplo de cómo utilizar el enfoque de análisis FODA desde un punto de vista estratégico.

i) Fortalezas: El programa utilizará la última tecnología e instrumentación, exceso de capacidad técnica que se puede utilizar, un fuerte apoyo de liderazgo y recursos financieros suficientes. ii) Debilidades: escasez de personal, problemas de moral, sistema de mensajería inadecuado, falta de patólogos, experiencia limitada en la prestación de servicios de sistemas de información de laboratorio multi-hospitalarios/ clientes, problemas de tiempo de respuesta. iii) Oportunidades: ampliar el menú de prueba y aumentar los ingresos. iv) Amenazas: Competencia de otros laboratorios y reducción de reembolsos.

Estrategias para mejorar los procesos de toma de decisiones

Se pueden utilizar técnicas de toma de decisiones después de la etapa de recopilación de datos. Las opciones varían desde técnicas de votación como unanimidad, mayoría y pluralidad. Se pueden utilizar técnicas de toma de decisiones autocráticas o multicriterio para evaluar y clasificar ideas. Es importante señalar que este proceso no es el resultado de la creación de un solo individuo, sino que se deriva de un comité.

Estrategias de implementación para el lanzamiento de nuevos sistemas

Al implementar un nuevo programa estratégico, es importante asignar tareas a las personas adecuadas, utilizando la matriz responsable, con consultas e información. Por ejemplo, al lanzar un nuevo instrumento o prueba, los laboratorios deben crear protocolos de validación y brindar capacitación técnica para garantizar que el personal sea competente con el nuevo sistema o método. Evaluar las competencias del personal es una forma importante de asegurarse de que sean competentes. Además, también es fundamental discutir los requisitos de control de calidad, los criterios de presentación de informes y la facturación. Finalmente, evaluar los procesos utilizando indicadores clave de desempeño.......

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sábado, 23 de diciembre de 2023

¡¡ Felices Fiestas Colegas !!






La Navidad no es un momento ni una estación, sino un estado de la mente. Valorar la paz, la generosidad y tener merced, es comprender el verdadero significado de Navidad.  

J.C. Coolige (1872-1933)

                       
                      

jueves, 21 de diciembre de 2023

1027- Generación in vitro de ovocitos funcionales a partir de ratones machos

Kenta Murakami, Nobuhiko Hamazaki, Norio Hamada, Go Nagamatsu, Ikuhiro Okamoto, Hiroshi Ohta, Yoshiaki Nosaka, Yukiko Ishikura, Tomoya S. Kitajima, Yuichiro Semba, Yuya Kunisaki, Fumio Arai, Koichi Akashi, Mitinori Saitou, Kiyoko Kato & Katsuhiko Hayashi. Generación in vitro de ovocitos funcionales a partir de ratones machos. (Tesis Doctoral). Nature 2023; 615:900–906. Department of Stem Cell Biology and Medicine and Department of Obstetrics and Gynecology, Graduate School of Medical Sciences, Kyushu University, Fukuoka, Japan

Resumen de la publicación generada por ChatGPT-3.5;
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Este innovador estudio fue realizado por un equipo de investigadores de la Universidad de Kyushu, la Universidad de Kyoto y el Centro RIKEN de Investigación de Dinámica de Biosistemas.

Algunas preguntas 

1- ¿Cuál es la importancia de generar in vitro ovocitos funcionales a partir de ratones macho in vitro?

La importancia de generar ovocitos funcionales a partir de ratones macho in vitro es que proporcionan conocimientos que podrían conducir a una cura para la infertilidad causada por trastornos cromosómicos sexuales o autosómicos, y allana el camino hacia la reproducción bipaternal. Esta investigación también arroja luz sobre la función y estructura adecuadas de los cromosomas sexuales que subyacen al dimorfismo sexual en la gametogénesis de los mamíferos. El estudio supone un gran avance en la medicina reproductiva y podría tener importantes implicaciones para la fertilidad humana.

2- ¿Cómo lograron los investigadores esta hazaña y cuáles fueron los hallazgos clave del estudio?

Los investigadores lograron la generación de ovocitos funcionales a partir de ratones macho in vitro convirtiendo eficientemente el conjunto de cromosomas XY en dos cromosomas X sin un cromosoma Y adicional en células madre pluripotentes (PSC) de ratón. Esta alteración cromosómica erradicó con éxito la trisomía 16 en las CEP, que es un modelo de síndrome de Down. Las PSC XX euploides producidas artificialmente se diferenciaron en ovocitos maduros en cultivo con tanta eficacia como las PSC XX nativas. Es importante destacar que las células madre pluripotentes inducidas (iPSC) de la cola de un macho sexualmente maduro se diferenciaron en ovocitos completamente potentes, que dieron origen a la descendencia después de la fertilización. Los hallazgos clave del estudio incluyen la generación exitosa de ovocitos funcionales a partir de ratones macho in vitro, la erradicación de la trisomía 16 en las CEP y el potencial de reproducción bipaternal.

3- ¿Cuáles son las posibles implicaciones de esta investigación para la fertilidad humana y la medicina reproductiva?

Las posibles implicaciones de esta investigación para la fertilidad humana y la medicina reproductiva son significativas. La generación de ovocitos funcionales a partir de ratones macho in vitro abre nuevas posibilidades para abordar la infertilidad causada por trastornos cromosómicos sexuales o autosómicos. Esta investigación podría conducir potencialmente al desarrollo de nuevos tratamientos para la infertilidad y brindar esperanza a las personas que luchan con desafíos reproductivos. Además, el estudio allana el camino para la reproducción bipaternal, lo que podría tener implicaciones de gran alcance para las tecnologías de reproducción asistida y la planificación familiar. En general, esta investigación tiene el potencial de mejorar nuestra comprensión de la gametogénesis y ofrecer nuevas vías para abordar la infertilidad en humanos.

Información adicional

  • El estudio se realizó en ratones y no está claro si la misma técnica tendría éxito en otros mamíferos, incluidos los humanos.
  • Las implicaciones éticas de esta investigación necesitan una cuidadosa consideración, ya que plantea preguntas sobre la naturaleza de la paternidad y el potencial de explotación.
  • Incluso si esta tecnología se desarrollara para uso humano, probablemente pasarían muchos años antes de que se convirtiera en una opción viable para la reproducción asistida

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lunes, 18 de diciembre de 2023

1026- Estadísticas en el Comité de Revisión del PNAS

Adrian E. Raftery, Alicia L. Carriquiry, Michael J. Daniels, Constantine Gatsonis, Steven N. Goodman,  Amy H. Herring, Nancy M. Reid. El PNAS establece estadisticas en el Comité de Revisión. Proc Natl Acad Sci USA. 2023; 120 (47): e2317870120. Department of Statistics, Department of Sociology University of Washington, Seattle, WA- USA 

La mayoría de los artículos publicados en PNAS (Proc Natl Acad Sci) implican análisis estadísticos. El análisis estadístico de datos puede ser complicado y desafiante, especialmente porque los datos científicos han aumentado constantemente en volumen y complejidad. Si bien se desconoce la prevalencia de errores estadísticos en las publicaciones científicas, incluido las del PNAS, se ha afirmado de manera creíble que son grandes. Se ha identificado que los errores en el análisis estadístico contribuyen en la crisis de reproducibilidad en la ciencia. Estos errores surgen incluso en presencia de una revisión por pares rigurosa, cuya forma es actualmente objeto de debate (3).

Un remedio a este dilema que se ha descubierto que mejora la calidad estadística de los artículos científicos publicados es la revisión estadística de expertos.  La revisión estadística ha sido una característica habitual de las revistas biomédicas desde finales de los años 1970, pero ha sido menos prominente en otros campos. Con este fin, varias revistas de ciencia general han establecido grupos de editores estadísticos en la última década, incluidos PLoS One , PLoS Biology y Science.

Hasta hace poco, los editores de PNAS buscaban revisores estadísticos externos cuando veían la necesidad. El éxito de este enfoque fue desigual, ya que los estadísticos ya están muy comprometidos y a menudo no están disponibles para revisiones estadísticas ad hoc fuera de su propia especialidad. 

En respuesta, PNAS estableció un Statistical Review Committee en septiembre de 2022, compuesto inicialmente por siete estadísticos. Los manuscritos que se consideran potencialmente aceptables, pero cuya solidez estadística los revisores originales no han podido evaluar, son marcados por el editor, el miembro del consejo editorial o un revisor y remitidos al Statistical Review Committee para una evaluación adicional. El comité revisa formalmente el manuscrito: el comité puede evaluar los métodos estadísticos por sí mismos o remitir el manuscrito a un revisor estadístico o metodológico adicional con la experiencia adecuada.

Hasta ahora, el comité ha funcionado bien y se han evaluado más de 56 manuscritos. Algunos de ellos se han mejorado al abordar por retro-alimentación en la revisión estadística. Además, algunos artículos han sido rechazados debido a preocupaciones planteadas sobre la idoneidad de los métodos estadísticos utilizados. 

Se prevé que el comité ayudará a elevar la calidad de la realización, presentación o interpretación de los análisis estadísticos en los artículos de PNAS, así como a mejorar la reproducibilidad de los artículos en la revista.

 1) Leer el articulo original

2) Leer referencia 3)

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viernes, 15 de diciembre de 2023

1025- Standarizar el nombres de las pruebas de laboratorio.

Jane Dickerson, Darci Sternen. ¿Cincuenta formas para solicitar una pedido de albúmina?           ADLM-Clin Labor News, art Nov. 2023  

Jane Dickerson y Darci Sternen del Laboratory Stewardship Focus entrevistaron recientemente a la patóloga e informática Ila Singh, sobre el esfuerzo nacional para estandarizar la denominación de pruebas de laboratorio a través de TRUU-Lab. Singh es jefe de medicina de laboratorio e informática de patología del Texas Children's Hospital y profesor de la Facultad de Medicina de Baylor.

¿Que es TRUU-LAB?  

TRUU-Lab o Test Renaming for Understanding and Utilization-Lab, es una iniciativa que une a las personas que participan en garantizar que las pruebas de laboratorio se realicen correctamente. Las partes interesadas de TRUU-Lab incluyen médicos; proveedores de registros médicos electrónicos (EMR), sistemas informáticos de laboratorio e instrumentación; representantes de sociedades profesionales como la Association for Diagnóstico y  Laboratorio de Medicina (ADLM, anteriormente AACC); e incluso agencias federales, como los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC), la Administración de Alimentos y Medicamentos (FDA) y los Centros de Servicios de Medicare y Medicaid (CMS). Las partes interesadas asisten constantemente a reuniones y están comprometidas en tratar de lograr cierta estandarización en los nombres de las pruebas de laboratorio.

Existe una comprensión común de que muchos errores ocurren porque los médicos no necesariamente entienden qué prueba solicitar. Hay muy poca estandarización en torno a la selección de nombres para las pruebas; de hecho, la mayoría de las veces, las personas eligen los nombres de las pruebas de laboratorio, a menudo sin consulta, incluso dentro de su propia institución.

Por ejemplo, hay un artículo del Departamento de Asuntos de Veteranos (VA) que muestra que hay más de 50 nombres para el pedido de la determinación de albúmina solo dentro del sistema VA (Med Care 2019;57:e22-7).

¿Puede contarnos la historia de cómo surgió la idea deTRUU-LAB ?

Bueno, el Patient-centered Laboratory Utilization Guidance Services (PLUGS) fue indirectamente involucrados en esto porque alrededor de 2018-2019 cuando estuve en el National Committee for Laboratory Stewardship pense que cada uno de nosotros que estamos sentados en los comités de pruebas de administración de nuestro propio hospital o laboratorio teníamos la misma conversación sobre los nombres confusos de las pruebas de vitamina D. 

Simplemente se me ocurrió que es necesario que haya algo más unido. Nos tomo más de 6 meses unificar los nombres de las pruebas de vitamina D en mi propia institución,  una prueba que es una herramienta de decisión clínica y en el caso de la 1,25 dihidroxivitamina D requirió tanto tiempo. Simplemente sentí como enorme pérdida de tiempo para todos. Debería haber algo mejor, más unificado, que nos ahorraría a todos mucho tiempo.

Y fue entonces cuando pensé que debíamos trabajar hacia la estandarización. Por la misma época también tuvimos un caso de sarampión y nadie pudo encontrar el nombre de la prueba porque estaba clasificada en el sistema como “rubéola”. Eso también me hizo pensar que cuando el médico solicita una prueba, su única ventana a la prueba es el nombre de la prueba en el EMR. Es casi increíble que haya más información disponible sobre un artículo de $5 en Amazon que la prueba más cara en un EMR.

El EMR no intenta decirle que es posible que necesite un algoritmo más extenso al solicitar una prueba. Si los médicos necesitan más información, a menudo necesitan salir del EMR y consultar un catálogo de pruebas o utilizar un motor de búsqueda. Si un laboratorio quiere proporcionar más información, se ve obligado a desarrollar alertas  u otras herramientas de decisión clínica que ralentizan a todos con más clics.

¿Cuales son los objetivos mas urgentes para TRUU-LAB?

Tenemos cuatro objetivos principales.

 i) La primera es descubrir qué características de una prueba de laboratorio individual la hacen más comprensible para los médicos  que la solicitan; ¿Qué partes del nombre de una prueba se consideran útiles; ¿Cuáles no?; ¿Podemos establecer algunas pautas sobre la denominación de pruebas utilizando nuestra comprensión de los nombres de las pruebas? Ese es uno de nuestros mayores objetivos porque la mayoría de los nombres se han creado sin la participación de las personas que los usan.

ii) El segundo objetivo es utilizar esa comprensión de las características de las pruebas y crear una lista de nombres de pruebas.

iii) El tercer objetivo es probarlos en un EMR simulado, colocar estos nombres de pruebas de TRUU-Lab junto con otros nombres de pruebas y ver si las personas seleccionan la prueba deseada.

iv) El objetivo final es tener estos nombres de prueba como parte de la construcción básica de todos los sistemas EMR, de modo que podamos decir "estos son nombres cuidadosamente seleccionados y examinados, y todos deberíamos usarlos"........

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domingo, 10 de diciembre de 2023

1024- Biomarcadores en trastornos de ansiedad

K. Roseberry, H. Le-Niculescu, D.F. Levey, R. Bhagar, K. Soe, J. Rogers, S. Palkowitz, N. Pina, W. A. Anastasiadis, S. Gill, M. Kurian, A. Shekhar, A. B. Niculescu. Hacia una medicina de precisión para los trastornos de ansiedad: evaluación objetiva, predicción de riesgos, farmacogenómica y fármacos utilizados. Mol Psychiatry. 2023; 28(7): 2894–2912. Department of Psychiatry and Stark Neuroscience Research Institute, Indiana University School of Medicine, Indianapolis, USA

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Este estudio integral tiene como objetivo proporcionar una evaluación objetiva, predicción de riesgos, farmacogenómica y medicamentos utilizados para el tratamiento de los trastornos de ansiedad.

Algunas preguntas :

¿Cuál es el enfoque de cuatro pasos utilizado para descubrir biomarcadores sanguíneos para la ansiedad?

Se describe el enfoque de cuatro pasos utilizado para descubrir biomarcadores sanguíneos para la ansiedad. i) Se utilizó un diseño longitudinal intrasujeto para descubrir cambios en la expresión de genes sanguíneos entre estados de ansiedad baja y alta auto-informados. ii) Se utilizó un enfoque de genómica funcional convergente similar al bayesiano para priorizar la lista de biomarcadores candidatos. iii) Los principales biomarcadores y su prioridad se validaron de una cohorte independiente de sujetos psiquiátricos con ansiedad clínicamente grave. iv) Se evaluó la capacidad de los biomarcadores candidatos para predecir el estado de gravedad de la ansiedad y el empeoramiento clínico futuro de otra cohorte independiente de sujetos psiquiátricos.

¿Cómo se validaron los principales biomarcadores en una cohorte independiente de sujetos psiquiátricos?

La validación se realizó considerando el cambio gradual del grupo con ansiedad severa vs sujetos con ansiedad alta y ansiedad baja y nuevamente al grupo de validación con ansiedad severa, utilizando ANOVA. También se registró el número de prueba.

¿Cuáles fueron los resultados de probar la utilidad clínica de estos biomarcadores candidatos para predecir el estado de gravedad de la ansiedad y el futuro empeoramiento clínico?

Se comprobó la utilidad clínica de los biomarcadores candidatos, es decir, su capacidad para predecir el estado de gravedad de la ansiedad y el empeoramiento clínico futuro (hospitalizaciones con ansiedad como causa contribuyente), en una cohorte independiente de sujetos psiquiátricos. El estudio mostró una mayor precisión de los biomarcadores individuales con un enfoque personalizado, por género y diagnóstico, particularmente en mujeres. 

Los biomarcadores con mejor evidencia global fueron: GAD1 (Glutamate Decarboxylase1), NTRK3 (Neurotrophic Receptor Tyrosine Kinase 3), ADRA2A (Adrenoceptor Alpha 2A), FZD10 (Frizzled Class Receptor 10), GRK4 (G Protein-Coupled Receptor Kinase 4), y  SLC6A4 (Solute Carrier Family 6 Member 4).

Finalmente, el estudio identificó cuáles de estos biomarcadores son objetivos de medicamentos existentes, como valproato, ácidos grasos omega-3, fluoxetina, litio, sertralina, benzodiazepinas y ketamina, y por lo tanto pueden usarse para relacionar a los pacientes con los medicamentos y medir la respuesta de ellos al tratamiento.

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